Nas proteínas, os aminoácidos são unidos covalentemente por ligações peptídicas. Considerando a ligação peptídica e suas características

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Os aminoácidos que constituem as proteínas são formados por ligações peptídicas entre o nitrogênio do grupo amino terminal e o oxigênio do grupo carboxi terminal do aminoácido adjacente. Essa é uma ligação forte que constitui a estrutura primária da proteína. Além disso, as proteínas apresentam conformação em forma helicoidal ou em folha beta-pregueada (estrutura secundária) e mantém ligações não covalentes entre pontos distantes da proteína, que aumenta seu enovelamento (estrutura trerciária). Durante a digestão das proteínas, o baixo pH do estômago devido à liberação de ácido clorídrico vai romper as lligações não covalentes, expondo as peptídicas, além de liberar a enzima pepsina (a apartir da clivagem do zimógeno pepsinogênio) que vai romper as ligações peptídicas, formando peptídios menores. Essa digestão será continuado no intestino delgado, onde o sulco pancreático rico em enzimas fará a digestão até aminoácidos, capazes de ser absorvidos pela mucosa intestinal.