A principal diferença entre o método de semeadura em superfície e do em profundidade, é que no de superfície o agente solidificante, por exemplo o ágar-ágar, já vai estar adicionado na placa e solidificado, e portanto a inoculação da amostra será realizada nesta superfície sólida. Na semeadura em profundidade, primeiro é feito a inoculação da amostra na placa, e posteriormente é adicionado o agente solidificante. Outras diferenças, na semeadura em superfície o volume inoculado geralmente é menor do que em profundidade, em geral 0,1 mL para facilitar o espalhamento na superfície do ágar e não haver excesso de amostra, nesta técnica utiliza-se a alça de drigalski para espalhar a amostra. Na em profundidade consiste em se adicionar 1 mL de uma suspensão bacteriana que esteja sendo estudada (analisada) a 20 mL de um meio de cultura fundido e resfriado, com posterior homogeneização com movimentos circulares Em ambas as técnicas é necessário que o espalhamento da amostra seja bem distribuído e uniforme, para que não ocorra crescimentos agrupados, o inviabilizaria a contagem do número de células crescidas.
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