O metabolismo das células vegetais pode ser dividido entre metabolismo primário e metabolismo secundário. Processos metabólicos com função vital, como a respiração, fotossíntese, translocação de solutos, síntese de proteínas, assimilação de nutrientes, entre outros correspondem ao metabolismo primário. Já para o metabolismo secundário, as substancias produzidas normalmente não estão envolvidas em funções vitais, a função normalmente está relacionada contra a ação da herbívora, atração de polinizadores, etc. Existe também diferenças espacial entre eles, os met. primários apresentam ampla distribuição em todos os grupos vegetais, já os met. secundários são restritos a uma espécie ou grupo de espécies relacionadas.
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