Polimorfismo

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Polimorfismo 
O que é?
Os polimorfismos são variações genéticas que aparecem como consequências de mutações, podendo ter diferentes classificações dependendo da mutação original. A categoria mais básica de polimorfismo é originada a partir de uma simples mutação, quando ocorre uma troca de um nucleotídeo por outro. 
Obsevação: Mutação é a alteração em que a frequência na população é menor que 1% já os polimorfismos é uma alteração no dna mais frequente, e esta presente em mais de 1% da população. Polimorfismo são o que faz uma pessoa ser única.
Análise de polimorfismos genéticos
• Polimorfismos podem ser utilizados como marcadores genéticos (característica que mostra as diferenças entre dois ou mais indivíduos ou organismos);
• Consideram-se os marcadores como codominantes, ou seja, não há relação de dominância ou recessividade como visto em alelos comuns; 
• Formas de detecção de marcadores genéticos – blots (Southern Blot, hibridização, microarrays ou PCRs). 
• Utilidade dos marcadores: identificar genes em desequilíbrio de ligação (linkage: se refere a genes que estão fisicamente ligados, ou seja, que pertencem a um mesmo cromossomo.)
Tipos de polimorfismo genético
• Single Nucleotide Polymorphisms – SNP (polimorfismo de nucleotídeo único); 
• Short Tandem Repeats – STR (pequenas repetições em tandem); 
• Variable Number of Tandem Repeats – VNTRs (Número variável de repetições em tandem).
Snip
Polimorfismo de de nucleotídeo 
Um ou outro nucleotídeo
• Uma variação no DNA em qualquer uma das 4 bases (A,T,C,G) que diferencia um indivíduo de outro, ou entre pares de cromossomos;
• Pode ser uma mutação sinônima (sem alterar o aminoácido final); 
• Pode ser uma mutação não-sinônima (alterando o aminoácido final). 
• As não-sinônimas ainda podem ser missense (muda para uma classe diferente de aminoácido) ou nonsense (insere um códon de parada prematuro). 
• Importância: Esse tipo de variação pode afetar em como seres humanos desenvolvem doenças ou respondem à drogas, patógenos, etc.
STRs – microssatélites
Pequenas regiões em repetidas em série 
Localização: em todo genoma, cromossomos autossômicos e sexuais. Principalmente em regiões intergenicas ou intronicas 
Quando encontrado em regiões genômicas as repetições trazem risco de virarem mutações de impacto negativo pro ser humano.
APLICAÇÃO:
Teste de paternidade
Analise de Dna forense 
• Pequenas repetições de 2 a 6 bp (nucleotidios); 
• Pode se repetir algumas poucas vezes, ou centenas de vezes; 
• Dinucleotídeos: (GC)*n (n = número de repetições); • Trinucleotídeos: (GAC)*n; 
• Tetranucleotídeos, pentanucleotídeos, hexanucleotídeos. 
• Contagem recente das repetições: 128.000 Di; 8.740 Tri; 23.680 Tetra; 4.300 Penta; 230 Hexa. 
• Os hexanucleotídeos correspondem às regiões teloméricas. 
• Os STRs são bastante polimórficos na população geral.
VNTRs - Minissatélites; 
• Similar aos STRs, com unidades repetitivas de pelo menos 7 a algumas dezenas de pares de base; 
• Não é bem utilizado por PCR, por causa do tamanho do amplicon; 
• Melhor visualizado utilizando Southern blot.