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ORGANIZAÇÃO DO GENOMA Alguns conceitos importantes: • Genoma: é o conjunto de genes de um organismo • Gene: sequência de DNA que codifica (transcreve) um produto funcional (RNA ou proteína) • ORF: sequência de nucleotídeos que potencialmente pode codificar uma proteína. Quando codifica também é um gene. • Expressão gênica: processo pelo qual a informação das bases nitrogenadas (genes) é processada em um produto gênico funcional (RNA ou proteína) PROCARIOTOS: Algumas partes que fazem parte do genoma de organismos procariotos: • Promotor: é a sequência de DNA que controla a transcrição a partir da região codificadora, ele não é transcrito. • Terminador: sequência que sinaliza a finalização da transcrição. • Operon: unidade funcional da bactéria que permite que um promotor possa ativar a transcrição de várias regiões codificadoras ao mesmo tempo, formando um RNA único capaz de traduzir proteínas diferentes. Esse tipo de RNA é chamado de RNA policistrônico. • UTR: região não traduzida. Um vai até o start codon e o outro a partir do stop codon até o último nucleotídeo de RNAm. • RBS: fica dentro do UTR, é a região do RNAm que sinaliza onde deve começar a tradução As bactérias possuem cromossomos únicos, ou seja, ausência de complemento diplóide. 20 a 30% dos genes estão em operons e quase todo o genoma codifica proteínas. Possuem colinearidade dos genes e seus produtos proteicos, ou seja, a sequência de bases nitrogenadas do DNA é equivalente a sequência de aminoácidos da proteína. Existem alguma unidades genéticas acessórias como os plasmídeos, bacteriofragos e transposons. Uma característica a ser analisada também é a sobreposição de genes, fazendo com que uma sequência de DNA tenha mais de um gene para codificar. EUCARIOTOS: Algumas partes que fazem parte do genoma de organismos eucariotos: • nhRNA: é o RNA heterogêneo nuclear, que contém os exons e introns. o Slicing: processo que remove os íntrons para a união dos exons formando o RNA mensageiro que será traduzido. • CAP: sítio de ligação do ribossomo, é o local onde o ribossomo se liga no RNAm. o Depois que o RNA é transcrito ele recebe uma guanina modificada (não codificante) que forma o CAP. • PoliA: adição de uma cadeia de várias adeninas na ponta 3’ do RNAm, ele vai encurtando no citoplasma a medida que o RNA vai transcrevendo. Ele determina o tempo que o RNAm tem para gerar proteína antes de degradar. • URT • Promotor: no promotor existe a interação de várias proteínas (fatores de transcrição TAF) que ligam no gene promotor para indicar para a RNA polimerase quando ela deve começar a transcrever. • Acentuadores (enhancers): são as sequências de DNA que aumentam a taxa de transcrição. • Silenciadores: são as sequências de DNA que diminuem a taxa de transcrição.
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