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Citologia Biomedicina Replicação DNA Conhecendo o Genoma Genoma - Conjunto de genes presentes num indivíduo Genoma/Proteoma/Transcriptoma/Glicoma Hoje em dia, um novo gene (com cerca de 12 mil bases) tem a sua sequência decifrada num simples minuto; O projeto genoma requer 3 gigabytes de espaço para armazenamento de dados O DNA humano é 98% idêntico ao DNA do chipanzé; Aproximadamente 98% Genona não codifica proteína (gene) “Lixo DNA” Todas as células possuem o mesmo genoma? Se o genoma é igual, o que diferencia as células???? Expressão Gênica e Diferenciação Celular Em cada célula só parte do seu genoma está em uso, esse conjunto de genes varia, determinando, assim, as características da célula. Expressão Gênica e Diferenciação Celular Em cada célula só parte do seu genoma está em uso, esse conjunto de genes varia, determinando, assim, as características da célula. Expressão Gênica e Diferenciação Celular Como a célula lê o genoma? Processo de Expressão Gênica Gene Replicação Transcrição Tradução Como a célula lê o genoma? Processo de Expressão Gênica RNA – Diferentes Tipos Replicação Transcrição Tradução RNA – ácido ribonucléico RNA – RiboNucleic Acid ESTRUTURA MOLECULAR DO RNA ➢ Formado por vários nucleotídeos ➢ Precisa do DNA para ser formado ➢ O açúcar do RNA é uma pentose (RIBOSE) ➢ URACILA no lugar de TIMINA ➢ NÃO POSSUI DUPLA HÉLICE (única camada) Os RNAs, existem na célula como produto direto de genes e pertencem a 3 classes distintas: ➢ RNA mensageiro (mRNA), o qual contém a informação que posteriormente será traduzida numa proteína; ➢ RNA ribossomal (rRNA), componente principal do ribossoma; ➢ RNA de transferência (tRNA), que funciona como uma molécula transportadora de aminoácidos no decorrer do processo de tradução. Tipos de RNA http://www.sobiologia.com.br/conteudos/Citologia2/AcNucleico5.php Imagem: Autor desconhecido / domínio público mRNA – RNA mensageiro ➢ Cada aminoácido é codificado por 3 nucleotídeos (códon) tRNA – RNA transferência ➢ transporta os aminoácidos ➢ Braço aceptor – ligação com o aa ➢ Braço do anticódon – 3 nt complementares aos códons Tipos de RNA rRNA – RNA Ribossômico ➢ Proteínas associadas a rRNA ➢ Duas subunidades Transcrição Transcrição da Informação Genética ➢ Transcrição é a primeira etapa da expressão do gene. ➢ Envolve a cópia da sequência de DNA de um gene para produzir uma molécula de RNA. ➢ A transcrição é realizada por enzimas chamadas RNA polimerases, que ligam nucleotídeos para produzir uma cadeia de RNA (usando uma cadeia de DNA como modelo). ➢ Transcrição é o processo de formação do RNA a partir do DNA. ➢ Esse RNA formado é o RNAm (RNA mensageiro), que tem a função "informar" ao RNAt (RNA transportador) a ordem correta dos aminoácidos que originarão proteínas. Pra quê serve? ➢ Define o repertório de genes ativos a cada instante - o transcriptoma ➢ Muda de acordo com o tecido, alimentação, estímulos ambientais ➢ Um entendimento fino e preciso da regulação da transcrição gênica define a adaptação do indivíduo ao meio, diferenciação celular, embriogênese, etc... Transcrição da Informação Genética Pontos Principais: ➢ A transcrição é o processo no qual um gene da sequência de DNA é copiado (transcrito) para fazer uma molécula de RNA. ➢ RNA polimerase é a principal enzima de transcrição. ➢ A transcrição começa quando a RNA polimerase se liga a uma sequência promotora próxima ao início de um gene (diretamente ou através das proteínas auxiliares). ➢ A RNA polimerase usa uma das fitas de DNA (a fita molde) como uma referência para fazer uma molécula de RNA nova, complementar. ➢ A transcrição acaba num processo chamado terminação. ➢ A terminação depende das sequências no RNA, que sinalizam que a transcrição acabou Transcrição da Informação Genética A síntese de RNA (mensageiro, por exemplo) se inicia com a separação das duas fitas de DNA. Apenas uma das fitas do DNA serve de molde para a produção da molécula de RNAm. Replicação e Transcrição: ➢ os nucleotídeos utilizados possuem o açúcar ribose no lugar desoxibibose e há a participação de nucleotídeos de uracila no lugar de nucleotídeos de timina. ➢ Assim, se na fita de DNA que está sendo transcrita aparecer adenina, encaminha-se para ela um nucleotídeo complementar contendo uracila; Transcrição da Informação Genética Antes que a transcrição possa ocorrer, a dupla hélice de DNA deve se desenrolar próximo ao gene que está sendo transcrito. A região do DNA aberto é chamada de bolha de transcrição. Iniciação - A RNA polimerase se liga a dupla fita do DNA na região denominada promotor. A iniciação é um passo muito importante na expressão gênica!!! Elongamento - Adição covalente de nucleotídeos a extremidade 3' da cadeia polinucleotídica crescente; isto envolve o desenvolvimento transitório de um curto trecho de DNA fita simples. Término - Reconhecimento da sequência de término e liberação da RNA polimerase. Embora a transcrição seja realizada pela RNA polimerase, outras enzimas são necessárias para produzir o transcrito, além de outras proteínas. Estes fatores ou se associam diretamente com a RNA polimerase ou auxiliam na formação do aparato transcricional. Inicialização da Transcrição ➢ Todas as RNA polimerases eucarióticas requerem a ajuda de fatores proteicos de transcrição para começar a síntese de uma cadeia de RNA. ➢ Esses fatores de transcrição devem se ligar a uma região promotora no DNA e formar um complexo de iniciação apropriado antes que a RNA polimerase se ligue e inicie a transcrição. ➢ A síntese de RNA começa em regiões do DNA chamadas de promotoras - sequências específicas reconhecidas pela RNA polimerase - que direcionam a transcrição de genes. Região Promotora Essas sequências podem ser bastante variáveis, porém, mantêm conservadas regiões responsáveis pela função promotora. Nos eucariotos a principal região promotora é conhecida como TATA box. 5'-TATAAA-3 Cerca de 25 nucleotídeos antes do local de início da transcrição Essas sequências são reconhecidas por algumas proteínas específicas (Proteínas Ligadoras TATA box), chamadas de fatores de transcrição, que trazem a RNA polimerase para realizar a montagem dos RNAs Inicialização da Transcrição Alongamento Uma vez que a RNA polimerase está na posição do promotor, o próximo passo da transcrição — o alongamento — pode começar. Basicamente, o alongamento é a fase que a sequência de RNA fica mais longa, graças à adição de novos nucleotídeos. Durante o alongamento, a RNA polimerase "caminha" ao longo de uma fita de DNA, conhecida como fita molde, da 3' para 5’. Para cada nucleotídeo no molde, a RNA polimerase adiciona um nucleotídeo de RNA correspondente (complementar) à extremidade 3' da fita do RNA. Alongamento O transcrito de RNA é quase idêntico à fita de DNA não molde ou codificante. ➢ Contudo, as fitas de RNA têm a base uracila (U) em vez de timina (T) ➢ Assim como um açúcar ligeiramente diferente no nucleotídeo. ➢ Cada T da fita codificante é substituído por um U no transcrito de RNA Terminação A RNA polimerase vai continuar transcrevendo até encontrar sinais para parar. O processo de término da transcrição é chamado terminação e isso acontece uma vez que a polimerase transcreve uma sequência de DNA conhecida como terminador. Em eucariontes como os humanos, a terminação da transcrição acontece de forma diferente dependendo do tipo de gene envolvido. Terminação DNA para RNA Com o fim da transcrição, as duas fitas de DNA seu unem novamente, refazendo-se a dupla hélice. RNAm produzido destaca-se de seu molde e, após passar por um processamento, atravessa a carioteca e se dirige para o citoplasma, onde se dará a síntese proteica. Terminação Pré-mRNA - ???? Splicing Processamento do RNA, ocorre no núcleo e consiste na remoção dos íntrons e união éxons imediatamente após a transcrição do RNA. Os íntronsretirados do pré-RNA são “destruídos” dentro do núcleo gerando nucleotídeos livres que são reciclados. Splicing Alternativo A descoberta de apenas 30.000 genes em humanos não reflete a dimensão correta do número possível de proteínas a serem sintetizadas. O splicing alternativo permite que uma única fita de RNA mensageiro recém- sintetizada sofra diversas possibilidades de processamento, aumentando consideravelmente o número total possível de proteínas. Tradução Tradução ➢ No processo de tradução, a célula lê a informação de uma molécula chamada RNA mensageiro (RNAm) e usa essa informação para construir uma proteína. ➢ A tradução envolve "decodificar" um RNA mensageiro (RNAm) e usar sua informação para produzir um polipeptídeo ou cadeia de aminoácidos. ➢ No geral, polipeptídio é basicamente uma proteína (com a diferença técnica que algumas proteínas grandes são formadas por muitas cadeias de polipeptídios. Fases ➢ Iniciação ➢ Alongamento ➢ Terminação . Tradução Em um RNAm, as instruções para a produção de um polipeptídeo vêm em grupos de três nucleotídeos chamados códons. Aqui estão algumas características principais dos códons. ➢ Existem 61 códons diferentes para os aminoácidos ➢ Três códons de "parada" marcam o polipeptídeo como terminado ➢ Um códon AUG é um sinal de "início" para começar a tradução (também especifica o aminoácido metionina) Essas relações entre os códons do RNAm e os aminoácidos são conhecidas como código genético Código Genético - Códons Código Genético - Códons Código Genético - Códons Códons e Aminoácidos ➢ Na tradução, os códons de um RNAm são lidos por ordem (da extremidade 5' para a extremidade 3') por moléculas chamadas de RNAs de transferência ou RNAt. ➢ Cada RNAt possui um anticódon, um conjunto de três nucleotídeos que se liga ao códon correspondente no RNAm através do pareamento de bases. ➢ A outra extremidade do RNAt traz o aminoácido especificado pelo códon. Tradução Tradução: começo, meio e fim (livro) Três etapas: iniciação, alongamento e terminação. ➢ Iniciação ("começo"): nesta etapa, o ribossomo se junta ao RNAm e ao primeiro RNAt para que a tradução possa ter início. ➢ Alongamento ("meio"): nesta etapa, os aminoácidos são trazidos ao ribossomo pelos RNAt e são ligados entre si para formar uma cadeia. ➢ Terminação ("fim"): na última etapa, o polipeptídeo final é liberado para que possa cumprir sua função na célula Inicialização Para que se possa dar início à tradução, alguns ingredientes são necessários. Esses incluem: ➢ Um ribossomo (o qual tem duas parte, uma pequena e uma grande) ➢ Um RNAm com as instruções para a proteína que será construída ➢ Um RNAt "iniciador" transportando o primeiro aminoácido da proteína, que quase sempre é a metionina (Met) Durante a iniciação, essas peças devem se unir de maneira correta. Juntas, elas formam o complexo de iniciação, a configuração molecular necessária para começar a fazer uma nova proteína Inicialização Alongamento Nosso primeiro RNAt transportador de metionina começa no compartimento do meio no ribossomo, chamado de sítio P. Ao lado, um novo códon é exposto em outro compartimento, chamado de sítio A. O sítio A será o "desembarque" para o próximo RNAt, aquele cujo anticódon é o correspondente perfeito (complementar) do códon em exposição E – Exit P – Peptídeo A - Aminoácido Alongamento Alongamento Terminação ➢ A tradução acaba em um processo chamado terminação. ➢ A terminação acontece quando um códon de parada no RNAm (UAA, UAG ou UGA) entra no sítio A. ➢ Códons de parada são reconhecidos por proteínas chamadas de fatores de liberação, os quais se adaptam perfeitamente no sítio P (embora não sejam RNAt). ➢ Fatores de liberação confundem a enzima que normalmente forma as ligações peptídicas: fazem-na adicionar uma molécula de água ao último aminoácido da cadeia. ➢ Essa reação separa a cadeia do RNAt, assim a proteína recém- produzida é liberada. Terminação Código Genético 3 bases nitrogenadas 1 aminoacido Fluxo da Informação Genética Transcrição da Informação Genética ➢ RNA mensageiro (mRNA), ➢ RNA ribossomal (rRNA) ➢ RNA de transferência (tRNA), Transcreveu - Traduzir Tradução da Informação Genética http://hyperphysics.phy-astr.gsu.edu/hbase/organic/translation.html Exercícios Exercícios DNA mRNA -Códon Anticódon Aminoácidos Proteína Monte uma proteína DNA mRNA -Códon Monte uma proteína DNA mRNA -Códon Anticódon Monte uma proteína DNA mRNA -Códon Anticódon Aminoácidos Proteína 2.O esquema abaixo representa a sequência de aminoácidos de um trecho de uma proteína e os respectivos anticódons dos RNA transportadores: AAA – GCU – UUC – ACG – CAG: Anticódons RNAt. FEN – ARG – LIS – CIS – VAL: Trecho da proteína. Assinale a alternativa que contém a sequência de códons do RNA mensageiro que participou dessa tradução: a) UUU – CGT – TTG – UGC – GUC b) UUU – CGA – AAG – UGC – GUC c) TTT – CGT – TTC – TGC – GTC. d) CCC – TAC – CCA – CAT – ACT Considere um fragmento de DNA com a seguinte sequência de bases – GTA – GCC – TAG – e responda ao que se pede: a) Determine a sequência: I. Do DNA complementar a esta sequência. II. RNAm transcrito a partir deste DNA. III. RNAt transcrito a partir do RNAm. Considere um fragmento de DNA com a seguinte sequência de bases – GTA – GCC – TAG – e responda ao que se pede: a) Determine a sequência: I. Do DNA complementar a esta sequência. CAT CGG ATC II. RNAm transcrito a partir deste DNA. CAU CGG AUC III. RNAt transcrito a partir do RNAm. GUA GCC UAG Modificações Pós Traducionais É a modificação química de uma cadeia proteica depois de sua tradução. Tipos de Modificações: ➢ Enovelamento de proteínas ➢ Fosforilação ➢ Formação de pontes dissulfeto ➢ Glicosilação ➢ Sulfatação Síntese RNA Núcleo Glicosilação Remoção Sinal Segregação Tradução Fosforilação Açúcares modificados Distribuição Proteólise Armazenamento Condensação Empacotamento Modificações Pós Traducionais Lisossomo
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