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Química Farmacêutica Medicinal Profa. Dr. Carolina Horta Andrade Aula Prática Estudo das características e propriedades dos AINES 1. INTRODUÇÃO Os anti-inflamatórios não esteroides (AINEs) são um grupo variado de fármacos (Figura 1) que têm em comum a capacidade de controlar a inflamação, de analgesia (reduzir a dor), e de combater a febre. O termo foi criado em 1960 por Michael W. Whitehouse. Os AINEs são inibidores específicos da enzima ciclooxigenase (COX). A COX possui duas formas ligeiramente diferentes, designadas COX-1 e COX-2. Estas são importantíssimas na cascata do ácido araquidônico, pois transformam o ácido araquidônico, uma substância formada a partir de lipídeos presentes na membrana celular pela ação da fosfolipase A2, em dois tipos de compostos, as prostaglandinas e os tromboxanos. O papel destes mediadores na inflamação e na dor, assim como em vários outros processos fisiológicos (como na coagulação) é amplamente aceito. Figura 1. Principais classes químicas de AINEs. 2. OBJETIVOS • Analisar o modo de ligação dos AINEs no sítio ativo da COX; • Investigar a importância dos grupos funcionais dos fármacos para atividade farmacológica com base na análise das interações intermoleculares; • Conhecer as diferenças no modo de ligação entre fármacos pertencentes à mesma classe química ou de classes diferentes. 3. Métodos 1) Para analisar as interações intermoleculares, utilize os códigos PDB destacados na tabela abaixo para encontrar os complexos fármaco-receptor determinados experimentalmente através de cristalografia de Raios-X; 2) Em seguida, acesse o aplicativo online e gratuito PLIP (https://plip-tool.biotec.tu- dresden.de/plip-web/plip/index); 3) Digite o código PDB no campo “Find PDB ID using our search tool” e depois clique em “Run Analysis”; 4) Após alguns segundos a página inicial do PLIP será redirecionada. Clique na imagem do complexo fármaco-receptor e anote as interações intermoleculares. Uma legenda indicando os tipos de interação estará disponível na página de resultados; 5) Anote os resultados das interações intermoleculares no formato de um diagrama 2D. Um exemplo de diagrama 2D está representado abaixo: 6) Você pode desenhar o diagrama 2D manualmente e colar uma foto do seu desenho (de caderno) no relatório, ou utilizar uma ferramenta de desenho de estruturas químicas, como o MarvinSketch. O programa MarvinSketch pode ser baixado gratuitamente em https://chemaxon.com/products/marvin. 4. RELATÓRIO DE AULA PRÁTICA 1) Aponte as principais interações intermoleculares (exemplo: ligações de hidrogênio, interações iônicas e interações de Van der Waals) do substrato e fármacos listados na tabela abaixo com a COX utilizando diagramas de interação 2D. https://plip-tool.biotec.tu-dresden.de/plip-web/plip/index https://plip-tool.biotec.tu-dresden.de/plip-web/plip/index https://chemaxon.com/products/marvin https://chemaxon.com/products/marvin a) Código PDB: 1DIY Fármaco/substrato: ácido araquidônico Diagrama de interação 2D: 1DIY - Ácido Araquidônico Resíduo de AA AA Distância (Å) Tipo de ligação 205A PHE 3.91 Hydrophobic Interactions 205A PHE 3.41 Hydrophobic Interactions 209A PHE 3.60 Hydrophobic Interactions 209A PHE 3.69 Hydrophobic Interactions 344A VAL 3.90 Hydrophobic Interactions 348A TYR 3.20 Hydrophobic Interactions 349A VAL 3.14 Hydrophobic Interactions 352A LEU 3.42 Hydrophobic Interactions 377A ILE 3.66 Hydrophobic Interactions 381A PHE 3.92 Hydrophobic Interactions 381A PHE 3.51 Hydrophobic Interactions 385A TYR 3.43 Hydrophobic Interactions 387A TRP 3.38 Hydrophobic Interactions 523A ILE 3.31 Hydrophobic Interactions 527A ALA 3.52 Hydrophobic Interactions 534A LEU 3.91 Hydrophobic Interactions 534A LEU 3.54 Hydrophobic Interactions 120A ARG 4.23 Salt Bridges b) Código PDB: 4COX Fármaco/substrato: indometacina Diagrama de interação 2D: 4COX - Indometacina Resíduo de AA AA Distância (Å) Tipo de ligação 385A TYR 3.62 Hydrophobic Interactions 387A TRP 3.68 Hydrophobic Interactions 523A VAL 3.35 Hydrophobic Interactions 523A VAL 3.90 Hydrophobic Interactions 531A LEU 3.49 Hydrophobic Interactions 355A TYR 2.96 Hydrogen Bonds 530A SER 2.74 Hydrogen Bonds 120A ARG 3.62 Salt Bridges c) Código PDB: 5IKR Fármaco/substrato: Ácido Mefenâmico Diagrama de interação 2D: 5IKR - Ácido Mefenâmico Resíduo de AA AA Distância (Å) Tipo de ligação 349A VAL 3.41 Hydrophobic Interactions 352A LEU 3.41 Hydrophobic Interactions 385A TYR 3.76 Hydrophobic Interactions 387A TRP 3.63 Hydrophobic Interactions 523A VAL 3.64 Hydrophobic Interactions 527A ALA 3.64 Hydrophobic Interactions 531A LEU 3.63 Hydrophobic Interactions 385A TYR 2.03 Hydrogen Bonds 530A SER 1.99 Hydrogen Bonds d) Código PDB: 1HT5 Fármaco/substrato: flurbiprofeno Diagrama de interação 2D: 1HT5 - Flurbiprofeno Resíduo de AA AA Distância (Å) Tipo de ligação 349A VAL 3.54 Hydrophobic Interactions 352A LEU 3.72 Hydrophobic Interactions 355A TYR 3.48 Hydrophobic Interactions 359A LEU 3.71 Hydrophobic Interactions 385A TYR 3.76 Hydrophobic Interactions 387A TRP 3.39 Hydrophobic Interactions 387A TRP 3.90 Hydrophobic Interactions 527A ALA 3.70 Hydrophobic Interactions 355A TYR 1.52 Hydrogen Bonds 120A ARG 3.56 Salt Bridges e) Código PDB: 3LN1 Fármaco/substrato: celecoxibe Diagrama de interação 2D: 3LN1 - Celecoxibe Resíduo de AA AA Distância (Å) Tipo de ligação 335A VAL 3.55 Hydrophobic Interactions 338A LEU 3.98 Hydrophobic Interactions 370A LEU 3.96 Hydrophobic Interactions 371A TYR 3.57 Hydrophobic Interactions 373A TRP 3.35 Hydrophobic Interactions 504A PHE 3.81 Hydrophobic Interactions 509A VAL 3.50 Hydrophobic Interactions 513A ALA 3.60 Hydrophobic Interactions 178A GLN 3.51 Hydrogen Bonds 339A SER 2.03 Hydrogen Bonds 341A TYR 3.68 Hydrogen Bonds 499A ARG 2.51 Hydrogen Bonds 504A PHE 2.82 Hydrogen Bonds 106A ARG 3.61 Halogen Bonds 2) Aponte as principais semelhanças entre o modo de ligação (interações intermoleculares) entre o substrato natural (ácido araquidônico) e os fármacos elencados na tabela acima. Fármacos Semelhanças do modo de ligação comparando ao substrato Indometacina O grupamento ácido (-COOH) da indometacina mimetiza o grupamento ácido do substrato realizando interação intermolecular com o aminoácido tirosina 355 e arginina 120; o anel aromático mimetiza as duas ligações duplas iniciais do substrato e o segundo sistema aromático (anel clorado) permite melhor interação no sítio ativo da COX-1, por mimetizar as outras duas ligações duplas do ácido araquidônico. Ácido Mefenâmico O grupamento ácido (-COOH) do ácido mefenâmico mimetiza o grupamento ácido do substrato realizando interação intermolecular com o aminoácido tirosina e o anel aromático mimetiza as duas ligações duplas iniciais do substrato. Flurbiprofeno O grupamento ácido (-COOH) da flurbiprofeno mimetiza o grupamento ácido do substrato realizando interação intermolecular com o aminoácido arginina 120 e o anel aromático mimetiza as duas ligações duplas iniciais do substrato. Celecoxibe O grupamento ácido (fenilssulfonamida) do celecoxibe mimetiza o grupamento ácido do substrato realizando interações em um bolsão da COX-2 e os anéis aromáticos mimetiza ligações duplas do substrato. 3) Aponte as características químicas gerais (ex. grupos funcionais, propriedades físico-químicas) comuns à maior parte dos fármacos acima, assim como sua importância para inibição da COX. As características químicas gerais comuns entre a Indometacina, Ácido Mefenâmico, Flurbiprofeno e Celecoxibe é ter um grupamento funcional ácido, sendo um ácido carboxílicona Indometacina, no Ácido Mefenâmico e no Flurbiprofeno e, uma sulfonamida no Celecoxibe, além dos anéis aromáticos com propriedade lipofílica realizando interações hidrofóbicas com o sítio ativo. A importância desses grupamentos para a inibição da COX é que eles são grupamentos com propriedades físico-químicas que mimetizam as interações mínimas necessárias para atividade intrínseca feitas pelo substrato das COXs. 4) O grupamento sulfonamida do celecoxibe é um bioisóstero de ácido carboxílico. Com base na análise das interações intermoleculares, explique porque os dois grupos são bioisósteros. O grupamento sulfonamida é um bioisóstero de ácido carboxílico porque possui similaridade físico-químicas do ácido carboxílico, ou seja, por também ser um grupamento ácido, sendo esse grupamento um entre os dois grupamentos farmacofóricos dos AINES.
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