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12/03/2018 1 INTRODUÇÃO A GENÉTICA QUANTITATIVA Profª. Drª. Talita Barban Bilhassi � Introdução - Característica controlada por muitos pares de genes são denominadas de “Características Poligênicas;” - Como se referem à mensurações são denominadas de “Características Quantitativas”; � Poligenes - Genes com um pequeno efeito individual que agem em conjunto sobre uma determinada característica, produzindo alterações quantitativas observáveis. HERANÇA POLIGÊNICA E HERANÇA SIMPLES � Introdução - As características controladas por poucos pares de genes são denominadas de “Características Qualitativas”. HERANÇA POLIGÊNICA E HERANÇA SIMPLES � Características cujos fenótipos tem expressão contínua: Exemplo: Produção de leite, ganho de peso, perímetro escrotal; � Não há possibilidade de serem classificadas em grupos fenotípicos distintos; � Descritas por valores numéricos; - São analisadas por meio de estimação de parâmetros populacionais (média, variância, etc); � São devido à ação das “Poligenes”; � Sofrem muita influência do meio ambiente. CARACTERÍSTICAS QUANTITATIVAS CARACTERÍSTICAS QUANTITATIVAS � Exemplos de Características Quantitativas: - Ganho de peso, eficiência alimentar, produção de leite, duração da lactação, produção de ovos, peso dos ovos, produção de lã, idade ao primeiro parto e, dentre outras; Representa a maioria das características de interesse econômico!!! CARACTERÍSTICAS QUALITATIVAS - Características cujos fenótipos são expressos em categorias (ocorrem em classes fenotípicas bem definidas); Exemplo: Presença/ausência de chifres, aprumos; - Não são descritos por valores numéricos; - São analisadas por meio de contagens e proporções; - São devido a ação de um ou poucos pares de genes – “Herança Simples”; - O ambiente desempenha um papel irrelevante na manifestação fenotípica dos caracteres qualitativos. 12/03/2018 2 CARACTERÍSTICAS QUALITATIVAS Exemplo: - Presença/ausência de chifres em bovinos. � Características Qualitativas e Quantitativas: - Se referem como a característica se expressa; � Herança Simples ou Poligênica: - Se referem como a característica é herdada; � Característica de Limiar - São características poligênicas que exibem fenótipos categóricos; Exemplo: - Dificuldade de parto; - Ocorrência de prenhez. DIFERENÇAS ENTRE AS CARACTERÍSTICAS APLICAÇÃO DA ESTATÍSTICA AO MELHORAMENTO ANIMAL MÉDIA - Consiste na soma de todos os valores de distribuição, dividido pelo número total de observações (n); � Cálculo da média: n X n XXX X n i i n ∑ = = +++ = 121 ... MEDIDAS DE VARIAÇÃO VARIÂNCIA - Média dos desvios quadráticos das medidas em relação à média geral; - Medida de variabilidade que ocorre em uma população em relação a uma determinada característica. 12/03/2018 3 1 2 1 1 2 − − ∑ ∑ = = N N X X n i in i i = VARIÂNCIA 2 σ � Cálculo da variância: DESVIO-PADRÃO - Corresponde a raiz quadrada da variância; - Considerado uma medida básica de variabilidade, por ser expresso na mesma unidade de valores dos conjuntos de dados, facilitando a interpretação dos resultados. DP = 2σ COEFICIENTE DE VARIAÇÃO - Medida absoluta da dispersão, no qual expressa o desvio-padrão que seria obtido se a média fosse igual a 100. CV = ______________ µ 2 σ X 100 � A covariância "mede" a relação entre duas características (variáveis); � Associação Entre as Características: � Direção (+ ou -); � Grau (força) de associação; � Quanto de mudança vai ocorrer em uma característica, devido à mudança em uma outra característica. COVARIÂNCIA O que importa na análise de covariância é conhecer, o sentido da variação entre as características (positiva/negativa). COVARIÂNCIA �Exemplos: � Covariância Positiva - Peso ao nascer e peso ao desmame; - Comprimento do corpo do suíno e quantidade de carne magra; - Peso do vêlo e diâmetro; - Duração da lactação e produção de leite; � Covariância Negativa - Perímetro escrotal e idade à puberdade em novilhas; - Peso do vêlo e qualidade da lã em ovinos. COVARIÂNCIA 12/03/2018 4 � Cálculo da Covariância: COVARIÂNCIA Cov (x,y) = ΣXi .Yi – [(ΣXi . ΣYi) / N] (N-1) ___________________________________________ �O resultado de covariância entre as características está sujeito às unidades das variáveis em análise; Exemplo: Se a variável "x"estiver em metros e a variável 'y" em "reais", a unidade da covariância será em metros*reais. COVARIÂNCIA � É relativamente difícil fazer julgamentos sobre o poder de associação entre duas variáveis analisando apenas a covariância, pois ela não é uma medida padronizada; A correlação é a medida padronizada da relação entre duas variáveis!!! COVARIÂNCIA � Importância da Correlação - O grau de associação e o sentido das respostas correlacionadas são determinados, principalmente, pela correlação genética entre as características envolvidas; OBS: O valor econômico de um animal resulta no número de características desejáveis que influem no seu desempenho. CORRELAÇÃO � Importância da Correlação - As correlações genéticas entre duas características mostram a extensão em que os mesmos genes afetam a expressão de ambas; - Mede a probabilidade de duas características diferentes serem afetadas pelo mesmo gene. PLEIOTROPIA CORRELAÇÃO � Consequências da Correlação - Se duas características de importância econômica possuem correlação positiva, a ênfase na seleção deverá ser em apenas uma delas, para o melhoramento de ambas; Redução no número de características selecionas. CORRELAÇÃO 12/03/2018 5 � Consequências da Correlação - Se duas características de importância econômica não possuem correlação, a seleção de uma não afetará a outra. CORRELAÇÃO � Consequências da Correlação - Se as características estão negativamente correlacionadas, a seleção para a melhoria de uma poderá ser (ou não) vantajosa, em virtude da redução na segunda; Exemplos: Produção de leite x % de gordura no leite; Produção de ovos x peso corporal em aves. CORRELAÇÃO � Cálculo da correlação CORRELAÇÃO Cov (X, Y) _______________________________________r X, Y = (σ X ) . (σ Y) LIMITE: -1 < rX, Y < +1 � LIMITE: -1 < rX, Y < +1 - Próximo +1: Características muito associáveis – correlação no mesmo sentido; - Próximo 0: Características pouco associáveis; - Próximo -1: Características muito associáveis – correlação no sentido contrário. CORRELAÇÃO � Coeficiente de Correlação CORRELAÇÃO 0 2 4 6 8 10 12 0 2 4 6 8 rX, Y = +0,80 0 2 4 6 8 10 12 14 0 2 4 6 8 rX, Y = -0,80 rX, Y = 0,0 COEFICIENTE DE REGRESSÃO - Quanto que se pode esperar de mudança em uma característica (variável), por mudança de uma unidade em outra característica (variável); - Uma das variáveis é em função da outra. � bY, X = Regressão de Y sobre X � bX, Y = Regressão de X sobre Y 12/03/2018 6 COEFICIENTE DE REGRESSÃO �bY, X = Regressão de Y sobre X bY, X = bX, Y = COV ( X, Y) COV ( X, Y) ______________________ ______________________ X 2 σ Y 2 σ �bY, X = Regressão de X sobre Y EQUAÇÃO DE PREDIÇÃO - Predição do desempenho futuro da progênie Yi = Y + b. (Xi – X) Yi = Valor predito para o animal i; Y = Média da característica Y; b = Regressão dos valores preditos sobre a informação X; Xi = Valor do animal para determinada característica; X = Média da característica X. � Exemplo 1 - Os dados a seguir se referem aos pesos (Kg) avaliados em diferentes idades, em gado de corte: peso ao nascer (PN) e ao desmame (PD). Determinar: a) A média, a variância, e o desvio padrão das características; b) A covariância entre as características; c) O coeficiente de correlação entre PN e PD. Interprete os resultados d) Estimar o coeficiente de regressão do PD sobre o PN. Qual a variação no PD, para cada unidade de variação no PN? RESOLUÇÃO ANIMALANIMALANIMALANIMAL ((((X) PESO AO NASCER X) PESO AO NASCER X) PESO AO NASCER X) PESO AO NASCER ((((Y) PESO À DESMAMA Y) PESO À DESMAMA Y)PESO À DESMAMA Y) PESO À DESMAMA 1 27 193,5 2 31,5 225 3 30,6 220,1 4 27,9 193,5 5 29,3 198 6 33,8 236,3 7 27 207 8 29,3 180 9 27,9 191,3 10 28,4 184,5 N = 10N = 10N = 10N = 10 Quadro 1. Peso ao nascer (PN – X, Kg) e peso ao desmame (PD – Y, Kg) em gado de corte . RESOLUÇÃO � Média - PN = 29,27Kg - PD = 202,92Kg � Variância - T2 PN = 4,676 Kg2 - T2 PD = 346,097 Kg2 � Desvio-Padrão DP PN = ± 2,162 Kg 4,676 DP PD = ± 18,60 Kg 346,097 RESOLUÇÃO � Covariância entre as características Cov (PN,PD) = (ΣPN . PD) - (ΣPN . ΣPD) / 10 ___________________________________________ (10-1) Cov (PN,PD) = + 31,048 Kg2 As características variam no mesmo sentido!!! RESOLUÇÃO 12/03/2018 7 � Coeficiente de correlação entre PN e PD r PN, PD = Cov (PN, PD) ___________________________________________ [(σ PN ) . (σ PD)] r PN, PD = 31,048 ___________________________________________ [(σ 2,162 ) . (σ 18,60)] r PN, PD = + 0,80 Coeficiente de correlação próximo de +1: Associação forte entre PN e PD. Correlação no mesmo sentido (+), na qual as características são muito associáveis!!! RESOLUÇÃO � Coeficiente de regressão do PD sobre PN RESOLUÇÃO bPD, PN = COV ( X, Y) = 31,048___________________________________ T2 PN = 4,676 bPD, PN = 6,64 Kg Se o PN dos animais aumentar em 1Kg, significa dizer, que o PD irá aumentar 6,64Kg. � Exemplo 2: Os dados a seguir se referem aos pesos à 8 semanas de idade em aves de corte, da raça White Plynouth Rock. X = peso do pai; Y= peso da progênie, em gramas. a) Determinar o coeficiente de correlação entre X e Y; b) Determinar o coeficiente de regressão de Y sobre X; c) Prever o peso da progênie de um pai pesando 890g; d) Qual a variação do peso da progênie para cada unidade de variação do peso do pai? PESO DO PAI = X PESO DA PROGÊNIE = Y 601 910 733 983 793 976 795 1050 818 1080 838 1040 854 1040 880 1025 882 994 895 1030 952 1021 953 1078 961 964 679 976 995 1110 997 1041 1040 1035 Quadro 2. X = Peso do pai; Y= Peso da progênie, em gramas de aves de corte da raça White Plynouth Rock. HERDABILIDADE � Herdabilidade (h²) - Determinada por métodos estatísticos, com o objetivo de identificar se uma característica de interesse econômico é ou não passível de seleção direta; - O conhecimento de h² é de fundamental importância para a definição dos métodos de melhoramento genético mais apropriados. HERDABILIDADE 12/03/2018 8 � Definição “Superioridade (ou inferioridade)dos pais em relação à determinada característica que será transmitida a sua progênie (Falconer e Mackay, 1996)” HERDABILIDADE � h² das Características Qualitativas - Cor da pelagem, ausência/presença de chifres, aprumos; - Determinadas por poucos pares de genes, são pouco influenciadas pelo ambiente em que os animais são manejados: Alto coeficiente de h². HERDABILIDADE � h² das Características Quantitativas - Peso, ganho de peso, altura, número de cordeiros nascidos por parto, perímetro escrotal, idade ao primeiro parto; - Determinadas por muitos pares de genes, na qual o ambiente em que os animais são manejados exerce forte influência sob essas características: h² varia de baixa à alta magnitude. HERDABILIDADE �Cálculo da Herdabilidade (h²) - Corresponde a proporção da variância fenotípica, causada por diferenças entre genes ou genótipos dos indivíduos; - Proporção da superioridade dos pais, que espera-se que seja transmitida à sua progênie. HERDABILIDADE �Importância da h² Das Características HERDABILIDADE P = G + E P = G + E 2 σ 2 σ 2 σ 2 σP = A + D + I + E 2 σ 2 σ 2 σ 2 σ HERDABILIDADE h² = h² = � h² Sentido Amplo � h² Sentido Restrito G 2 σ P 2 σ P 2 σ ______________ ______________ A 2 σ 12/03/2018 9 � Coeficiente de h2 HERDABILIDADE 0 < h2 < 1 (0 a 100%) � Classificação da h2 - Baixa; - Moderada; - Alta. � Interpretação Exemplo: h2 = 0,1 - As combinações gênicas e o ambiente são responsáveis, pela variação entre os indivíduos da população para uma determinada característica; - Pequena parte dessa superioridade será transmitida à progênie. BAIXA (MENOR OU IGUAL A 20%) MODERADA �h2 Moderada (varia entre 20% e 40%) � Interpretação Exemplo: h2 = 0,7 - As diferenças, entre os indivíduos da população para uma determinada característica é devido aos méritos genético do indivíduo; - Grande parte dessa superioridade será transmitida à progênie; - Animais que apresentam o melhor desempenho são os geneticamente superiores para determinadas características. ALTA (MAIOR OU IGUAL A 40%) � Correlação entre os Valores Genéticos e Valores Fenotípicos - A correlação entre os Valores Genéticos e os Valores Fenotípicos é igual a raiz quadrada da h2. HERDABILIDADE rA, P = h2 BAIXA (MENOR OU IGUAL A 20%) � Interpretação Exemplo: rA, P = 0,31 h2 = 0,1 - Correlação entre o genótipo e fenótipo é pequena; - Fenótipo não será um bom indicador para se realizar a seleção; - Necessidade de um maior número de informações para tomar decisões. 12/03/2018 10 ALTA (MAIOR OU IGUAL A 40%) � Interpretação Exemplo: rA, P = 0,83 h2 = 0,7 - Correlação alta entre o genótipo e o fenótipo do indivíduo; - Fenótipo constitui indicação segura do Valor Genético do indivíduo (fenótipo é um bom indicador para se realizar a seleção). CLASSIFICAÇÃO GERAL DE GRUPOS DE CARACTERÍSTICAS, DE ACORDO COM A H² Quadro 3. Classificação da h2, de acordo com o tipo de característica. CARACTERÍSTICAS CLASSIFICAÇÃO h2 Reprodutivas Baixa 5 – 15 Produtivas Moderada à Alta 20 – 40 Qualidade de Produtos Alta 45 – 60 Anatômicos Alta >50 H² DE ALGUMAS CARACTERÍSTICAS EM GADO DE CORTE BOVINOS DE CORTE h2 Intervalo de Partos (IP) 0 - 10 Peso ao Nascer (PN) 30 - 40 Peso ao Desmame (PD) 20 - 30 Habilidade Materna 20 -30 Ganho de Peso (GP) 20 - 30 Peso Final 30 -50 Quadro 4. H² de algumas características em bovinos. ESTIMATIVAS DE H² PARA CARACTERÍSTICAS REPRODUTIVAS EM SUÍNOS CARACTERÍSTICAS h2 MACHOS Libido 0,15 Motilidade dos espermatozóides 0,17 Quantidade de espermatozóides 0,37 Peso dos testículos 0,44 FÊMEAS Idade à puberdade 0,33 Reflexo de monta 0,29 Taxa de ovulação 0,32 Nº total de nascimentos 0,11 Nº de nascidos vivos 0,09 Nº de desmamados 0,07 Sobrevivência até a desmama 0,05 Peso da leitegada aos 21 dias 0,17 Quadro 5. H² de características de importância econômica em suínos. ESTIMATIVAS DE H² PARA CARACTERÍSTICAS ECONOMICAMENTE IMPORTANTES EM OVINOS CARACTERÍSTICA RAÇA h2 Peso ao nascer (a) Santa Inês 0,48 Morada Nova 0,15 Peso à desmama (a) Santa Inês 0 - 0,46 Bergamácia 0,32 Suffolk 0,14 - 0,55 Dorper 0,08 - 0,020 Área de olho de lombo (b) Merino 0,27 Cordeiros/ninhada (c) Bergamácia 0,04 Intervalo entre partos (c) Bergamácia 0,12 Quadro 6. Estimativa de h2 referentes, ao desempenho (a), qualidade de carcaça (b) e reprodutivas (c), em ovinos de diferentes raças criadas no Brasil. DÚVIDAS COMUNS À RESPEITO DA H² � Toda característica determinada geneticamente tem h² diferente de zero? - h² = 0 (não existe diferença genética); - Herdável: característica que possui h² diferente de 0; Há características que são devido à fatores genéticos, porém h²= 0 - Exemplo: Número de pernas em humanos. 12/03/2018 11 � h² consiste em um parâmetro populacional ou individual? - Populacional; � A h² de um parâmetro é constante? - Não é um parâmetro constante, pois pode ocorrer modificações ambientais, onde a população é manejada; - É específica para cada população, pois cada uma delas possui uma determinada frequência alélica, na qual irá alterar os componentes genéticos. DÚVIDAS COMUNS À RESPEITO DA H² AULA PRÁTICA � Lista de Exercícios 4 1) Descreva as principais diferenças entre as características poligênicas e características de herança simples. 2) O que é herdabilidade (h²)? 3) O coeficiente de h², consiste em um parâmetro populacional ou é inerente ao indivíduo de uma população? � Lista de Exercícios 4 4) A variância total relativaao peso de uma população de Suínos aos 180 dias de idade é de 60Kg2. As variâncias derivadas dos efeitos de dominância, epistasia e de meio ambiente são 15, 12 e 80Kg2, respectivamente. Estimar a herdabilidade restrita sob consideração. AULA PRÁTICA
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