Estudo Dirigido - Química Medicinal Avançada

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1) Destaque os seguintes aspectos das patentes de medicamentos no Brasil: 
A) MITOS E VERDADES 
Resposta: 
O primeiro mito é que o produto está no mercado durante todo período de 
exclusividade, já que o período em que o medicamento será comercializado é 
em torno de 10 anos, o que caracteriza a metade do tempo definido pela lei, 
de 20 anos. Posteriormente, o fato do paciente ficar dependente do detentor 
da patente e caracterizar o período de exclusividade como um monopólio 
compreende outro mito, já que para o medicamento ser patenteado ele 
deverá concorrer com outros que já existam no mercado, a única coisa que o 
detentor da patente possui é a exclusividade temporária para comercialização 
do produto. 
 
B) PRÓS E CONTRAS DAS PATENTES 
Resposta: 
A patenteação é importante principalmente pelo fato de incentivar a 
pesquisa, porém, necessita de altos investimentos. Para ficar mais claro, trata-
se de um subinvestimento em Pesquisa e Desenvolvimento. Caso não existisse 
os direitos patentários, provavelmente, grande parte dos medicamentos não 
seriam criados, pois, não haveria inventivo ao investimento de pesquisas, já 
que se trata de um processo caro, demorado, além dos resultados serem 
imprevisíveis, sendo poucas as moléculas que passam para a fase de testes 
clínicos até serem comercializadas. Outro ponto positivo a ser considerado é 
que através das patentes é possível assegurar futuros tratamentos e a criação 
de novos genéricos, pois o mesmo para ser comercializado deve ser 
submetido a testes de eficiência e tolerabilidade comparados ao de 
referência. 
 
C) DESCREVA UM FLUXO ATÉ O DEPÓSITO DE UMA PATENTE 
Resposta: 
Para realização do depósito de uma patente, vários procedimentos devem ser 
feitos anteriormente, como por exemplo, buscar se há algum produto igual já 
patenteado, através da Busca de Anterioridade. Logo após deverá ser 
realizado o envio do processo SEI para CIT, incluindo diversos documentos, 
como a Notificação de invenção, Busca de Anterioridade e o ofício solicitando 
o depósito da patente. Posteriormente, após a análise da documentação, 
deverá ser realizado o Pagamento da GRU (Guia de Recolhimento da União) 
pelos serviços prestados pelo INPI (Instituto Nacional de Propriedade 
Industrial). Só após a confirmação do pagamento, o pedido de depósito da 
patente será feito junto a INPI, emitindo assim o CIT (Certificado de Adição de 
Invenção). 
 
2) Qual o papel da Bioinformática no desenvolvimento de novos medicamentos? 
 Resposta: 
 Sabe-se que, atualmente, grande parte do conhecimento adquirido pelos 
seres humanos estão depositadas em banco de dados, diante disso, a 
bioinformática consiste na aplicação de ferramentas computacionais que 
auxiliam no estudo de sistemas biológicos, sendo importante para o 
entendimento de bases moleculares e o seu funcionamento através de 
modelagens computacional, além disso, também permite que as novas 
enfermidades possam ser solucionadas através de desenhos de fármacos 
baseados nas estruturas já encontradas em banco de dados, já que a 
bioinformática teve grande progresso com através de informações obtidas em 
projetos de sequenciamento de genomas e estudo das proteínas, assim, 
facilitando e diminuindo o tempo empregado na etapa de criação, aumentando 
também a expectativa de vida. 
 
3) O que é PDB? Qual a sua importância para o desenvolvimento de novos fármacos? 
Resposta: 
PDB (Protein Data Bank) trata-se de um banco de dados em 3D que contém 
inúmeros arquivos de estruturas de protéinas, ácidos nucleicos e outras 
biomoléculas. O PDB é um importante aliado da farmacologia pois auxilia na 
estratégia de planejamento de fármacos através de modificações moleculares 
em desenhos de novos protótipos principalmente através da observação da 
afinidade do ligante com o sítio alvo e estruturas semelhantes. 
 
4) Discorra de maneira objetiva o esquema abaixo: 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Resposta: 
A primeira parte do esquema é caracterizado pela proteína alvo, que deve ser bem 
definida para logo após realizar a varredura dos compostos bioquímicos, 
Posteriormente temos a estrutura da proteína alvo que também irá realizar 
varredura de alguns compostos que possam ser modificados ou alterados caso seja 
necessário, originando assim, o composto de partida que será o alvo. Logo após será 
realizada a otimização do inibidor baseado na estrutura do complexo proteína-
ligante. Após esses passos, o novo inibidor será sintetizado e submetido a ensaios in 
vitro, in vivo, e em seres humanos, até chegar na etapa do fármaco ideal. 
 
5) O que significa Modelagem Molecular por Homologia Estrutural? Qual a sua 
importância na aplicação de um plano de desenvolvimento de novos fármacos? Quais 
são os fatores que agregam qualidade dos modelos estruturais obtidos? 
Resposta: 
Modelagem Molecular por Homologia Estrutural trata-se de um procedimento 
comparativo para a construção de modelos estruturais, além disso, durante esse 
processo são utilizadas estruturas de proteínas determinadas 
experimentalmente para se predizer a conformação de outra proteína que 
apresenta uma sequência de aminoácidos similar. É de extrema importância no 
planejamento e desenvolvimento de novos fármacos, pois é empregada desde a 
etapa de planejamento, até na otimização estrutural, que podem ter sua 
qualidade afetada caso fatores como o grau de similaridade entre a proteína-
molde e proteína-alvo não sejam considerados. 
 
6) Quais são as etapas de um processo de Modelagem Molecular por Homologia 
Comparativa? Descreva de maneira suscinta cada uma delas. 
Resposta: 
O processo de Modelagem Molecular por Homologia Comparativa tem como 
primeira etapa a identificação e seleção da proteína que que servirá como molde, 
nessa etapa ocorre a utilização do PDB, caso a família proteica for conhecida, caso 
seja ao contrário, será necessário utilizar outras ferramentas de busca. A segunda 
etapa consiste no alinhamento das sequências alvo com o molde, reconhecendo 
regiões estruturalmente conservadas e variáveis, observando estruturas em 
comum. Posteriormente, temos a terceira etapa, caracterizada pela construção 
do modelo, que otimiza as restrições da proteína molde que foram identificadas 
através do alinhamento, visualizando também através de uma estrutura 
tridimensional. Por fim, temos a validação do modelo, já que é necessário 
garantir a qualidade, podendo ser realizada em níveis estereoquímico, 
conformacional e energético, diante disso, a qualidade do modelo estará 
interligada com a escolha da proteína molde, e alinhamento da sequência que 
servirá de referência para construção estrutural da proteína. 
 
7) O que significa Docking Molecular? Descreva um exemplo. 
Resposta: 
Docking Molecular trata-se de uma sobreposição através do encaixe dos 
grupamentos funcionais de um ligante, que possam interagir com a estrutura 
tridimensional de um fármaco no seu sítio ativo, possivelmente apresentando 
atividade biológica, também denominada de ancoragem molecular. Um exemplo 
da utilização de docking molecular é a modelagem e síntese de um novo derivado 
indolinônico candidato a inibidor seletivo da cox-2, através da comparação do 
celecoxib e lumiracoxib que indica que um composto com apenas duas ligações 
também seja capaz de interagir seletivamente com a cox-2.