Simulados bioinformatica

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1a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Por que o "Projeto Genoma Humano" tem uma grande relação com a história da bioinformática?
		
	
	Durante o período de execução desse projeto, a bioinformática ficou estagnada, e poucos avanços ocorram nessa área.
	
	Foi durante esse projeto que se descobriu do que é feita e como se organiza a molécula de DNA.
	
	Pois ficou provado que as ferramentas computacionais não eram essenciais para determinar e interpretar o genoma humano.
	 
	Pois muitas ferramentas computacionais precisaram ser desenvolvidas e aprimoradas para determinar todo o genoma humano e interpretar essas informações.
	
	Porque foi a primeira vez que uma ferramenta computacional foi aplicada para analisar dados biológicos.
	
	Explicação:
Esse projeto gerou muitos dados computacionais, que impulsionaram o avança da bioinformática.
	
		2a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	 A evolução por homologia associa a similaridade morfológica de algumas estruturas corporais com a presença de um ancestral comum entre as espécies. As evidências evolutivas de que as espécies evoluíram por homologia é a presença de genes homólogos, ou seja, genes que apresentem com sequências nucleotídicas iguais ou altamente semelhantes que podem codificar para estruturas com a mesma função ou não. A respeito dos genes homólogos marque a alternativa correta.
		
	
	 Os genes parálogos são aqueles que divergiram após o processo de inversão dentro do genoma de uma mesma espécie.
 
	 
	 Os genes ortólogos são genes homólogos que divergiram após o processo de especiação, onde cada espécie descendente apresenta uma cópia do genee.
 
	
	Os genes homólogos encontrado no indivíduo são herdados apenas da mãe ou do pai.
 
	
	 
 Os genes ortólogos são provenientes dum ancestral comum e apresentam funções muito diferentes.
 
	
	 
Os genes paralogos são genes ortólogos  que divergiram após o processo de duplicação dentro do genoma de uma mesma espécie.
 
	
	Explicação:
Resposta correta letra B
	
		3a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Uma molécula de RNA é formada a partir de uma molécula de DNA, que atua como um molde. Esse processo é denominado de:
		
	
	tradução.
	 
	transcrição.
	
	 replicação.
	
	transcrição reversa.
	
	reprodução
	
	
	Explicação:
Transcrição é o nome do processo em que a molécula de RNA é formada a partir do DNA como molde.
	
		4a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Sobre o desenho experimental, marque a alternativa correta.
		
	
	Grupos controle, variáveis dependentes e independentes não são fatores importantes para pesquisa cientifica experimental, apenas para pesquisa científica não experimental.
	
	A pesquisa científica experimental não busca ajudar um pesquisador a determinar o efeito causal entre dois fatores.
	
	A hipótese nula de uma pesquisa confirma a relação de causa-efeito.
	 
	A pesquisa experimental tem como finalidade testar hipóteses que dizem respeito à convicção do pesquisador, envolvendo grupos de controle, seleção aleatória e manipulação de variáveis.
	
	Uma pesquisa científica pode ser desenvolvida sem o estabelecimento de uma hipótese.
	
	
	
		5a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Sobre a estrutura do DNA, marque a alternativa incorreta:
		
	
	O DNA carrega as informações genéticas do indivíduo.
	
	Os cromossomos são formados principalmente por DNA.
	 
	Os nucleotídeos que formam o DNA diferenciam-se do RNA por apresentarem uma ribose e a base timina.
	
	Os cromossomos são formados principalmente por RNA.
	
	O DNA, assim como o RNA, é formado por nucleotídeos, que são constituídos por um fosfato, um açúcar e uma base nitrogenada.
	
	Explicação:
 O DNA, assim como o RNA, é formado por nucleotídios. Estes se diferem pelo açúcar, que no RNA é uma ribose, mas no DNA é uma desoxirribose, e pela base nitrogenada. Somente no DNA ocorre a base timina.
	
		6a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Em relação ao estudo da genômica, podemos encontrá-las divididas em dois diferentes grupos, sendo chamados de genômica funcional e estrutural, em relação a genômica funcional, assinale a alternativa correta:
		
	
	Objetiva a caracterização da natureza física dos genomas completos.
	
	Caracteriza a atividade genética dos genes.
	
	Busca entender a classificação dos genes.
	 
	Busca caracterizar a função biológica dos genes.
	
	Visa avaliar e comparar os genomas do indivíduo
		7a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Á respeito da temática "alinhamento genômico" marque a opção correta.
		
	 
	Softwares de alinhamento genômico analisam os diferentes tipos de alinhamentos e nos sugerem o alinhamento ótimo no final do processo. 
	
	Os alinhamentos multiplos globais são método  que exigem pouca capacidade computacional e, dependendo da quantidade de sequências envolvidas, pode requerer tempos curtos para processamento.
	
	Os traços que podem aparecer nas sequencias após o alinhamento  são os indels, que representam as translocações que foram realizadas naquele genoma.
	
	Os alinhamentos genômicos são técnicas de comparação entre sequências biológicas, que utilizam algoritmos computacionais apenas para apontar as diferenças localizadas na mesma posição das sequências analisadas
	
	O BLAST é uma ferramenta de busca por alinhamento global básico par-a-par 
	
		8a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	A metagenômica é uma técnica que permite estudar os genomas de microrganismos___________.
		
	
	de um nicho ecológico sem necessidade de fazer culturas coletivas.
	 
	​​​​​de um nicho ecológico sem necessidade de fazer culturas individuais.
	
	de um nicho ecológico com necessidade de fazer culturas individuais.
	
	de um nicho ecológico com necessidade de fazer culturas individuais e coletivas.
	
	de um nicho ecológico com necessidade de fazer culturas coletivas.
	
	
		9a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Escolha a sequência correta de etapas envolvidas no processo de interpretação do genoma de um organismo:
		
	
	extração do DNA -> sequenciamento -> anotação funcional -> predição gênica.
	
	sequenciamento -> predição gênica -> anotação funcional -> extração do DNA.
	
	predição gênica -> extração do DNA -> anotação funcional -> sequenciamento.
	 
	extração do DNA -> sequenciamento -> predição gênica -> anotação funcional.
	
	extração do DNA -> predição gênica -> sequenciamento -> anotação funcional.
	
	
		10a
          Questão
	Acerto: 0,0  / 1,0
	
	O aluno Rafael está começando agora uma nova iniciação científica. Sua orientadora lhe disse que ele irá trabalhar com a proteína OprD, mas ele ainda não compreende a importância do seu projeto. Ele precisa acessar um banco de dados biológico que reúna uma grande variedade de informações sobre essa proteína, como vias metabólicas e variações dessa proteína entre diferentes organismos. Qual banco de dados você recomendaria a ele?
		
	
	GenBank.
	 
	KEGG.
	
	SWISS-Prot.
	
	Gene Ontology (GO).
	 
	PDB.
	
	Explicação:
KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes.
		1a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Por que o "Projeto Genoma Humano" tem uma grande relação com a história da bioinformática?
		
	 
	Pois muitas ferramentas computacionais precisaram ser desenvolvidas e aprimoradas para determinar todo o genoma humano e interpretar essas informações.
	
	Porque foi a primeira vez que uma ferramenta computacional foi aplicada para analisar dados biológicos.
	
	Foi durante esse projeto que se descobriu do que é feita e como se organiza a molécula de DNA.
	
	Durante o período de execução desse projeto, a bioinformática ficou estagnada, e poucos avanços ocorram nessa área.
	
	Pois ficou provado que as ferramentas computacionais não eram essenciais para determinar e interpretar o genoma humano.
	
	
	Explicação:
Esse projeto gerou muitos dados computacionais, que impulsionaram o avança da bioinformática.2a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Quais são os principais eventos genéticos responsáveis pela variação gênica dos organismos ?
 
		
	
	Mutação e duplicação cromossômica
 
	
	Inversão e duplicação gênica
 
	
	Translocação cromossômica e mutação
	 
	Mutação e duplicação gênica
	
	Inserção e translocação genica
 
	
	
		3a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	A prestigiada revista Science elegeu como um dos principais avanços científicos de 2017 um caso de terapia gênica em crianças portadoras de atrofia muscular espinhal do tipo 1, uma doença genética caracterizada pela atrofia progressiva dos músculos esqueléticos e morte precoce antes dos 2 anos de idade. A doença é causada por um gene defeituoso, que deixa de codificar uma proteína essencial para o funcionamento dos neurônios. No estudo, vírus não patogênicos que continham uma cópia normal do gene em questão foram injetados em quinze crianças doentes. As crianças tratadas sobreviveram além dos 2 anos e apresentaram melhoras na capacidade de movimento.
(Disponível em https://vis.sciencemag.org/.)
Assinale a alternativa que preenche corretamente as lacunas na frase a seguir.
Os vírus injetados nas crianças foram capazes de (i) ________, restaurando a produção (ii) _________, que passaram, então, a controlar adequadamente (iii)
_________.
		
	
	 (i) atingir a medula óssea e induzir a produção de linfócitos do sangue; (ii) de anticorpos contra o vírus; (iii) a infecção, restaurando os movimentos das
crianças.
	
	(i) atingir a medula óssea e introduzir nas células-tronco a cópia normal do gene; (ii) de neurônios no cérebro; (iii) a medula espinhal e, portanto, os músculos.
	 
	(i) atingir a medula espinhal e introduzir nos neurônios a cópia normal do gene; (ii) da proteína essencial à função dos neurônios da medula; (iii) os músculos.
	
	 (i) atingir a medula óssea e induzir a produção de linfócitos na linfa; (ii) de anticorpos contra o vírus; (iii) a infecção, restaurando os movimentos das
crianças.
	
	(i) atingir a medula espinhal e remover dos neurônios a cópia defeituosa do gene; (ii) de hormônios; (iii) a geração de impulsos elétricos e os músculos.
	
	
	Explicação:
Os vírus foram capazes de atingir a medula espinhal e de introduzir nos neurônios a cópia do gene normal. Dessa forma, os neurônios foram capazes de sintetizar a proteína essencial ao funcionamento da medula, possibilitando o controle dos músculos.
	
		4a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Sobre o desenho experimental, marque a alternativa correta.
		
	 
	A pesquisa experimental tem como finalidade testar hipóteses que dizem respeito à convicção do pesquisador, envolvendo grupos de controle, seleção aleatória e manipulação de variáveis.
	
	Grupos controle, variáveis dependentes e independentes não são fatores importantes para pesquisa cientifica experimental, apenas para pesquisa científica não experimental.
	
	Uma pesquisa científica pode ser desenvolvida sem o estabelecimento de uma hipótese.
	
	A pesquisa científica experimental não busca ajudar um pesquisador a determinar o efeito causal entre dois fatores.
	
	A hipótese nula de uma pesquisa confirma a relação de causa-efeito.
	
	
	
		5a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	(MPU2007) Um pesquisador deseja isolar um gene de uma espécie de planta hipotética que codifica uma proteína capaz de inibir a proliferação de fungos que crescem sobre a superfície das suas folhas. O pesquisador tem disponível em seu laboratório uma biblioteca genômica, várias bibliotecas de cDNA, uma biblioteca de expressão dessa espécie de planta e a proteína purificada. O pesquisador encontrará mais rapidamente o gene desejado se:
		
	
	seqüenciar os aminoácidos das proteínas produzidas na biblioteca de expressão até identificar a proteína desejada.
	
	clonar o cDNA da espécie e com ele triar a biblioteca genômica.
	 
	produzir um anticorpo específico para essa proteína e com ele triar a biblioteca de expressão.
	
	seqüenciar o DNA da biblioteca genômica e procurar os ESTs.
	
	seqüenciar o DNA da biblioteca de cDNA e pesquisar os quadros de leitura.
	
	
		6a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	São aspectos relacionados à transcriptômica, exceto:
		
	
	Uma de suas limitações está relacionada ao fato de que a abundância do mRNA nem sempre é bem correlacionada com a abundância da proteína.
	
	Tem como objetivo determinar os perfis da expressão de todos os genes presentes em um genoma.
	
	Sua análise é característica de cada tipo de célula, e pode diferir em função de diferentes situações fisiológicas ou patológicas.
	
	Várias técnicas podem ser aplicadas para seu estudo, a exemplo dos microarranjos de DNA.
	 
	Tem sido utilizada para o estudo das respostas metabólicas de organismos a fatores bióticos e abióticos.
	
	
	Explicação:
A metabolômica estuda as mudanças na expressão de pequenas moléculas orgânicas, conhecidas como metabólitos.
	
		7a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Á respeito da temática "alinhamento genômico" marque a opção correta.
		
	
	Os traços que podem aparecer nas sequencias após o alinhamento  são os indels, que representam as translocações que foram realizadas naquele genoma.
	 
	Softwares de alinhamento genômico analisam os diferentes tipos de alinhamentos e nos sugerem o ¿alinhamento ótimo¿ no final do processo. 
	
	Os alinhamentos multiplos globais são método  que exigem pouca capacidade computacional e, dependendo da quantidade de sequências envolvidas, pode requerer tempos curtos para processamento.
	
	Os alinhamentos genômicos são técnicas de comparação entre sequências biológicas, que utilizam algoritmos computacionais apenas para apontar as diferenças localizadas na mesma posição das sequências analisadas
	
	O BLAST é uma ferramenta de busca por alinhamento global básico par-a-par 
	
	
		8a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Em relação ao desenho de primers, é incorreto, afirmar que:
		
	
	Incompatibilidade significativa do par de primers pode levar à má amplificação
	
	Primers de tamanho muito curto leva a baixa especificidade, resultando em amplificação não específica
	 
	Repetições não aumenta o potencial de anelamento incorreto/inespecífico
	
	O número máximo de repetições aceitável é de 4 dinucleotideos
	
	O tamanho dos primers determina especificidade e afeta seu anelamento com o DNA molde
	
	Explicação:
Repetições longas aumenta o potencial de anelamento inespecífco, pois pode ocorrer um erro de leitura da fita. O ideal é que no desenho de primers, não exista repetições longas para que não ocorra o anelamento inespecífico.
	
		9a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Em que consiste o GenBank?
		
	
	é um algoritmo para alinhamento de sequências
	
	é um banco de dados extremamente completo
	 
	é uma coleção de todas as sequências de DNA disponíveis ao público.
	
	é um banco que armazena a anotação detalhada de proteínas
	
	Anotar a função de genes é um processo basicamente comparativo
	
	Explicação:
Retorne no tópico sobre GenBank.
	
		10a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	"O ____________ busca usar um número limitado de palavras para descrever três conjuntos de informações sobre uma proteína. O conjunto "biological process" (processo biológico) representa objetivos específicos que o organismo é geneticamente programado para atingir, como por exemplo o processo biológico da divisão celular resulta na criação de duas células filhas a partir de uma única célula-mãe. Qual opção completa corretamente a lacuna?
		
	
	KEGG.
	
	GenBank.
	
	PDB.
	
	CARD.
	 
	Gene Ontology (GO).
	
	
	Explicação:
A descrição corresponde ao banco Gene Ontology.