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bioinformatica pdf 1

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Ref.: 6069794 Pontos: 1,00 / 1,00 
 
O quadro a seguir mostra uma matriz de dados táxons x caracteres, sendo apresentados 9 
espécies (de A ao I) e 9 caracteres (de 1 ao 9): 
 
Fornecida a matriz de dados acima, qual a distância genética entre a espécie A e C? 
 
 
0,9 
 
1 
 0,44 
 
0,2 
 
0,6 
 
 
 2. Ref.: 6069792 Pontos: 1,00 / 1,00 
 
A construção da árvore filogenética começa no tempo atual e vai estimando as relações no 
tempo passado. Os fósseis servem como retratos de um período da evolução e fornecem 
importantíssimas compreensões. Numa árvore filogenética, o fóssil é representado por um 
ramo em que seu ponto terminal está numa idade anterior a atual. Todas as espécies vivas, 
entretanto, terminam alinhadas na parte mais extrema do gráfico, representando a idade 
atual. Para a construção de uma árvore uma metodologia empregada é a máxima 
parcimônia. Assim, uma matriz de táxon/caracter produz uma única árvore parcimoniosa 
de comprimento 43. A que se refere o número 43? 
 
 
É a maior probabilidade de uma árvore ser escolhida. 
 
É o número de clados da árvore mais parcimoniosa. 
 É o número de mudanças de estado do caractere necessárias para explicar todos os 
dados na árvore. 
 
É o número de caracteres previamente escolhidos. 
 
É a probabilidade posterior de uma árvore ser escolhida. 
 
 
 3. Ref.: 6069487 Pontos: 0,00 / 1,00 
 
O estudo da classificação e evolução dos organismos é um dos principais assuntos da 
Biologia moderna. Isso tudo graças aos conceitos de Darwin e Wallace, no século XIX, e a 
metodologia de Hennig, no século XX. Sobre esse assunto podemos dizer que atualmente 
os cientistas procuram agrupar os organismos que possuem? 
 
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Descendentes de linhagens modernas 
 Ancestral comum e todos os descendentes 
 Linhagem ancestral polifilética 
 
Hábitats amórficos 
 
Morfologias com funções descentralizadas 
 
 
 
 
02925 - NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS 
 
 
 4. Ref.: 6045362 Pontos: 0,00 / 1,00 
 
O programa BLAST é uma ferramenta disponível em vários bancos de dados como uma 
opção de busca. O portal do NCBI também conta com essa opção para que o usuário possa 
fazer buscas em bancos como GenBank e RefSeq. Qual tipo de dado biológico é usado pelo 
BLAST em suas execuções? 
 
 Sequências de nucleotídeos ou aminoácidos. 
 Artigos científicos. 
 
Número da atividade enzimática de proteínas. 
 
Anotação de função de proteínas. 
 
Estrutura tridimensional de proteínas. 
 
 
 5. Ref.: 6045575 Pontos: 0,00 / 1,00 
 
Sobre a figura abaixo, é correto afirmar que: 
 
Fonte: LarsonGCD/Wikimedia.org/CC BY 
3.0 https://commons.wikimedia.org/wiki/File:FAM149A_Promoter_region_(FASTA_format).png 
 
 
Mostra uma sequência de nucleotídeos no formato PDF. 
 
Representa o formato Docx de uma sequência de aminoácidos. 
 
Exibe uma sequência de nucleotídeos em formato PDB. 
 Apresenta o formato FASTA de uma sequência de nucleotídeos. 
 Ilustra uma sequência de aminoácidos no formato FASTA. 
 
 
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 6. Ref.: 6045336 Pontos: 0,00 / 1,00 
 
Qual ferramenta é uma das mais comuns em bioinformática para alinhamento múltiplo de 
sequências biológicas de forma heurística? 
 
 Clustal. 
 
GenBank. 
 
PubMed. 
 
Primer3. 
 BLAST. 
 
 
 
 
03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA 
 
 
 7. Ref.: 6054821 Pontos: 1,00 / 1,00 
 
Eduarda é bioinformata e trabalha com a análise de genomas. Seu chefe lhe enviou um 
arquivo com várias sequências de genes separadas. Ele disse que precisava que ela 
terminasse o processo de anotação genômica, e que estava faltando apenas a última etapa, 
de anotação funcional. O que Eduarda precisa fazer com esses dados para realizar a 
anotação funcional? 
 
 
Determinar a estrutura tridimensional das proteínas codificadas pelos genes por 
meio da técnica de Ressonância Magnética Nuclear (RMN). 
 
Comparar as sequências dos genes entre si, identificando o maior número de 
similaridade entre elas. 
 
Encontrar regiões de sobreposição entre as sequências dos genes, a fim de montar o 
genoma final. 
 Comparar a sequências de proteínas traduzidas a partir dos genes com sequências 
presentes em bancos de dados curados como o UniProtKB/Swiss-Prot. 
 
Armazenar as sequências de nucleotídeos correspondentes aos genes em um 
arquivo de sequência, como o formato FASTA. 
 
 
 8. Ref.: 6054629 Pontos: 0,00 / 1,00 
 
Após determinar a ordem de nucleotídeos do genoma de um organismo a partir do 
sequenciamento, a próxima etapa é a anotação genômica. Ela pode ser dividida em duas 
fases: predição gênica e anotação funcional. O que é feito durante a predição gênica? 
 
 Os genes, principalmente de regiões codificadoras de proteínas, são identificados ao 
longo da sequência de DNA. 
 
A relação evolutiva entre as sequências é determinada a partir do resultado de 
alinhamentos múltiplos. 
 
Os fragmentos de DNA sequenciados são sobrepostos a partir das suas regiões 
alinhadas e sequências maiores de nucleotídeos podem ser definidas. 
 A ordem dos nucleotídeos no DNA é determinada. 
 
A função biológica das proteínas codificadas pelos genes é identificada por meio de 
comparação com banco de dados. 
 
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03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA 
 
 
 9. Ref.: 6075023 Pontos: 1,00 / 1,00 
 
Observe a figura a seguir: 
 
Conceitualmente, a estrutura das proteínas pode ser dividida em quatro diferentes níveis de 
organização: primário, secundário, terciário e quaternário. Baseado na figura e em seus 
conhecimentos, assinale a alternativa correta. 
 
 
A estrutura quaternária é formada pelas interações entre as α-hélices, folhas-β e 
regiões de loop de uma única subunidade. 
 
A estrutura terciária é formada por α-hélices, folhas-β e regiões de loop. 
 
A estrutura secundária é formada pela união de diferentes subunidades. 
 
A estrutura terciária é constituída pelas ligações peptídicas, interações entre 
resíduos de aminoácidos formando uma cadeia peptídica. 
 A estrutura primária é constituída pelas ligações peptídicas, que são interações entre 
resíduos de aminoácidos formando uma cadeia peptídica. 
 
 
 10. Ref.: 6074929 Pontos: 1,00 / 1,00 
 
Um gene hipotético apresente a seguinte sequência de nucleotídeos: 
...CGT GCG TGT ACG GAA GCG ATG GGC ATA CTG TAA CCA ATA ATT ..... 
Uma mutação ocorreu na décima terceira base nitrogenada, da sequência apresentada, da 
esquerda para a direita, substituindo-a por uma citosina. 
Assinale a alternativa que apresenta a sequência de bases CORRETA após ocorrida a 
transcrição deste gene: 
 
 
...GCA CGC ACA UCC CUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ... 
 ...GCA CGC ACA UGC GUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ... 
 
...GCT CGC UCU UGC CAA CGC AUC CCG AUC GAC UUA GGA AUA AUU ... 
 
...GTA CGC ACA TGC CTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ... 
 
...GTA CGC ACA TGC GTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ... 
 
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