Av1 - Bioinformática

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1.
	Ref.: 6069489
	Pontos: 0,00  / 1,00
	
	Na figura a seguir vemos uma matriz com 3 táxons (A ao C) e 4 caracteres (1 ao 3).
A seguir são listadas 5 topografias de árvores diferentes (A ao E). Analise a alternativa que está de acordo com a matriz táxon × caractere.
		
	
	
	 
	
	
	
	 
	
	
	
	
	
	 2.
	Ref.: 6069594
	Pontos: 0,00  / 1,00
	
	A seguir são apresentadas diferentes árvores filogenéticas (de A ao E). Analise os gráficos e responda:
Imagem: Leandro Pederneiras
Qual dos gráficos acima (a, b, c, d ou e) é um filograma e um cronograma, respectivamente?
		
	
	Árvore a e c
	 
	Árvore d e e
	
	Árvore e e b
	
	Árvore d e a
	 
	Árvore b e e
	
	
	 3.
	Ref.: 6069684
	Pontos: 0,00  / 1,00
	
	Analise a árvore filogenética a seguir.
Fonte: Leandro C.Pederneiras
Qual a distância evolutiva entre o táxon F e o táxon J?
		
	
	3,65
	 
	2,25
	
	1,9
	
	3,6
	 
	4,35
	
	
	 
		
	02925 - NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS
	 
	 
	 4.
	Ref.: 6045464
	Pontos: 0,00  / 1,00
	
	Pesquisadores do Grupo Pardini em parceria com a UFMG desenvolveram um teste de genotipagem para as variantes P.1 (Manaus), P.2 (RJ) e B.1.1.7 (Reino Unido) do SARS-CoV-2. A partir da sequência genética de cada uma das variantes do vírus causador da covid-19, eles desenvolveram um par de primers que vão "grudar" naquela sequência exata do vírus.
(Fonte: https://www1.folha.uol.com.br/equilibrioesaude/2021/04/laboratorio-lanca-teste-capaz-de-identificar-variantes-do-coronavirus.shtml).
Qual das características abaixo contribui para que os primers usados sejam bastante específicos para a região do genoma que contém a mutação?
		
	
	Temperatura de anelamento baixa, menor que 50°C.
	
	Produtos amplificados maiores que 100pb.
	 
	Comprimento suficientemente grande, maior que vinte nucleotídeos.
	 
	Porcentagem baixa de guanina (G) e citosina (C) ao longo da sequência (menor que 40%).
	
	Temperatura de melting baixa, menor que 55°C.
	
	
	 5.
	Ref.: 6045572
	Pontos: 1,00  / 1,00
	
	A frase abaixo está incorreta.
"O NCBI contém o RefSeq, que representa a subdivisão do GenBank, que contém sequências de processamento alternativo de forma não curada e redundante em determinado genoma."
Escolha a alternativa que explica onde está o erro.
 
		
	
	O RefSeq não é um banco de dados.
	
	O RefSeq não está contido no portal do NCBI.
	
	O RefSeq é um banco de dados de artigos científicos.
	 
	O RefSeq é um banco curado e não redundante.
	
	O RefSeq não é uma subdivisão do GenBank.
	
	
	 6.
	Ref.: 6045642
	Pontos: 1,00  / 1,00
	
	O objetivo dos programas de alinhamento de sequências é encontrar o melhor pareamento possível, aquele que reflita o maior número de similaridade entre as sequências comparadas. Existem diferentes tipos e aplicações de alinhamento de sequências. Assim, o que é o alinhamento local de sequências?
		
	
	Alinhamento aproximado do perfeito.
	
	Alinhamento da extensão total das sequências envolvidas.
	
	Alinhamento de apenas duas sequências.
	 
	Alinhamento de regiões das sequências envolvidas.
	
	Alinhamento de três ou mais sequências.
	
	
	 
		
	03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA
	 
	 
	 7.
	Ref.: 6054637
	Pontos: 1,00  / 1,00
	
	Técnicas como espectrometria de massas (EM) e eletroforese bidimensional em gel de poliacrilamida (2D-PAGE) são usadas para caracterizar moléculas de acordo com suas propriedades químicas. A seguir é listada uma série de estudos ômicos. Assinale a alternativa que é um exemplo de estudo ômico que utiliza essa técnica:
		
	
	Farmacogenômica.
	
	Genômica.
	
	Transcriptômica.
	 
	Proteômica.
	
	Lipdômica.
	
	
	 8.
	Ref.: 6055138
	Pontos: 0,00  / 1,00
	
	Não é interessante que o mesmo tipo de dados biológico esteja fragmentado em diferentes bancos, pois isso dificultaria o acesso a essas informações. Nesse sentido, a Colaboração Internacional de Bancos de Dados de Sequências de Nucleotídeos (International Nucleotide Sequence Database Collaboration, INSDC) agrega informações dos seguintes bancos de dados primários:
		
	 
	Swiss-Prot, EMBL e GenBank.
	 
	DDBJ, EMBL e GenBank.
	
	PDB, EMBL e GenBank.
	
	DDBJ, EMBL e Swiss-Prot.
	
	DDBJ, EMBL e KEGG.
	
	
	 
		
	03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA
	 
	 
	 9.
	Ref.: 6075023
	Pontos: 0,00  / 1,00
	
	Observe a figura a seguir:
Conceitualmente, a estrutura das proteínas pode ser dividida em quatro diferentes níveis de organização: primário, secundário, terciário e quaternário. Baseado na figura e em seus conhecimentos, assinale a alternativa correta.
		
	 
	A estrutura primária é constituída pelas ligações peptídicas, que são interações entre resíduos de aminoácidos formando uma cadeia peptídica.
	
	A estrutura quaternária é formada pelas interações entre as α-hélices, folhas-β e regiões de loop de uma única subunidade.
	
	A estrutura terciária é formada por α-hélices, folhas-β e regiões de loop.
	 
	A estrutura terciária é constituída pelas ligações peptídicas, interações entre resíduos de aminoácidos formando uma cadeia peptídica.
	
	A estrutura secundária é formada pela união de diferentes subunidades.
	
	
	 10.
	Ref.: 6074929
	Pontos: 1,00  / 1,00
	
	Um gene hipotético apresente a seguinte sequência de nucleotídeos:
...CGT GCG TGT ACG GAA GCG ATG GGC ATA CTG TAA CCA ATA ATT .....
Uma mutação ocorreu na décima terceira base nitrogenada, da sequência apresentada, da esquerda para a direita, substituindo-a por uma citosina.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência de bases CORRETA após ocorrida a transcrição deste gene:
		
	
	...GTA CGC ACA TGC CTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ...
	
	...GTA CGC ACA TGC GTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ...
	
	...GCT CGC UCU UGC CAA CGC AUC CCG AUC GAC UUA GGA AUA AUU ...
	
	...GCA CGC ACA UCC CUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ...
	 
	...GCA CGC ACA UGC GUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ...