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Disc.: SDE4449 - BIOINFORMÁTICA
	Período: 2022.3 EAD (G)
	Aluno: KELLY REIS
	Matr.: 202107200031
	
	Turma: 9001
		Lupa
	
	
	
		VERIFICAR E ENCAMINHAR
	
Prezado(a) Aluno(a),
Responda a todas as questões com atenção. Somente clique no botão FINALIZAR PROVA ao ter certeza de que respondeu a todas as questões e que não precisará mais alterá-las. 
A prova será SEM consulta. O aluno poderá fazer uso, durante a prova, de uma folha em branco, para rascunho. Nesta folha não será permitido qualquer tipo de anotação prévia, cabendo ao aplicador, nestes casos, recolher a folha de rascunho do aluno.
Valor da prova: 10 pontos.
	
	 
	 
		1 ponto
	
		1.
		Observe a figura a seguir:
Conceitualmente, a estrutura das proteínas pode ser dividida em quatro diferentes níveis de organização: primário, secundário, terciário e quaternário. Baseado na figura e em seus conhecimentos, assinale a alternativa correta.
 (Ref.: 202113295057)
	
	
	
	
	A estrutura secundária é formada pela união de diferentes subunidades.
	
	
	A estrutura quaternária é formada pelas interações entre as α-hélices, folhas-β e regiões de loop de uma única subunidade.
	
	
	A estrutura terciária é constituída pelas ligações peptídicas, interações entre resíduos de aminoácidos formando uma cadeia peptídica.
	
	
	A estrutura terciária é formada por α-hélices, folhas-β e regiões de loop.
	
	
	A estrutura primária é constituída pelas ligações peptídicas, que são interações entre resíduos de aminoácidos formando uma cadeia peptídica.
	
	 
	 
		1 ponto
	
		2.
		Um gene hipotético apresente a seguinte sequência de nucleotídeos:
...CGT GCG TGT ACG GAA GCG ATG GGC ATA CTG TAA CCA ATA ATT .....
Uma mutação ocorreu na décima terceira base nitrogenada, da sequência apresentada, da esquerda para a direita, substituindo-a por uma citosina.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência de bases CORRETA após ocorrida a transcrição deste gene:
 (Ref.: 202113294963)
	
	
	
	
	...GTA CGC ACA TGC CTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ...
	
	
	...GCT CGC UCU UGC CAA CGC AUC CCG AUC GAC UUA GGA AUA AUU ...
	
	
	...GCA CGC ACA UCC CUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ...
	
	
	...GCA CGC ACA UGC GUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ...
	
	
	...GTA CGC ACA TGC GTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ...
	
	 
	 
		1 ponto
	
		3.
		Uma árvore filogenética busca desvendar a história evolutiva de um grupo de organismos. Isso pode ser feito a partir da comparação de sequências biológicas. Uma boa estratégia é escolher um gene que todas as espécies comparadas possuam, e identificar a partir de alinhamentos as similaridades entre as sequências de cada espécie. Supondo que você irá comparar a sequência completa do gene para DNA polimerase de 50 espécies bacterianas diferentes, qual o tipo de alinhamento é o mais adequado nessa situação?
 (Ref.: 202113265573)
	
	
	
	
	Alinhamento local e global.
	
	
	Alinhamento simples e múltiplo.
	
	
	Alinhamento múltiplo e global.
	
	
	Alinhamento múltiplo e local.
	
	
	Alinhamento simples e local.
	
	 
	 
		1 ponto
	
		4.
		A partir do portal do NCBI (National Center for Biotechnology Information) é possível ter acesso a diferentes bancos de dados biológicos. É importante saber de qual dado precisamos para escolher corretamente em qual banco vamos realizar a busca. Caso você esteja desenvolvendo seu trabalho de conclusão de curso, qual banco de dados você utilizaria para obter resumos e/ou textos completos de artigos publicados em milhares revistas diferentes?
 (Ref.: 202113265493)
	
	
	
	
	KEGG.
	
	
	PubMed.
	
	
	UniProt/SwissProt.
	
	
	RefSeq.
	
	
	GenBank.
	
	 
	 
		1 ponto
	
		5.
		A frase abaixo está incorreta.
"O NCBI contém o RefSeq, que representa a subdivisão do GenBank, que contém sequências de processamento alternativo de forma não curada e redundante em determinado genoma."
Escolha a alternativa que explica onde está o erro.
 
 (Ref.: 202113265606)
	
	
	
	
	O RefSeq não é um banco de dados.
	
	
	O RefSeq não é uma subdivisão do GenBank.
	
	
	O RefSeq é um banco curado e não redundante.
	
	
	O RefSeq não está contido no portal do NCBI.
	
	
	O RefSeq é um banco de dados de artigos científicos.
	
	 
	 
		1 ponto
	
		6.
		A anotação de um genoma consiste na identificação de suas regiões funcionais ou de relevância biológica ao longo das sequências de DNA. Dessa forma, podemos extrair dessas sequências a maior quantidade possível de dados úteis. Podemos dividir a anotação do genoma em etapa de predição gênica e etapa de anotação funcional. É importante saber que tipo de organismo foi sequenciado, procarioto ou eucarioto, na hora de escolher o software ideal, principalmente na etapa de predição de genes.Qual das afirmativas abaixo justifica essa necessidade?
 (Ref.: 202113275076)
	
	
	
	
	Organismos procariotos possuem RNA como material genético, enquanto os eucariotos possuem DNA.
	
	
	Há muito poucas espécies de procariotos conhecidas, enquanto o número de espécies de organismos eucariotos é enorme.
	
	
	O código genético de procariotos é diferente daquele seguido pelos eucariotos.
	
	
	O material genético dos procariotos sofre mutações, enquanto o dos eucariotos não.
	
	
	A complexidade da estrutura gênica dos eucariotos é muito maior, por exemplo, possuem íntrons que interrompem as regiões codificantes.
	
	 
	 
		1 ponto
	
		
		Existem diferentes bancos de dados biológicos que podem ser acessados de acordo com o interesse de pesquisa. Qual dos bancos abaixo é o principal reservatório de informações sobre sequências de proteínas, cujos dados são curados, validados por especialistas e revisados.
 (Ref.: 202113275074)
	
	
	
	
	Swiss-Prot.
	
	
	PDB.
	
	
	PubMed.
	
	
	KEGG.
	
	
	GenBank.
	
	 
	 
		1 ponto
	
		8.
		A inferência Bayesiano é um método que avaliar a probabilidade posterior de uma árvore. Qual das afirmações a seguir é verdadeira para as probabilidades posteriores?
 (Ref.: 202113289716)
	
	
	
	
	Hipóteses com probabilidades posteriores menores são favorecidas em relação àquelas com valores maiores.
	
	
	Não precisam de dados adicionais.
	
	
	Usa o teorema de Bayes.
	
	
	Pode ser calculada exclusivamente pelo teorema de Pitágoras.
	
	
	Não dependem da escolha de um modelo.
	
	 
	 
		1 ponto
	
		9.
		A construção da árvore filogenética começa no tempo atual e vai estimando as relações no tempo passado. Os fósseis servem como retratos de um período da evolução e fornecem importantíssimas compreensões. Numa árvore filogenética, o fóssil é representado por um ramo em que seu ponto terminal está numa idade anterior a atual. Todas as espécies vivas, entretanto, terminam alinhadas na parte mais extrema do gráfico, representando a idade atual. Para a construção de uma árvore uma metodologia empregada é a máxima parcimônia. Assim, uma matriz de táxon/caracter produz uma única árvore parcimoniosa de comprimento 43. A que se refere o número 43?
 (Ref.: 202113289826)
	
	
	
	
	É o número de mudanças de estado do caractere necessárias para explicar todos os dados na árvore.
	
	
	É a maior probabilidade de uma árvore ser escolhida.
	
	
	É o número de clados da árvore mais parcimoniosa.
	
	
	É a probabilidade posterior de uma árvore ser escolhida.
	
	
	É o número de caracteres previamente escolhidos.
	
	 
	 
		1 ponto
	
		10.
		O quadro a seguir mostra uma matriz de dados táxons x caracteres, sendo apresentados 9 espécies (de A ao I) e 9 caracteres (de 1 ao 9):
Fornecida a matriz de dados acima, qual a distância genética entre a espécie A e C?
 (Ref.: 202113289828)
	
	
	
	
	0,9
	
	
	0,44
	
	
	0,2
	
	
	0,6
	
	
	1

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