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Rhodococcus equi; MSA (Mannitol Salt Agar): utilizado para o isolamento seletivo de estafilococos e para a detecção de Staphylococcus aureus provenientes de amostras clínicas. Ágar Xilose-Lisina-Desoxicolato (XLD): a região onde a bactéria cresce se torna vermelha e com coloração negra devido à produção de H2S; Ágar Hektoen (HEK) - a região onde a bactéria cresce se torna verde e com coloração negra devido à produção de H2S; Kits comercias: Bactray: Identificação bioquímica de bactérias gram- negativas oxidase + ou -; Vitek 2; OmniLog®; MALDI-TOF MS (Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization – Time of Flight). A partir da identificação bacteriana: Realização de teste de susceptibilidade aos antimicrobianos Produção de vacinas autógenas Diagnóstico definitivo Teste de susceptibilidade aos antimicrobianos: Métodos: Disco-difusão; CIM e CBM; E-test. Resistência intrínseca X Resistência adquirida: Intrínseca – nunca entrou em contato com o antimicrobiano mas possui resistência já em seus genes. Já sabemos que algumas bactérias são resistentes a tais ATB normalmente. Adquirida – através de contatos com ATB. Disco-difusão: Teste qualitativo – é resistente ou não. Ágar Mueller hinton e Mueller hinton sangue. Utiliza doses terapêuticas. Manter 37°C por 24h. CIM CBM Diluições seriadas para ver até qual concentração é capaz de inibir/matar. Note que na primeira linha inibiu mas não matou. E-TEST: Fitas com ATB com diferentes concentrações. Cabe até 6 fitas em uma placa. Mais caro, menos medicamentos do que no disco-difusão. TESTES MOLECULARES 1) PCR para genes específicos 2) PCR para gene 16S e sequenciamento PCR: Amostra Extração Amplificação Visualização em gel. Amostras: Fezes, Tecidos/órgãos, Sangue, Secreções, Leite, Líquor, Urina, Isolado. Mais comum utilização do isolado, porém não pode ser utilizado se vier em amostra no ágar. Termo extração ou fervura: Rompe membrana; centrifugação. Purificação: reagentes com sais diferentes. MIX: enzima constrói novas fitas de DNA. Água ultrapura; Tampão; Cloreto de magnésio; dNTPs – nucleotídeos. Primers; Enzima TaqDNA polimerase: Amostra de DNA/RNA. Amplificação: Desnaturação: 94 a 97°C; Anelamento: 45 a 60°C; Extensão: 72°C. Termociclador: 2-3h + 1h para correr o gel. Desnaturação: 20 a 40 vezes. Quebra a fita dupla do DNA. Faz várias copias do genoma. Anelamento:
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