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UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA FACULDADE DE CIÊNCIAS AGRÁRIAS E VETERINÁRIAS DE JABOTICABAL MÉT. PURIF. ANÁL. PROTEÍNAS – CIÊNCIAS BIOLÓGICAS – 1 o SEMESTRE, 2017 DESENVOLVIMENTO DE PROJETO Purificação de Proteínas Recombinantes 1. Remova o pellet de células do freezer, transferindo-o para o gelo. Adicione 500 μl de Tampão de Extração 1 (TE1) e ressuspenda as células totalmente. 2. Transfira as células ressuspendidas para um tubo Eppendorf. Adicione 500 μl de Tampão de Extração 2 (TE2) e misture a amostra por inversão, cuidadosamente para evitar excesso de bolhas. Incube por 10 min no gelo com inversões periódicas a cada 1 min. 3. Centrifugue o tubo a 4°C por 3 min a 13000 rpm. Remova 50 μl do sobrenadante (que representa a Fração Solúvel do extrato proteico) e transfira para um novo tubo Eppendorf no gelo. 4. Na bancada a sua frente, há um tubo Eppendorf com 40 μl da resina Ni-NTA. NÃO INVERTA ESTE TUBO OU RESSUSPENDA A RESINA. Remova o sobrenadante do tubo com a resina e transfira o restante da Fração Solúvel (~1 ml) para o tubo com a resina. Misture bem por inversão, cuidadosamente para evitar excesso de bolhas. 5. Incube por 30 min no gelo com inversões periódicas a cada 5 min. Remova o sobrenadante para um novo tubo Eppendorf no gelo. Este será chamado de Flow Through. 6. À resina no gelo, adicione 1 ml do Tampão de Lavagem (TL) e misture bem por inversão. Incube por 7 min no gelo com inversões periódicas a cada 1 min. Remova o sobrenadante (que representa a fração Wash) e transfira para um novo tubo Eppendorf no gelo. 7. À resina no gelo, adicione 500 μl do Tampão de Eluição 1 (Elu1) e misture bem por inversão. Incube por 7 min no gelo com inversões periódicas a cada 1 min. Remova o sobrenadante (que representa a fração Eluato 1) e transfira para um novo tubo Eppendorf no gelo. 8. À resina no gelo, adicione 500 μl do Tampão de Eluição 2 (Elu2) e misture bem por inversão. Incube por 7 min no gelo com inversões periódicas a cada 1 min. Remova o sobrenadante (que representa a fração Eluato 2) e transfira para um novo tubo Eppendorf no gelo. 9. À resina no gelo, adicione 500 μl do Tampão de Eluição 3 (Elu3) e misture bem por inversão. Incube por 7 min no gelo com inversões periódicas a cada 1 min. Remova o sobrenadante (que representa a fração Eluato 3) e transfira para um novo tubo Eppendorf no gelo. 10. As frações Solúvel, Flow Through, Wash, Eluato 1, Eluato 2 e Eluato 3, obtidas hoje, em combinação com as frações Não-Induzida e Induzida, obtidas na aula passada, serão usadas na próxima etapa de preparação das amostras para o SDS-PAGE. Constituição dos Tampões: Tampão de Extração 1 – 50 mM Tris HCl pH 8.0 200 mM NaCl 0,1 mM EDTA pH 8.0 30 mM imidazol 0,05% Triton X-100 Tampão de Extração 2 – 50 mM Tris HCl pH 8.0 500 mM NaCl 0,1 mM EDTA pH 8.0 30 mM imidazol 0,5% Triton X-100 0,1% SDS Tampão de Lavagem – 50 mM Tris HCl pH 8.0 500 mM NaCl 0,1 mM EDTA pH 8.0 30 mM imidazol 0,05% Triton X-100 Tampão de Eluição 1 – 50 mM Tris HCl pH 8.0 500 mM NaCl 0,1 mM EDTA pH 8.0 100 mM imidazol 0,05% Triton X-100 Tampão de Eluição 2 – 50 mM Tris HCl pH 8.0 500 mM NaCl 0,1 mM EDTA pH 8.0 250 mM imidazol 0,05% Triton X-100 Tampão de Eluição 3 – 50 mM Tris HCl pH 8.0 500 mM NaCl 0,1 mM EDTA pH 8.0 500 mM imidazol 0,05% Triton X-100 ________________________________________________________________________________ Preparação das Amostras para o SDS-PAGE 1. Remova os tubos com as frações Não-Induzida e Induzida do freezer, transferindo-os para o gelo. Adicione 50 μl de Tampão de Extração 1 e ressuspenda as células totalmente. 2. Prepare 9 tubos Eppendorf novos, numerando-os de 1 a 9. Adicione 10 μl de Tampão de Laemmli no fundo dos tubos 2 a 9. 3. Adicione 5 μl do Marcador de Peso Molecular no tubo 1 e 10 μl de cada fração aos tubos numerados, de acordo com a tabela abaixo: Tubo Amostra Volume (μL) Tampão de Laemmli (μL) 1 Marcador de Peso Molecular 5 - 2 Fração Não-Induzida 10 10 3 Fração Induzida 10 10 4 Fração Solúvel 10 10 5 Fração Flow Through 10 10 6 Fração Wash 10 10 7 Fração Eluato 1 10 10 8 Fração Eluato 2 10 10 9 Fração Eluato 3 10 10 4. Feche bem os tubos e armazene em freezer -20°C até a próxima aula, quando então correremos um gel de SDS-poliacrilamida para analisar nossa estratégia de purificação.
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