Baixe o app para aproveitar ainda mais
Prévia do material em texto
UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA Instituto de Ciências Biológicas Departamento de Biologia Celular Profa. Dra. Jane Mary L. N. Gelinski Brasília, DF 2023 BIOQUÍMICA MÓDULO I 2 ❑ Introdução Geral à Bioquímica ❑ Água: estrutura, propriedades físico-químicas, interações com macro e micromoléculas; equilíbrio ácido-base, pH e pOH, tampões ❑Biomoléculas - Estrutura química, propriedades físico-químicas e funções: Carboidratos, lipídios, aminoácidos, proteínas, purinas e pirimidinas, ácidos nucléicos ❑ Enzimas: ação catalítica, cinética, inibição enzimática, equação de MichaelisMenten, KM e Vmax, efeitos da temperatura, pH e inibidores sobre a atividade das enzimas; conceito de alosteria. ❑Vitaminas e coenzimas Parte 1 Introdução geral à bioquímica Água como composto de interesse biológico: estrutura, funções, propriedades físico-químicas, equilíbrio ácido-base e sistemas tamponantes, interações com macro e micromoléculas. 3 Processos metabólicos • o que são e o que envolvem? fatores de controle: temperatura, osmolaridade, eletrólitos, nutrientes, oxigênio, dióxido de carbono e íons hidrogênio (pH); BIOQUIMICA “ Com a célula, a biologia descobriu seu átomo... Dessa forma, para caracterizar a vida, é essencial estudar a célula e analisar sua estrutura: escolher os denominadores comuns necessários para a vida de cada célula, assim como identificar diferenças associadas com o desempenho de funções especiais”. François Jacob, La logique du vivant: une histoire de l’hérédité (A Lógica da Vida: Uma História da Hereditariedade), 1970. Estuda a estrutura química da matéria viva, as reações que explicam as funções (fisiologia) das células e tecidos, ou sejam os processos metabólicos vitais. (Aranha, 1999) 5 O total de água doce no nosso planeta, corresponde a 40 x 1015 litros = 3% de toda água da Terra; 97% restantes são de água salgada, sendo que 2% fazem parte da calota glacial. Assim, 1%= água doce líquida. 10% - Brasil INTRODUÇÃO 6 A água, em seu estado natural mais comum, é um líquido transparente, assumindo a cor azul esverdeada em lugares profundos. Possui uma densidade máxima de 1 g/cm3 a 4ºC e seu calor específico é de 1 cal/ºC. Propriedades da água que tornam a vida possível 1. Alta tensão superficial Coesão de moléculas 2. CAPILARIDADE • Moléculas são atraídas por outras mol.de água Adesão – transporte/movimento 5. Capacidade de expansão ao congelamento 3. Energia requerida para evaporar 4. Resistência à mudança de temperatura 10 Tabela 1. Ponto de fusão, ponto de ebulição e calor de evaporação de alguns solventes comuns Água Metano Etanol Propanol Butanol Acetona Hexano Benzeno Butano Cloroformio • IMPORTANCIA DA ÁGUA NOS SISTEMAS BIOLÓGICOS 11 70% em massa dos organismos vivos Solvente dos cristaloides e dispergente dos coloides protoplasmáticos; Limite 20% de desidratação, Se 30% -- para o metabolismo; Participa nas transformações metabólicas, como hidrólise, hidratação; Indispensável para a função das proteínas e processos metabólicos celulares; Veículo de transporte e excreção de substâncias Regulador térmico do organismo, pela evaporação dissipa o calor; Importante na manutenção da pressão osmótica e do pH tecidual. ÁGUA NO ORGANISMO H20: ESTRUTURA, PROPRIEDADES FÍSICO-QUÍMICAS E FUNÇÕES 12 Fonte: Bioquímica de Lehninger 13 Duas moléculas de H2O unidas por uma ligação de hidrogênio entre o átomo de oxigênio da molécula superior e um átomo de hidrogênio da molécula inferior. Fonte: Bioquímica de Lehninger As ligações de hidrogênio são mais longas e mais fracas que as ligações covalentes O-H. 14 Ligações de hidrogênio comuns em sistemas biológicos. O aceptor de hidrogênio é geralmente oxigênio ou nitrogênio; ACEPTOR DE HIDROGÊNIO DOADOR DE HIDROGÊNIO 15 Algumas ligações de H importantes Entre o grupo OH de um álcool e água Entre o grupo carbonil (C=O) de uma cetona e água Entre grupos peptídeos em polipeptídeos Entre bases complementares de DNA A = T C G 16 17 Densidade Líquida: 0,9998396 g/mL a 0 °C 0,9970474 g/mL a 25 °C 0,961893 g/mL a 95 °C Sólida: 0,9167 g/ml a 0 °C PROPRIEDADES FÍSICO-QUÍMICAS Ponto de fusão 0 °C, 32 °F (273,15 K) Ponto de ebulição 100 °C, 212 °F (373,15 K) PROPRIEDADES FÍSICO-QUÍMICAS Pressão de vapor Tensão superficial alta Alta viscosidade Calor Específico Calor latente de fusão Calor latente de vaporização 23,78 torr (25 °C) 1 cal/ g.oC 80 cal/g. 537 cal/g 19 CAPACIDADE DE DISSOLUÇÃO Fonte: Bioquímica de Lehninger 20 Fonte: Bioquímica de Lehninger 21 pH – POTENCIAL HIDROGENIÔNICO pH de uma solução é definido como o logaritmo de base 10 da recíproca de H+ pH água a 25ºC = 7,0 [H+] = [OH] = 7,0 Para cada unidade de pH inferior a 7,0 os H+ aumentam em 10 vezes. E para cada pH acima de 7,0 ele é diminuído 10 vezes. ➢pH – importância da manutenção dos níveis de íons H+ ex. Integridade/função de proteínas, Ácidos nucleicos 22 SODA CAUSTICAÁGUA POTÁVEL NEUTRO ÁCIDO ALCALINO QUANDO ÁCIDOS SÃO POSTOS EM SOLUÇÃO, EXISTE DISSOCIAÇÃO DE COMPONENTE ÁCIDO (HA-) EM SEU PROTON (H+) E EXISTE ACIDO LIVRE (A-) UMA RELAÇÃO PARA ESSA DISSOCIAÇÃO PODE SER DEFINIDA MATEMATICAMENTE COMO: 23 0 ÁCIDO 7 BASE 14 0 ÁCIDO 7 BASE 14 pH pOH NEUTRO Qual é o pH de uma solução cuja concentração é de [H+]= 10-5 moles/l? A constante de equilíbrio para a ionização reversível da água: Keq = [H+] [OH-]/[H20] Em água pura a 25˚C, a concentração de H2O é 55,5 M. O valor de Keq, determinado por medições de condutividade elétrica, é 1,8 x 10-16 M: KW = [H +].[OH-] = (55.5 M) ( 1.8 x 10-16 M) ou KW = [H +] [OH-] = 1.0 x 10-14 M2. OS CÁLCULOS ACIMA INDICAM QUE O PRODUTO [H+] [OH-] EM SOLUÇÃO AQUOSA A 25°C É SEMPRE IGUAL A1 x 10-14 M2 Quando [H+] = [OH-] = √KW = √1 x 10 -14 M2 = 1 x 10-7 M = pH 7,0. PORTANTO: pH + pOH=14 25 Considerando a dissociação da água pura H20: H+ + HO- tem-se: [H+]=[HO-]= 10-7 ions g/l (moles/l) ENTÃO, pH= -log[H+] e pOH= -log[HO-] Solução Neutra [H+]=[HO-] = 10-7 moles/l pH =-log10-7 = 7 Água pura pOH =-log10-7 = 7 (pH=pOH-7) pH= 7,0 Solução ácida [H+]>[HO-] >10-7 ions moles/l -log [H+] > -log10-7 pH< 7,0 Solução básica [H+]<[HO-] <10-7 íons g/l -log[H+]<-log10-7 pH >7,0 26 Para água pura Considere lembrar que: log0= 0; log1= 0; log2= 0,3; log3= 0,47; log4= 0,6; log5= 0,7; log6= 0,77; log7= 0,83; log8= 0,9 ; log9= 0,94; log10= 1,0. E para pH= -log10-9? Exemplo: Se pH= - log [H+] então, Para pH= - log 10-5 - pH= 5 sol. ácida. pH= -log10-2 = 2 Sol. ácida - logH+ é o pH 27 ÁCIDO= espécie molecular que tende a perder um íon hidrogênio (próton) ou seja, capaz de doar íons H+; BASE= molécula com tendência a receber um íon hidrogênio, ou seja, capaz de receber íons H+ 28 (Bettelheim et al., 2012) 29 30 ÁCIDO/BASE CONJUGADA HA H+ + A- Expressão geral para as bases de Bronsted FORMA PROTONADA FORMA DESPROTONADA 31 MEDIÇÃO DE pH Fitas indicadoras pHmetro digital Phmetro de mesa Phmetro portátil KHAN ACADEMY -2022 SISTEMAS TAMPÕES 33 ❑ SOLUÇÃO TAMPÃO • Solução que resistem a variação de pH quando quando pequenas quantidades de íons H3O+ (hidrônio) e OH- (hidróxido) são adicionadas. ❑ COMPOSIÇÃO: • Quantidades aproximadamente iguais de ácidos e bases conjugadas ❑ CAPACIDADE TAMPONANTE OU DE TAMPONAMENTO. O tampão é mais eficiente no valor de pH=pKa, quanto mais próximo desse valor, maior a capacidade tamponante, 34 Dois equilíbrios reversíveis estão envolvidos na titulação de um ácido fraco, tais como o ácido acético (HAc) H2O H + + OH- À MEDIDA QUE OH- É ADICIONADO, COMBINA-SE COM H+PARA FORMAR ÁGUA. HAc H+ + Ac-. À MEDIDA QUE O H+ LIVRE É REMOVIDO, O HAc SUBSEQUENTEMENTE SE DISSOCIA PARA SATISFAZER SUA PRÓPRIA EQUAÇÃO DE EQUILÍBRIO Seguindo suas equações de equilíbrio características: (água) KW = [H +] [OH-] = 1.0 x 10-14 M2 Ka = [H +] [Ac-] / [HAc] = 1.74 x 10-5 M. EQUAÇÃO DE HENDERSON HASSELBACH E O SIGNIFICADO DE pKa 35 Concentração do sal ou base conjugada Concentração do ácido pKa É o valor do pH da solução quando a concentração do sal é igual à concentração do ácido. Como pKa é uma constante, o pH de um tampão passa a depender, apenas da relação. [A-]/ [HA] 𝐾𝑎 = 𝐻 + . 𝐴 − [𝐻𝐴] Constante de dissociação ácido HA H+ + A - Mas, se –log H+ é por definição o pH e -logKa é pKa tem-se então: HA= ácido fraco conjugado 36 Titulações São usadas para determinar a quantidade de ácido fraco numa solução. Titulações também produzem o valor de pKa (ácido fraco) Curva de titulação para ácido acético A forma de ácido conjugado (HA) de um ácido fraco é estequiometricamente convertida em sua forma de base conjugada (A-) pela adição de uma base forte. Região de tamponamento Percentual de titulação Um tampão eficaz tem pH = pKa ± 1. Fonte: Bioquímica de Lehninger 37 Fonte: Bioquímica de Lehninger 38 IMPORTÂNCIA DA MANUTENÇÃO/ESTABILIDADE DO pH Como um grande número de reações metabólicas conduz à formação de ácidos ou bases no organismo, é importante a estabilidade do pH dos fluidos biológicos, porque: ❑ alterações na concentração de prótons, íons H +podem causar modificações na estrutura das proteínas (enzimas); ❑ muitos processos de absorção e excreção são dependentes de grau de ionização de certos compostos, dependentes do pH do meio; ❑ alterações no pH podem induzir à degradação de vários componentes celulares, como por exemplo, no ácido ribonucléico (RNA), que degrada em pH acima de 8,0; PRINCIPAIS ÁCIDOS E BASES PRODUZIDOS PELO ORGANISMO ✓ GÁS CARBÔNICO ✓ ÁCIDO SULFÚRICO ✓ ÁCIDO FOSFÓRICO ✓ ÁCIDO CLORÍDRICO ✓ ÁCIDO LÁTICO ✓ ÁCIDO CÍTRICO PRINCIPAIS ÁCIDOS E BASES PRODUZIDOS PELO ORGANISMO ✓ GÁS CARBÔNICO CO2 – PRODUTO FINAL DAS OXIDAÇÕES BIOLÓGICAS. + H2O = HC02. ✓ ÁCIDO SULFÚRICO H2SO4 - FORMADO A PARTIR DO METABOLISMO DE AMINOÁCIDOS (Metionina, cisteína); ✓ÁCIDO FOSFÓRICO H2PO4 - FORMADO PELA HIDRÓLISE DE FOSFOÉSTERES DE PROTEÍNAS E ÁCIDOS NUCLÉICOS. PRINCIPAIS ÁCIDOS E BASES PRODUZIDOS PELO ORGANISMO ✓ ÁCIDO CLORÍDRICO HCl - METABOLISMO DE AMINOÁCIDOS (LISINA, ARGININA, HISTIDINA). ✓ ÁCIDO LÁTICO C3H6O3 – PRODUTO DA GLICONEOGÊNESE – Músculo em exercício intenso. ✓ ÁCIDO CÍTRICO C6H8O7. – NO C. KREBS E BIOSSÍNTESE DE ÁCIDOS GRAXOS. BIBLIOGRAFIA • Lehninger, A; Nelson, D. e Cox, M. Princípios de Bioquímica de Lehninger; tradução: Carla Dalmaz, Carlos Termignoni, Maria Luiza Saraiva Pereira. - 7a ed. – PoA: ArtMed, 2019. 1278 p. ISBN 978-85-8271- 533-8 • Lehninger, A; Nelson, D. e Cox, M. Princípios de Bioquímica de Lehninger - 6a ed. ArtMed, SP. 2014. • Voet, D., Voet, J.G. & Pratt, C.W. Fundamentos de Bioquímica. 4ª ed. Art Med, PoA, 2014. • Marzzoco, A. & Torres, B.T. Bioquímica Básica. 4a ed. Guanabara Koogan, 1999. BIBLIOGRAFIA COMPLEMENTAR Stryer, L. Biochemistry. W.H. Freeman and Company, New York, 1995. Stryer, L. Bioquímica. Ed. Sarvier, São Paulo. 2004. Voet, D., Voet, J.G. & Pratt, C.W. Bioquímica. 4ª ed. Art Med, PoA, 2013. Raven, P.H.; Evert, R.F.; Eichhorn, S.E. (1999). Biology of Plants. W.H. Freeman & Company, New York. Campbell, M.K. e Farrel, S.O., Bioquímica (Tradução da 8ª edição norte americana), Cengage Learning Edições Ltda. 2016. 42 43 METABOLISMO MOLÉCULAS SIMPLES MOLÉCULAS SIMPLESMOLÉCULAS COMPLEXAS MOLÉCULAS COMPLEXAS CATABOLISMO ANABOLISMO CRESCIMENTO, REPRODUÇÃO E REPARO E ESTRUTURAS CELULARES CRESCIMENTO, REPRODUÇÃO E REPARO E ESTRUTURAS CELULARES PROVER ENERGIA PARA OS PROCESSOS VITAIS, INCLUINDO MOVIMENTOS, TRANSPORTE E SÍNTESE DE MOL. COMPLEXAS, OU SEJA ANABOLISMO PROVER ENERGIA PARA OS PROCESSOS VITAIS, INCLUINDO MOVIMENTOS, TRANSPORTE E SÍNTESE DE MOL. COMPLEXAS, OU SEJA ANABOLISMO Seção Padrão Slide 1: UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA Instituto de Ciências Biológicas Departamento de Biologia Celular Slide 2: MÓDULO I Slide 3: Parte 1 Introdução geral à bioquímica Água como composto de interesse biológico: estrutura, funções, propriedades físico-químicas, equilíbrio ácido-base e sistemas tamponantes, interações com macro e micromoléculas. Slide 4 Slide 5 Slide 6 Slide 7: Propriedades da água que tornam a vida possível Slide 8 Slide 9 Slide 10 Slide 11 Slide 12: H20: ESTRUTURA, PROPRIEDADES FÍSICO-QUÍMICAS E FUNÇÕES Slide 13 Slide 14 Slide 15 Slide 16 Slide 17 Slide 18 Slide 19 Slide 20 Slide 21 Slide 22 Slide 23 Slide 24 Slide 25 Slide 26 Slide 27 Slide 28 Slide 29 Slide 30 Slide 31 Slide 32 Slide 33: SISTEMAS TAMPÕES Slide 34 Slide 35: EQUAÇÃO DE HENDERSON HASSELBACH E O SIGNIFICADO DE pKa Slide 36 Slide 37 Slide 38 Slide 39 Slide 40 Slide 41 Slide 42 Slide 43
Compartilhar