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Disciplina: BIOINFORMÁTICABIOINFORMÁTICA  AVAV
Aluno: FELICIANA DE JESUS MARTINS LAGEFELICIANA DE JESUS MARTINS LAGE 201908611863201908611863
Professor: DJULI MILENE HERMESDJULI MILENE HERMES
  
Turma: 90019001
SDE4449_AV_201908611863 (AG)   07/06/2023 15:41:56 (F) 
Avaliação: 5,005,00 pts Nota SIA: 6,006,00 pts
 
02265 - ANÁLISE FILOGENÉTICA02265 - ANÁLISE FILOGENÉTICA  
 
 1.1. Ref.: 6069594 Pontos: 0,000,00  / 1,001,00
A seguir são apresentadas diferentes árvores filogenéticas (de A ao E). Analise os gráficos e responda:
Imagem: Leandro Pederneiras
Qual dos gráficos acima (a, b, c, d ou e) é um filograma e um cronograma, respectivamente?
 Árvore bb e ee
Árvore aa e cc
 Árvore ee e bb
Árvore dd e aa
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Árvore dd e ee
 2.2. Ref.: 6069586 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
Analise a figura abaixo:
Imagem: Leandro Pederneiras
Considerando a figura acima, porque W é mais próximo relacionado a U do que a Y?
Porque W e U são separados somente por dois nós.
Porque o ancestral de W e U viveram antes do ancestral de Y
Porque W e Y possuem um ancestral comum mais recente do que W e U
 Porque W e U possuem um ancestral comum mais recente do que W e Y
Porque W e U são mais similares entre si do que com Y.
 
02925 - NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS02925 - NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS  
 
 3.3. Ref.: 6045539 Pontos: 0,000,00  / 1,001,00
Uma árvore filogenética busca desvendar a história evolutiva de um grupo de organismos. Isso pode ser
feito a partir da comparação de sequências biológicas. Uma boa estratégia é escolher um gene que todas
as espécies comparadas possuam, e identificar a partir de alinhamentos as similaridades entre as
sequências de cada espécie. Supondo que você irá comparar a sequência completa do gene para DNA
polimerase de 50 espécies bacterianas diferentes, qual o tipo de alinhamento é o mais adequado nessa
situação?
 Alinhamento múltiplo e global.
Alinhamento simples e múltiplo.
 Alinhamento local e global.
Alinhamento simples e local.
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Alinhamento múltiplo e local.
 4.4. Ref.: 6045336 Pontos: 0,000,00  / 1,001,00
Qual ferramenta é uma das mais comuns em bioinformática para alinhamento múltiplo de sequências
biológicas de forma heurística?
PubMed.
 BLAST.
 Clustal.
Primer3.
GenBank.
 5.5. Ref.: 6045329 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
Observe o alinhamento entre quatro sequências de proteínas mostrado na figura. Existem algumas
posições que estão representadas com um traço (-), isso significa que nessas posições existem gaps.
Marque a alternativa que apresenta o significado biológico correto de regiões de gaps.
Fonte: Wikimedia.org/CC by 3.0
Gaps são regiões conservadas entre as sequências.
Gaps são posição no alinhamento em que o resíduo é diferente entre as sequências comparadas.
Gaps são mutações por substituição, representam troca de um aminoácido por outro.
Gaps é o total do somatório de matches subtraídos do número de mismatches ao longo do
alinhamento.
 Gaps são regiões de deleções ou inserções, em que algumas das sequências perderam ou ganharam
uma nova "parte".
 
03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA  
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 6.6. Ref.: 6054915 Pontos: 0,000,00  / 1,001,00
O sequenciamento de DNA é a técnica utilizada para estudos genômicos. Existem diferentes aparelhos
capazes de determinar a ordem de nucleotídeos do genoma. Porém, determinado tipo de abordagem de
sequenciamento é o mais indicada, devido à rapidez da obtenção dos resultados e aos menores custos.
Qual é essa abordagem?
Microarranjo.
 Nova geração.
 Sanger.
Espectrometria.
PCR.
 7.7. Ref.: 6054821 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
Eduarda é bioinformata e trabalha com a análise de genomas. Seu chefe lhe enviou um arquivo com várias
sequências de genes separadas. Ele disse que precisava que ela terminasse o processo de anotação
genômica, e que estava faltando apenas a última etapa, de anotação funcional. O que Eduarda precisa
fazer com esses dados para realizar a anotação funcional?
Encontrar regiões de sobreposição entre as sequências dos genes, a fim de montar o genoma final.
Comparar as sequências dos genes entre si, identificando o maior número de similaridade entre elas.
Armazenar as sequências de nucleotídeos correspondentes aos genes em um arquivo de sequência,
como o formato FASTA.
Determinar a estrutura tridimensional das proteínas codificadas pelos genes por meio da técnica de
Ressonância Magnética Nuclear (RMN).
 Comparar a sequências de proteínas traduzidas a partir dos genes com sequências presentes em
bancos de dados curados como o UniProtKB/Swiss-Prot.
 
03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA  
 
 8.8. Ref.: 6075100 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
(adaptado de CESPE -2013-Química) O excesso de peso e uma alimentação rica em gordura podem
causar alterações genéticas, segundo um estudo que analisou o genoma de 703 pessoas obesas, magras e
com excesso de peso. Nesse estudo, os pesquisadores mostraram que o gene LY86, possível contribuidor
da obesidade, sofreu uma metilação sobre vários substratos. Os resultados revelam uma mudança
química no genoma, como se o organismo se adaptasse ao "novo" ambiente. Considerando as informações
apresentadas, é correto afirmar que a alteração sofrida pelo gene LY86 está relacionada.
À sequência de bases nitrogenadas.
Ao aumento do splicing.
Ao número de cópias de DN.
 À taxa de transcrição gênica.
À replicação.
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 9.9. Ref.: 6075099 Pontos: 0,000,00  / 1,001,00
Adaptada de UPENET/IAUPE - 2017 - UPE ¿ Biólogo) Ao compararmos um gene e uma proteína, ficamos
restritos a tratar da sequência de DNA, que se estende entre os pontos correspondentes às extremidades
da proteína. O processo pelo qual um gene dá origem a uma proteína é chamado expressão gênica. Nesse
contexto, observe as sequências selvagem (esquerda) e mutante (direita) da cadeia β da hemoglobina.
Para responder, utilize a tabela de códons a seguir:
Após analisar as sequências de nucleotídeos normal e selvagem e a tabela de códon, analise a relação
entre as assertivas a seguir:
I. A diferença entre o DNA selvagem e mutante da cadeia β da hemoglobina, é devido a uma mutação
silenciosa após a troca do nucleotídeo A pelo T.
PORQUE
II. A alteração no nucleotídeo de A pelo T não altera o aminoácido que é adicionado na cadeia peptídica,
sendo nos dois casos adicionados a alanina.
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta:
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justificativa da I.
 A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira.
 As asserções I e II são proposições falsas.
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A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa.
 10.10. Ref.: 6074929 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
Um gene hipotético apresente a seguinte sequência de nucleotídeos:
...CGT GCG TGT ACG GAA GCG ATG GGC ATA CTG TAA CCA ATA ATT .....
Uma mutação ocorreu na décima terceira base nitrogenada, da sequência apresentada, da esquerda para
a direita, substituindo-a por uma citosina.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência de bases CORRETA após ocorrida a transcrição deste
gene:
...GCA CGC ACA UCC CUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ...
...GTA CGC ACA TGC CTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ...
 ...GCA CGC ACA UGC GUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ...
...GCT CGC UCU UGC CAA CGC AUC CCG AUC GAC UUA GGA AUA AUU ...
...GTA CGC ACA TGC GTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ...
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