bioinformática

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Bioinformática
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ANÁLISE
 
FILOGENÉTICA
) (
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6069684
1.
)
Analise a árvore klogenética a seguir.
Fonte: Leandro C.Pederneiras Qual a distância evolutiva entre o táxon F e o táxon J?
1,9
 2,25
4,35
 3,6
 3,65
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6069487
2.
)
O estudo da classikcação e evolução dos organismos é um dos principais assuntos da Biologia moderna. Isso tudo graças aos conceitos de Darwin e Wallace, no século XIX, e a metodologia de Hennig, no século XX. Sobre esse assunto podemos dizer que atualmente os cientistas procuram agrupar os organismos que possuem?
 Hábitats amórkcos
 Descendentes de linhagens modernas Ancestral comum e todos os descendentes
 Linhagem ancestral poliklética
 Morfologias com funções descentralizadas
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6069489
3.
)
Na kgura a seguir vemos uma matriz com 3 táxons (A ao C) e 4 caracteres (1 ao 3).
A seguir são listadas 5 topograkas de árvores diferentes (A ao E). Analise a alternativa que está de acordo com a matriz táxon × caractere.
	
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02925
 
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NCBI
 
E
 
ALINHAMENTO
 
DE
 
SEQUÊNCIAS
) (
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6045362
4.
)
O programa BLAST é uma ferramenta disponível em vários bancos de dados como uma opção de busca. O portal do NCBI também conta com essa opção para que o usuário possa fazer buscas em bancos como GenBank e RefSeq.
Qual tipo de dado biológico é usado pelo BLAST em suas execuções?
Sequências de nucleotídeos ou aminoácidos. Artigos cientíkcos.
 Anotação de função de proteínas.
 Estrutura tridimensional de proteínas.
 Número da atividade enzimática de proteínas.
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6045459
5.
)
A partir do portal do NCBI (National Center for Biotechnology Information) é possível ter acesso a diferentes bancos de dados biológicos. É importante saber de qual dado precisamos para escolher corretamente em qual banco vamos realizar a busca. Caso você esteja desenvolvendo seu trabalho de conclusão de curso, qual banco de dados você utilizaria para obter resumos e/ou textos completos de artigos publicados em milhares revistas diferentes?
PubMed. RefSeq. GenBank. KEGG.
 UniProt/SwissProt.
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6045329
6.
)
Observe o alinhamento entre quatro sequências de proteínas mostrado na kgura. Existem algumas posições que estão representadas com um traço (-), isso signikca que nessas posições existem gaps. Marque a alternativa que apresenta o signikcado biológico correto de regiões de gaps.
Fonte: Wikimedia.org/CC by 3.0
 Gaps são posição no alinhamento em que o resíduo é diferente entre as sequências comparadas.
 Gaps são regiões conservadas entre as sequências.
Gaps são regiões de deleções ou inserções, em que algumas das sequências perderam ou ganharam uma nova "parte".
 Gaps são mutações por substituição, representam troca de um aminoácido por outro.
 Gaps é o total do somatório de matches subtraídos do número de mismatches ao longo do alinhamento.
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03015
 
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ANOTAÇÃO
 
GÊNICA
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6054821
7.
)
Eduarda é bioinformata e trabalha com a análise de genomas. Seu chefe lhe enviou um arquivo com várias sequências de genes separadas. Ele disse que precisava que ela terminasse o processo de anotação genômica, e que estava faltando apenas a última etapa, de anotação funcional. O que Eduarda precisa fazer com esses dados para realizar a anotação funcional?
 Encontrar regiões de sobreposição entre as sequências dos genes, a km de montar o genoma knal.
Comparar as sequências dos genes entre si, identikcando o maior número de similaridade entre elas.
 Armazenar as sequências de nucleotídeos correspondentes aos genes em um arquivo de sequência, como o formato FASTA.
 Determinar a estrutura tridimensional das proteínas codikcadas pelos genes por meio da técnica de Ressonância Magnética Nuclear (RMN).
Comparar a sequências de proteínas traduzidas a partir dos genes com sequências presentes em bancos de dados curados como o UniProtKB/Swiss-Prot.
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6054629
8.
)
Após determinar a ordem de nucleotídeos do genoma de um organismo a partir do sequenciamento, a próxima etapa é a anotação genômica. Ela pode ser dividida em duas fases: predição gênica e anotação funcional. O que é feito durante a predição gênica?
 Os fragmentos de DNA sequenciados são sobrepostos a partir das suas regiões alinhadas e sequências maiores de nucleotídeos podem ser deknidas.
 A ordem dos nucleotídeos no DNA é determinada.
 A função biológica das proteínas codikcadas pelos genes é identikcada por meio de comparação com banco de dados.
Os genes, principalmente de regiões codikcadoras de proteínas, são identikcados ao longo da sequência de DNA.
 A relação evolutiva entre as sequências é determinada a partir do resultado de alinhamentos múltiplos.
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03017
 
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INTRODUÇÃO
 
À
 
BIOINFORMÁTICA
) (
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6075023
9.
)
Observe a kgura a seguir:
Conceitualmente, a estrutura das proteínas pode ser dividida em quatro diferentes níveis de organização: primário, secundário, terciário e quaternário. Baseado na kgura e em seus conhecimentos, assinale a alternativa correta.
A estrutura primária é constituída pelas ligações peptídicas, que são interações entre resíduos de aminoácidos formando uma cadeia peptídica.
 A estrutura secundária é formada pela união de diferentes subunidades.
 A estrutura terciária é constituída pelas ligações peptídicas, interações entre resíduos de aminoácidos formando uma cadeia peptídica.
 A estrutura terciária é formada por α-hélices, folhas-β e regiões de loop.
 A estrutura quaternária é formada pelas interações entre as α-hélices, folhas-β e regiões de loop de uma única subunidade.
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6074929
10.
)
Um gene hipotético apresente a seguinte sequência de nucleotídeos:
...CGT GCG TGT ACG GAA GCG ATG GGC ATA CTG TAA CCA ATA ATT .....
Uma mutação ocorreu na décima terceira base nitrogenada, da sequência apresentada, da esquerda para a direita, substituindo-a por uma citosina.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência de bases CORRETA após ocorrida a transcrição deste gene:
 ...GTA CGC ACA TGC CTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ...
 ...GCT CGC UCU UGC CAA CGC AUC CCG AUC GAC UUA GGA AUA AUU ...
 ...GCA CGC ACA UCC CUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ...
...GCA CGC ACA UGC GUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ...
 ...GTA CGC ACA TGC GTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ...