Baixe o app para aproveitar ainda mais
Prévia do material em texto
Prof. Rafael Fernandes Ferreira Tecnologia do DNA Recombinante Março/2022 5 LEMBRETES CITOLOGIA GENÉTICA BIOQUÍMICA BIOLOGIA MOLECULAR ANTES DE ENTENDER COMO FAZER PROTEÍNA RECOMBINANTE Organização estrutural das células Organização Nuclear e Nomenclaturas Transferência da informação do DNA para a proteína ENDONUCLEASES DE RESTRIÇÃO Composição do DNA Organização estrutural das células Organização Nuclear e Nomenclaturas Composição do DNA Transferência da informação do DNA para a proteína Endonuclease de Restrição (Enzima de Restrição) POR QUE ESTAS ENZIMAS NÃO DEGRADAM O DNA DAS BACTÉRIAS? Elas se protegem metilando as sequências de seu DNA Nomenclatura As enzimas de restrição são chamadas de acordo com a bactéria que o produziu RY 13 Exemplo: EcoR I Escherichia coli 1º enzima a ser descoberta nesta bactéria Gênero Ordem de descoberta Espécie Linhagem • EcoRI Escherichia coli • BamHI Bacillus amyloliquefaciens RH • BglII Bacillus globigii • PvuII Proteus vulgaris • HindIII Haemophilus influenzae Rd • HinfI Haemophilus influenzae Rf • Sau3A Staphylococcus aureus • AluI Arthrobacter luteus • TaqI Thermus aquaticus • HaeIII Haemophilus aegyptius • NotI Nocardia otitidis-caviarum Clonagem de DNA é o processo de fazer várias cópias idênticas de um pedaço específico de DNA. O gene ou outro fragmento de DNA de interesse é primeiramente inserido numa peça circular de DNA chamada plasmídeo. Organismo Hospedeiro (BACTÉRIAS) PROTEÍNA DE INTERESSE Qual a finalidade de produzir várias cópias de uma sequência de DNA num plasmídeo? Em alguns casos, precisamos de muitas cópias de DNA para realizar experimentos ou construir novos plasmídeos. Qual a finalidade de produzir várias cópias de uma sequência de DNA num plasmídeo? O fragmento de DNA codifica uma proteína útil, e as bactérias são usadas como "fábricas" para produção dessa proteína 1. ISOLAR O GENE DE INTERESSE Para que se tenha o DNA recombinante, de duas origens diferentes, é necessário utilizar as enzimas de restrição. Essas enzimas reconhecem a sequência alvo específica e cortam seletivamente o fragmento que será utilizado. 1. ISOLAR O GENE DE INTERESSE (Enzimas de Restrição) 1. ISOLAR O GENE DE INTERESSE (Enzimas de Restrição) 1. ISOLAR O GENE DE INTERESSE (Enzimas de Restrição) Enzimas de restrição são nomeadas a partir das espécies de procariontes dos quais foram isoladas. Por exemplo, as enzimas isoladas da bactéria Escherichia coli começariam com Eco (como em EcoRI). 2. UNIR O GENE AO VETOR: DNA RECOMBINANTE O fragmento de DNA é inserido em um vetor, que é uma molécula de DNA na qual um gene é inserido para construir a molécula de DNA recombinante. 2. UNIR O GENE AO VETOR: DNA RECOMBINANTE DNA LIGASE Para que a sua sequência de interesse seja inserida dentro do plasmídeo, uma enzima deve ser utilizada: é a DNA ligase. Ela irá formar ligações fosfodiéster entre o seu DNA e as duas extremidades dos plasmídeos. 2. UNIR O GENE AO VETOR: DNA RECOMBINANTE DNA LIGASE 2. UNIR O GENE AO VETOR: DNA RECOMBINANTE PLASMÍDEOS Vetor de clonagem mais utilizado são plasmídeos de Escherichia coli. Eles são moléculas de DNA circular compostas por regiões funcionais: • Uma origem de replicação; • Um gene de resistência a determinado antibiótico; • Um gene LacZ (cor azul); • Alguns sítios de restrição (região onde o inserto será inserido). 3.TRANSFORMAÇÃO Molécula de DNA recombinante produzida é introduzida em um organismo hospedeiro, podendo então ser replicadas. As células hospedeiras copiam o DNA do vetor juntamente com o próprio DNA, criando múltiplas cópias do DNA inserido. Exemplos de células hospedeiras: bactérias Escherichia coli e Bacillus subtilis e a levedura Saccharomyces cerevisiae. 4. SEMEADURA E INCUBAÇÃO ✓ Bactérias são semeadas em ágar contendo o antibiótico correspondente ao gene de resistência presente no plasmídeo, e somente as bactérias que possuem o plasmídeo (contendo o gene de resistência) dentro delas conseguirão crescer no meio. ✓ Nesse meio de cultura também é adicionado um substrato cromógeno, como por exemplo a X-Gal (análogo da lactose→ galactose + indol). ✓ Enzima β-galactosidase (produzida pelo LacZ) cliva a X-Gal em galactose e um composto azul escuro. 4. SEMEADURA E INCUBAÇÃO 5. TRIAGEM AZUL-BRANCA Houve ligação (plasmídeo + inserto?) Mudança de cor nas colônias para fazer a triagem. Dois tipos de colônias podem se formar: Colônias brancas: bactérias em que os plasmídeos contendo o inserto estão presentes. Isso significa que o gene LacZ foi interrompido pelo inserto, não produziu a enzima e não clivou a X-gal. DEU CERTO!!! Colônias azuis: bactérias que têm os plasmídeos, mas eles não tem o inserto. Isso significa que o gene LacZ não foi interrompido pelo inserto e foi transcrito na enzima e produziu a cor azul. 5. TRIAGEM AZUL-BRANCA 6. Confirmação se o inserto realmente está no plasmídeo O próximo passo é selecionar algumas colônias brancas e semeá-las novamente, porém em meio líquido (caldo) e não em ágar. Extração somente do DNA plasmidial Restrição Enzimática Eletroforese 6. Confirmação se o inserto realmente está no plasmídeo Se tiver dado certo, você verá duas bandas: uma do plasmídeo e outra do seu inserto. Somente as colônias 1, 3 e 4 possuíam o plasmídeo recombinante com seu inserto. 7. PURIFICAÇÃO DE PROTEÍNAS A proteína de interesse é então purificada, separada dos demais conteúdos das células, por exemplo, outras proteínas e macromoléculas. Isso garante que não haja nenhuma impureza, restando apenas o produto final (ex.: insulina). APLICAÇÕES Biofármacos Produzir proteínas humanas com aplicações terapêuticas, como: Insulina Hormônio do crescimento humano Ativador de plasminogênio tecidual (tPA/ APt) (usado para tratar derrames e prevenir coágulos sanguíneos). APLICAÇÕES Terapia genética (TG) Desordens genéticas → pacientes não possuem a forma funcional de um gene. TG → fornece uma cópia normal do gene para as células do corpo do paciente. Construir plasmídeos com uma versão normal do gene que é não funcional na fibrose cística. Quando os plasmídeos foram liberados nos pulmões dos pacientes com fibrose cística, a função pulmonar deteriorou menos rapidamente APLICAÇÕES Organização de DNA nas células. Universidade Federal de Santa Maria. Acesso em Fev 2022. http://coral.ufsm.br/blg220/hide/organizDNA.htm Enzimas de Restrição. Universidade de São Paulo. Acesso em Fev 2022. http://www.iq.usp.br/bayardo/softwares/proteina/advanced/cap3/tarefas3.html Kesik-Brodacka M. Progress in biopharmaceutical development. Biotechnol Appl Biochem. 2018;65(3):306-322. doi:10.1002/bab.1617. Creech CB, Walker SC, Samuels RJ. SARS-CoV-2 Vaccines. JAMA. 2021 Apr 6;325(13):1318-1320. doi: 10.1001/jama.2021.3199. PMID: 33635317. Weyand AC, Pipe SW. New therapies for hemophilia. Blood. 2019 Jan 31;133(5):389-398. doi: 10.1182/blood- 2018-08-872291. Epub 2018 Dec 17. PMID: 30559264. O'Flaherty R, Bergin A, Flampouri E, Mota LM, Obaidi I, Quigley A, Xie Y, Butler M. Mammalian cell culture for production of recombinant proteins: A review of the critical steps in their biomanufacturing. Biotechnol Adv. 2020 Nov 1;43:107552. doi: 10.1016/j.biotechadv.2020.107552. Epub 2020 May 13. PMID: 32416132. Oliveira, Luciana Gonzaga de e Mantovani, Simone MoraesTransformações biológicas: contribuições e perspectivas. Química Nova [online]. 2009, v. 32, n. 3 [Acessado 3 Março 2022] , pp. 742-756. Disponível em: <https://doi.org/10.1590/S0100-40422009000300018>. Epub 22 Maio 2009. ISSN 1678-7064. https://doi.org/10.1590/S0100-40422009000300018. REFERÊNCIAS
Compartilhar