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TDR: TECNOLOGIA DO DNA RECOMBINANTE 1° - O gene de interesse é chamado de inserto, ele é ligado ao vetor (outra molécula de DNA) para formar o DNA recombinante. (Inserto + vetor = DNA recombinante) 2° - Transformação, processo no qual o DNA recombinante é introduzido em uma célula hospedeira compatível, essa célula que adquiriu o DNA recombinante e chamada de transformante. 3° - Expressa o gene de interesse. INSERTO É a amostra de DNA (gene) de interesse a ser inserido no hospedeiro. E necessário fazer a: EXTRAÇÃO > PURIFICAÇÃO > CORTE COM ENZIMAS DE RESTRIÇÃO = INSERTO E depois faz a amplificação desse inserto. VETORES DE CLONAGEM Para a clonagem molecular é necessário a extração do inserto e fazer a sua inserção em uma célula hospedeira. Para isso utiliza-se vetores de clonagem, que são pequenas moléculas de DNA que tem a capacidade fazer auto replicação dentro de uma célula hospedeira. Os vetores mais usados são: Plasmídeos, Bacteriófagos e Cosmídios. Características de um vetor de clonagem: - Baixo peso molecular - Auto replicação (ORI) - DNA duplex - Sítios de restrição - Sistemas de seleção (taxa de sucesso do DNA recombinante). PLASMÍDEOS São moléculas de DNA circular, dupla fita, extracromossômico Não é encontrado em todas as bactérias Novas características são devido a mutações nele, sendo ele um dos grandes fatores que confere resistência a antibióticos ORI – Permite a autorreplicação do plasmídeo. Ele seria como um iniciador da replicação sendo que a perca desse sitio não possibilita que o plasmídeo não faça a autorreplicação. Sitios de restrição (Polylinker): são multiplos sitios de clonagem (MSC), é o local de clivage e inserção do inserto. Ele permite a escolha do plasmídeo de acordo com o tipo de inserto e enzima de restrição. pBR322 (4361pb) ORI Ndel Pst I Eco RI ORI Inserto de 500pb EX – 1: Sal I + Eco RV 651pb – 185pb = 466pb – 4361pb = 3895pb 3895pb + 500pb = 4395pb (inviável lise ) Esse fragmento se torna inviável pois não se pode alterar o n° de pb do vetor para isso retira-se um fragmento com tamanho semelhante ao que vai ser inserido. EX – 2: Sal I – Hind III 651pb – 29pb = 622pb – 4361pb = 3739pb 3739pb + 500pb = 4239pb (sucesso) MARCADORES DE SELETIVIDADE Permite reconhecer a bactéria que houve a inserção do DNA no plasmídeo. Marcadores de resistência: resistência a antibiótico, no meio de cultivo (placa), o antibiótico mata as que não receberão o sitio de resistência ai fica só as recombinantes. Fatores de virulência: ex.: a bactéria produz toxinas que mata as que não receberam o fragmento de produção Metabólicos: permitem às bactérias degradar compostos que irão diferenciar bactérias recombinantes de não recombinantes. Um dos marcadores de seleção e o Gene lac Z, ele codifica a enzima beta-galactosidase, que e responsável pela clivagem da galactose, o gene lacZ, que codifica a enzima β - galactosidase, responsável por clivar a galactose (ou, neste caso, o reagente X-gal, um análogo da galactose). O sítio reconhecido pelas enzimas de restrição, onde será inserido o fragmento de DNA, encontra-se inserido no gene lacZ, o que permite dividi- lo em duas partes. Quando não há inserção do inserto (DNA de interesse) no vetor, essas duas partes estão ligadas, reconstruindo o gene lacZ, então a enzima β -galactosidase é produzida, de modo que o X-gal é por ela metabolizado, tornando a colônia azul. Se as partes do gene lacZ fossem separadas pela inserção do DNA de interesse, a enzima β- galactosidase não seria produzida, então o X-gal não seria metabolizado e a colônia permaneceria branca. Para esse processo funcionar, é necessário adicionar IPTG ao meio, juntamente com X-gal. Esse composto mimetiza a lactose e é indutor do sistema, pois liga-se ao repressor do gene lacZ, possibilitando a tradução da β-galactosidase, além de não ser metabolizado. BACTERIÓFAGO É um vírus parasita intracelular obrigatório de bactérias, apresenta geralmente dupla fita filamentar com extremidades complementar chamado de sitio COS. O capsídeo e um envelope proteico, é uma estrutura de proteínas que protege o material genético O bacteriófago usa a estrutura de uma célula parasitaria para se replicar VANTAGENS: - Possui um sistema de reconhecimento próprio, ele é reconhecido por um receptor e abre uma proteína trans membrana, que faz com que ele injete o material genético e apenas ele entra. - Sua eficiência de transformação é de 800cel por micrograma. A única desvantagem e que o fragmento não pode passar de 15kb COSMÍDIOS São plasmídeos com fragmento de DNA fago que inclui o sitio COS Vantagem suporta fragmentos de DNA de 35 a 40kb, inclui genes humanos em bactérias para a produção de substancias. Um dos seus fatores limitantes e fazer o empacotamento in vitro Sitio: sempre deve-se cortar com a mesma enzima para criar a complementariedade; Ligação: usa-se a DNA ligase, que faz ligação fosfodiester em frag de DNA. TRANSFORMAÇÃO Inserção do DNA recombinante dentro de uma célula. TIPOS Procariotas: Transformação/Competência Eletroporação ou transfecção com bacteriófagos ou cosmídeos. Eucariontes: Vesículas de lipossomos, biobalística, vírus cromossomos artificiais TRANSFORMAÇÃO BACTERIANA INDUÇÃO DE COMPETENCIA Retira-se a polaridade da molécula, retirando a impermeabilidade desta ela deixa de ser seletiva. Trata-se com Cloreto de cálcio Desestabiliza a carga da bactéria, capacitando ela de absorver o DNA recombinante ELETROPORAÇÃO