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Os princípios e regras da nomenclatura botânica são desenvolvidos e atualizados em uma série de conferências internacionais e estão listados no Código Internacional de Nomenclatura Botânica. O principal objetivo dos ICBNs é fornecer o nome correto para cada táxon (ou grupo) na taxonomia. Os sistemáticos de plantas usam nomes científicos latinizados. Cada táxon, como uma espécie, gênero ou família, tem um nome, e esse nome é usado em todo o mundo. Nomes comuns ou populares não são apropriados para estes propósitos por numerosos motivos: com frequência estes nomes populares estão limitados a uma única linguagem ou a uma região geográfica em particular; às vezes, o mesmo nome comum é aplicado a muitos taxa diferentes; muitas espécies, especialmente se são raras ou não apresentam importância econômica, carecem de nome comum e com frequência os nomes populares são enganosos quanto às relações filogenéticas. 
Os nomes científicos são binomiais, ou seja, consistem em duas palavras ou nomes latinizados. A primeira palavra do nome é singular e consiste no nome do gênero ao qual a planta pertence. A segunda palavra pode ser um adjetivo qualificando o substantivo comum (e, portanto, deve concordar em gênero com o substantivo comum), um sinônimo ou um substantivo possessivo. Em todos os três casos, é chamado de epíteto específico. A maioria dos epítetos específicos referem-se a propriedades características, sejam elas morfológicas, ecológicas ou químicas. Alguns epítetos referem-se ao alcance do táxon; outros homenageiam a pessoa que primeiro coletou o táxon ou um cientista cujo trabalho contribuiu para o conhecimento botânico de uma determinada região ou táxon. Tanto o epíteto genérico quanto o específico são escritos em itálico ou sublinhados; a primeira letra do nome genérico sempre é maiúscula e o ICBN recomenda que o epiteto especifico seja sempre escrito em letra minúscula. Por fim, o epíteto específico não deve repetir exatamente o nome genérico, tais nomes são denominados tautônimos. 
 O epíteto específico geralmente é seguido pelo nome de um ou mais autores: o nome da pessoa que primeiro descreveu (ou descreveram) o táxon. Às vezes, os nomes dos autores taxonômicos são separados pela preposição ex ou in. Nomes separados por ex indicam que o segundo autor publicou um nome que foi proposto (mas nunca publicado) pelo primeiro autor. Um nome separado por in indica que o primeiro autor publicou o nome em um livro ou artigo editado (ou parcialmente escrito) pelo segundo autor. De acordo com o ICBN, não há necessidade de citar autores anteriores ou posteriores. Classes, subespécies ou variedades infraespecíficas são geralmente identificadas em espécies variáveis. As raças geográficas são frequentemente consideradas subespécies ou subespecíficos. Nesse caso, eles recebem epítetos varietais ou subespécies. O epíteto da variedade ou subespécie que contém o espécime tipo da espécie repete o epíteto específico, mas sem nomear um autor; esta é a variedade denominada nominal, ou "típica". Os nomes científicos das categorías hierárquicas superiores - gênero e supragenéricas - são uninomiais; isto é, são compostos por uma única palavra. Os nomes das categorias supragenéricas são nomes latinizados em plural. Em geral, a terminação do nome indica a categoria em que o táxon se situa.
O ICBN reconhece sete categorias principais: reino, filo/divisão, classe, ordem, família, gênero e espécie, mas permite que outras categorias adicionais sejam intercaladas. Estas categorias adicionais se utilizam dos prefixos super- (acima) e sub- (abaixo). Nos princípios nomenclaturais temos que: a nomenclatura botânica é independente da zoológica, a aplicação de nomes para grupos taxonômicos é regida por meio de tipos nomenclaturais, a nomenclatura dos grupos taxonômicos baseia-se no princípio de prioridade de publicação, cada táxon deve ter apenas um único nome correto, exceto em casos especificados e os nomes científicos são em latim ou latinizados, in- dependentemente da sua origem.
Os nomes híbridos entre duas espécies do mesmo gênero devem ser designados pela listagem alfabética dos nomes das espécies parentais separados pelo símbolo x. Os híbridos entre espécies de diferentes gêneros podem ser designados pelos nomes das espécies parentais separados pelo símbolo x. Além disso, existem os assim chamados "híbridos de enxertia", que são quimeras. Estas plantas podem ser designadas pelos nomes das espécies parentais separados pelo símbolo + ou podem ser nomeados de acordo com a fórmula + Crataegomespilus. Já as plantas produzidas em cultivo através de hibridização, seleção artificial ou outros processos podem receber epítetos adicionais. A aplicação de tais nomes é regida pelo Código Internacional de Nomenclatura para Plantas Cultivadas (ICNCP), que reconhece "cultivares" ou "grupos de cultivares"