Estácio_ AV

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Disciplina: BIOINFORMÁTICA  AV
Aluno: ELISABETH CRISTINA SANTOS DA CRUZ 202104180926
Professor: VIVECA ANTONIA GIONGO GALVAO DA SILVA
 
Turma: 9001
SDE4449_AV_202104180926 (AG)   06/11/2023 14:33:14 (F) 
Avaliação: 10,00 pts Nota SIA: 10,00 pts
 
02265 - ANÁLISE FILOGENÉTICA  
 
 1. Ref.: 6069586 Pontos: 1,00  / 1,00
Analise a �gura abaixo:
Imagem: Leandro Pederneiras
Considerando a �gura acima, porque W é mais próximo relacionado a U do que a Y?
Porque W e U são separados somente por dois nós.
Porque W e Y possuem um ancestral comum mais recente do que W e U
Porque W e U são mais similares entre si do que com Y.
Porque o ancestral de W e U viveram antes do ancestral de Y
 Porque W e U possuem um ancestral comum mais recente do que W e Y
 2. Ref.: 6069682 Pontos: 1,00  / 1,00
A inferência Bayesiano é um método que avaliar a probabilidade posterior de uma árvore. Qual das a�rmações a
seguir é verdadeira para as probabilidades posteriores?
Hipóteses com probabilidades posteriores menores são favorecidas em relação àquelas com valores
maiores.
Não precisam de dados adicionais.
Não dependem da escolha de um modelo.
 Usa o teorema de Bayes.
Pode ser calculada exclusivamente pelo teorema de Pitágoras.
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 3. Ref.: 6069787 Pontos: 1,00  / 1,00
Observe o caldograma seguir:
Imagem: Leandro Pederneiras
A seguir são listadas algumas relações �logenéticas. A partir do cladograma, analise as a�rmativas e assinale a que
retrata uma correta análise �logenética:
A espécie G é mais próxima relacionada de E do que de H.
A espécie E possui igual proximidade de relacionamento entre D e F.
A espécie I é mais próxima relacionada de P do que de L.
A espécie W possui igual proximidade de relacionamento entre V e X.
 A espécie N é mais próxima relacionada de Q do que de M.
 
02925 - NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS  
 
 4. Ref.: 6045464 Pontos: 1,00  / 1,00
Pesquisadores do Grupo Pardini em parceria com a UFMG desenvolveram um teste de genotipagem para as
variantes P.1 (Manaus), P.2 (RJ) e B.1.1.7 (Reino Unido) do SARS-CoV-2. A partir da sequência genética de cada uma
das variantes do vírus causador da covid-19, eles desenvolveram um par de primers que vão "grudar"  naquela
sequência exata do vírus.
(Fonte: https://www1.folha.uol.com.br/equilibrioesaude/2021/04/laboratorio-lanca-teste-capaz-de-identi�car-
variantes-do-coronavirus.shtml).
Qual das características abaixo contribui para que os primers usados sejam bastante especí�cos para a região do
genoma que contém a mutação?
Porcentagem baixa de guanina (G) e citosina (C) ao longo da sequência (menor que 40%).
Temperatura de melting baixa, menor que 55°C.
 Comprimento su�cientemente grande, maior que vinte nucleotídeos.
Produtos ampli�cados maiores que 100pb.
Temperatura de anelamento baixa, menor que 50°C.
 5. Ref.: 6045572 Pontos: 1,00  / 1,00
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A frase abaixo está incorreta.
"O NCBI contém o RefSeq, que representa a subdivisão do GenBank, que contém sequências de processamento
alternativo de forma não curada e redundante em determinado genoma."
Escolha a alternativa que explica onde está o erro.
 
O RefSeq não é uma subdivisão do GenBank.
O RefSeq é um banco de dados de artigos cientí�cos.
 O RefSeq é um banco curado e não redundante.
O RefSeq não está contido no portal do NCBI.
O RefSeq não é um banco de dados.
 6. Ref.: 6045539 Pontos: 1,00  / 1,00
Uma árvore �logenética busca desvendar a história evolutiva de um grupo de organismos. Isso pode ser feito a partir
da comparação de sequências biológicas. Uma boa estratégia é escolher um gene que todas as espécies comparadas
possuam, e identi�car a partir de alinhamentos as similaridades entre as sequências de cada espécie. Supondo que
você irá comparar a sequência completa do gene para DNA polimerase de 50 espécies bacterianas diferentes, qual o
tipo de alinhamento é o mais adequado nessa situação?
Alinhamento local e global.
Alinhamento múltiplo e local.
Alinhamento simples e múltiplo.
Alinhamento simples e local.
 Alinhamento múltiplo e global.
 
03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA  
 
 7. Ref.: 6054821 Pontos: 1,00  / 1,00
Eduarda é bioinformata e trabalha com a análise de genomas. Seu chefe lhe enviou um arquivo com várias
sequências de genes separadas. Ele disse que precisava que ela terminasse o processo de anotação genômica, e que
estava faltando apenas a última etapa, de anotação funcional. O que Eduarda precisa fazer com esses dados para
realizar a anotação funcional?
Armazenar as sequências de nucleotídeos correspondentes aos genes em um arquivo de sequência, como o
formato FASTA.
Determinar a estrutura tridimensional das proteínas codi�cadas pelos genes por meio da técnica de
Ressonância Magnética Nuclear (RMN).
Comparar as sequências dos genes entre si, identi�cando o maior número de similaridade entre elas.
 Comparar a sequências de proteínas traduzidas a partir dos genes com sequências presentes em bancos de
dados curados como o UniProtKB/Swiss-Prot.
Encontrar regiões de sobreposição entre as sequências dos genes, a �m de montar o genoma �nal.
 8. Ref.: 6055040 Pontos: 1,00  / 1,00
Existem diferentes bancos de dados biológicos que podem ser acessados de acordo com o interesse de pesquisa.
Qual dos bancos abaixo é o principal reservatório de informações sobre sequências de proteínas, cujos dados são
curados, validados por especialistas e revisados.
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javascript:alert('C%C3%B3digo da quest%C3%A3o: 6054821.');
javascript:alert('C%C3%B3digo da quest%C3%A3o: 6055040.');
javascript:alert('C%C3%B3digo da quest%C3%A3o: 6055040.');
PubMed.
GenBank.
PDB.
 Swiss-Prot.
KEGG.
 
03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA  
 
 9. Ref.: 6075099 Pontos: 1,00  / 1,00
Adaptada de UPENET/IAUPE - 2017 - UPE ¿ Biólogo) Ao compararmos um gene e uma proteína, �camos restritos a
tratar da sequência de DNA, que se estende entre os pontos correspondentes às extremidades da proteína. O
processo pelo qual um gene dá origem a uma proteína é chamado expressão gênica. Nesse contexto, observe as
sequências selvagem (esquerda) e mutante (direita) da cadeia β da hemoglobina.
Para responder, utilize a tabela de códons a seguir:
Após analisar as sequências de nucleotídeos normal e selvagem e a tabela de códon, analise a relação entre as
assertivas a seguir:
I. A diferença entre o DNA selvagem e mutante da cadeia β da hemoglobina, é devido a uma mutação silenciosa após
a troca do nucleotídeo A pelo T.
PORQUE
II. A alteração no nucleotídeo de A pelo T não altera o aminoácido que é adicionado na cadeia peptídica, sendo nos
dois casos adicionados a alanina.
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta:
 As asserções I e II são proposições falsas.
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justi�cativa da I.
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As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justi�cativa da I.
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa.
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira.
 10. Ref.: 6075023 Pontos: 1,00  / 1,00
Observe a �gura a seguir:
Conceitualmente, a estrutura das proteínas pode ser dividida em quatro diferentesníveis de organização: primário,
secundário, terciário e quaternário. Baseado na �gura e em seus conhecimentos, assinale a alternativa correta.
A estrutura terciária é formada por α-hélices, folhas-β e regiões de loop.
 A estrutura primária é constituída pelas ligações peptídicas, que são interações entre resíduos de
aminoácidos formando uma cadeia peptídica.
A estrutura quaternária é formada pelas interações entre as α-hélices, folhas-β e regiões de loop de uma
única subunidade.
A estrutura terciária é constituída pelas ligações peptídicas, interações entre resíduos de aminoácidos
formando uma cadeia peptídica.
A estrutura secundária é formada pela união de diferentes subunidades.
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