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Material de Estudo - Bioinformática - 32 1. Qual formato de arquivo é comumente utilizado para armazenar sequências biológicas (DNA, RNA ou proteínas) e suas respectivas anotações, como identificadores, descrição e informações sobre as características da sequência? a) .txt b) .csv c) .fasta d) .xml e) .pdb Resposta: c) O formato FASTA é um padrão para representar sequências biológicas. 2. Qual algoritmo de alinhamento de sequências é mais adequado para encontrar similaridades locais significativas entre duas sequências biológicas, permitindo identificar regiões conservadas ou domínios compartilhados? a) BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). b) Needleman-Wunsch. c) Smith-Waterman. d) ClustalW. e) Phylip. Resposta: c) Smith-Waterman realiza alinhamento local ótimo. 3. Qual banco de dados público contém informações sobre a estrutura tridimensional de proteínas e ácidos nucleicos, obtidas por cristalografia de raios X, ressonância magnética nuclear (RMN) e microscopia eletrônica? a) GenBank. b) UniProt. c) PDB (Protein Data Bank). d) KEGG. e) GO (Gene Ontology). Resposta: c) O PDB é o principal repositório de estruturas biomoleculares. 4. Qual método computacional é utilizado para construir árvores filogenéticas, representando as relações evolutivas entre diferentes espécies ou genes, com base em dados de sequências moleculares? a) Alinhamento múltiplo de sequências. b) Análise de componentes principais (PCA). c) Inferência filogenética. d) Modelagem molecular. e) Docking molecular. Resposta: c) A inferência filogenética estima as relações evolutivas. 5. Qual ferramenta bioinformática é utilizada para realizar anotação funcional de genes e proteínas, classificando-os em categorias com base em seus processos biológicos, funções moleculares e componentes celulares? a) BLAST. b) UniProt. c) GO (Gene Ontology). d) KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes). e) STRING. Resposta: c) A Gene Ontology fornece um sistema de classificação funcional hierárquico. 6. Qual técnica de análise de dados de sequenciamento de nova geração (NGS) é utilizada para identificar variações genéticas em um genoma, como polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e pequenas inserções ou deleções (indels)? a) Montagem de genomas (genome assembly). b) Alinhamento de leitura (read alignment). c) Chamada de variantes (variant calling). d) Análise de expressão gênica (gene expression analysis). e) Metagenômica. Resposta: c) A chamada de variantes identifica diferenças em relação a um genoma de referência.