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Regulação da Expressão Gênica Prof. Eldo Campos O que é? Os mecanismos que regulam o processo de transcrição do DNA para sintetizar RNA, e, posteriormente, a tradução desses para gerar proteínas, são conhecidos como a regulação da expressão gênica. Por que é necessária? Somente uma fração dos genes é expressa na célula em um dado momento. A quantidade dos produtos gênicos varia. A necessidade de alguns produtos gênicos muda com o tempo. A síntese protéica tem alto custo energético. Para a síntese de uma proteína com ~300aa: 1.350 moléculas de ATP 1.650 átomos de C 540 átomos de N Regulação da Expressão Gênica • A expressão gênica pode ser regulada, teoricamente, em todos os passos desde o DNA até a síntese protéica. Possíveis pontos de controle da expressão gênica em eucariotos Elementos importantes Genes essenciais – seus produtos são necessários em qualquer condição Gene com expressão constitutiva – genes expressos de forma constante Genes com expressão regulada – seus produtos aumentam ou diminuem em resposta a sinais moleculares Genes reprimíveis – seus produtos diminuem em resposta a um sinal molecular Genes induzíveis – seus produtos aumentam sob certas circunstâncias moleculares A transcrição é mediada e regulada por interação DNA-proteína. Ligação da RNA pol. ao promotor Seqüência consenso para vários promotores de E. coli Sequência consenso para genes heat-shock em E. coli Fatores σ alternativos de E. coli Fator associado Fator associado GeneGene Função e características relevantesFunção e características relevantes !70!70 rpoDrpoD Reconhecimento de promotores canônicos de expressão regular. Reconhecimento de promotores canônicos de expressão regular. !32!32 rpoHrpoH Reconhecimento de promotores de genes ligados ao choque térmico (heat-shock). Reconhecimento de promotores de genes ligados ao choque térmico (heat-shock). !28!28 rpoFrpoF Reconhecimento de promotores de genes flagelares e de quimiotaxia. Reconhecimento de promotores de genes flagelares e de quimiotaxia. !54!54 rpoNrpoN Reconhecimento de promotores de genes ligados ao metabolismo de nitrogênio. Reconhecimento de promotores de genes ligados ao metabolismo de nitrogênio. !20!20 rpoErpoE Reconhecimento de promotores de genes ligados ao choque térmico (heat-shock) extremo. Reconhecimento de promotores de genes ligados ao choque térmico (heat-shock) extremo. Proteínas que regulam a iniciação da transcrição através da RNA polimerase Fatores de especificidade – altera a especificidade da RNA pol. pelo promotor (fator σ) Repressores – impedem o acesso da RNA pol. ao promotor Ativadores – potencializam a interação entre a RNA pol. e o promotor • A expressão gênica é controlada por proteínas reguladoras. Proteínas Reguladoras Expressão gênica Ativadores Expressão positiva Repressores Expressão Negativa Regulação da transcrição gênica Ligação entre proteína e DNA Proteínas regulatórias geralmente se ligam a seqüência específicas do DNA. As proteínas regulatórias possuem domínios de ligação ao DNA, que incluem um ou mais motivos estruturais. Motivos de ligação ao DNA em proteínas regulatórias Hélice-volta-hélice (helix-turn-helix) Em laranja e vermelho Cinza – repressor lac Azul – DNA Vermelho – Grupos que interagem por pontes de H La ran ja – Grupos que interagem por interação hidrofóbica Motivos de ligação ao DNA em proteínas regulatórias Dedo de zinco (zinc finger) Três dedos de zinco ligados ao DNA Comum em proteínas eucarióticas Poucos exemplos em procariotos. Mecanismos de controle da iniciação da transcrição Utilização da lactose Uma bactéria, como E. coli, pode utilizar a lactose como fonte de carbono e energia para o seu crescimento. Transportador de lactose Lactose permease de E. coli Transportador simporte Utilização da lactose no metabolismo Stryer, p. 459. A galactose 1-fosfato é convertida a glicose 6-fosfato através de uma série de reações. Detecção da atividade de β- galactosidase A adição de lactose a uma cultura de E. coli faz com que a produção de β-galactosidase aumente. Operon da lactose (lac) Proteínas sintetizadas pelo operon lac: 1. β-galactosidase (gene z) – enzima que cataliza a hidrólise da lactose em galactose e glicose; 2. galactosídeo permease (gene y) – transporte de lactose através da membrana celular da bactéria; 3. tiogalactosídeo transacetilase (gene a) – parece ter um papel na eliminação de compostos que também podem ser transportados pela permease. p = promotor gene i = codifica o repressor o = operador Stryer, 5a. ed. p. 893. Regulação negativa do operon lac Estrutura do repressor lac Estrutura do repressor lac Sítio de ligação ao DNA Repressor lac ligado ao DNA volta formada no DNA Regulação da Expressão do Operon lac Lactose ausente 1. Repressor lac ligado ao DNA 2. Transcrição reprimida Lactose presente 1. Alolactose ligada ao repressor lac 2. Repressor lac desligado do DNA 3. Transcrição ocorre Glicose ou Lactose? CAP (proteína ativadora do catabolismo) Estrutura da proteína CAP DNA Duas subunidadescAMP PDB 1cgp PDB 1iw7 RNA polimera se CAP DNA Contato entre o DNA e a C A P, f e i t o a t ravés de duas a r g i n i n a s e u m g l u t a m a t o n a proteína. O operon triptofano (trp) A bactéria E. coli é capaz de sintetizar os 20 aminoácidos necessários à síntese de proteínas. Os genes necessários à síntese de um dado aminoácido são geralmente agrupados em um operon. O operon trp de E. coli inclui cinco genes para as enzimas necessárias à conversão do corismato ao triptofano. Regulação do operon trp por atenuação A proteína repressora trp DNA Dímero As cadeias estão em azul e cinza triptofano Seqüência responsável pelo mecanismo de atenuação Formam uma estrutura em grampo por pareamento de bases que age como um terminador de transcrição O pareamento de bases NÃO permite a formação do atenuador e a transcrição continua Peptídeo líder Determina se haverá pareamento de bases entre as regiões 2 e 3 ou 3 e 4 Atenuação em alta concentração de Trp Transcrição em baixa concentração de Trp Regulação da expressão gênica em eucariotos Remodelamento da cromatina Região N-terminal Co-ativador Ativador Co-repressor Repressor Histonas acetiladas: Cromatina ativa Histonas desacetiladas: Cromatina inativa Grupo Acetil (Ac) Lisina Região N-terminal Co-ativador Ativador Co-repressor Repressor Histonas acetiladas: Cromatina ativa Histonas desacetiladas: Cromatina inativa Grupo Acetil (Ac) Lisina Acetilação das histonas pelas histonas transacetilases (HAT) Fatores de remodelamento da cromatina (SWI/SNF) estimulam a ligação de fatores de transcrição A acetilação diminui a afinidade do nucleossomo pelo DNA e impede ou promove a interação de proteínas envolvidas na regulação. Um código de histona Fatores específicos
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