Bioquímica - Função das Proteínas.pdf

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Aula de Bioquímica I
Tema:
Função de Proteínas:
Mioglobina e Hemoglobina
Prof. Dr. Júlio César Borges
Depto. de Química e Física Molecular – DQFM
Instituto de Química de São Carlos – IQSC
Universidade de São Paulo – USP
E-mail: borgesjc@iqsc.usp.br
Proteínas
Funções
Transporte e Estoque;
Catálise enzimática;
Movimento;
Suporte mecânico;
Proteção imune;
Sinalização intra e extracelular;
etc.
Variedade Funcional  Diferentes Estruturas Tridimensionais
Estrutura 3D  Estrutura Estável em função do tempo
Estabilidade versus flexibilidade
Função versus Conformação.
Como as Proteínas Funcionam
Grande maioria → interação com outras moléculas
Interações reversíveis → ligante (qualquer tipo de molécula, inclusive proteína);
***Natureza transitória das interações proteína-ligante***
↓
VIDA
↓
RESPOSTA RÁPIDA E REVERSÍVEL A MUDANÇAS AMBIENTAIS E CONDIÇÕES
METABÓLICAS
SÍTIO DE LIGAÇÃO
→ Interação específica
→ Acoplada a uma mudança conformacional → ENCAIXE INDUZIDO
*ENZIMAS: Substratos; Sítio catalítico ou Sítio ativo.
Introdução
 Organismos aeróbicos  Necessitam de suprimento de O2 constante
Organismos multicelulares vertebrados
- Desenvolvimento de sistema circulatório
- Desenvolveram proteínas de transporte de O2
1 – Mioglobina  músculo 
- mantém suprimento local de O2
2 – Hemoglobina  sangue  hemácias 
- Transporta O2 dos pulmões para os tecidos
- Transporta CO2 e H3O
+ dos tecidos para os pulmões
Mioglobina versus Hemoglobina
- São similares na Estrutura Primária, Secundária e Terciária
- Ligam O2 de maneira muito similar
- Em condições similares aos tecidos, a Hemoglobina está 7% saturada com O2 enquanto 
que a Mioglobina apenas 90% saturada
- Hemoglobina liga O2 de maneira cooperativa e é uma proteína alostérica
- Ambas são importantes proteínas-modelo de estudo Bioquímico
Grupo Prostético = Heme
A ligação O2 pelas globinas depende do grupo Heme
 Grupo Heme  Protoporfirina + Fe2+ =  responsável pela cor vermelha do sangue
- Protoporfirina  4 anéis pirrólicos (anel tetrapirrólico) 
- 8 Cadeias Laterais = 4 metilas, 2 vinilas e 2 Ácidos Caboxílicos
- Ferro é coordenado no centro pelos átomos de Nitrogênio dos 4 grupos Pirróis.
Porfirina Heme Fe2+
Coordenação 
Hexagonal
Holomioglobina
Grupo heme está ligado à apoproteína: 
1) pelo ocupação do Quinto ponto de coordenação do Fe2+ pela His proximal
2) Interações Hidrofóbicas do anel tetrapirrólico
- Sexto ponto de coordenação do Fe2+ é ocupado pelo O2
- Na forma deoxi, a His Proximal retira o Fe2+ do plano central da porfirina
Holomioglobina
Grupo heme permite monitoramento: 
Holomioglobina
 1º Proteína a ter a sua estrutura 3D resolvida
- Estrutura em Hélices Alfa - Possui 153 resíduos de AA
- Total de 8 hélices anfipáticas – nomeadas de A a H
 Grupo Heme está ligado entre as hélices E e F
- Hélice alfa F contém a His Proximal (Chamada de His F8)
- Hélice alfa E contém a His Distal (Chamada de His E7)
Holomioglobina
 Grupo Heme está ligado entre as hélices E e F
- Hélice alfa F contém a His Proximal (Chamada de His F8)
- Hélice alfa E contém a His Distal (Chamada de His E7)
 A ligação O2–Fe
2+ gera a 
transferência parcial de 1 
elétron do Fe2+ para o O2
 forma o íon superóxido
O2
-
 A His E7 estabiliza o O2
ligado ao Fe2+ por uma 
ligação de H;
 Evita a formação do 
íon superóxido;
- O componente protéico 
estabiliza a reatividade do 
O2
Interação Proteína-Ligante 
pode ser quantificada
Proteínas são capazes de interagir especificamente com ligantes
A interação Proteína P com o Ligante L obedece as leis da Termodinâmica
Questões apresentadas
1) Qual é o máximo número de moles de ligante por proteína? 
2) Qual é a constante de equilíbrio deste ligante por cada um dos sítios de ligação?
3) A constante de equilíbrio do L por cada um dos sítios é independente da ocupação dos 
demais?
4) A constante de equilíbrio do L é modificada pela presença de um segundo ligante?
P + L PL
k1
k2
Interação Proteína-Ligante 
pode ser quantificada
A interação Proteína P com o Ligante L obedece as leis da Termodinâmica
k1 e k2 são as constantes de velocidade de associação e dissociação
KA e KD são as constantes de equilíbrio no sentido de associação e dissociação
KA é dado em (mol/L)
-1 (M-1) Quanto maior o valor de KA maior a afinidade da interação PL
KD é dado em mol/L (M) Quanto menor o valor de KD maior a afinidade da interação PL
 Quando a [L] é >>> [P] podemos considerar que a formação do PL não altera a [L]
 A fração de Sítios de ligação na P frente ao L pode ser descrita pela seguinte equação
P + L PL
k1
k2
A
DAeq
K
K
LP
PL
k
k
KK
1
]][[
][
2
1 
][][
][
sDisponívei Sítios de Total
Ocupados Sítios
PPL
PL


Interação Proteína-Ligante 
pode ser quantificada
Θ pode ser monitorado e seu valor em função da [L] resulta numa hiperbólica retangular
][][
][
PPL
PL


]][[][
]][[
][
LPKPL
LP
PL
K AA 
D
A
A
A
A
A
KL
L
K
L
L
LK
LK
PLPK
LPK








][
][
1
][
][
1][
][
][]][[
]][[
Dividindo 
ambos os 
por [P]
Dividindo 
ambos por 
KA
D
A
K
K

1
Quando [L] = KD  [L]
onde metade dos sítios 
de ligação estão 
ocupados pelo Ligante
 Para 90% de 
saturação [L] = 9 x KD
Substituindo [PL]
Interação Mioglobina-O2
A interação entre a mioglobina e O2 segue as leis da termodinâmica mesmo considerando o 
Oxigênio como gás
- Adequação experimental e matemática é necessária
DKO
O
θ


][
][
2
2
Se P50 = [O2] na qual metade 
dos sítios estão ocupados
Quando pO2 for equivalente à metade do 
sinal máximo temos KD e assim podemos 
definir P50
DKpO
pO
θ


2
2
O2 liga fortemente à 
mioglobina com um P50 de 
0.26 kPa
- Condição na qual metade 
dos sítios estão ocupados
A [O2] em solução depende 
diretamente da pressão de O2 na 
atmosfera que pode ser controlada.
502
2
PpO
pO
θ


DKP 50
Estrutura da Hemoglobina
 A Hemoglobina é um heterotetrâmero
- Duas cadeias Alfa (141 resíduos) e duas cadeias Beta (146 resíduos)
- Possui estrutura em hélice alfa
 Hemoglobina A (HbA) = par de dímeros α1β1 e α2β2
- A interface α1β1 e α2β2 apresenta ~30 contatos
- A interface α1β2 e α2β1 apresenta ~19 contatos
 Maioria hidrofóbicos e alguns hidrofílicos  Importantes para regulação
- Grupos Heme estão bem separados (24-40 Å)
Estrutura da Hemoglobina
 Cadeia Alfa e Beta da HbA apresentam ~25% de identidade com a Mioglobina
 Alta identidade estrutural
- Apesar da baixa identidade sequencial
- Identidade estrutural é mais conservada 
 Mesma forma de ligar grupo Heme
-Possui His Proximal e Distal
Estrutura da Hemoglobina
 A HbA liga O2 de maneira cooperativa – curva Sigmoidal
- A ligação de O2 com HbA é >10 x mais fraca do que com a Mioglobina
- A ligação ou saída de O2 em uma cadeia da HbA aumenta a ligação ou a saída de O2 nas 
demais cadeias
 A baixa afinidade da HbA por O2 está relacionada com a função desta proteína
- Captar O2 nos pulmões (“alta” pO2) e liberar nos tecidos (“baixa” pO2)
 A alta afinidade da Mioglobina por O2 está relacionada com a função: Armazenar O2
Cooperatividade
 A Alosteria – “outra forma” – está envolvida na cooperatividade
Sistema de variação de afinidade/atividade frente à 
modulação.
 Envolve a participação de um Modulador
- Modulador  Ativador ou inibidor
- Modulação homotrópica: Ligante e modulador iguais- Modulação heterotrópica: Ligante e modulador diferentes
 Uma curva de ligação sigmoidal é um sinal de ligação 
cooperativa.
Cooperatividade
 A ligação cooperativa de O2 na HbA foi analisada por Archibald Hill (1910)
P + nL PLn
k1
k2 n
n
Aeq
LP
PL
k
k
KK
]][[
][
2
1 
D
n
K
L
θn
θ ][


DKnLn
θn
θ
log]log[log 






Equação de Hill
1][
][


n
An
n
An
LK
LKn

1) Reorganizando
2) Dividindo ambos por KA
3) Substituindo por KD
 Curva de Hill  log [θ/(1-θ)] versus log[L] onde a inclinação = n = nH
Aplicando Log
Cooperatividade
 A ligação cooperativa de O2 na HbA foi analisada por Archibald Hill (1910)
   502 log0loglog Pnpn
θn
θ







nH não representa o número de sítios 
de ligação, mas o grau de interação 
entre eles: o grau de cooperatividade
 nH representa a cooperatividade
entre os sítios de ligação
 nH < n
Ligação de O2 na Hemoglobina
 Em exercício, o sangue arterial, após uma passagem pelo pulmão, apresenta ~98% de 
saturação da HbA com O2
 Após passar pelos tecidos, o sangue venoso apresenta ~32% de saturação de O2
- Portanto, ~66% dos pontos de ligação contribuíram para o transporte de O2
 A ação cooperativa da HbA favorece a DESCARGA adequada de O2
- Nestas condições, a Mioglobina permaneceria com 91% de saturação  7% de transporte
 A HbA transporta ~10 x mais O2 do que a Mioglobina
O2
A cooperatividade da HbA
 A ligação de O2 na HbA resulta em mudanças conformacionais na tetrâmero de HbA-O2
- Um dímero Alfa-Beta sofrem rotação de 15º em relação ao outro
 A HbA existe em duas conformações principais:
1) T (Tenso)  Estado deoxigenado
2) R (Relaxado)  Estado Oxigenado
- O Estado R apresenta maior afinidade por O2 do que o estado T
- Na presença de O2, o estado R é mais estável
A cooperatividade da HbA
 Estado T apresenta um intricada rede de pares iônicos na interface α1β2 e α2β1
 A ligação de O2 altera a estrutura do grupo Heme que perturba a rede de pares iônicos
- Mudanças no 
ambiente do grupo 
Heme são 
transmitidas para 
as outras cadeias 
do oligômero
A cooperatividade da HbA
 Estado T apresenta um intricada rede de pares iônicos na interface α1β2 e α2β1
 A ligação de O2 altera a estrutura do grupo Heme que perturba a rede de pares iônicos
A cooperatividade da HbA
 A HbA pura no estado T é muito instável
- Liga avidamente O2 em baixas [O2] e libera apenas 8% de O2 em condições fisiológicas
 A transição T  R adequada depende de um ligante – o 2,3-Bisfosfoglierato – 2,3-BPG
 A [2,3-BPG] nas hemácias 
é aumentada na altitude.
- Adaptação em ~ 24 horas
- Permite menor afinidade 
entre HbA-O2
- A HbA liga menos O2, 
MAS descarga de O2 nos 
tecidos é MAIOR apesar da 
menor pO2 atmosférica
A cooperatividade da HbA
 Efeito do 2,3-Bisfosfoglierato – 2,3-BPG na p50
A cooperatividade da HbA
O 2,3-BPG:
1) Liga-se no centro do Tetrâmero da HbA;
2) É liberado após transição T  R;
3) Age mantendo HbA no Estado T;
4) É um Efetor Alostérico.
A cooperatividade da HbA
A transição T  R expulsa o BPG do sítio de ligação
Estado REstado T
A Hemoglobina Fetal
- A Hb fetal contem duas cadeia Alfa e duas cadeias Gama 
 A cadeia Gama é 72% idêntica à cadeia Beta na seqüência de aminoácidos
- A modificação Beta-His143  Gama-Ser143
- Modifica o sítio de interação do 2,3-BPG com a Hb
Consequências:
- Redução da afinidade da Hb Fetal por 2,3-BGP
- Aumento da afinidade da Hb Fetal por O2
 Permite que a Hb Fetal receba 
eficientemente o O2 transportado pela HbA
maternal
- O feto não “experimenta” pO2 atmosférica
Outros genes
 Existem outras 3 cadeias de hemoglobina 
expressas em diferentes estágios do 
desenvolvimento
Existem ainda: Neuroglobina e citoglobina
(+ similares à mioglobina)
A HbA transporta H+ e CO2 
dos tecidos para o pulmão
 A HbA é sensível aos níveis de H+ e CO2 nos tecidos
- H+ e CO2 são efetores alostéricos da HbA  aumentam a liberação de O2 para os tecidos
 O estado T é estabilizado pela redução do pH
- Resultado: descarga de O2 nos tecidos
 É chamado de Efeito Bohr (Christian Bohr, pai de Niels Bohr)
 O CO2 é hidratado pela enzima 
Anidrase Carbônica nas hemácias
 A afinidade da HbA por O2
diminui com a redução do pH
A HbA liga H+ e CO2 
 A HbA transporta H+ dos tecidos para o pulmão
 A Hidratação do 
CO2 é catalisada 
pela Anidrase
carbônica
No capilar sanguíneo (tecidos)
O próton liberado pela 
hidratação do CO2 liga-se à cadeia 
alfa e beta da HbA estabilizando 
uma ponte salina  estabilização 
do estado T
 Permite o transporte de próton 
para os pulmões 
- 80% do transporte
Ponte salina na 
interface α2β1
A HbA liga H+ e CO2 
 A HbA transporta CO2 dos tecidos para o pulmão
 O CO2 liga-se à aminas terminais 
- ~15-20% do transporte ligado à HbA
- Restante é transportado na forma de HCO3
- solúvel
 Forma grupos carbamato  carga negativa
 Estabiliza estado T por favorecer interações 
eletrostáticas na interface cadeia Alfa-Beta da HbA
Descarga de O2 pela HbA
66%
77%
88%
Mutações na HbA
 Os genes da Hb sofrem mutações que alteram a cadeia protéica
- Podem prejudicar a afinidade da Hb pelo O2
- Originam as Hemoglobinopatias – são as anemias hereditárias 
- ~ 500 tipos de mutações identificadas na população humana
- Muitas mutações são inócuas
- O Surgimento da anemia depende se o indivíduo é heterozigoto ou homozigoto
 Anemia falciforme 
- devido à mutação D6V na cadeia 
Beta
- Forma a Hemoglobina S
- Forma um contato hidrofóbico com 
a F85 e V88 entre as cadeias beta 
inter-tetrâmeros
Mutações na HbA
 As pontes hidrofóbicas inter-cadeias propicia a fibrilação
Mutações na HbA
 As pontes hidrofóbicas inter-cadeias precipitam a HbS  não liga O2 
Mutações na HbA
A HbS forma fibras que deformam a estrutura das hemácias
 HbS aumenta resistência à malária  parasita vive dentro das hemácias
-possível fator seletivo positivo da HbS  por isto foi “selecionada” e persiste presente