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Introdução à bioquímica Élio Waichert Júnior Classes de biomoléculas Simplicidade no complexo: Existem somente 4 classe de macromoléculas na bioquímica cada uma formada por seu respectivo conjunto de blocos construtivos Proteínas Polissacarídeos Ácidos nucléicos Lipídeos UNIDADE CONSTRUTUVA (TIJOLO) O O- N O H H OH H H O O O O O O EXEMPLO insulina RNA (ácido ribonucléico) celulose Triacil glicerol (banha) CLASSE Aminoácido nucleotídeo açúcar Ácido graxo (também glicerol e outros componentes) Funcionalidade nos sistemas biológicos Nos sistemas biológicos tudo tem função desde membros, órgãos e tecidos Olhosvisão Pernaslocomoção Intestinodigestão Isso também é verdade a nível celular Eritrócitos (hemácias, células vermelhas do sangue)transporte de O2 Neurôniossinalização e processamento nervoso E também é verdade no nível molecular. Tanto para moléculas como para vias metabólicas Anticorpos(proteínas) Enzimas(proteínas) Glicose Via glicolítica Via da biossíntese de glicogênio Compreender a função de cada sistema bioquímico é muito importante porque só assim é possível saber porque, afinal de contas, ele existe e como ele interage com outros sistemas cada um com sua função Resposta imune Catálise Combustível biológico Obtenção de energia pela oxidação da glicose Armazenamento de combustível na forma de glicogênio Macromoléculas biológicas Macromolécula Polimerização Unidade construtiva Característica notável OBS Proteínas Polímero linear Aminoácido Catálise Muitas funções Extremamente versátil quanto à forma e à função Ácidos nucléicos Polímero linear Nucleotídeo Auto replicação Polissacarídeos Polímero linear/ramificado Monos- sacarídeos Usado como Reserva de energia Estruturas muito resistentes A celulose á a biomolécula mais abundante na Terra Lipídeos Não são polímeros Ácido graxo e outros Forma membranas Muito variados quanto as unidades constitutivas Composição percentual de biomoléculas numa célula bacteriana % do peso total Número de moléculas deste tipo Água 70 1 Proteínas 15 3.000 Ácidos nucléicos DNA 1 1 RNA 6 >3.000 Polissacarídeos 3 ~5 Lipídeos 2 ~20 Monômeros e intermediários 2 ~500 Íon inorgânicos (Ca2+, Na+, K+, PO4 2-...) 1 ~20 % do peso seco 50 3,3 20 10 6,6 6,6 3,3 ESTRUTURA CELULAR CÉLULAS: UNIDADE FUNDAMENTAL DOS SERES VIVOS. BIOQUÍMICA As células são os menores e mais simples componentes do corpo humano. A maioria das células são tão pequenas, que é necessário juntar milhares para cobrir a área de um centímetro quadrado. As unidades de medida são o micrômetro (µm), o nanômetro (nm) e o angstron (Å). Foi quando estudava a cortiça que Hooke usou pela primeira vez na história da ciência a palavra célula, com o mesmo significado biológico adotado atualmente; descrevia as pequenas celas vazias encontradas no material, formadas pelas paredes das células mortas da casca do sobreiro. • As primeiras observações de células foram feitas no século XVII, por Robert Hooke (um dos maiores gênios das ciências experimentais do século), na Inglaterra. * Cortiça = súber tecido vegetal morto Hierarquia estrutural na organização molecular da célula Célula Organelas Macromoléculas Unidades Monoméricas Nível 4 Nível 3 Nível 2 Nível 1 Radicais livres • Moléculas muito reativas • Apresentam um elétron desemparelhado no orbital externo • Podem iniciar reações em cadeia que levam à formação de novos radicais: • amplifica a capacidade de produzir lesões • Podem atuar como reguladores de atividades celulares • ativação de enzimas, fatores de transcrição, controle de receptores celulares • A formação de novos radicais amplifica a capacidade de produzir lesões Sistemas anti-oxidantes • A SUPERÓXIDO DISMUTASE elimina os radicais superóxido convertendo-os em peróxido de hidrogênio. • O peróxido de hidrogênio produzido por esta reação pode ser metabolizado por duas outras enzimas: – CATALASE: converte peróxido de hidrogênio em oxigênio molecular e água. – PEROXIDASE: converte peróxido de hidrogênio em água. A enzima SUPERÓXIDO DISMUTASE está presente em todos os aeróbios e ausente nos anaeróbios Consiste na explicação para a intolerância dos anaeróbios ao oxigênio As radicais livres estão envolvidos com muitas variedades de doenças humanas Cheeseman 1993 ANTIOXIDANTES Radical THIOL Poucos dos 112 elementos são utilizados nos organismos vivos H + O > 70% H+O+C>95% H+O+C+P>98% macroelementos Microelementos (oligoelementos) Bactéria que se alimenta de arsênio Cientistas norte-americanos descobrem bactéria que se alimenta de arsênio, elemento considerado altamente tóxico, em substituição a outro que seria essencial à sua condição de ser vivo. Publicado em 02/12/2010 | Atualizado em 08/12/2010 “A vida como nós a conhecemos exige elementos químicos específicos e exclui outros”, afirma um dos autores do artigo, Ariel Anbar Esse é o primeiro caso em que um microrganismo é capaz de substituir algum dos seis elementos essenciais à vida (carbono, hidrogênio, nitrogênio, oxigênio, enxofre e fósforo). De acordo com os pesquisadores, as bactérias são capazes de incorporar esse novo elemento ao próprio DNA. O lago em que foi encontrada a nova bactéria é conhecido por ser altamente salino e ter altas concentrações de arsênio • Bactérias existem há mais do que 3,5 bilhões de anos. • Graça às estruturas simples, bactérias podem sobreviver em todos ambientes da terra. • Podem ser encontrados por exemplo no ar, no solo, na água, vulcão, no mar profundo, nas fontes quentes, no gelo, no sal, na pele dos homens, etc. • Em condições desfavoráveis algumas bactérias formam esporos, que podem sobreviver milhões de anos. MORFOLOGIA As formas não são constantes, podem variar de acordo com o meio e com o tipo de associação. As mudanças de forma podem ser consideradas como: Involução - mudança de forma devido à condições desfavoráveis, presença ou ausência de oxigênio, pH, ou por produtos tóxicos, entre outros. Pleomorfismo - a bactéria não apresenta uma morfologia única, mesmo que se encontre em condições favoráveis à sua sobrevivência. PRESENÇA E DISTRIBUIÇÃO DAS BACTÉRIAS NO ORGANISMO HUMANO MICROBIOTA NORMAL AUSENTE: Sangue SNC, LCR, Parênquima VARIAÇÕES: Inter/intra indivíduos, Sexo, Idade, Dieta, Higiene MICROBIOTA NORMAL VANTAGENS DESVANTAGENS Adaptação e multiplicação sem causar dano; Competição com as bactérias patogênicas; Síntese de vitaminas; Produção de anti-microbianos. Perigo de infecção oportunista quando há perda do equilíbrio; Processos inflamatórios locais ou disseminados; Risco de sepse e choque. Microbiota humana Localização Gênero Colon Bacteroides, Clostridium, Escherichia, Proteus Orelha Corynebacterium, Mycobacterium, Staphylococcus Boca Actinomyces, Bacteriodes, Streptococcus Nariz Corynebacterium, Staphylococcus Nasofaringe Streptococcus, Haemophilus (e.g. H. influenzae) Pele Propionibacterium, Staphylococcus, Others (personal hygiene, environment)Uretra Acinetobacter, Escherichia, Staphylococcus Vagina (adulto) Acinetobacter, Corynebacterium, Lactobacillus, Staphylococcus 99,4% 0,6% Composição percentual elementar do corpo humano macroelementos microelementos (oligoelementos) Tanto os macroelementos como os oligoelementos são igualmente essenciais à vida!!! Abundância relativa dos elementos (%) Crosta Terrestre Corpo Humano O 47,0 H 63,0 Si 28,0 O 25,5 Al 7,9 C 9,5 Fe 4,5 N 1,4 Ca 3,5 Ca 0,31 Na 2,5 P 0,22 K 2,5 Cl 0,08 Mg 2,2 K 0,06 Ti 0,46 S 0,05 H 0,22 Na 0,03 C 0,19 Mg 0,01 alanina (aminoácido) glicose 0,5nm 89Da 0,7nm 180Da 3 ,5 n m Mioglobina (uma proteína pequena) 16.900Da Fosfolipídeo 750Da Escala de tamanho em bioquímica Escala de tamanho em bioquímica (cont.) 3,5nm Mioglobina 16.900Da 6,8nm Hemoglobina (proteína média) 65.000Da 6,8nm Hemoglobina 65.000Da miosina 160nm 470.000Da Escala de tamanho em bioquímica (cont.) 25nm Bacteriófago FX-174 Um dos menores vírus conhecidos 6.200.000Da 16nm Ribossoma de E.Coli 2.800.000Da miosina 160nm 470.000Da Vírus do mosaico do tabaco 300nm 40.000.000Da Escala de tamanho em bioquímica (cont.) 9.000nm 9mm Hemácia (célula vermelha do sangue) 2.000nm 2mm E coli bactéria Cloroplasto de espinafre 8.000nm 8mm Mitocôndria de hepatócito 1,5mm Vírus do mosaico do tabaco Escala de tamanho em bioquímica (cont.) Célula do fígado 20.000nm 20mm Escala de tamanho das estruturas biológicas Metro (m) 100 metro Milímetro (mm) 10-3 metro Micrômetro (mm) 10-6 metro Nanômetro (nm) 10-9 metro alanina (0,5nm) glicose 0,7nm Vírus do mosaico do tabaco 300nm Mitocôndria 1,5mm Hemácia 9mm Humano 1,7 m Hemoglobina 6,8nm Célula do fígado 20mm Vírus FX-174 25nm Origem das biomoléculas Aparelho para demonstrar a abiótica formação de biomoléculas simulando as condições da atmosfera primitiva Mistura de NH3 (amônia) H2(hidrogênio) CH4 (metano) e água 80oC C en te lh as Condensador Eletrodos Compostos produzidos neste experimento Glicina (aminoácido) Alanina (aminoácido) Acido a-aminobutírico N-metil alanina Ác. Aspártico (aminoácido) Ác. glutâmico (aminoácido) Ác. Acético Ác succínico (intermediário do ciclo de Krebs) Uréia ...muitos outros Um esquema possível para a evolução molecular Surgimento do genoma de DNA Desenvolvimento de um sistema de tradução primitivo. Genoma de RNA e catalizadores RNA-Proteína Co-evolução do RNA e das proteínas Síntese de peptídeos catalizada por RNA Surgimento de moléculas de RNA com atividade catalítica auto-replicativa Produção de pequenas moléculas de RNA com seqüências aleatórias “Sopa” pré-biótica contendo diversas biomoléculas originadas de precurssores na atmosfera primitiva 4,5 Bilhões de anos Surgimento da Terra 3,5 Bilhões de anos Primeiro microorganismo fóssil 4,0 Bilhões de anos Formação dos oceanos e continentes Bioquímica: Composição dos Seres Vivos Substâncias Inorgânicas: moléculas pequenas. • Água • Sais Minerais Substâncias Orgânicas: moléculas complexas, formadas por cadeias carbônicas. • Glícídios (carboidratos) • Lipídios • Proteínas • Vitaminas • Ácidos Nucleicos Água • Está presente em todos os seres vivos. • Solvente universal. • Muitas reações químicas corporais dependem dela. • Possui função termorreguladora. • Quantidade de água no corpo varia com a idade, o metabolismo e a espécie. • Queda na quantidade de água, no corpo dos seres vivos, pode provocar desidratação. @BIO318 Sais Minerais • Estão presentes em pequenas quantidades nas células. • São essenciais para o metabolismo. • A carência de sais minerais pode provocar o mal funcionamento do organismo. • São exemplos de sais minerais: magnésio, sódio, ferro, potássio, fosfato, iodo, cálcio, cloro, flúor, enxofre, zinco, selênio etc. @BIO321 Carboidratos • Também chamados de açúcares ou glicídios. • Maioria dos carboidratos possuem função energética, mas podem atuar na constituição estrutural e genética. • São formados por átomos de carbono, hidrogênio e oxigênio. • Podem ser classificados em: monossacarídeos, oligossacarídeos e polissacarídeos. • Menores moléculas de carboidratos. • Fórmula geral: Cn(H2O)n – onde n= nº de C. • Exemplos: trioses, tetraoses, pentoses e hexoses. Carboidratos: Monossacarídeos Carboidratos: Monossacarídeos Carboidratos: Oligossacarídeos • Formados por até 10 monossacarídeos. • A união de 2 ou mais monossacarídeos ocorre através da reação de desidratação (perda de uma molécula de água). • Os dissacarídeos são os oligossacarídeos mais importantes. Carboidratos: Oligossacarídeos Exemplos de dissacarídeos: Carboidratos: Polissacarídeos • Formados por mais de 10 monossacarídeos. Exemplos de polissacarídeos amido, celulose, glicogênio, quitina etc. Lipídios • Possuem função energética e estrutural. • Apresentam maior quantidade de energia que os carboidratos. • São a 2ª fonte de energia do organismo. • São formados por uma molécula de glicerol ligada a três cadeias de ácidos graxos. • São insolúveis em água. Lipídios Lipídios • Colesterol, quando em excesso o LDL pode se depositar nas artérias causando a aterosclerose ou infarto do miocárdio. (fato?) Lipídios Níveis aceitáveis de colesterol LDL de acordo com a American Heart Association: Proteínas • Substâncias orgânicas mais abundantes nos seres vivos. • Possuem função estrutural, enzimática, hormonal, imunológica etc. • São formadas por átomos de carbono, hidrogênio, oxigênio, nitrogênio e, às vezes, enxofre. • Os aminoácidos são as unidades proteicas. Proteínas • Cada aminoácido é composto por um carbono alfa, um grupamento amina e um grupamento carboxila. Junto ao carbono alfa temos o radical, o qual muda de aminoácido para aminoácido. • Os aminoácidos são unidos entre si pelas ligações peptídicas. • Podem ser classificados em dipeptídeo, tripeptídeo, oligopeptídeo e polipeptídeo. Proteínas • Os aminoácidos são unidos entre si pelas ligações peptídicas. @BIO545 Proteínas Classificação dos aminoácidos: • Os aminoácidos NATURAIS são os que um ser vivo pode produzir. • Os aminoácidos ESSENCIAIS são os que um ser vivo não pode produzir, portanto devem ser obtidos via alimentação. A lista de aminoácidos naturais e essenciais muda de espécie para espécie. Proteínas Estrutura das proteínas: Proteínas: enzimas • Aceleram as reações químicas. • Possuem alta especificidade enzima-substrato (modelo da chave- fechadura) Proteínas: enzimas Proteínas: atuam na imunização • Anticorpos defendem o nosso corpo. • Podemos classificar o processo de imunização em: • Imunização ativa: organismo aprende a “fabricar” anticorpos, ou pegando a doença ou através de vacinas. • Imunização passiva: quando o organismo recebe pronto os anticorpos (amamentação, placenta, soro).Vitaminas • Necessárias em pequenas quantidades. • Indispensáveis para o funcionamento do corpo. • Atuam como reguladoras das reações químicas. • Podem ser classificadas em: • Lipossolúveis: se dissolvem em lipídios. Ex.: vitaminas A, D, E e K. • Hidrossolúveis: se dissolvem em água. Ex.: vitamina C e vitaminas do complexo B. V I T A M I N A S Ácidos Nucleicos • Comandam as atividades celulares. • São a base dos caracteres hereditários. • São conhecidos por DNA ou ADN (ácido desoxirribonucleico) e o RNA ou ARN (ácido ribonucleico). • São formados por unidades denominadas nucleotídeos. • Cada nucleotídeo é formado por um grupo fosfato, uma pentose e uma base nitrogenada. Ácidos Nucleicos Ácidos Nucleicos Diferenças entre DNA e RNA: Diferenças entre DNA e RNA
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