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UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO DE JANEIRO CAMPUS DUQUE DE CAXIAS Bioquímica I - Biotecnologia-2017/1 Exercícios - Aminoácidos e proteínas 1. Qual o único aminoácido, entre os 20 presentes em proteínas, que não é oticamente ativo? Por quê? 2. Como os aminoácidos podem ser classificados, baseando-se em suas cadeias laterais? 3. Como é formada uma ligação dissulfeto? Represente-a. 4. Faça a curva de titulação de uma alanina (pK1=2,1 e pK2=9,8). 5. O ponto isoelétrico (pI) é o pH no qual o aminoácido não tem nenhuma migração quando submetido a um campo elétrico (eletroforese), ou seja, sua carga global é zero. Calcule o pI da alanina e indique no gráfico. 6. O pKa de um aminoácido depende do microambiente no qual se encontra. Na natureza, as proteínas adotam conformações específicas para desempenhar suas funções. Em alguns casos, essas conformações induzem uma alteração do pKa de alguns aminoácidos, a fim de estabilizar a estrutura final. Comparando com o pKa do aminoácido livre em solução, discuta o que poderá ocorrer com o valor de pKa da cadeia lateral de um glutamato nas seguintes situações: a. quando está exposto ao solvente (água) b. quando está próximo de uma lisina (carga positiva) 7. Em uma solução extremamente básica (pH=13), qual a forma predominante da glicina? 8. Para aminoácidos com cadeia lateral neutra, qual a forma predominante quando em um pH abaixo de seu pI? 9. O que é uma ligação peptídica? Quais são suas principais características? 10. Em pH fisiológico, a mais alta capacidade de tamponamento seria conferida por uma proteína rica em lisina, ácido aspártico, valina ou histidina? Explique. 11. Descreva os níveis de estrutura encontrados em proteínas, especificando que tipo de interações estão envolvidas na estabilização de cada um deles. 12. Como é possível promover a desnaturação de uma proteína? Explique. 13. Descreva o processo geral de enovelamento espontâneo de uma proteína. 14. O que são chaperonas?
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