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Genética quantitativa Kian Eghrari Moraes kianem@gmail.com Tópicos • Caracteres quantitativos vs caracteres qualitativos; • Segregação contínua (altura de planta, ciclo, produtividade) vs segregação descontínua (cor da flor, grão liso e rugoso, milho doce e milho verde); • Interações alélicas: aditiva, dominante e sobredominante; • Sistema de reprodução das plantas (assexuadas e sexuadas, sendo as últimas classificadas como plantas autógamas e plantas alógamas); • Heterose e endogamia; • Herdabilidade = VarGenética/VarFenotípica Caracteres qualitativos Controlados por poucos genes; Segregação mendeliana 3:1, 9:3:3:1; Pouco influenciados pelo ambiente http://www.jamesandthegiantcorn.com/2010/02/03/we-got-to-genetics-in-class-today-and- the-story-of-the-shrunken-2-gene/ http://www.uagro.com.br/editorias/agricultura/milho/2013/06/18/colheita-do-milho-avanca-em- mato-grosso-e-36-da-safra-ja-foi-comercializada.html Caracteres quantitativos Poligênicos, ou seja, controlados por muitos genes; Mensurações de quantidades, como: g, m², kg ha-1, cm2; Muito influenciados pelo ambiente Fenótipo (F) = Genótipo (G) + Ambiente (A) Experimentos de Mendel Caracteres qualitativos Hipótese dos fatores multíplos (Nilsson-Ehle e East, 1910) • Característica controlada por muitos genes; • Cada gene tem um pequeno efeito sobre o fenótipo; • Grande número de classes fenotípicas; • Binômio de Newton (a+b)m; m = número de alelos Hipótese dos fatores múltiplos - poligenes Distribuição de frequência para o caráter peso das sementes do feijoeiro, considerando ausência de efeito ambiental e diferentes números de genes de efeito ADITIVO: 2 genes 1 gene 4 genes Hipótese dos fatores múltiplos - poligenes 8 genes Hipótese dos fatores múltiplos - poligenes Caracteres quantitativos • Utilização de parâmetros estatísticos: médias, variâncias, coeficientes de regressão, correlações; • Trabalhar com grandes populações; • Grande número de genes poligênico cada gene influencia um pouco a característica ambiente afeta cada gene; • Exemplos: altura de planta e produtividade de grãos. *Ambiente: fertilidade do solo, umidade relativa do ar, temperatura, fotoperíodo, ventos, regime hídrico, intensidade de chuvas... Genótipos diferentes podem apresentar o mesmo fenótipo Genótipos iguais podem ter fenótipos diferentes; Ambiente F = G + A Variação ambiental http://maize.org/16-new-cimmyt-maize-lines-released/ Trabalho de East, 1916 Trabalho pioneiro no estudo de caráter quantitativo Variação contínua Curva normal Caracteres qualitativos • Um ou poucos genes influenciam a característica; • Variação descontínua; • Classes fenotípicas distintas; • Exemplos: textura da semente do milho, cor de flor da soja, eventos transgênicos. Exemplo gene shrunken2 http://www.jamesandthegiantcorn.com/2010/02/03/we-got-to-genetics-in-class-today-and-the-story-of-the-shrunken-2-gene/ http://senweb.lr.k12.nj.us/downing/corn_genetics_1.htm Interações alélicas • Interação alélica dominante; • Interação alélica aditiva; • Interação alélica sobredominante. Interações Alélicas: Dominância a = 25 d = 25 d = a ou d/a = 1,0 Interação Alélica de Dominância µ = 35 µ representa o ponto médio entre os dois genótipos homozigóticos a mede o afastamento de cada genótipo homozigótico em relação a média d mede o afastamento do heterozigoto em relação à média aa AA, Aa 10 60-a +a35 µ d Interação alélica dominante •F1 = P1 : F2 < F1 • AA = 2 • BB = 2 • Aa = 2 • Bb = 2 • aa = 1 • bb = 1 AABB AABb AAbb 4 4 3 AaBB AaBb Aabb 4 4 3 aaBB aaBb aabb 3 3 2 Número de locos com dois alelos Número de genótipos Número de fenótipos* 1 (A, a) 3 2 2 (A, a, B, b) 9 4 ... ... ... 20 3.486.784.401 1.048.576 N 3n 2n *com dominância completa Interações Alélicas: Aditiva aa AA µ 10 60-a +a35 d Aa a = 25 µ = 35 Considerando 1 gene com 2 alelos: d = 0 ou d/a = 0 Interação Alélica Aditivad = 0 µ representa o ponto médio entre os dois genótipos homozigóticos a mede o afastamento de cada genótipo homozigótico em relação à média d mede o afastamento do heterozigoto em relação à média Interação alélica aditiva •F1 = (P1 + P2)/2 : F2 = F1 • A = 2 • B = 2 • a = 1 • b = 1 AABB AABb AAbb 8 7 6 AaBB AaBb Aabb 7 6 5 aaBB aaBb aabb 6 5 4 Interações Alélicas: Sobredominância a = 25 d = 45 d > a ou d/a > 1,0 Interação Alélica de Sobredominância µ = 35 10 AA -a +a µ 35 d Aa 60 80 aa µ representa o ponto médio entre os dois genótipos homozigóticos a mede o afastamento de cada genótipo homozigótico em relação à média d mede o afastamento do heterozigoto em relação à média Interação alélica sobredominante •F1 > P1 : F1 > (P1 + P2)/2 : F2 < F1 • Aa = 3 • Bb = 3 • AA = 2 • BB = 2 • aa = 1 • bb = 1 AABB AABb AAbb 4 5 3 AaBB AaBb Aabb 5 6 4 aaBB aaBb aabb 3 3 2 Outro exemplo em caráter qualitativo • Assexuadas • Sexuadas: autógamas e alógamas Sistema de reprodução de plantas Assexuadas • Propagadas vegetativamente; • Alto grau de heterozigose; • Alta segregação quando propagadas por via sexual. Fonte: http://www.sifaeg.com.br/xtimeline/inovacao-plantio-da-cana-de-acucar/ Sistema de reprodução de plantas https://www.upmbiofore.com/upm/long-term-commitment-to-eucalyptus-in-uruguay/ Sistema de reprodução de plantas intermediárias Sexuadas • Autofecundação natural; • População mistura de linhagens endogâmicas; • Variabilidade genética: diferentes genótipos homozigóticos; • Estrutura: cleistogamia – antes da antese (fecundação com a flor fechada). Sistema de reprodução de plantas Autógamas Fonte: https://pixabay.com/pt/arroz-planta-campo-agricultura-2207438/ Fonte: http://denisegomesludwig.blogspot.com.br/2015/05/19-de- maio-soja-leguminosa-planta.html Fonte: http://panoramaagrario.com/2016/07/fao-preve-mayor- produccion-trigo-consumo-cereal-en-2016-2017/ Fonte: http://denisegomesl udwig.blogspot.com .br/2015/05/18-de- maio-feijao- leguminosa- semente.html Alógamas • Polinização aberta; • Estruturas: protoginia, protandria; monoicia, dioicia, autoincompatibilidade. Sistema de reprodução de plantas Fonte: http://www.curasaudavel.com/site/?p=1438 Fonte: http://denisegomesludwig.blogspot.com.br/2015/05/15-de-maio-milharal-milho- planta-cereal.html Fonte: https://biology.stackexchange.com/questions/2773 8/which-papaya-lechosa-plant-male-or-female- bears-fruit Intermediárias • Algodão • Sorgo Sistema de reprodução de plantas Fonte: http://diariodebiologia.com/2015/07/qual-a-origem-do-algodao- comprado-no-supermercado/ Fonte: http://www.dowagro.com/pt-br/brasil/cultures/sorgo Heterose • Conhecida também como vigor híbrido; • Produção de híbridos com maiores vigor e produtividade. Fenômeno pouco entendido Hipóteses: Dominância; Sobredominância; Epistasia. Definições: É o aumento de vigor, da altura de planta, do conteúdo de carboidratos, da produtividade e da intensidade de fenômenos fisiológicos entre indivíduos contrastantes (FEHR, 1987); Restauração do vigor após o primeiro cruzamento entre indivíduos endogâmicos (DARWIN, 1878; SHULL, 1908). http://www.esalq.usp.br/cprural/glossario/letra?ini=H http://mooselab.cropsci.illinois.edu/heterosis.html Quantificando a heterose • No âmbito genético/acadêmico h = F1 - (P1 + P2)/2 Superioridade em relação a média dos parentais • No âmbito comercial/econômico h = F1 - Psuperior (parental superior); h = F1 - Híbirido Elite (híbrido comercial)KRIEGER et al., 2010 Heterose na prática • 1 kg de variedade de tomate = R$ 25,00; • Independente da genética da semente o custo por planta é R$ 5,00; • 1.000 pés produzem 100 caixas; • Caixa = R$ 40,00; • Renda = R$ 4.000,00 • 1.000 sementes híbridas de tomate (3 g) = R$ 300,00; • Independente da genética da semente o custo por planta é R$ 5,00; • 1.000 pés produzem 500 caixas; • Caixa = R$ 80,00; • Renda = R$ 40.000,00 Endogamia • Cruzamento entre indivíduos aparentados; • Depressão por endogamia: Perda de vigor, altura e produtividade pela presença de alelos recessivos em homozigose; Homozigose de alelos recessivos; Carga genética. Autógamas Alógamas Genótipo do esporófito Homozigoto Heterozigoto Genótipo dos gametas de uma única planta Todos Iguais Todos Diferentes Progênie de uma planta Homogênea Heterogênea Depressão endogâmica Não Ocorre Frequente Autoincompatibilidade Não Ocorre Frequente Sistema de reprodução de plantas Viglioni Penna, 2011 VG/VF grau de determinação genética Estimativa dos componentes de variância Ramalho et al., 2012; Falconer, 1989 h2 Correspondência entre o fenótipo e o valor genético h2 varia de 0 a 1 h2 baixa sofre muita influência ambiental Zea mays Notas de doença em genótipos de milho. Variância Média P1 0,87 2,95 P2 0,24 7,82 F1 0,52 2,90 F2 2,93 4,79 RCP1 1,38 3,0 RCP2 2,56 6,14 (0,87 + 0,24 + 0,52)/3 = 0,54 2,93 – 0,57 = 2,36 Herberte Silva, 2017 Notas de doença em folhas de milho de 1 a 9. *A nota mais baixa representa menor severidade da doença. Herdabilidade no sentido amplo (ha2) ha2 = VG/VF ha2 = 2,36/2,93 ha2 = 0,805 Zea mays Herberte Silva, 2017 Notas de doença em genótipos de milho. Variância Média P1 0,87 2,95 P2 0,24 7,82 F1 0,52 2,90 F2 2,93 4,79 RCP1 1,38 3,0 RCP2 2,56 6,14 1,92/2,93 = 0,65 = 65% (2*2,93 – 1,38 – 2,56) = 1,92 Herdabilidade no sentido restrito (hr2) VA/VF: o quanto do fenótipo da progênie é determinado pelos genes dos parentais (Falconer, 1989).
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