Aula 08 Identificação de Proteínas Roteiro Aula Prática (1)

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UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ 
CAMPUS DE PARNAÍBA 
CURSO DE BIOMEDICINA 
Disciplina: BIOINFORMÁTICA 
Prof. Jefferson Soares de Oliveira 
 
Roteiro de atividades da Aula Pratica – Identificação de Proteínas 
 
Para responder as questões a seguir, utilize a ferramenta “by experimental pI/Mw range” presente no 
site do SWISS-2DPAGE (http://world-2dpage.expasy.org/swiss-2dpage/). 
 
1- Analisando mapas bidimensionais obtidos a partir da extração de proteínas de cultura de linfócitos 
humanos, indique quantas proteínas foram identificadas nos géis dentro do intervalo de pH 5.5 – 6.0 e 
massa molecular 20 a 30 kDa? 
2- Descreva o ponto isoelétrico e massa molecular de cada proteína encontrada. A que genes estão 
relacionados? 
3- Qual a estratégia experimental utilizada pra identificar as proteínas citadas na questão anterior? 
 
Para responder as questões a seguir, utilize a ferramenta “Peptide mass fingerprint” presente no site do 
Matrix Science (http://www.matrixscience.com/search_form_select.html). 
 
1- Para estudar as mudanças na expressão de proteínas em células humanas em processo neoplásico, 
um pesquisador analisou o padrão de expressão de proteínas através da técnica de eletroforese 
bidimensional. Após análise criteriosa e comparação com mapas bidimensionais de células controle, o 
pesquisador selecionou 200 proteínas que apresentaram expressão alterada. Abaixo são apresentados 
os valores das massas de duas proteínas que chamaram especial atenção do pesquisador. Estes dados 
foram obtidas após excisão das proteínas do gel de eletroforese, digestão destas com tripsina e análise 
dos fragmentos por espectrometria de massas. Diante destas informações, indique os genes 
relacionados a cada uma das proteínas. Explique o que lhe permite relacionar (ou não) a proteína ao 
gene. 
 
Massa das proteínas obtidas após digestão com tripsina 
 
Proteína A Proteína B 
801.3964 
817.3913 
822.4468 
888.5149 
907.4342 
978.5619 
979.4956 
980.4935 
1028.5597 
1044.5547 
1071.6045 
1091.5844 
1122.5612 
1181.6273 
1247.6743 
1336.6500 
1551.8602 
1798.9666 
1840.9772 
1853.9830 
1869.9779 
1930.0071 
1946.0020 
1972.0177 
1988.0126 
2033.0801 
2317.0589 
2333.0538 
2349.0488 
2365.0437 
977.4721 
966.5003 
961.4771 
952.4959 
907.4190 
3648.6543 
3632.6593 
2700.2253 
2634.2288 
2618.2339 
2602.2390 
2586.2441 
2457.1458 
2412.2477 
1988.0126 
1972.0177 
1946.0020 
1930.0071 
1869.9779 
1859.7600 
1853.9830 
1843.7651 
1840.9772 
1798.9666 
1792.8321 
1600.7346 
1584.7396 
1568.7447 
1551.8602 
1513.7315 
1471.7863 
1386.7528 
 
UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ 
CAMPUS DE PARNAÍBA 
CURSO DE BIOMEDICINA 
Disciplina: BIOINFORMÁTICA 
Prof. Jefferson Soares de Oliveira 
 
2586.2441 
2602.2390 
2618.2339 
2634.2288 
2700.2253 
2716.2202 
2778.3227 
2794.3177 
2810.3126 
2826.3075 
3084.4374 
3100.4323 
3616.6644 
3632.6593 
3648.6543 
1360.7120 
1343.6914 
1336.6500 
1184.6092 
1181.6273 
1153.5670 
1122.5612 
1091.5844 
1087.5742 
1071.6045 
1044.5547 
1042.5316 
1033.5465 
1028.5597