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Bsc. Maria Carolina Viana Divisão de Genética - Instituto Nacional de Câncer PCR – Polymerase Chain Reaction PCR – Polymerase Chain Reaction Ou Reação em Cadeia da Polimerase Processo semiconservativo de cópia (amplificação) exponencial de um segmento específico de DNA, a partir de uma pequena quantidade do DNA original (DNA molde). A reação "in vitro" utiliza elementos sintéticos básicos para o processo de replicação do DNA, onde as duas cadeias se separam e novas cadeias complementares são produzidas. A reação é realizada em aparelhos chamados TERMOCICLADORES e é composta de três etapas que se intercalam, com diferentes temperaturas, formando um ciclo. Reação em Cadeia da Polimerase Essas etapas são: Desnaturação Anelamento Extensão Etapas da PCR * Ciclagem básica Elementos básicos sintéticos + H2O estéril + DNA molde Ambiente e material estéril DESNATURAÇÃO INICIAL / DESNATURAÇÃO A elevação da temperatura promove a separação das duas cadeias da dupla fita de DNA através da quebra das pontes de hidrogênio entre as bases complementares. 5’ ‘3 3’ ‘5 5’ ‘3 3’ ‘5 ANELAMENTO Pareamento dos iniciadores com região pré-determinada do DNA molde. * Determinação dos iniciadores Ex.: Fragmento 4CD do éxon 4 do gene MECP2 1. Busca de sequências em banco de dados online (GenBank) ANELAMENTO 2. Alinhamento de sequências; 3. Escolha de regiões conservadas; ANELAMENTO 4. Teste dos primers – Ferramentas online - IN-SILICO PCR Escolha do banco de dados Primers desenhados baseados em regiões conservadas ANELAMENTO 4. Teste dos primers – Ferramentas online - PRIMER 3 Sequência nucleotídica do fragmento desejado Opção Primers desenhados baseados em regiões conservadas OU Primers sugeridos pela ferramenta ANELAMENTO Pareamento dos iniciadores Primer F Primer F Primer R Primer R TAQ DNA POL TAQ DNA POL 5’ ‘3 3’ ‘5 5’ ‘3 3’ ‘5 5’ ‘3 3’ ‘5 EXTENSÃO / EXTENSÃO FINAL Primer F Primer R TAQ DNA POL TAQ DNA POL TAQ DNA POL TAQ DNA POL Primer F Primer R Amplificação exponencial 5’ ‘3 3’ ‘5 5’ ‘3 3’ ‘5 Resultado da PCR O resultado da PCR é verificado por eletroforese em gel de agarose. O produto da PCR é submetido a um campo elétrico e os amplicons migram através do gel, deixando marcas (bandas) que são quantificadas em pares de base (pb) de acordo com o marcador molecular.
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