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FRACIONAMENTO CELULAR FRACIONAMENTO CELULAR Lise celular Aparelhos para lise celular Fracionamento celular 1. Rompimento das células em uma solução tampão que preserve as estruturas intracelulares (HOMOGEINIZAÇÃO por choque osmótico, ultrasom, processo físico); 2. Separação dos componentes celulares por tamanho e densidade na centrifugação; A separação de estruturas maiores como o núcleo ou mitocêndrias é feita em centrífugas denominadas de preparativas, com velocidades até 20.000 r.p.m. Centrifugação - 1924 Theodor Svedberg inventou a ultracentrífuga analítica Prêmio Nobel em Química (1926) Centrifugação - 1938 G. Beherens isolou pela primeira vez, núcleo de uma célula por centrifugação; - 1954 C. de duve isolou lisossomos (primeira organela não identificada pela microscopia) Centrifugação Centrifugação diferencial Centrifugação A separação de estruturas pequenas como o ribossomo é feita em centrífugas denominadas de ultracentrífugas, com velocidades acima de 20.000 r.p.m., podendo chegar a 100.000 r.p.m. 3.000 a 5.000 r.p.m. Até 20.000 r.p.m. Acima de 50.000 r.p.m. Ultracentrifugação Centrifugação Centrifugação ZONAL ou por velocidade de sedimentação e ISOPÍCNICA ou sedimentação por equilíbrio Tamanho é mais importante Densidade é mais importante Centrifugação por gradientes Centrifugação Densidades de estruturas celulares em sacarose Estrutura Densidade (g/cm3) Golgi 1.06-1.10 Membrana Plasmática 1.16 REL 1.16 Mitocôndria 1.19 Lisossomos 1.21 Peroxissomos 1.23 Vírus de Planta 1.30-1.45 Rhino- and enterovirus 1.30-1.45 Ácidos nucleicos, ribossomos 1.60-1.75 Glicogênio 1.70 Centrifugação Tipos de rotores Coeficiente de sedimentação (s) Definido pela relação entre a velocidade com que uma partícula sedimenta em uma dada solução e a aceleração centrífuga aplicada. S = v/a = m {1-(d/d’)}/f onde: m = massa da partícula; d = densidade da partícula; d’ = densidade do solvente; f = coeficiente de fricção (depende da forma da partícula e viscosidade da solução) Isolamento de DNA extracromossomal de bactérias (plasmídios) Centrifugação por densidade flutuante (buoyant density). Centrifuga-se uma solução aquosa contendo DNA e outras moléculas Orgânicas em uma solução de um sal com alta densidade (por ex.cloreto de césio), até a formação de um gradiente de densidade. Para que isso ocorra, velocidades de 200.000 a 500,000 x g são usadas Ver link: https://pt.scribd.com/doc/102633265/Buoyant-Density-of-DNA RNA DNA circularDNA linear Proteina e Lipídeos =1.2g/ml 1.6 1.7 1.8 g/ml Centrifugação Purificação de DNA plasmidial de bactérias por centrifugação isopícnica. http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/cellfractionation.html Cromatografia Um dos métodos mais utilizados para separação de proteínas é a cromatografia; Primeiramente desenvolvida para separação de moléculas pequenas como a aminoácidos e açúcares; Amostra (soluto) interage fiscamente com duas fases- Uma móvel (gás ou líquido) e um suporte sólido (fase estacionária; solvente ou Matriz). A fase móvel movimenta o soluto através da fase estacionária. A atração diferencial do soluto pelas fases móvel e estacionária afetará a sua mobilidade. • Tipos de cromatografia: • a = Partição (papel ou de camada fina); • b = Coluna (troca iônica, hidrofóbica, filtração em gel, afinidade) material da coluna pode ser celulose ou silica; • c = HPLC (high performance liquid chromatography) Cromatografia Cromatografia Aplicações: Separação de misturas complexas de biomoléculas em componentes individuais para propósitos analíticos ou quantitativos. Isolamento em uma forma pura de uma biomolécula simples a partir de uma mistura complexa Cromatografia de papel • Envolve a separação de um soluto entre um solvente ligado firmemente a uma fase estacionária polar e um segundo solvente (fase móvel) que se move através da fase estacionária Exemplo: • Fase estacionária = Água ligada a celulose • Fase móvel (apolar ou menos polar) = mistura de solventes • e.g. butanol, chlorofórmio • Útil na separação de moléculas similares e.g. amino acids Exemplo Camada fina • Envolve partição (menor contribuição) e adsorção na fase estacionária. • - fase estacionária : acídica (silica) or básica (alumina) • - soluto adsorve por ligação de hidrogênio; a força da ligação depende da polaridade do soluto • - a separação do soluto da fase estacionária requer um solvente mais polar do que o soluto Cromatografia de camada fina Cromatografia Papel ou camada fina Coluna Cromatografia de coluna Cromatografia 3 Tipos de cromatografia de coluna Tipos de coluna Cromatografia 4 3 passos cromatográficos consecutivos usados para purificar uma proteína. Em A, resultados de uma coluna de troca iônica; B, Filtração em gel e C, Cromatografia de afinidade. Colunas de HPLC
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