Lista de Exercicios p1 e p2

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Lista de Exercícios (Bioquímica I) 
(Prof. André Luiz Gomes Vieira) 
Questão 1: Considere os aminoácidos abaixo bem como seus pKs e responda as 
questões que se seguem: 
 
a) Quais são polares não carregados? 
b) Quais são apolares? 
c) Quais são carregados positivamente em pH 7? 
d) Quais são carregados negativamente em pH 7? 
e) Quais têm carga zero em pH 7? 
f) Calcule o ponto isoelétrico para cada um dos aminoácidos acima. 
g) Quais possuem carga líquida igual a +1 em pH 1? 
h) Quais possuem carga +2 em pH 1? 
i) Qual a carga líquida da maioria das moléculas do aminoácido C em pH 9,5? 
j) Quais possuem 2 regiões tamponamento e quais possuem 3? Justifique sua 
resposta 
k) Desenhe a estrutura de um tetrapeptídeos cuja carga líquida em pH 7 seja igual 
a +2. 
l) Desenhe um tripeptídeo cuja carga líquida em pH 7 seja igual a -3. 
m) Em um tripeptídeo formado apenas pelo aminoácido B, você esperaria que o 
valor do pK do grupo carboxila fosse maior ou menor do que o pK1 do mesmo 
aminoácido? Justifique 
n) Esboce a curva de titulação do aminoácido A indicando seus principais pontos e 
apresente o desenho da estrutura predominante do aminoácido em cada ponto 
da curva. 
o) Quais aminoácidos apresentam mais de um centro assimétrico (quiral). Calcule 
o número de estereoisômeros para cada um. 
 
 
Questão 2: Quais as principais forças que estabilizam a estrutura nativa de uma 
proteína? 
 
Questão 3: Qual a diferença de desnaturação de uma proteína para degradação de 
uma proteína? Por que um dos processos é reversível e o outro não? 
 
Questão 4: Quais os diferentes níveis de organização estrutural que uma proteína 
pode possuir? Quais as principais forças que os estabilizam? 
 
Questão 5: Quais as principais diferenças entre proteínas fibrosas e proteínas 
globulares? Por que a diversidade de funções é maior entre as proteínas globulares do 
que entre as fibrosas? 
 
Questão 6: Por que uma proteína que apresenta atividade ótima a uma temperatura 
em torno de 37oC perde sua função à medida que a temperatura se eleva? 
 
Questão 7: Por que uma proteína que apresenta atividade ótima em pH 7 perde sua 
função em pH extremamente ácido (pH 1-3) ou extremamente básico (pH 10-14)? 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Questão 8: A figura ao lado apresenta a estrutura do 
hormônio insulina. 
a) Quais os níveis de organização estrutural são 
possíveis identificar nessa figura? 
b) Qual a principal força que estabiliza a estrutura 
mostrada e por quê? 
c) Sabendo que o pKR dos aminoácidos Glu, Arg, His, 
Lys e Tyr são, respectivamente, 4.25, 12.48, 6.0, 
10.53 e 10.07, e desprezando o efeito da 
vizinhança sobre esses valores de pKR, calcule a 
carga líquida da insulina em pH 7. 
d) Em um campo elétrico, a molécula de insulina 
migraria para o pólo positivo, pólo negativo ou não 
migraria? 
Questão 9: Uma estratégia das células para contornar uma reação 
termodinamicamente desfavorável consiste no acoplamento desta com outra reação 
termodinamicamente favorável. A fosforilação direta da glicose por Pi é descrita pela 
equação a seguir: 
 
 
a) Explique por que essa reação é termodinamicamente desfavorável. 
 
 
b) Qual das reações a seguir poderia ser acoplada à reação de fosforilação da 
glicose a fim de torná-la termodinamicamente favorável? Justifique sua 
resposta apresentando o somatório das reações de dos ∆Gs. 
 
 
Questão 10: Considere as estruturas abaixo: 
 
 
a) Quais os níveis estruturais são possíveis identificar em cada uma delas? 
b) Você esperaria que as seqüências primárias das proteínas acima fossem iguais? 
Justifique 
c) Você esperaria que a função das proteínas acima fosse igual? Justifique 
 
Questão 11: Imagine duas proteínas (A e B), ambas com o mesmo número de 
aminoácidos (1000 resíduos). A proteína A apresenta 4 pontes dissulfeto, enquanto 
que a proteína B não apresenta tais ligações entre seus resíduos de cisteína. 
a) Para qual proteína você esperaria encontrar o maior Tm? Justifique 
b) Desenhe um gráfico que mostre a porcentagem de desnaturação em função da 
temperatura para as proteínas A e B. 
c) Explique porque as curvas apresentam esse perfil.