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Pergunta de inicio de aula Um estudo com as baratas do Instituto de Biologia encontrou 3000 baratas de asas compridas e 1000 baratas de asas curtas. Tamanho da asa é determinado por um loco autossômico dialélico. Qual alelo é dominante? Braquidactilia “Se a braquidactilia fosse um caractere dominante, nós esperaríamos, ao longo do tempo e na ausência de outros fatores, que a quantidade de pessoas com braquidactilia aumentasse até que chegássemos a uma proporção de 3:1” (Yule, 1903, Proc. R. Soc. Medicine) Dedos das mãos e dos pés encurtados em relação à maioria das pessoas. Dominante ou recessivo? Equilíbrio de Hardy-Weinberg Evolução – Aula 2 Prof. Antonio Solé-Cava O equilíbrio de Hardy, 1908 Godfray Hardy Hardy O equilíbrio de Weinberg, 1908 • Wilhelm Weinberg foi um médico alemão que trabalhou anos como clínico geral e obstetra. Ele fez mais de 3500 partos. • Seu alto poder de percepção o levou a postular, pela primeira vez, que deveriam existir dois tipos de gêmeos (uni e multi-vitelinos). • Weinberg publicou, no mesmo ano que Hardy, um artigo mais completo sobre proporções genotípicas, que incluía cálculos com alelos múltiplos. Wilhelm Weinberg Weinberg, W. (1908). "uber den Nachweis der Vererbung beim Menschen". (“Sobre a prova da transmissão nas pessoas”) Jahreshefte des Vereins fur vaterländische Naturkunde in Wurttemberg 64: 368–382. A lei de Hardy-Weinberg • O artigo de Weinberg, apesar de mais completo que o de Hardy, ficou desconhecido, por ter sido publicado em alemão, até que, 35 anos mais tarde, foi redescoberto por Stern (1943). “Crescei e multiplicai-vos” (Deus, 4000 A.C.) “Crescei e multiplicai-vos” (Deus, 4000 A.C.) • Ou seja, reprodução é uma multiplicação • Então, se uma população se reproduz com outra, as frequências genotípicas serão iguais à multiplicação das freq gênicas de cada população. • Freq genotípicas da F1 • (alelos pop 1) x (alelos pop 2) • Freq genotipicas da F1 Cruzamento 2 pops • (alelos pop 1) x (alelos pop 2) no caso de dois alelos • F1 = (p1+q1) x (p2+q2) = • F1 = p1p2+ p1q2 + q1p2 + q1q2 • Freq genotipicas da F1 Cruzamento 2 pops • (alelos pop 1) x (alelos pop 2) no caso de dois alelos • F1 = (p1+q1) x (p2+q2) = • F1 = p1p2+ p1q2 + q1p2 + q1q2 Mas se, ao invés de duas populações, for apenas uma? Neste caso, p1=p2= p e q1=q2= q • Freq genotipicas da F1 Cruzamento 2 pops • (alelos pop 1) x (alelos pop 2) no caso de dois alelos • F1 = (p1+q1) x (p2+q2) = • F1 = p1p2+ p1q2 + q1p2 + q1q2 F1 = pp + pq + pq + qq = p2 + 2pq + q2 Mas se, ao invés de duas populações, for apenas uma? Neste caso, p1=p2= p e q1=q2= q Grupos sanguíneos em uma população dos EUA Quais são as frequências genotípicas na geração analisada? GMM = 0,298 GMN = 0,489 GNN = 0,213 Total 1000 Quais são as frequências gênicas na geração analisada? fM = (2 X 298 + 489)/(2 x 1000) = 0,5425 fN = (2 X 213 + 489)/(2 x 1000) = 0,4575 Cada MM tem 2 M Cada MN tem 1 M cada individuo tem dois alelos Quais serão as frequências genotípicas na próxima geração? fM 0,5425 fN 0,4575 fM 0,5425 0,5425 X 0,5425 0,5425 X 0,4575 fN 0,4575 0,5425 X 0,4575 0,4575 X 0,4575 es pe rm at oz ói de s óvulos Quais serão as frequências genotípicas na próxima geração? SE: cruzamentos ao acaso SE: sobrevivência independente do fenótipo fM 0,5425 fN 0,4575 fM 0,5425 0,5425 X 0,5425 0,5425 X 0,4575 fN 0,4575 0,5425 X 0,4575 0,4575 X 0,4575 es pe rm at oz ói de s óvulos GMM = 0,5425 X 0,5425 = 0,2943 fM 0,5425 fN 0,4575 fM 0,5425 0,5425 X 0,5425 0,5425 X 0,4575 fN 0,4575 0,5425 X 0,4575 0,4575 X 0,4575 es pe rm at oz ói de s óvulos Quais serão as frequências genotípicas na próxima geração? GMM = 0,5425 X 0,5425 = 0,2943 fM 0,5425 fN 0,4575 fM 0,5425 0,5425 X 0,5425 0,2943 0,5425 X 0,4575 fN 0,4575 0,5425 X 0,4575 0,4575 X 0,4575 es pe rm at oz ói de s óvulos Quais serão as frequências genotípicas na próxima geração? GMM = 0,5425 X 0,5425 = 0,2943 GMN = (0,5425 X 0,4575) = 0,2482 GNN = 0,4575 X 0,4575 = 0,2093 fM 0,5425 fN 0,4575 fM 0,5425 0,5425 X 0,5425 0,5425 X 0,4575 fN 0,4575 0,5425 X 0,4575 0,4575 X 0,4575 es pe rm at oz ói de s óvulos Quais serão as frequências genotípicas na próxima geração? 0,2943 0,2482 0,20930,2482 X 2= 0,4964 Quais são as frequências gênotípicas na geração analisada? GMM = 0,2980 GMN = 0,4890 GNN = 0,2130 Geração parental Geração F1 GMM = 0,2943 GMN = 0,4964 GNN = 0,2093 As frequências genotípicas mudaram? GMM = 0,2980 GMN = 0,4890 GNN = 0,2130 Geração parental Geração F1 GMM = 0,2943 GMN = 0,4964 GNN = 0,2093 Podemos dizer que houve evolução? As frequências gênicas mudaram? GMM = 0,2980 GMN = 0,4890 GNN = 0,2130 Geração parental Geração F1 GMM = 0,2943 GMN = 0,4964 GNN = 0,2093 fM = (0,298 + 0,489)/2 = 0,5425 fN = (0,213 + 0,489)/2 = 0,4575 fM = (0,2943 + 0,4964)/2 = 0,5425 fN = (0,2093 + 0,4964)/2 = 0,4575 Podemos dizer que houve evolução? E quais serão as frequências genotípicas na geração F2? GMM = 0,5425 X 0,5425 = 0,2943 GMN = (0,5425 X 0,4575) + (0,5425 X 0,4575) = 0,4964 GNN = 0,4575 X 0,4575 = 0,2093 fM 0,5425 fN 0,4575 fM 0,5425 0,5425 X 0,5425 0,5425 X 0,4575 fN 0,4575 0,5425 X 0,4575 0,4575 X 0,4575 es pe rm at oz ói de s óvulos As frequências genotípicas mudaram? GMM = 0,2980 GMN = 0,4890 GNN = 0,2130 Geração parental Geração F1 GMM = 0,2943 GMN = 0,4964 GNN = 0,2093 As frequências genotípicas não mudam entre a F1 e a F2. Então por que mudaram entre a P e a F1? Geração F2 GMM = 0,2943 GMN = 0,4964 GNN = 0,2093 A lei de Hardy-Weinberg • Tanto as frequências gênicas como as frequências genotípicas não mudam por este processo. • Corolário: – Se houverem mudanças nessas frequências, então alguma força evolutiva está interferindo no processo • O equilíbrio de HW é a hipótese nula para a detecção de Evolução Características da Ho • Deve ser falsificável • Em geral é a posição mais conservadora • Nunca pode ser provada verdadeira O que é uma hipótese nula (Ho)? • Será que dar três pancadinhas no tubo de PCR faz com que ele funcione melhor? Ho? • Os alunos da Biologia são maiores que os da Farmácia? Ho? • Está ocorrendo evolução nesta população? Ho? O que é uma hipótese nula (Ho)? • Será que dar três pancadinhas no tubo de PCR faz com que ele funcione melhor? Ho? • Os alunos da Biologia são maiores que os da Farmácia? Ho? • Está ocorrendo evolução nesta população? Ho? Ela está em equilíbrio de HW O que é uma hipótese nula (Ho)? • Será que dar três pancadinhas no tubo de PCR faz com que ela funcione melhor? A PCR não melhorou. Conclusão? • Os alunos da Biologia são maiores que os da Farmácia? As alturas dos alunos da biologia são significativamente maiores do que os da Farmácia. Conclusão? • Está ocorrendo evolução nesta população? Não foram observados desvios significativos em relação ao esperado por HW. Conclusão? Rejeitar a Ho significa acusá-la de falsa • A falta de provas de que a Ho seja falsa não significa que ela seja verdadeira • Tanto na justiça como em ciência, O ÔNUS DA PROVA É DE QUEM ACUSA • Nunca se deve condenar uma Ho (ou uma pessoa) sem provas (ou só com convicções). Testando o equilíbrio de HW Comofoi obtido o esperado? Inventando um teste estatístico 1) O que será testado? • Valores esperados e observados de frequencias genotipicas 2) Qual o tamanho da diferença? • (298-294,3)+(489-496,3)+(213-209,3) = • 3,7 + -7,3 + 3,7 = 0,1 • Notaram algo estranho? • Como eu resolvo isso? Inventando um teste estatístico 1) O que será testado? • Valores esperados e observados de frequencias genotipicas 2) Qual o tamanho da diferença? • (298-294,3)+(489-496,3)+(213-209,3) = • 3,7 + -7,3 + 3,7 = 0,1 • Como eu resolvo isso? • Elevando ao quadrado (para eliminar os negativos) • 3,72 = 13,69 • -7,32 = 53,29 • 3,72 = 13,69 Total dos quadrados das diferenças = 80,67 Inventando um teste estatístico Total dos quadrados das diferenças = 80,67 Esse número é grande? Ele é significativo? Inventando um teste estatístico 1) O que será testado? • Se o tamanho de um grupo de animais é maior do que outro 2) Qual o tamanho da diferença? • 10 cms 10 cm Inventando um teste estatístico 1) O que será testado? • Se o tamanho de um grupo de animais é maior do que outro 2) Qual o tamanho da diferença? • 10 cms 10 cm 10 cm Inventando um teste estatístico 1) O que será testado? • Se o tamanho de um grupo de animais é maior do que outro 2) Qual o tamanho da diferença? • 10 cms 3) Qual o tamanho RELATIVO da diferença? • 10 cms/tamanho médio 4) No caso da barata, 10 cm/10 cm = 100% 5) No caso do elefante, 10 cm/300cm = 3,3% Inventando um teste estatístico 1) O que será testado? • Se o tamanho de um grupo de animais é maior do que outro 2) Qual o tamanho da diferença? • 10 cms 3) Qual o tamanho RELATIVO da diferença? • 10 cms/tamanho médio 4) Essa diferença é maior do que o esperado ao acaso? Será que a diferença entre obtido e esperado é SIGNIFICATIVA? O que significa ”ser significativo”? Testando as diferenças... c2 (298-294,3)2 / 294,3 (489-496,3)2 / 496,3 (213-209,3)2 / 209,3 c2 0,0465 0,1074 0,0654 c2 = 0,0465 + 0,1074 + 0,0654 = 0,2193 Será que a diferença entre obtido e esperado é SIGNIFICATIVA? • Conclusão? • O que é um c2 significativo? c2 = 0,2193 O que é a curva de distribuição de um teste estatístico? Construindo uma curva empírica de distribuição Caras Coroas c2 11 9 (11-10)2/10+(9-10)2/10= 12/10+-12/10= 0,1+0,1= 0,2 10 10 0 8 12 (8-10)2/10+(12-10)2/10= 22/10+-22/10= 0,4+0,4= 0,8 Ho: proporção de caras = coroas Resultados obtidos com moedas não viciadas Construindo uma curva empírica de distribuição Caras Coroas c2 11 9 0,2 10 10 0 8 12 0,8 12 8 0,8 13 7 1,8 11 9 0,2 12 8 0,8 6 14 3,2 Caras Coroas c2 7 13 1,8 10 10 0 9 11 0,2 12 8 0,8 8 12 0,8 12 8 0,8 10 10 0 9 11 0,2 Ho: proporção de caras = coroas Resultados obtidos com moedas não viciadas Distribuição de frequências: 30 vezes jogadas 20 moedas Cara ou coroa = duas categorias As distribuições dependem do número de categorias G.L. = 1 G.L. = 2 G.L. = 3 G.L. = 4 O que são graus de liberdade? • Graus de liberdade é quanto que os dados são livres para variar. • Por exemplo, eu sei que se 60% dos lançamentos deram cara, então 40% deram coroa, ou seja, eu tenho duas medidas, mas apenas um grau de liberdade. • Em qualquer teste, o número de graus de liberdade vai ser, no máximo, igual ao número de categorias menos um (já que, a partir do total, posso adivinhar o valor da última categoria) Graus de liberdade em EHW • No caso de testes para EHW, • G.L. = número de fenótipos esperados-número de alelos Graus de liberdade em qui-quadrado • Exemplos: AA=20, AB=30, BB=20 Classes fenotípicas esperadas Alelos G.L. 3 2 3-2=1 AA=20, AB=30 3 2 3-2=1 AA=20, AB=30, AC=20, BC=5 6 3 6-3=3 AA=20, AB=30, AC=20, BC=5, CD=3, AD=2 10 4 10-4=6 Grupos sanguineos A=20, B=15, AB=6, 0=30 4 3 4-3=1 AFLP/RAPD Banda=30, sem banda=20 2 2 2-2=0 Alguns erros comuns • O equilíbrio de HW é a hipótese nula para os testes • Este loco está em equilíbrio? • AA=15 AB = 32 BB = 12 • fA = 0,5254 fB = 0,4746 • G.L. = 1 c2 = 0,452 Conclusão? Alguns erros comuns • O equilíbrio de HW é a hipótese nula para os testes • Portanto, quando o resultado não é significativo, a conclusão deve ser de não rejeição da hipótese nula (ou seja, não podemos rejeitar a hipótese do equilíbrio, ou seja, não podemos dizer que a população não está em equilíbrio) • Dizer que, como a hipótese nula não foi rejeitada, isso significa que a população está em equilíbrio é errado. Alguns erros comuns • Estou estudando populações de ostras de 10 localidades ao longo da costa brasileira. Analisei dados de 5 loci de microssatélites, e testei as proporções genotípicas desses loci em cada localidade. Observei desvios em relação ao EHW no loco Microsat2 no ES e no loco Microsat4 no RJ. Conclusão? Alguns erros comuns • Quando se fazem múltiplos testes estatísticos, espera-se que, ao acaso, alguns deles sejam significativos (com que frequência isso vai acontecer?) • Essas significâncias aleatórias não devem ser levadas em conta. • O que fazer? • Correção de Bonferroni – Significância é dividida pelo número de testes • Ex: fiz análise de 5 loci gênicos polimórficos em 10 populações. Fiz testes para EHW e encontrei dois casos de rejeição da hipótese nula Alguns erros comuns Conclusao 1 – nesses casos alguma força evolutiva está atuando Conclusão 2 – essas significâncias aconteceram ao acaso Correção de Bonferroni • Se foram 10 loci polimórficos em 5 populações, fiz 50 testes de EHW • Espera-se, ao acaso, que 5% desses testes sejam significativos • 5% de 50 = 2,5 testes • Portanto os 2 loci não mostraram, de fato, desequilíbrio, certo? Errado!! Por que? Depende de quanto significativa foi a rejeição da Ho! Correção de Bonferroni • Significância corrigida por Bonferroni: = 0,05/50 = 0,001 Se os c2 forem rejeitados mesmo com um nível de significância menor que 0,001, então os loci apresentarão desvios de HW (rejeitando a Ho) Um exemplo real Espécie: Actinia bermudensis Número de testes de EHW de alozimas: 23 Significativos: 2 Bermudas: Octopina desidrogenase P<0,009 Santa Catarina: Malato desidrogenase P<0,023 Será que essas populações não estão em equilíbrio? Significância corrigida por Bonferroni = 0,05/23 = 0,0022 Conclusão? Resumindo • As frequências gênicas não se alteram de uma geração para outra, a não ser que alguma força evolutiva esteja atuando (o acaso também é considerado uma força evolutiva?) • As frequências genotípicas podem ser previstas diretamente a partir das frequências gênicas Resumindo • Essa manutenção, ao longo das gerações, das frequências genotípicas é conhecida como “Lei do Equilíbrio de Hardy- Weinberg” • O EHW é a hipótese nula sobre a qual se testa a hipótese alternativa de que Evolução está ocorrendo na população. • A maneira de testar isso é pela comparação das frequências genotípicas de uma população com aquelas que essa mesma população teria após uma geração sem atuação de forças evolutivas Resumindo • Quando são feitos testes múltiplos, devemos corrigir a significância, para que não rejeitemos a hipótese nula por acaso. • Uma das maneiras de fazer isso é através da correção de Bonferroni, que, na sua forma mais simples, é a divisão da significância pelo número de testes.
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