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1 Marcos Sousa 1 Estrutura do Gene Marcos Sousa 2 O genoma contém toda a codificação de um organismo Marcos Sousa 3 Gene, como se define? O Conceito de gene não é estático! O termo gene foi introduzido por Wilhelm Johannsen em 1009. Unidade de informação genética que controla um aspecto específico do fenótipo. Marcos Sousa 4 Marcos Sousa 5 Evolução do Conceito de Gene Mendel, 1866 => caráter ou fator hereditário Archibald E. Garrod, 1900 => um gene mutante => um bloqueio metabólico George W. Beadle e Edward L. Tatum, 1940 => um gene => uma enzima Um gene => um polipetídeo (muitas enzimas contém 2 ou + polipetídeos diferentes). um gene => um transcrito Marcos Sousa 6 Alcaptonúria Bloqueio no catabolismo da fenilalanina, causando acúmulo de ácido homogentísico na urina. 2 Marcos Sousa 7 Um gene => Uma enzima Prêmio Nobel Em 1958 Marcos Sousa 8 Gene, como se define? Porção de DNA responsável pela síntese de um RNA ou um polipeptídeo. Marcos Sousa 9 Estrutura do gene Gene => unidade básica da hereditariedade Gene análogos a um colar de pérolas => recombinação ocorria entre eles e não dentro deles. Menor unidade do material genético não subdivisível por recombinação. Menor unidade do material genético capaz de mutação independente. Colinearidade de genes e proteínas Marcos Sousa 10 COLINEARIDADE DOS GENES E SEUS PRODUTOS PROTÉICOS Marcos Sousa 11 Estrutura do gene Clarence Oliver, 1940 => recombinação dentro do gene lozenge de Drosophila. Mostrou que o gene possui sítios mutantes separáveis por recombinação sendo divisível através de crossing-over. Seymour Benzer => 119 sítios dentro do gene rIIA do bacteriófago T4. Par de nucleotídeos => unidade básica da hereditariedade Marcos Sousa 12 3 Marcos Sousa 13 Final dos anos 60 => genes superpostos genes dentro de genes Final do anos 70 => éxons e íntrons Estrutura do gene Marcos Sousa 14 Genes superpostos e genes dentro de genes Genes se superpõem => quando diferentes matrizes de leitura da mesma sequência de DNA codificam proteínas diferentes. Genes dentro de genes => ocorre quando a sequência de um gene está localizada inteiramente dentro da sequência de outro gene. Marcos Sousa 15 Marcos Sousa 16 Marcos Sousa 17 Gene, como se define? Região operacionalmente testada pelo teste de complementação e que inclui as regiões 5´ e 3´e regiões não codificantes envolvidas na regulação da transcrição e tradução do gene e todos os íntrons dentro dele. Marcos Sousa 18 Promotor Região Codificadora Terminador Promotor Regiões Codificadoras Terminador OPERONOPERON ESTRUTURA DE UM GENE DE PROCARIOTO 4 Marcos Sousa 19 Estrutura e organização do gene estrutura típica de um gene procarioto. Estrutura típica de um gene procarioto. RBS = sítio ligador de ribossomo; ATG = códon de iniciação da síntese protéica; Cds ou ORF = quadro aberto de leitura; stop = qualquer um dos três códons de finalização da síntese protéica; terminador = região terminadora da transcrição Marcos Sousa 20 GENES X ORFs Gene: seqüência que codifica para uma proteína ou RNA conhecidos ORF = open reading frame (fase de leitura aberta): seqüência de nucleotídeos que potencialmente pode codificar para uma proteína Marcos Sousa 21 ESTRUTURA DE UM GENE DE PROCARIOTO Fita Codificadora: orientação 5’ – 3’ Fita Molde: orientação 3’ – 5’ Marcos Sousa 22 ORGANIZAÇÃO DOS GENES EM OPERONS - Número variável de regiões codificadoras - Regiões intercistrônicas variam de 1 a 40 pb - Aproximadamente 20 a 30% dos genes estão em operons Promotor Regiões Codificadoras Terminador OPERONOPERON Marcos Sousa 23 Promotor Região Codificadora Sítio de PoliA hnRNA AAAAAAAAAA mRNA AAAAAAAAAA Exon Intron D N A R N A Splicing ESTRUTURA DE UM GENE DE EUCARIOTO Marcos Sousa 24 Estrutura e organização do gene estrutura típica de um gene Eucarioto. No genoma humano os íntrons iniciam sempre com GU e terminam em AG. 5 Marcos Sousa 25 Algumas informações sobre íntrons 3,7 íntrons por kb de região codificadora No homem o número médio é de 5 íntrons por gene 94 % dos genes contém íntrons O tamanho médio dos íntrons é de 125 pb O tamanho médio dos éxons é de 90 a 120 pb (30 a 40 aa) Marcos Sousa 26 Estrutura e expressão de um gene eucariótico Marcos Sousa 27 Tamanho médio dos genes E. coli – 0,9 kb S. cerevisiae – 1,4 kb D. melanogaster – 11,3 kb H. sapiens – 19,2 kb Marcos Sousa 28 Definição operacional do gene Definição genética de gene Edward B. Lewis => teste de complementação ou cis-trans Permite determinar se duas mutações independentes estão situadas no mesmo gene ou em genes diferentes. Marcos Sousa 29 Marcos Sousa 30 6 Marcos Sousa 31 Relações do complexo gene- proteína Vias alternativas de recomposição do transcrito => isoformas de proteínas Éxons diferentes de um gene podem ser unidos para produzir um conjunto correlato de mRNA codificando uma pequena família de polipetídeos correlata. Marcos Sousa 32 Marcos Sousa 33 Relações do complexo gene- proteína Montagem de genes a partir de segmentos gênicos Exemplo dos sistema imunológico, Cada anticorpo contém quatro polipetídeos, duas cadeias pesadas e duas leves. As sequências de DNA que codificam estas cadeias estão presentes em segmentos gênicos que são unidos para produzir os genes. Marcos Sousa 34 Marcos Sousa 35 Geração de múltiplas cópias de RNA a partir de um único gene Gene da proteína 4.1 de eritrócitos humanos Número de proteínas ≠ número de genes Marcos Sousa 36 Famílias gênicas 25 a 50% dos genes são de cópia única Família gênica: > 40 % de identidade (parálogos) Genes que codificam tRNAs: > 1300 cópias no homem Genes que codificam rRNA (rDNA): de 100 a 200 cópias por genoma Genes que codificam histonas: 300 a 1.000 cópias 7 Marcos Sousa 37 GENES CÓPIAS, PARÁLOGOS OU ORTÓLOGOS Marcos Sousa 38 Seqüência de DNA repetitivo Fração de reassociação rápida DNA de seqüência simples Seqüência curta (5 a 10 pb) repetida milhares de vezes, em tandem. Representa 10 a 15% do DNA Fração de reassociação intermediária Transposons – elementos genéticos móveis LTR - Retrotransposons Não LTR - Retrotransposons LINES SINES Marcos Sousa 39 Retrotransposons (similares a retrovírus) Possuem LTRs (long terminal repeat) – 500 pb Tamanho de 5 a 9 kb – 8,3% do genoma Possuem o gene gag (capsídio) e o pol (polimerase) Marcos Sousa 40 Retrotransposons (similares a mRNA celular) LINESLINES => Long interspersed repetitive elements (transcritos reversos para RNA = RNA polimerase II) (> 10.000 cópias, > 5 kb, codificam para transposase, transpõem com freqüência, 20% do genoma humano) SINESSINES => Short interspersed repetitive elements (transcritos reversos para RNA =>RNA polimerase III => tRNA, rRNA, snRNA) (> 100.000 cópias, < 500 pb, não codificam para transposase, transpõem com freqüência, 13,6% do genoma)
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