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Eletroforese em Gel de Agarose corado com Safer Dye OBJETIVO DA AULA Preparar um gel de agarose e montar uma corrida eletroforética utilizando safer dye como corante. PROCEDIMENTO Preparo do gel de agarose - Selar a forma de eletroforese com fita adesiva. - Utilizando um Erlenmeyer pesar a agarose (concentração de 1,0%) seguindo o quadro abaixo. - Homogeneizar a agarose em 72 mL de TBE 1X. - Vedar o Erlenmeyer com plástico filme e fazer furos. - Aquecer o frasco com agarose em micro-ondas até completa dissolução da agarose; - Homogeneizar - Colocar os pentes na forma de eletroforese. - Esperar temperatura chegar a 50°C e verter o gel na forma (cuidar para não fazer bolhas). -Enquanto ocorre a solidificação do gel de agarose preparar as amostras para corrida. Preparo das amostras e Ladder - Todo o preparo desta etapa deve ser realizado em Banho-gelo. - Em um Eppendorf de 0,5 mL preparar, as amostras e Ladder pipetando cada item na ordem e aplicando a gota dos reagentes no fundo do tubo. Centro Universitário Cesumar – Unicesumar Departamento de Ciências Biológicas e da Saúde Disciplina de Biologia Molecular e Engenharia Genética Amostra Ladder - Safer Dye 1 µL - Safer Dye 1 µL - Loading buffer 2 µL - Loading buffer 2 µL - Amostra 5 µL - Ladder 1kb 2 µL Total 8 µL Total 5 µL - Deixar as amostras em Banho-gelo até o momento de aplicação no gel de agarose. IMPORTANTE: caso a amostra fique distribuída no Eppendorf, colocar na centrífuga e aplicar um minispin para que toda reação se concentre no fundo do tubo. Preparo da corrida eletroforética e aplicação das amostras - Após o gel endurecer, retire a fita adesiva e ajuste a forma na cuba de eletroforese (o local onde esta os poços deve ficar voltado para o pólo negativo/cor preto). - Adicionar tampão TBE 1X até cobrir o gel aproximadamente 2-5 milímetros. - Retirar os pentes do gel de agarose. - Aplicar 10 µL de cada amostra nos respectivos poços e o marcador de peso molécula no primeiro poço. - Feche a tampa da cuba ligue os cabos dos eletrodos na fonte de maneira que o DNA migre para o ânodo. - Ajustar da fonte da eletroforese 100 V, 60 Am, 80W para uma corrida de 60 minutos. - Ligue a fonte. - Corra o gel até que o azul de bromofenol migre a uma distância apropriada - Desligue a fonte, remova os cabos e a tampa da cuba. Revelação e registro dos resultados - Transfira o gel de corrida para o Transiluminador de LED. - Feche a porta e ligue o equipamento. - Fotografar o gel com os resultados. - Despreze o gel em recipiente adequado para inativação. - O tampão TBE 1X deve ser colocado em frasco e marcador a data de uso. Este tampão pode ser reutilizado em outras corridas.