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Ácidos Nucleicos Genes & Genomas Prof. Dr. Sídio Werdes Machado, M.D. Ácidos Nucleicos • O QUE SÃO ÁCIDOS NUCLEICOS? • Lehninger são polinucleotídios de ocorrência biológica onde as unidades (nucleotídios) estão ligadas a uma sequência específica por ligações fosfodiéster. • Stryer são longos polímeros que levam informações sob uma forma que pode ser transmitida de uma geração para a seguinte. São macromoléculas constituídas de um grande número de nucleotídios ligados, cada um composto de uma ose, um fosfato e uma base nitrogenada. DNA e RNA Os ácidos nucleicos foram identificados antes mesmo de se conhecer sua relação com a hereditariedade. Vários experimentos comprovaram sua existência. Composição química DNA RNA Açúcar (pentose) Desoxirribose Ribose Radical químico Fosfato ( PO4 ) Fosfato ( PO4 ) Bases nitrogenadas Pirimidinas Citosina Pirimidinas Citosina Timina Uracila Purinas Adenina Purinas Adenina Guanina Guanina Composição química do DNA Nucleobases não-usuais Composição química do DNA • Molécula formada por duas fitas em antiparalelo • Composição: pentose (desoxirribose), fosfato (PO4) e bases nitrogenadas (adenina-A; timina-T; guanina-G; citosina-C. Nucleotídeo (ou nucleotídio) (unidade dos ácidos nucleicos) Nucleotídio é formado por três partes: um açúcar ligado ao radical fosfato e a uma base nitrogenada. Nucleotídio e nucleosídio Nucleosídio é formado por duas partes: um açúcar ligado a uma base nitrogenada. Pentoses dos ácidos nucleicos • Pentose do RNA (Ribose) C5H10O5 • Pentose do DNA (Desoxirribose) C5H10O4 Bases nitrogenadas (compostos cíclicos com anéis contendo nitrogênio) • Bases pirimidínicas ou pirimídicas (Uracil, Timina e Citosina) • Bases purínicas ou púricas (Adenina e Guanina) Pareamento de bases Pareamento A-T (duas ligações de hidrogênio) e pareamento C-G (três ligações de hidrogênio) Carbono-3 da pentose apresenta OH, enquanto carbono-5 da pentose possui Fosfato. Extremidades 3’ e 5’ Sentido 5’3’ Grupo OH do carbono-3 da pentose anterior liga-se ao fosfato do carbono-5 da pentose seguinte por uma ligação fosfodiéster. Pentose anterior Pentose seguinte Ligação fosfodiéster Na ligação fosfodiéster, o radical fosfato liga-se ao carbono-5 da pentose seguinte e, ao mesmo tempo, ao grupo OH do carbono-3 da pentose anterior. Estrutura do DNA Estrutura Moléculas Primária Sequência de nucleotídios Secundária Estrutura de fita 3D Terciária Superdobramento Quaternária Associação com proteínas (ribossomos e cromossomos). Estrutura secundária do DNA Sulco maior e sulco menor Estrutura terciária do DNA (Superdobramento e giro) A-DNA B-DNA Z-DNA Forma da hélice Mais amplo Intermediário Mais estreito Diâmetro da hélice 25.5 A 23.7 A 18.4 A Sentido do giro Direita Direita Esquerda Par de base por sulco 11 10.4 12 GENOMA • O QUE É GENOMA? Eucarionte: Genoma = DNA cromossômico + DNA mitocondrial e/ou plastidial Procarionte: Genoma = DNA cromossômico+DNA plasmídico Ex: Vibrio cholerae: 2 moléculas de DNA circulares 2, 96 MB (3885 genes); 71% genoma 1,07 MB (plasmídio) Vírus: Genoma = DNA cromossômico ou RNA cromossômico Genoma de procariontes e eucariontes Eucariontes Célula compartimentos celulares delimitados por membranas: animais, plantas, fungos e protistas Genoma 2 ou mais moléculas de DNA lineares DNA mitocondrial e plastidial . menores dimensões e circulares 1x102 Mb- 1x105 MB (o menor = 10 Mb) Procariontes Célula não compartimentalização interna (moneras) Genoma 1 molécula DNA circular haploides 1- 10 Mb (informação genética mais compacta) plasmídios (1 kb-250 kb) Dimensões dos Genomas Genomas de alguns organismos Relação complexidade dos organismos/genoma • Organismos mais complexos devem ter genoma com maiores dimensões. Ex. Homo sapiens (3 Gb), enquanto Drosophila melanogaster (180 Mb). • Paradoxo C (Enigma C) “tamanho do genoma não se correlaciona com a complexidade do organismo”; por exemplo, salamandra (> 90 Gb) e alguns protistas unicelulares possuem genomas muito maiores que os humanos (Homem: 3 Gb) Relação nº de genes com dimensão do genoma • Genoma da levedura Saccharomyces cerevisae (12 Mb) equivale a 0,004 do genoma humano (3 Gb) • Genoma humano tem 35.000 genes x 0,004 = 140 genes para S. cerevisae • Genoma da levedura S. cerevisae contém aproximadamente 5.800 genes Organização do DNA cromossômico em Escherichia coli Um cromossomo circular Tamanho do Genoma: 4.64 milhões bp Número de genes: 4.289 Conteúdo G + C : 51% Organização do DNA cromossômico em eucariotas Organização do DNA cromossômico em eucariotas Organização do DNA cromossômico em eucariotas Organização do DNA cromossômico em eucariotas Nucleossoma: unidade elementar da cromatina Estrutura do nucleossomo Octômero de histonas Estruturas dos cromossomas lineares Classificação dos cromossomos O que é um gene? • Unidade de informação genética contida num segmento de DNA, logo é uma sequência de nucleotídios. O produto final pode ser uma proteína ou um transcrito (ex: tRNA) • Pode variar entre 75 pb e 2.300.000 pb • A informação biológica está contida na sequência de nucleotídios e é tornada disponível através da expressão genética, que é altamente REGULADA. • Os genes estão organizados de diferentes modos nos diferentes organismos Genes de procariontes e eucariontes Gene de procarionte Alguns genes de procariotas estão organizados linearmente sob o controle da mesma região reguladora da transcrição formando um óperon. Gene de eucarionte F I M Aula baseada em Princípios de Bioquímica (Lehninger) Capítulos 1, 2 e 3 – pg. 1- 60
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