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Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 1 LIGAÇÃO GÊNICA 1. CONCEITO Quanto à localização, dois genes podem ser INDEPENDENTES ou LIGADOS. Genes LIGADOS são genes localizados num mesmo CR. Como o número de genes é muito maior que o número de CRS, há “grupos de ligação”. Grupo de ligação é um conjunto de genes localizados num mesmo CR. 2. CONSEQUÊNCIA O fato de dois genes serem ligados afeta a relação gamética dos indivíduos heterozigotos para dois ou mais genes considerados simultaneamente, ou seja, não se aplica o princípio da segregação independente, conforme mostrado adiante. 2.1. Supor dois genes (A/a e B/b) independentes Exemplo: - Espécie 2n = 2X = 4 - Genótipo AaBb As distribuições individuais dos genes A/a e B/b nos gametas desse indivíduo são: Gameta A a Total Gameta B b Total Freqüência 1/2 1/2 1 Freqüência 1/2 1/2 1 A distribuição conjunta dos genes A/a e B/b nos gametas desse indivíduo é obtida por do produto das probabilidade individuais. Gameta AB Ab aB ab Total Freqüência 1/4 1/4 1/4 1/4 1 Freqüência =½ x ½ =½ x ½ =½ x ½ =½ x ½ 1 A relação genotípica esperada entre os descendentes de um cruzamento é conseqüência da relação gamética dos pais: b B a A Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 2 AaBb ↓ AB 1/4 Ab 1/4 aB 1/4 ab 1/4 ⇒ AaBb ↓⊗ A_B_ 9 A_bb 3 aaB_ 3 aabb 1 ; AaBb X aabb ↓ AaBb 1/4 Aabb 1/4 aaBb 1/4 aabb 1/4 Se dois genes A/a e B/b são independentes, na progênie de um cruzamento qualquer tem-se: P ( A_ B_ ) P ( A_ bb ) = = P ( A_ ) x P ( B_ ) P ( A_ ) x P ( bb ) P ( aa B_ ) P ( aa bb ) = = P ( aa ) x P ( B_ ) P ( aa ) x P ( bb ) 2.2. Supor dois genes (A/a e B/b) ligados Exemplo: - Espécie 2n = 2X = 4 - Genótipo AaBb As distribuições individuais dos genes A/a e B/b nos gametas desse indivíduo são: Gameta A a Total Gameta B b Total Freqüência 1/2 1/2 1 Freqüência 1/2 1/2 1 A distribuição conjunta dos genes A/a e B/b nos gametas desse indivíduo é obtida por do produto das probabilidade individuais. Gameta AB Ab aB ab Total Freqüência ≠ 1/4 ≠1/4 ≠1/4 ≠1/4 1 Freqüência ≠ ½ x ½ ≠ ½ x ½ ≠ ½ x ½ ≠ ½ x ½ 1 A relação genotípica esperada entre os descendentes de um cruzamento é conseqüência da relação gamética dos pais: b B a A Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 3 AaBb ↓ AB ≠ 1/4 Ab ≠ 1/4 aB ≠ 1/4 ab ≠ 1/4 ⇒ AaBb ↓⊗ A_B_ ≠ 9/16 A_bb ≠ 3/16 aaB_ ≠ 3/16 aabb ≠ 1/16 ; AaBb X aabb ↓ AaBb ≠ 1/4 Aabb ≠ 1/4 aaBb ≠ 1/4 aabb ≠ 1/4 Se dois genes A/a e B/b são ligados, na progênie de um cruzamento qualquer tem-se: P ( A_ B_ ) P ( A_ bb ) ≠ ≠ P ( A_ ) x P ( B_ ) P ( A_ ) x P ( bb ) P ( aa B_ ) P ( aa bb ) ≠ ≠ P ( aa ) x P ( B_ ) P ( aa ) x P ( bb ) 3. ARRANJO DE GENES LIGADOS Quando dois genes são ligados, o arranjo dos alelos de dois genes pode ser de dois tipos no heterozigoto para ambos os genes. 3.1. Cis ou aproximação Os dois alelos dominantes estão localizados em um membro do par de cromossomos, com os dois recessivos no outro. 3.2. Trans ou repulsão O dominante de um par de alelos e o recessivo do outro estão localizados em um cromossomo do par, com o recessivo do primeiro par de genes e o dominante do segundo no outro cromossomo. 4. PERMUTA ENTRE DOIS GENES B A b a b A B a Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 4 Há distâncias entre dois genes tais que o número de permuta entre eles é “0” ou “1”, na meiose de cada célula. Na ilustração dessas duas possibilidades, está sendo considerado um indivíduo duplo heterozigoto em repulsão. 4.1. Possibilidade 1: não ocorre permuta entre os dois genes ⇒ Sendo 0 % quiasmas, são produzidos 100 % Gametas paternais, sendo 50% Ab e 50% aB 4.2. Possibilidade 2: ocorre uma permuta entre os dois genes ⇒ ocorrendo 100 % quiasmas, são produzidos 50 % gametas paternais (25% Ab e 25% aB no exemplo) e 50 % de gametas recombinantes (25% AB e 255 ab no exemplo) b A b A B a B a b A B a b A B a b A B a P P P P ( Prófase I ) ( Fim da Meiose I ) ( Gametas ) b A B a B A b A b a B a b A b a B A B a P R R P ( Prófase I ) ( Fim da Meiose I ) ( Gametas ) Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 5 4.3. % de quiasmas vs. % gametas recombinantes EXERCÍCIO- Quatro células de um indivíduo passam pela gametogênese, produzindo 16 gametas. Apresente o número de gametas recombinantes caso ocorram permutas em “0”, “1”, “2”, “3” ou “4” das quatro células e verifique a relação que há entre % de gametas recombinantes e % quiasmas. Número de gametas Número de quiasmas % quiasmas Paternais Recombinantes % de gametas recombinantes 0 0 16 0 0 4 100 8 8 50 1 25 14 2 12,5 2 50 12 4 25,0 3 75 10 6 37,5 No quadro acima, observa-se que % gametas recombinantes = 1/2 da % de quiasmas. 5. TIPOS DE DUPLO–HETEROZIGOTOS 5.1. DH p/ dois genes independentes Representação: AaBb Gametas: AB ( 1/4 ) Ab ( 1/4 ) aB ( 1/4 ) ab ( 1/4 ) No cruzamento AaBb x AaBb ocorre PF = 9 : 3 : 3 : 1 No cruzamento AaBb x aabb ocorre PF = 1 : 1 : 1 : 1 No cruzamento AaBb x AaBb, P (aabb) = P (ab) x P (ab) = 1/16 5.2. DH p/ dois genes ligados em aproximação Representação: A B/a b b B a A Gametogênese Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 6 Gametas: AB ( > 1/4 ) ← P Ab ( < 1/4 ) ← R aB ( < 1/4 ) ← R ab ( > 1/4 ) ← P No cruzamento AaBb x AaBb não ocorre PF = 9 : 3 : 3 : 1 No cruzamento AaBb x aabb não ocorre PF = 1 : 1 : 1 : 1 No cruzamento AaBb x AaBb, P (aabb) = P (ab) x P (ab) > 1/16 5.3. DH p/ dois genes ligados em repulsão Representação: A b/a B Gametas: AB ( < 1/4 ) ← R Ab ( > 1/4 ) ← P aB ( > 1/4 ) ← P ab ( < 1/4 ) ← R No cruzamento AaBb x AaBb não ocorre PF = 9 : 3 : 3 : 1 No cruzamento AaBb x aabb não ocorre PF = 1 : 1 : 1 : 1 No cruzamento AaBb x AaBb, P (aabb) = P (ab) x P (ab) < 1/16 EXERCÍCIO- Considere que na espécie humana os genes A/a (catarata / normal) e B/b (polidactilia / normal) estejam localizados num mesmo CR, muito próximos, de modo que não ocorra permuta entre eles. Indique a proporção fenotípica esperada na descendência dos dois casais abaixo. a) Casal 1: mulher normal com homem que apresenta ambas as doenças, sendo que o pai desse homem tem catarata e a mãe tem polidactilia. Resposta: o filho apresentará catarata (50%) ou polidactilia (50%).b) Casal 2: mulher normal com homem que apresenta ambas as doenças, sendo que o pai desse homem é normal e a mãe tem catarata e polidactilia. Resposta: o filho apresentará as duas doenças (50%) ou nenhuma (50%). B a b A Gametogênese b a B A Gametogênese Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 7 6. DISTÂNCIA ENTRE DOIS GENES P (Ad + aD) > P (AB + ab) > P (BD + bd) > distância > probabilidade de ocorrer permuta > % de quiasmas > freqüência de gametas recombinantes (r). Unidade de medida: unidade de mapa ou centimorgam (cM) – é a distância para a qual se observa 1% de gametas recominantes. Relação entre unidade de mapa e % de gametas recombinantes. GRÁFICO Distâncias de até 25 unidades de mapa entre dois genes: unidade de mapa ou cM = % de gametas recombinantes. Distâncias acima de 25 unidades de mapa entre dois genes: unidade de mapa ou cM > % de gametas recombinantes. EXERCÍCIO- Complete os espaços do quadro abaixo com genótipos e/ou com freqüências esperadas: % quiasmas, freqüência de gametas recombinantes (r), freqüência de cada tipo de gameta e (ou) distância em cM. Caso não seja possível completar algum (ns) dos espaços com as informações solicitadas, complete-o(s) com o sinal gráfico “?”. b D A B d a A D A d a D a d P R R P A B A b a B a b R P P R B D B d b D b d R P P R Gametas: Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 8 Indivíduo Genótipo % quiasmas r Gametas e freqüências esperadas cM 1 ____ ____ ____ AB ____ Ab ____ aB ____ ab 5% ____ 2 AB//ab ____ ____ AB ____ Ab ____ aB ____ ab ____ 10 3 ____ ____ ____ DE ____ De ____ dE ____ de 0,4 ____ 4 Fg//fG ____ 0,3 FG ____ Fg ____ fG ____ fg ____ ____ 7. ESTIMATIVA DA DISTÂNCIA ENTRE DOIS GENES As distâncias entre dois genes podem ser estimada por meio de uma geração F2 ou por meio da DESCENDÊNCIA DE UM CRUZAMENTO TESTE: P > ¼ P > 1/4 R < 1/4 R < 1/4 a b //ab //ab //ab //ab ( n1 ; > 1/4) ( n2 ; > 1/4) ( n3 ; < 1/4) ( n4 ; < 1/4) PF na descendência do CT = R. Gamética produzida pelo DH % recombinantes = 100x esdescendentdeTotal tesrecombinande.N O 100x nnnn nn 4321 43 +++ + = = cM = distância, se < 25%. EXERCÍCIO 1- No caupi, o alelo A, dominante, é responsável pela resistência ao Vírus da Mancha Anelar e o alelo B, também dominante, confere resistência ao Vírus do Mosaico. O cruzamento de uma planta resistente às duas doenças, com uma suscetível produziu a seguinte descendência: 145 plantas resistentes aos dois vírus; 151 plantas suscetíveis aos dois vírus; 450 plantas resistentes apenas ao vírus da Duplo Heterozigoto x Homozigoto Recessivo Descendência: 1 tipo: a b 4 tipos de gametas: 2 R 2 P Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 9 mancha anelar e 440 plantas resistentes apenas ao vírus do mosaico. a) Os genes são ligados? Justifique! b) Qual é a distância entre os dois genes? c) Atribuir genótipos d) Qual é a fase de ligação dos genes no progenitor resistente? Solução: A_ = resistente ao vírus da mancha anelar aa = suscetível B_= resistente ao mosaico bb = suscetível 145 Plantas resistentes aos dois vírus AB//ab 151 “ suscetíveis “ “ “ ab//ab 450 “ resistentes apenas ao vírus da mancha anelar Ab//ab 440 “ “ “ “ “ do mosaico aB//ab 1186 a) Os genes são ligados? Justifique ! Sim, pq as proporções observadas na descendência ....... b) Qual é a distância entre os dois genes? 96,24100x 440450151145 151145 tesrecombinangametas% = +++ + = ⇒ distância = 24,96 cM. c) Atribuir genótipos. Acima. d) Qual é a fase de ligação dos genes no progenitor resistente? Repulsão: Ab//aB EXERCÍCIO 2- No caupi, os genes A/a e B/b conferem resistência a dois vírus, conforme explicado no exercício anterior, e estão localizados num mesmo cromossomo, a 25 cM de distância. Uma variedade resistente aos dois vírus foi cruzada com uma variedade suscetível. A geração F1 resultante foi submetida a um cruzamento teste produzindo 2000 descendentes. Qual é o n.o esperado de cada fenótipo? Resistente 2 doenças x Suscetível 2 doenças A b a B a b a b Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 10 ab N.º esperado em 2000 AB AB//ab 0,375 ( res. duas doenças ) 750 Ab Ab//ab 0,125 ( res. apenas v. m. anelar) 250 AB aB//ab 0,125 ( res. apenas v. mosaico ) 250 ab Ab//ab 0,375 ( suscet. duas doenças ) 750 EXERCÍCIO 4- Um homem produz 5% de espermatozóides AB. Pede-se: a) os genes A/a e B/b estão ligados, explique; Sim, se fossem independentes, esse gameta ocorreria na freqüência de 1/4 b) qual é o genótipo desse homem; A b//aB c) qual é a freqüência de gametas Ab produzidos por esse homem; 45% d) qual é a distância entre os genes A/a e B/b e 10 cM e) durante a gametogênese, em que porcentagem de células ocorre permuta entre os genes A/a e B/b? 20 % EXERCÍCIO 3- Pericarpo vermelho no milho é devido ao alelo dominante I, enquanto pericarpo incolor é condicionado pelo alelo recessivo i. Sementes no pendão são devidas ao alelo recessivo s, enquanto pendão normal depende do alelo S. O cruzamento teste de 2 plantas produziu a seguinte descendência: P1 P2 Pericarpo vermelho, pendão com sementes 15 580 " Incolor, " normal 14 610 " " , " com sementes 1174 8 P ) Variedade resistente x Variedade suscetível F1 a b a b A B A B A B a b x a b a b 100% ab 0,375 aB AB Ab ab 0,375 0,125 0,125 Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 11 " vermelho, " normal 1219 9 2422 1207 a) Quais são os genótipos das plantas 1 e 2? P1 = IS//is; P2 = Is//iS b) Qual é a distância entre os dois genes? (1,3 cM) c) Qual é a freqüência esperada plantas com pericarpo incolor e semente no pendão, na descendência resultante: c1) do cruzamento entre as plantas 1 e 2; (0,0032 ou 0,32%) P = P( is ) x P ( is ) = 0,4935 x 0,0065 = (0,0032 ou 0,32%) c2) da autofecundação da planta 1; (0,24 ou 24%) c3) da autofecundação da planta 2? (4,225X10-5 ou 0,004225%) 7. TRÊS GENES 7.1. Cálculo de distâncias maiores que 20 cM Se dois genes A/a e D/d são ligados com distância maior que 20 cM é possível ocorrerem duas permutas entre eles (podem ocorrer 0, 1 ou 2 permutas entre os dois genes). Permutas duplas produzem, em média, 50% gametas recombinantes (o mesmo percentual que as permutas simples) ⇒ DA/a-D/d > % de gametas recombinantes.Exemplo: Genes r Distância A/a – D/d 0,36 ou 36% ?; > 36 cM No cálculo da distância entre os genes A/a e D/d é necessário envolver gene(s) intermediário(s), cujas distâncias em relação a esses genes sejam menores que 20cM. Considere um gene intermediário (B/b) de forma que • DA/a-B/b < 25 unidades de mapa • DB/b-D/d < 25 unidades de mapa Então Gametas D A d a A D ( P; 0,25 em média ) a d ( P; 0,25 em média ) A d ( R: 0,25 em média ) a D ( R; 0,25 em média ) Permuta Permuta Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 12 • DA/a-D/d = DA/a-B/b + DB/b-D/d Exemplo: Genes r distância A/a – B/b 0,20 ou 20% 20 cM B/b – D/d 0,174 ou 17,4% 17,4 cM A/a – D/d 0,36 ou 36% 37,4 cM 7.2. Gametas de um triplo-heterozigoto e determinação da ordem dos genes A determinação da ordem de três genes consiste em identificar o gene que ocupa a posição central. Ex.: L/l – N/n – M/m = M/m – N/n – L/l Considerando que a ordem dos genes é conhecida, o esquema abaixo mostra a relação que há entre a ocorrência de permutas e o aparecimento dos oito tipos de gametas do triplo-heterozigoto. Observe nesse esquema que a ordem pode ser determinada pela comparação entre gametas paternais e resultantes de permuta dupla. • Paternais ( > freqüência ) • Permuta dupla ( < freqüência ) • Diferem apenas com relação ao gene que ocupa a posição central. 7.3. Distância entre os genes Gametas A b D a B d a b D A B d A b d a B D A B D a b d R1 R2 b D A B d a P R1 R2 R1 e R2 Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 13 DA/a-D/d = DA/a-B/b + DB/b-D/d DA/a-B/b pode ser obtida • da maneira vista para dois genes, desconsiderando-se o gene D/d, ou • 100x esdescendentdeTotal RRRR DD11 +++ DB/b-D/d pode ser obtida • da maneira vista para dois genes, desconsiderando-se o gene A/a, ou • 100x esdescendentdeTotal RRRR DD22 +++ (Nessas expressões considerou-se o esquema do item 7.2 ) EXERCÍCIO- O cruzamento de um indivíduo triplo-heterozigoto com um triplo- recessivo produziu a seguinte descendência: l m n 6 m l n RD L M n 196 M L n R1 L m N 170 m L N R2 l M n 164 M l n R2 L m n 636 m L n P l m N 190 m l N R1 L M N 8 M L N RD l M N 630 M l N P 2000 a) Qual é a ordem dos genes ? R: R: L / l ocupa posição central ⇒ M/m – L/l – N/n ou N/n – L/l – M/m b) Qual é o genótipo do genitor heterozigoto ? R: nLm NlM c) Quais são as distâncias entre os genes ? Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 14 M/m – L/l L/l – N/n M/m – N/n cM20100x 2000 86190196 = +++ cM4,17100x 2000 16417086 = +++ 37,4 Outra maneira: ML → 204 = 196+8 Ml → 794 = 164+630 mL → 806 = 170+636 ml → 196 = 6 + 190 dM/m-L/l = cM20100x2000 204196 = + LN → 178 = 170+8 Ln → 832 = 196+636 lN → 820 = 190+630 ln → 170 = 6 +164 cM4,17100x 2000 170178d n/Nl/L = + = − d) Qual é a porcentagem de gametas recombinantes (r) produzidos por um duplo- heterozigoto para os M/m e N/n? MN → 638 = 8+630 Mn → 360 = 196+164 mN → 360 = 170+190 mn → 642 = 6+636 cM36100x 2000 360360 r = + = 7.4. Interferência e coincidência • A ocorrência de permuta em uma parte do cromossomo não é independente da permuta em outra parte adjacente desse cromossomo. • Interferência: uma vez ocorrida uma permuta, a probabilidade de ocorrer outra em uma região adjacente fica reduzida • 100x Total RRFRDO DD += = freqüência de recombinantes duplos região 1 região 2 a b c Roteiro de aula da disciplina “BIO 240 - Genética”/DBG/UFV. Professor: Marcos Ribeiro Furtado “Ligação Gênica”. 15 100x Total RR x Total RRFRDE 2211 ++= 100 distânciasduasdasproduto = FRDO < FRDE ⇒ ocorrência de interferência • A interferência varia entre partes de um mesmo CR e entre CRS • Os graus de interferências são comumente expressos em coeficientes de coincidência FRDE FRDOiaCoincidênc = • FRDE FRDOFRDE FRDE FRDO1ciaInterferên −=−=
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