Prévia do material em texto
Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas Universidade Federal de UberlândiaUniversidade Federal de Uberlândia Instituto de Genética e BioquímicaInstituto de Genética e Bioquímica Disciplina de Bioquímica Disciplina de Bioquímica –– Curso de Ciências BiológicasCurso de Ciências Biológicas Profa. Dra. Veridiana M. R. AvilaProfa. Dra. Veridiana M. R. Avila ProteínasProteínas Fitocromo ProteínasProteínas Hormônios Todos os organismos são constituídos porTodos os organismos são constituídos por: : órgãos…órgãos…célulascélulas…… e estes contéme estes contém estruturas estruturas supramolecularessupramoleculares constituídas porconstituídas por proteínasproteínas 4 Estrutura e Função de proteínasEstrutura e Função de proteínas Compreender a dinâmica dos processos Compreender a dinâmica dos processos biológicosbiológicos Compreender a patologia Compreender a patologia e encontrar e encontrar Métodos terapêuticosMétodos terapêuticos A função das proteínas (aminoácidos) no metabolismo A função das proteínas (aminoácidos) no metabolismo Aminoácidos: Os blocos Aminoácidos: Os blocos construtores das proteínasconstrutores das proteínas •• Por que precisamos conhecer esse assunto?Por que precisamos conhecer esse assunto? • O conhecimento das propriedades químicas e funcionais dos aminoácidos pode ser fundamental para o entendimento em nível molecular dopara o entendimento em nível molecular do funcionamento de proteínas e outros compostos relacionados e isto possibilita entre várias funções, estudar a catálise enzimática, a regulação de vários processos celulares, além de permitir o desenho de novos fármacos, etc. Antes de se compreender a estrutura e função das Antes de se compreender a estrutura e função das proteínas vamos entender melhor a estrutura, as proteínas vamos entender melhor a estrutura, as propriedades químicas e funcionais de quem as propriedades químicas e funcionais de quem as compõemcompõem Aminoácidos Aminoácidos em proteínas • Fazem parte da constituição das proteínas • 20 • α-aminoácidos (grupos amina e carboxilo ligados ao carbono 2 (carbono α)) Aminoácidos Aminoácidos livres • Presentes no organismo no estado livre • centenas • Funções especializadas (ex: intermediários de reações metabólicas) NomenclaturaNomenclatura • O químico holandês Gerardus Mulder foi o primeiro a utilizar o termo proteína em 1838 • Do grego proteus: primário o mais importante Amino Acid 3-Letter Code 1-Letter Code Molecular Weight† Hydrophobicity‡ Alanine Ala A 89.09 0.616 Cysteine Cys C 121.16 0.680 Aspartate Asp D 133.10 0.028 Glutamate Glu E 147.13 0.043 Phenylalanine Phe F 165.19 1.00 Glycine Gly G 75.07 0.501 Histidine His H 155.16 0.165 Isoleucine Ile I 131.18 0.943 Lysine Lys K 146.19 0.283 Abreviaturas dos aminoácidosAbreviaturas dos aminoácidos Lysine Lys K 146.19 0.283 Leucine Leu L 131.18 0.943 Methionine Met M 149.21 0.738 Asparagine Asn N 132.12 0.236 Proline Pro P 115.13 0.711 Glutamine Gln Q 146.15 0.251 Arginine Arg R 174.20 0.000 Serine Ser S 105.09 0.359 Threonine The T 119.12 0.450 Valine Val V 117.15 0.825 Tryptophan Trp W 204.23 0.878 Tyrosine Tyr Y 181.19 0.880 Aminoácidos proteicos são L- α - aminoácidos O Carbono α é assimétrico, ou seja, tem 4 ligantes diferentes COOCOO C C —— HH RR HH33N N —— ++ αααα Estrutura dos aminoácidos: a importância da Estrutura dos aminoácidos: a importância da estereoisomeriaestereoisomeria Existem 2 isômeros ópticos do Cα: formas L e D • são enantiômeros (imagens especulares) um do outro • não são interconversíveis sem quebra de ligações covalentes Essa propriedade define o Cα como um centro quiral e confere propriedades ópticas às moléculas. Estereoisomeria e atividade óptica A quiralidade (ou assimetria) do carbono α (ligação a 4 grupos diferentes) confere aos aminoácidos actividade óptica enantiômeros + 4. Observador gira a escala até coincidir com a luz emergente, para determinar o desvio Isomeria óptica Substâncias ópticamente ativas (possuem C quirais) interagem com a luz polarizada, girando o plano da luz para esquerda (levógiros) ou para a direita (dextrógiros) Essa propriedade foi inicialmente descoberta para ácidos orgânicos e açúcares, com vários C quirais. L-α-aminoácido Proteínas naturais possuem somente L-aminoácidos D-Aminoácidos ocorrem em peptídeos antibióticos COOCOO C C —— HH RR HH33N N —— ++ αααα - Fonte de luz Filtro polarizador 1. Um plano de luz é selecionado 2. Solução de substância opticamente ativa causa rotação do plano da luz polarizada 3. Plano da luz que emerge da solução foi desviado para a esquerda ou para a direita pela substância em solução determinar o desvio Levógiro: indicado por ( - ) giro da luz para esquerda Dextrógiro: indicado por ( + ) giro da luz para direita Um polarímetro Quais são as estruturas e as propriedades dos aminoácidos individuais? Classificação AA forma mais lógica de classificá-los baseia-se na polaridade do grupo Rpolaridade do grupo R e na sua carga carga elétrica elétrica para valores de pH fisiológicos Aminoácidos com grupos R não Aminoácidos com grupos R não polarespolares O AMINOÁCIDO PROLINA CONTEM UMA CADEIA LATERAL UNIDA TANTO AO CARBONO αααα COMO AO αααα - AMINOGRUPO. AMINOÁCIDOS DE CADEIA LATERAL AMINOÁCIDOS DE CADEIA LATERAL AROMÁTICA.AROMÁTICA. Os 3 aas apresentam cadeias laterais com graus variáveis de apolaridade, devido aos anéis aromáticos. A Tyr apresenta uma hidroxila ligada ao anel aromático e o Trp apresenta o N do anel indol que dão características mais polares a estes radicais. AMINOÁCIDOS DE AMINOÁCIDOS DE CADEIA LATERAL CADEIA LATERAL POLAR E NEUTRAPOLAR E NEUTRA.. O AMINOÁCIDO CISTEINA GERALMENTE APARECE AOS PARES NAS PROTEÍNAS, O AMINOÁCIDO CISTEINA GERALMENTE APARECE AOS PARES NAS PROTEÍNAS, FORMANDO PONTES DISSULFETO QUE ESTABILIZAM A ESTRUTURA TERCIÁRIA DE FORMANDO PONTES DISSULFETO QUE ESTABILIZAM A ESTRUTURA TERCIÁRIA DE PROTEÍNAS.PROTEÍNAS. Pontes S-S: Formação de pontes dissulfeto Como ocorre a interação de dois aminoácidos cisteína? Aminoácidos com grupos R Aminoácidos com grupos R carregados positivamentecarregados positivamente + H Aminoácidos com grupos R Aminoácidos com grupos R carregados negativamentecarregados negativamente AMINOACIDOS NÃO PADRÕES ENCONTRADOS EM PROTEINAS. �Além da sua função nas proteínas, os aminoácidos e os seus derivados têm muitas funções biológicas importantes... neurotransmissores Mediador de reacções alérgicas Hormona da tiróide que estimula o metabolismo Itermediário no metabolismo de aminoácidos Aminoácidos livres ou “não proteicos” Itermediários da biosíntese da ureia antibiótico Alguns aminoácidos merecem atenção especial por serem precursores de diversos hormônios e neurotransmissores • Síntese da Epinefrina; • Síntese do GABA (y-aminobutirato); • Síntese da Histamina;• Síntese da Histamina; • Síntese da Serotonina • Síntese dos hormônios tireoidianos Síntese da epinefrina Tirosina Epinefrina Síntese do GABA Síntese da Histamina Síntese da serotonina Aminoácidos têm propriedades ácido-básicas específicas Quando um aminoácido é dissolvido em água, ele existe na solução como um íon dipolar, ou “zwitterion” (do alemão, ‘íon híbrido”)alemão, ‘íon híbrido”) A ionização dos grupos amino e carboxílico varia, dependendo da variação do pH do meio. Caráter Caráter AnfóteroAnfótero variação do pH do meio. EQUAÇÃO DE IONIZAÇÃO DE UM AMINOÁCIDO.EQUAÇÃO DE IONIZAÇÃO DE UMAMINOÁCIDO. A B C (totalmente protonada) (Zwitterionica) (totalmente desprotonada) +1 0 –1 HA pK1 A HA pK2 A DISSOCIAÇÃO DE UM ÁCIDODISSOCIAÇÃO DE UM ÁCIDO Considere a equação geral de dissociação de um ácido HA dada abaixo: Quando a velocidade da reação 1 iguala-se a da reação 2, atingiu-se o ponto de equilíbrio. Pode-se dizer que a reação “terminou”, pois não há mais modificação das quantidades dos reagentes ou produtos de ambas as reações. H A H+ + A- v1 v2 Desprotonação (1) H A H+ + A- v1 v2 Protonação (2) (quando v1 é igual a v2)Keq = Kd = [ H +] . [A-] HA A Lei de Ação da Massas permite calcular a constante de equilíbrio da reação de dissociação do ácido, ou constante de dissociação, como se segue: OO pK é igual ao logaritmo negativo da KdpK é igual ao logaritmo negativo da Kd Observe os valores de pKs da tabela abaixo. pK dos α-NH3+ valor médio ~ 9.0pK dos α-COOH valor médio ~ 2.0valor médio ~ 2.0 Comportamento ácido-básico de aminoácidos: ionização Meio alcalino carga (-) Abaixo estão 4 formas de um aminoácido variando o estado de ionização do grupo amino e do grupo carboxila. Qual dessas formas de um aminoácido não pode existir ? Porque ? Meio ácido carga (+) Forma Forma anfotéricaanfotérica (sem carga)(sem carga) presente em pH fisiológicopresente em pH fisiológico Aminoácidos, peptídeos e proteínas são bons Aminoácidos, peptídeos e proteínas são bons tampõestampões Um tampão é definido como um composto ou conjunto de compostos que impedem variações da concentração de [H+], ou seja do pH, do meio. Para ter essa propriedade, os compostos devem ter grupos ionizáveis capazes de doar e de receber prótons H+ A faixa de pH em que um composto apresenta poder tamponante depende do pK de seus grupos ionizáveis. A Lei de Henderson-Hasselbach estabelece a correlação entre o pH do meio e o pK do tampão. QuandoQuando [ H+ ]. [ A- ] = [ HA ] pH = pK + log 1 zerozero [ H+ ] . [A-] [ HA ] = 1 ,,Temos queTemos que pH = pKpH = pKsubstituindo na equação:substituindo na equação: pH = pK + log [ H + ] . [A-] [ HA ] H AA- + H+ 50% 50% • o poder tamponante é máximo no pKpK pois há igual proporção das formas doadora e aceptora de prótons: Traduzindo: • quando o pHpH do meio é igualigual ao pKpK do grupo ionizável, este está 50%50% dissociado pK pK αααααααα −−−−−−−− NHNH33++ = 9.60= 9.60 pK pK αααααααα −−−−−−−− COOH = 2.34COOH = 2.34 Cálculo do ponto isoelétricoCálculo do ponto isoelétrico pI = pI = 2.34 + 9.62.34 + 9.6 = 5.97= 5.97 2 2 OHO pH 0 pH 0 -- 22 pH 2,34pH 2,34 pH 3.0 pH 3.0 -- pH 9.0pH 9.0 pH 9.6pH 9.6 pH 10 pH 10 -- 1414 OHO OO Como o estado de ionização e a carga elétrica da glicina variam em função do pH do meio? Como a GLICINA funcioaria como um TAMPÂO ? Para a glicina os valores de pK são: C OO 50% +1 -H+ +H+ -H+ +H+ +1 50%C CH2 NH3 + OHO C CH2 NH3++ OO ++ 50% C HC-H NH3+ OHO αααα C CH2 NH2 OO -1-H+ +H+ -H+ +H+ Em pH < 2,34, todos os grupos ionizáveis da glicina estão protonados. A molécula apresenta carga +1. Diminuindo a [H+] do meio, a α-COOH começa a desprotonar. No pH 2,34, metade das –COOH desprotonaram, gerando a glicina com carga zero. Em pH 5,97 ocorre o ponto isoéletrico da glicina. 100% das moléculas estão com carga zero. Aumentando mais o pH, até o valor 9,6, (pK do NH3+), haverá 50% de moléculas de glicina com carga -1. C CH2 NH3++ OO Em pH > 10 predomina a forma de glicina com carga -1. C CH2 NH3 + C CH2 NH2 OO ++ 50% 50% -1 Poder tamponante e curva de titulação da glicina A curva mostra a variação do pH de uma solução do aminoácido glicina quando se adiciona uma base, por exemplo, NaOH. A glicina vai se dissociando, e libera H+ para o meio. O poder tamponante da glicina pode ser observado em dois pontos da curva, em que o aumento de pH é mais lento. Observe que o pH da solução na metade pK α -NH3+ = 9.60 pK α -COOH = 2.34C NH3+ - C - H H O-O αααα adição de NaOH Observe também que há um ponto da curva onde o pH varia bruscamente. Nessa região ocorre o ponto isoelétrico (pI) da glicina, em que 100% das moléculas apresentam carga zero, como visto abaixo. Observe que o pH da solução na metade desses trechos da curva coincide com os valores de pK dos grupos ionizáveis da glicina. O efeito tampão nesses pHs ocorre por que há duas formas de glicina presentes na solução, uma dissociada (50%) e outra não, como mostra a figura. Glicina (forma anfotérica – carga zero) EQUAÇÃO DE IONIZAÇÃO E CURVA DE TITULAÇÃO DA Glicina EQUAÇÃO DE IONIZAÇÃO E CURVA DE TITULAÇÃO DO GLUTAMATO. EQUAÇÃO DE IONIZAÇÃO E CURVA DE TITULAÇÃO DO AMINOÁCIDO HISTIDINA. No seu pH isoelétrico, um aminoácido possui carga líquida nula Usando os valores de pK tabelados e as fórmulas dos aminoácidos apresentados alguns slides atrás, calcule o ponto isoelétrico e desenhe as formas ExercitandoExercitando emem casa:casa: calcule o ponto isoelétrico e desenhe as formas ionizadas em pH 1, 7 e 12 de um aminoácido: a) Hidrofóbico b) Hidrofílico neutro c) Ácido d) Básico e) da prolina (grupo especial)