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FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA SDE3895 Profa. Dra. Edjane Fabiula Buriti da Silva edjane.silva@estacio.br Aminoácidos e Peptídeos Aminoácidos e Peptídeos Definição Estrutura e Propriedades Curvas de Titulação Ligação Peptídica Peptídeos Aminoácido É uma molécula orgânica que contém um grupo amina e um grupo carboxila, e uma cadeia lateral que é específica para cada aminoácido. Plano de Ensino Aminoácidos e Peptídeos Aminoácidos e Peptídeos Grupo carboxila (ácido carboxílico) Grupo Amina Hidrogênio Grupo “R” (cadeia lateral) Sendo o R que define as propriedades de cada aminoácido de acordo com suas características de estrutura, tamanho, caga elétrica, solubilidade. Carbono α Assim, pode-se afirmar que: O grupo R determina a identidade de um aminoácido específico; Os elementos-chave de um aminoácido são carbono (C), hidrogênio (H), oxigênio (O) e nitrogênio (N); Alguns aminoácidos também podem conter enxofre; Uma das propriedades mais importantes é a sua forma tridimensional, ou Estereoquímica. Aminoácidos e Peptídeos Aminoácidos e Peptídeos Esterioquímica - é um ramo da química que estuda as disposições espaciais de moléculas. Cloro-metano (Superponível) Ácido lático (Não superponível) - Quiral Molécula Quiral É definida como aquela que não é superponível com a sua imagem especular. Uma molécula quiral e sua imagem especular são chamadas de um par de enantiômeros. Aminoácidos e Peptídeos Aminoácidos e Peptídeos A B C D L (Laevus)– Hidrogênio está do lado esquerdo da molécula D (Dexter)– Hidrogênio está do lado direito da molécula Aminoácidos e Peptídeos Resumidamente: Em um aminoácido, a posição do grupo amina no lado esquerdo ou direito do carbono α designa L ou D; Os aminoácidos que ocorrem em proteínas são todos de forma L; Os de forma D ocorrem na natureza, mais frequentemente em paredes de células bacterianas e antibióticos; No entanto não são encontrados em proteínas. Atenção! Aminoácidos e Peptídeos Estrutura e Propriedades Polaridade Acidez/Basicidade Grupos funcionais Natureza dos grupos funcionais Aminoácidos e Peptídeos Grupo I - Aminoácidos com Cadeias Laterais Apolares Desse grupo fazem parte a alanina, a valina, a leucina, a isoleucina, a prolina, a fenilalanina, o triptofano e a metionina; Em alguns esquemas de classificação, a glicina é inserida nesse grupo; Em vários elementos do grupo, a cadeia lateral é um grupo de hidrocarbonetos alinfáticos; Aminoácidos e Peptídeos Aminoácidos e Peptídeos Leucina Alanina Valina Prolina Atenção! O grupo amina da prolina é uma amina secundária; Todos os outros aminoácidos são aminas primárias; Na fenilalanina, o grupo hidrocarboneto é aromático; No tripofano a cadeia lateral apresenta um anel indol, aromático; Na metionina contém um átomo de enxofre. Aminoácidos e Peptídeos Grupo II - Aminoácidos com Cadeias Laterais Polares Eletricamente Neutras Desse grupo fazem parte a serina, a treonina, a tirosina, a cisteína, a glutamina e a asparagina; A glicina é inserida nesse grupo por ser eletricamente neutra; Na serina e na treonina, o grupo polar é uma hidroxila (-OH); Aminoácidos e Peptídeos Aminoácidos e Peptídeos Glutamina Asparagina Glicina Serina Atenção! O grupo hidroxila na tirosina, eventualmente perde um próton em pH’s mais altos; Na cisteína, a cadeia lateral polar constitui-se de um grupo tiol (-SH); Os glutamina e Asparagina, possuem grupos amida, os quais são derivados de grupos carboxila, em sua cadeia lateral; As ligações amida não se ionizam na faixa de pH normalmente encontradas em bioquímicas. Aminoácidos e Peptídeos Grupo III - Aminoácidos com Grupos Carboxila em Suas Cadeias Laterais (ácidas) Dois aminoácidos, o ácido glutâmico e o ácido aspártico, possuem grupos carboxila em sua cadeia lateral; O grupo carboxila pode perder um próton, formando o ânion carboxilato correspondente (glutamato e aspartato); Os grupos amida da cadeia lateral são eletricamente neutros; Aminoácidos e Peptídeos Aminoácidos e Peptídeos Ácido Aspártico Ácido Glutâmico Metionina Isoleucina Tirosina Cisteína Grupo IV - Aminoácidos com Cadeias Laterais (Básicas) Três aminoácidos, a histidina, a lisina e a arginina, possuem cadeia lateral básica; Em todos eles a cadeia lateral é carregada positivamente em torno do pH neutro; Na arginina, o grupo básico da cadeia lateral, o grupo guanidina, é mais complexo em estrutura do que o grupo amina; Aminoácidos e Peptídeos Histidina Lisina Arginina Aminoácidos e Peptídeos Aminoácidos Incomuns Esses aminoácidos são produzidos por modificações derivadas de aminoácidos comuns depois que a proteína é sintetizada pelo organismo, pós-tradução; Aminoácidos e Peptídeos Aminoácidos e Peptídeos A hidroxilisina e a hidroxiprolina diferem-se dos aminoácidos parentais por possuírem grupos hidroxila em suas cadeias laterais; São encontradas somente em algumas proteínas de tecidos conjuntivos, como o colágeno; A tiroxina difere-se da tirosina por ter um grupo aromático extra que contém iodo na cadeia lateral; É encontrada somente na glândula tireóide, ligada à proteína tiroglobulina. Resumidamente... Aminoácidos não-essenciais - ou dispensáveis são aqueles que o corpo humano pode sintetizar. São eles: alanina, asparagina, ácido aspártico, ácido glutâmico e serina. Aminoácidos essenciais - são aqueles que não podem ser produzidos pelo corpo humano. Dessa forma, são somente adquiridos pela ingestão de alimentos, vegetais ou animais. São eles: fenilalanina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, treonina, tripttofano, histidina e valina. Aminoácidos essenciais apenas em determinadas situações fisiológicas - são os aminoácidos que devido a determinadas patologias, não podem ser sintetizados pelo corpo humano. São eles: arginina, cisteína, glicina, glutamina, prolina, tirosina. Aminoácidos e Peptídeos Aminoácidos e Peptídeos Doador de H+ (Ácido) Aceptor de H+ (Base) Curvas de Titulação Substância anfotérica, ou anfólito, ou anfiprótico Aminoácidos e Peptídeos Ionização da alanina Curva de titulação da glicina Dois patamares de tamponamento, um para cada grupamento ativo do ponto de vista ácido-base: uma amina e uma carboxila; Em pH extremamente baixo temos a predominância da forma totalmente protonada; Em pH 2.34 ( pH =pKa temos a carboxila semititulada e quantidades equimolares das espécies negativa e neutra; Em pH 5,97 a carboxila está totalmente titulada, a espécie zwiteriônica é a predominante; Informações obtidas com a curva de titulação: Dois patamares de tamponamento Valores de pK1 e pK2 Espécies envolvidas e suas cargas elétricas 1+ 0 1- Aminoácidos e Peptídeos Assim... O pH no qual uma molécula tem carga líquida de zero é chamado de pH isoelétrico (PI); Nele, uma molécula não migrará em um campo elétrico; Essa propriedade pode ser utilizada em métodos de separação; O PI de um aminoácido pode ser calculado pela seguinte equação: 𝑃𝐼 = 𝑝𝐾𝑎1 + 𝑝𝐾𝑎2 2 Aminoácidos e Peptídeos Aminoácidos e Peptídeos É simplesmente uma estatística que mostra o percentual com que cada aminoácido aparece num universo de 1500 proteínas seqüenciadas. O que é Índice de hidrofobicidade? É uma escala teórica que procura estimar se as cadeias laterais dos aminoácios vão procurar ambientes aquosos (como o citoplasma) ou lipídicos (como as membranas celulares). Valores negativos indicamhidrofilicidade Valores positivos indicam hidrofobiciadade. ... Pode ser usado para estimar como uma proteína de membrana se insere na bicamada lipídica Aminoácidos e Peptídeos Asparagina foi o primeiro encontrada em aspargos, Glutamato no glúten de trigo; Tirosina foi isolada pela primeira vez do queijo (seu nome é derivado do grego ”tyros” , "queijo"); Asparagina Aspargo Glutamato trigo Tirosina queijo Aminoácidos e Peptídeos Aminoácidos e Peptídeos Ligações Peptídicas Os aminoácidos individualmente podem ser unidos pela formação de ligações covalentes; A ligação é formada entre o grupo α – carboxila de um aminoácido e o grupo α – amina do próximo; Água é eliminada no processo, obtendo-se resíduos de aminoácidos ligados; Peptídeos - são compostos formados pela ligação de um pequeno número de aminoácidos, que pode variar de dois a meia dúzia. Aminoácidos e Peptídeos Reação de Condensação Profa. Dra. Edjane Fabiula Buriti da Silva edjanefabiula@hotmail.com FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA SDE3895 1. Represente estruturalmente os seguintes aminoácidos: a) Leucina b) Glicina c) Prolina d) Glutamina e) Cisteína Exercícios 2. Calcule o pH isoelétrico para os seguintes aminoácidos: PK1 PK2 PI Alanina 2,34 9,69 - Valina 2,32 - 5,97 Asparagina - 8,80 5,41 3. Represente estruturalmente as ligações peptídicas. a) Leucina + Glicina b) Prolina + Glutamina c) Cisteína + Serina
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