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Estrutura tridimensional das proteínas Cacá Filho – MED 21 - UNIVASF As proteínas são macromoléculas constituídas pela polimerização de variados aminoácidos dispostos em cadeias lineares, unidos por ligações peptídicas. A nomenclatura “proteína” é usada para um polipeptídio, ou um complexo de polipeptídios, que tem uma estrutura 3D (estrutura espacial) bem definida, caracterizando assim propriedades físico-químicas para esta molécula. Por sua característica ser definida na estrutura espacial, cabe-se infinitas possíveis conformações para que um polipeptídio, ou uma sequência deles, se caracterize como uma proteína. Estas conformações são definidas pela rotação livre das proteínas. Princípios Básicos • Estrutura 3D determinada pela sequência de aminoácidos. • A função da proteína depende da sua estrutura • Existem um pequeno número de formas estruturais estáveis • Elas são mantidas por interações não covalentes Níveis Estruturais As proteínas apresentam diversos níveis de organização estrutural que são definidos pelo tipo de interação atômica entre os diversos constituintes da macromolécula. Estrutura Primária É representada pelo arranjo linear dos aminoácidos. Em suma, é ela quem define tudo o que irá vir. Atentar- se que nessa estrutura os aminoácidos estão ligados por ligações peptídicas e pontes dissulfeto. Estrutura Secundária São os elementos centrais da arquitetura das proteínas. Consistem de vários arranjos espaciais do dobramento de partes localizadas da cadeia peptídica. São estabilizados por ligações não-covalentes. As estruturas secundárias são definidas por variados tipos, porém, os tipos mais proeminentes são as α-hélices e as conformações β. α-hélice É uma estrutura helicoidal, no qual é o arranjo mais simples que uma cadeia polipeptídica pode assumir com ligações peptídicas rígidas (mas com as demais ligações simples livres para a rotação). Nessa conformação, os grupos R estão projetados para a face externa da hélice. Como pode-se imaginar, a α-hélice depende da sequência de aminoácidos para se formar. Conformações β É uma estrutura em “zigue-zague”. Esse padrão é chamado de folha β e tem em suma cadeias paralelas que se mantém estabilizadas umas com as outras por pontes de hidrogênio. Elas formam o assoalho de reconhecimento de várias proteínas. Estrutura Terciária O arranjo tridimensional de todos os átomos na proteína é chamado de estrutura terciária. Ela é estabilizada por interações hidrofóbicas entre cadeias laterais não-polares e ligações peptídicas. Proteínas Fibrosas São cadeias polipeptídicas arranjadas em fitas ou folhas. Sua unidade estrutural fundamental é um simples elemento repetitivo de estrutura secundária. Isso confere apoio, forma e proteção externa aos seres vertebrados. Comentado [Cacá Fº1]: Os 20 aminoácidos encontrados nas proteínas que são como um “alfabeto”. Comentado [Cacá Fº2]: Estrutura Terciária Comentado [Cacá Fº3]: Cada proteína possui uma função estrutural e química específica, sugerindo que cada uma tenha uma estrutura 3D única. Comentado [Cacá Fº4]: A sequência é o que definirá o “desenrolar”, ou no caso o “enrolar”, da proteína. A estrutura primária é o q vai reger para que as outras estruturas se formem, devido ao fato das interações dos aminoácidos determinarem as formas físicas (3D) que a proteína irá tomar. Comentado [Cacá Fº5]: Como dito acima, a função depende da estrutura, e esta depende da sequência dos aminoácidos. Comentado [Cacá Fº6]: O termo “estabilidade” refere-se sobre a tendência à manutenção de uma conformação nativa das proteínas. As PROTEÍNAS NATIVAS são aquelas em qualquer de suas conformações enoveladas funcionais. Comentado [Cacá Fº7]: São as lindas das pontes de hidrogênio que estabilizam as bitelas! =] Comentado [Cacá Fº8]: Enquanto o termo “estrutura secundária” se refere ao arranjo espacial dos resíduos de aminoácidos que são adjacentes na estrutura primária, a estrutura terciária inclui aspectos envolvendo “distancias mais longas” dentro da sequência de aminoácidos. Portanto, mais uma vez observa-se que tudo depende da sequência de aminoácidos. Comentado [Cacá Fº9]: Para proteínas monoméricas, este é o último nível de organização Comentado [Cacá Fº10]: α-queratina e colágeno Proteínas Globulares Em uma proteína globular, os segmentos da cadeia peptídica enovelam-se uns sobre os outros. Este enovelamento garante uma diversidade estrutural necessária para que as proteínas executem um grande conjunto de funções biológicas como enzimas, proteínas reguladoras, proteínas transportadoras e etc. Estruturas supersecundárias São combinações regulares de várias estruturas secundárias que acabam por construir a estrutura terciária. Domínios São subdivisões da estrutura terciária de proteínas grandes (com mais de 100 aminoácidos). Eles são divididos em Domínios Estruturais (Ex: fibroso e globular) e Domínios Funcionais (Ex: catalítico, ancorador e transmembrana). Estrutura Quaternária É o arranjo espacial tridimensional de proteínas com duas ou mais cadeias polipeptídicas separadas. Funções da Proteína • Receptores • Anticorpos: ϒ-globulinas • Enzimas: luciferase • Transportadoras: Hemoglobina, ceruloplasmina, transferrina • Canais iônicos • Estrutural: colágeno, queratina, elastina • Controla da transcrição • Hormônios: FSH, LH, somatotrófico • Contração: actina e miosina • Nutricional: zeína, caseína • Reguladoras: insulina, proteínas G • Sinalizadoras: incluem receptores de superfície e outras proteínas que transmitem sinais externos para o interior das células • Motoras: responsáveis pelos movimentos celulares Prionproteínas São as proteínas que têm formas alteradas e estão implicadas na etiologia de doenças Príons São proteínas infecciosas que não contém ácidos nucléicos. Elas são as responsáveis pelas doenças que são chamadas “doenças de prion” (Mal de Alzheimer e Creutzfeldt-Jakob). A proteína relacionada a um Prion (PrP) existe em duas isoformas: • PrPc: sensível à proteose, rico em α-hélices • PrPSc: isoforma patológica, resistente à protease, rico em folhas β Desnaturação e Enovelamento A perda da estrutura da proteína resulta na perda da função. Portanto, essa perda da estrutura é chamada de “desnaturação”. Esta por sua vez é a definição dada para quando uma proteína perca sua estrutura 3D. Existem variados fatores que interferem diretamente na desnaturação das proteínas como o calor, pH, solventes, detergentes e etc. Correlações Clínicas • Diferenças entre a insulina usada no tratamento do diabetes mellitus • Anemia falciforme Comentado [Cacá Fº11]: Diferentes proteínas podem compartilhar domínios comuns. Comentado [Cacá Fº12]: Para as proteínas multiméricas, este é o último nível de organização. Comentado [Cacá Fº13]: Observação muito relevante: O PrPc e o PrPSc tem estruturas primárias idênticas, mas diferentes estruturas terciárias e quaternárias. • Doenças de síntese do colágeno o Aneurisma da aorta, ossos, pele, articulações e etc • Hemoglobina glicosilada Estrutura tridimensional das proteínas Cacá Filho – MED 21 - UNIVASF Princípios Básicos Níveis Estruturais Estrutura Primária Estrutura Secundária α-hélice Conformações β Estrutura Terciária Proteínas Fibrosas Proteínas Globulares Estruturas supersecundárias Domínios Estrutura Quaternária Funções da Proteína Prionproteínas Príons Desnaturação e Enovelamento Correlações Clínicas