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Unidade III BIOLOGIA MOLECULAR Profa. Luciana Mantzouranis Transcrição A transcrição é o processo pelo qual são sintetizados todos os RNAs das células a partir de um molde de DNA. RNAs: funcionam como simples fita. essas fitas se dobram sobre si mesmas, com potencial para uma diversidade estrutural muito maior do que o DNA. O RNA é, portanto, adequado para uma variedade de funções celulares. A célula restringe a expressão da informação genética para a formação de produtos gênicos necessários em um dado momento. Transcrição Os RNAs são classificados de acordo com a localização e sua função na célula. RNA mensageiro (mRNA): transfere a informação genética do DNA para a síntese de proteínas. Representa cerca de 1 a 5% da quantidade total de RNA. RNA transportador (tRNA): é responsável por transportar os aminoácidos até o ribossomo. Representa 10 a 15% da quantidade total de RNA. Transcrição RNA ribossomal (rRNA): é o principal componente do ribossomo. Representa cerca de 75% da quantidade total de RNA. Pequenos RNAs nucleares (snRNA): faz parte de um sistema que processa os RNAs transcritos nas células eucarióticas. MicroRNA (miRNA): possui papel na regulação da quantidade de proteínas que são produzidas nas células eucarióticas. RNA de interferência (siRNA): ajuda a proteger a integridade do genoma de plantas e animais. Algumas moléculas de RNA possuem função catalítica. Os substratos para as enzimas de RNA são frequentemente outras moléculas de RNA. Transcrição O RNA é sintetizado por uma RNA polimerase. Requer molde de DNA. Uma das fitas da dupla hélice é utilizada como molde. Não requer iniciador. O RNA é sintetizado no sentido 5’→3’. Molde de DNA é lido no sentido 3’ → 5’. A fita de DNA que serviu de molde é chamada de molde ou antissenso. A outra fita de DNA tem sequência idêntica a do RNA transcrito, exceto por T no lugar de U. Essa fita é chamada de fita codificadora ou senso. Transcrição Fonte: NELSON, D. L.; COX, M, Lehninger. “Princípios de Bioquímica”. 3. ed. São Paulo: Sarvier, 2002. Transcrição A fita do DNA chamada de fita molde pode variar de acordo com o gene. 5’ Fita molde do gene B Fonte: Livro-texto. Transcrição em procariotos RNA polimerase: núcleo da enzima (cinco subunidades básicas): duas subunidades β, duas subunidades α e uma subunidade ω. Fator sigma. Fonte: Livro-texto. Transcrição em procariotos A subunidade sigma é variável e é designada pelo seu peso molecular. Exemplo: σ32 – genes de choque térmico. Liga-se transitoriamente ao núcleo básico e direciona para sítios específicos do DNA. Transcrição RNA polimerases não possuem uma atividade exonucleásica 3’ → 5’. Cerca de um erro é cometido a cada 10 a 10 ribonucleotídeos incorporados ao RNA durante a transcrição. Muitas cópias de um RNA são produzidas a partir de um único gene. Todos os RNAs são degradados e substituídos. 4 5 Transcrição em procariotos As RNA-polimerases desempenham todas as atividades necessárias para o processo de transcrição. Reconhecem e ligam-se à sequência específica do DNA. Abrem a dupla fita do DNA. Mantêm as fitas separadas na região onde está ocorrendo o processo de transcrição. Mantêm estável o duplex DNA- RNA formado na região da transcrição. Fecham a dupla fita após a síntese. Sozinha, ou com o auxílio de uma proteína específica, termina o processo de transcrição. Transcrição em procariotos Início da transcrição: RNA polimerase: liga-se a uma sequência específica do DNA – promotor. Em E. coli, a ligação da RNA polimerase ocorre dentro de uma região que se estende desde cerca de 70 pares de bases antes do sítio de início da transcrição até 30 pares de bases além dele. Por convenção, a primeira base do DNA a ser transcrita é chamada de sítio de início e recebe o valor de +1. Sequências localizadas antes do sítio de início recebem o número negativo. Sequências localizadas após o sítio de início recebem o número positivo. Transcrição em procariotos Duas regiões que se destacam na região promotora são -10 e -35. NELSON, D. L.; COX, M, Lehninger. “Princípios de Bioquímica”. 3. ed. São Paulo: Sarvier, 2002 A região -10 recebe o nome de TATA box. Elemento UP – rico em AT – ocorre em promotores de certos genes altamente expressos (- 40 e - 60). O elemento UP é ligado pela subunidade α da RNA polimerase. Transcrição Grande parte da regulação da transcrição é direcionada às etapas de ligação da polimerase e de iniciação da transcrição. Fonte: NELSON, D. L.; COX, M, Lehninger. “Princípios de Bioquímica”. 3. ed. São Paulo: Sarvier, 2002. Transcrição A ligação de proteínas a sequências tanto próximas quanto distantes do promotor pode também afetar os níveis de expressão gênica. A ligação de proteínas pode tanto ativar a transcrição, facilitando a ligação da RNA polimerase ou etapas posteriores no processo de iniciação, quanto reprimir a transcrição, bloqueando a atividade da polimerase. Interatividade Avalie as alternativas sobre a RNA polimerase e a transcrição e assinale a alternativa correta. a) A RNA polimerase requer um iniciador para fornecer uma extremidade 3’ para o início da síntese. b) A RNA polimerase faz a síntese do RNA no sentído 3’ → 5’. c) A RNA polimerase utiliza como molde uma outra fita de RNA. d) A RNA polimerase liga-se a uma sequência específica de DNA chamada de promotor para dar início a transcrição. e) A RNA polimerase possui atividade exonucleásica 3’ → 5’. Transcrição em procariotos Início da transcrição Fonte: Livro-texto. Transcrição em procariotos Início da transcrição Fonte: Livro-texto. Transcrição em procariotos Alongamento Fonte: Livro-texto. Transcrição em procariotos Término Mecanismos de término: independente de rho (intrínseco) e dependente de rho (rho-dependente) Terminação independente de rho. RNA possui: sequências autocomplementares permitindo a formação de uma estrutura em forma de grampo centrada em 15 a 20 nucleotídeos antes da extremidade da fita do RNA; sequência curta de adenilatos na fita molde, que é transcrito em uridilatos na extremidade 3’ do RNA. Transcrição em procariotos A formação da estrutura em grampo no RNA pode romper interações importantes entre o RNA e a RNA polimerase facilitando a dissociação do transcrito. Fonte: NELSON, D. L.; COX, M, Lehninger. “Princípios de Bioquímica”. 3. ed. São Paulo: Sarvier, 2002. Transcrição em procariotos Terminação dependente de rho. O RNA não possui a sequência de adenilatos na fita molde. As vezes o RNA possui uma sequência curta que é transcrita para formar um grampo. A proteína rho se liga no RNA em sítios de ligação específicos e migra no sentido 5’ → 3’ até alcançar o complexo de transcrição. A proteína rho possui atividade de helicase DNA – RNA. Transcrição em eucariotos Para a transcrição dos genes eucarióticos existem 3 RNA polimerases diferentes. RNA polimerase I – transcreve os genes dos RNAs ribossomais, exceto o rRNA 5S. RNA polimerase II – transcreve os RNAs mensageiros e pequenos RNAs nucleares. RNA polimerase III – transcreve os RNAs transportadores, alguns pequenos RNAs nucleares e o rRNA 5S Transcrição em eucariotos Início da transcrição Fonte: Livro-texto. Transcriçãoem eucariotos Complexo pré-iniciação Após a transcrição ter sido iniciada, os fatores de transcrição se separam da enzima RNA polimerase II e essa começa a transcrição propriamente dita. Fonte: Livro-texto. Transcrição em eucariotos Alongamento e processamento: O alongamento ocorre dentro da bolha de transcrição da mesma forma que ocorre na transcrição em procariotos. Em células eucarióticas, o RNA recém sintetizado é chamado pré-mRNA ou RNA primário. A medida que o RNA é sintetizado, ele sofre modificações, tornando-se um mRNA maduro. Interatividade Qual das alternativas representa uma característica necessária para a terminação independente de rho? a) Presença de promotor. b) Presença de fator de transcrição. c) Presença de primers. d) Presença de ATP. e) Presença de uma sequência curta de adenilatos na fita molde. Transcrição em eucariotos Processamento Quando a extremidade 5’ do RNA é sintetizada, uma estrutura de revestimento chamada de cap é adicionada nessa extremidade. O cap protege o RNA da degradação. Transcrição em eucariotos Após o término do processo de transcrição é adicionada na posição 3’ do RNA primário uma sequência de 150 a 200 nucleotídeos de adenina(A), essa sequência é chamada de cauda poli A. Fonte: Livro-texto. Transcrição em eucariotos Splicing Remoção dos íntrons e junção dos éxons A remoção dos íntrons e união dos éxons são catalisadas por moléculas de RNA. Os pequenos RNA nucleares e mais de 100 proteínas adicionais fazem parte do splicessomo. Transcrição em eucariotos Fonte: Livro-texto. Transcrição em eucariotos Splicing alternativo: Um gene pode codificar várias proteínas, isto ocorre quando há diferentes combinações de éxons, produzindo mRNAs diferentes e, consequentemente, proteínas diferentes. Em plantas esse processo é raro, mas nos genes humanos, mais de 70% dos genes são recompostos de maneira alternativa. Tradução Código genético; Decifrado em 1966; Tabela que mostra a correspondência entre uma sequência de nucleotídeos e a sequência de aminoácidos. É composto por 64 combinações de 3 nucleotídeos (trincas). Características do código genético: Todos os aminoácidos são codificados por uma combinação de 3 nucleotídeos, chamada de códon. Existem 3 códons específicos que são chamados de códons de terminação ou stop codon, UAA, UAG e UGA. Tradução Um mesmo aminoácido pode ser definido por mais de um códon. Esse códon é chamado de degenerado ou redundante. Fonte: http://www.sobiologia.com.br/conteudos/Citologia2/AcNucleico6.php Tradução A síntese de proteínas ocorre no citosol das células. São necessários o RNA mensageiro, o RNA transportador e o ribossomo. RNA transportador. Fonte: Livro-texto. Tradução Os aminoácidos são ligados ao tRNA por meio de enzimas específicas denominadas aminoacil-tRNA sintetases. Há uma enzima específica para cada um dos 20 aminoácidos. ATP + aa → aminoacil - AMP + PPi Aminoacil - AMP + tRNA → aminoacil - tRNA + AMP Tradução Ribossomos: Dividido em duas subunidades, subunidade menor e subunidade maior. Fonte: Livro-texto. Tradução Em E. coli: Subunidade menor – 30S Subunidade maior – 50S No ribossomo há 3 sítios: Sítio A – liga-se preferencialmente ao aminoacil-tRNA e localiza-se na subunidade 50S. Sítio P – liga-se tanto ao fMet-tRNA como ao peptidil-tRNA e localiza-se na subunidade 30S. Sítio E – é o sítio de saída das novas proteínas sintetizadas no ribossomo. Interatividade Qual das alternativas não corresponde a uma característica do código genético? a) É degenerado. b) É uma tabela. c) Relaciona o anticódon com o aminoácido. d) Mais de um códon pode codificar o mesmo aminoácido. e) É valido para humanos. Tradução Início da tradução. Fonte: Livro-texto. Tradução Fonte: NELSON, D. L.; COX, M, Lehninger. “Princípios de Bioquímica”. 3. ed. São Paulo: Sarvier, 2002. Tradução Fonte: NELSON, D. L.; COX, M, Lehninger. “Princípios de Bioquímica”. 3. ed. São Paulo: Sarvier, 2002. Tradução Fonte: NELSON, D. L.; COX, M, Lehninger. “Princípios de Bioquímica”. 3. ed. São Paulo: Sarvier, 2002. Tradução Fonte: NELSON, D. L.; COX, M, Lehninger. “Princípios de Bioquímica”. 3. ed. São Paulo: Sarvier, 2002. Tradução Fonte: NELSON, D. L.; COX, M, Lehninger. “Princípios de Bioquímica”. 3. ed. São Paulo: Sarvier, 2002. Tradução Fonte: NELSON, D. L.; COX, M, Lehninger. “Princípios de Bioquímica”. 3. ed. São Paulo: Sarvier, 2002. Tradução Fonte: NELSON, D. L.; COX, M, Lehninger. “Princípios de Bioquímica”. 3. ed. São Paulo: Sarvier, 2002. Tradução Fonte: NELSON, D. L.; COX, M, Lehninger. “Princípios de Bioquímica”. 3. ed. São Paulo: Sarvier, 2002. Controle da expressão gênica – procariotos Operon da lactose Fonte: Livro-texto. Controle da expressão gênica – procariotos Fonte: Livro-texto. Controle da expressão gênica – procariotos Fonte: Livro-texto. Interatividade Leias as afirmativas abaixo e classifique como V ou F. I. Existe uma molécula de tRNA específico para cada aminoácido. Possui uma região chamada de anticódon, um conjunto de três nucleotídeos que é complementar ao códon. ( ) II. Existe um tRNA específico para o códon stop. Neste caso o tRNA liga-se ao aminoácido de parada. ( ) III. O rRNA é o responsável pelo transporte de cada aminoácido por meio do anticódon localizado na subunidade menor do ribossomo. ( ) a) V, F, F. b) V, V, F. c) F, V, V. d) V, F, V. e) F, F, V. ATÉ A PRÓXIMA! Slide Number 1 Transcrição Transcrição Transcrição Transcrição Transcrição Transcrição Transcrição em procariotos Transcrição em procariotos Transcrição Transcrição em procariotos Transcrição em procariotos Transcrição em procariotos Transcrição Transcrição Interatividade Resposta Transcrição em procariotos Transcrição em procariotos Transcrição em procariotos Transcrição em procariotos Transcrição em procariotos Transcrição em procariotos Transcrição em eucariotos Transcrição em eucariotos Transcrição em eucariotos Transcrição em eucariotos Interatividade Resposta Transcrição em eucariotos Transcrição em eucariotos Transcrição em eucariotos Transcrição em eucariotos Transcrição em eucariotos Tradução Tradução Tradução Tradução Tradução Tradução Interatividade Resposta Tradução Tradução Tradução Tradução Tradução Tradução Tradução Tradução Tradução Controle da expressão gênica – procariotos Controle da expressão gênica – procariotos Controle da expressão gênica – procariotos Interatividade Resposta Slide Number 57