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Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 45 MUTAÇÃO DNA: bases freqüentemente expostas a agentes naturais ou artificiais que provocam modificações na sua estrutura ou composição química. Mutação: qualquer modificação súbita e hereditária no conj. gênico de um organismo que não é explicável pela recombinação da variabilidade genética preexistente. *Genômica *Cromossômica *Gênica Células germinativas: transmitida hereditariamente. Células somáticas: formação de tumores. Mutante: todo organismo que exibe uma forma alterada como resultado da presença de uma mutação (problemas na sobrevivência e eliminação por seleção natural). Mutação Seleção natural (matéria prima da evolução) Fonte básica da variabilidade genética frequência é deletéria. O DNA pode ser lesado por uma variedade de processos: 1. Espontâneos (nível basal 10-6 a10-10 mutações por gene). 2. Catalisados por agentes ambientais (agentes mutagênicos). 3. Replicação pode ocasionalmente deixar bases despareadas. Fenotipicamente Silenciosas Expressas *Silenciosas: 2 grupos 1. Envolvem troca de bases do DNA mas não causam a troca do aa presente na proteína correspondente. Ex: UUU (fenilamina) e UUC (fenilamina). 2. Levam a troca do aa mas a substituição não afeta a ativ. da proteína mutações neutras. *Qualquer base do DNA pode ser mutada. Mutação de ponto ou gênica: modificação em um único par de base (substituição, adição ou deleção). Pode ser resultado de: - Mau funcionamento do sistema celular que replica ou repara o DNA, inserindo uma base errada na cadeia nucleotídica que esta sendo sintetizada. - Interferência quím. diretamente sobre uma das bases do DNA. *Substituição de bases: Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 46 -Transição: PU PU – ACG (treonina) GCG (alanina) PI PI – ACA (treonina) AUA (isoleucina) -Transversão: PU PI – AAG (lisina) ACG (treonina) PI PU – UGC (cisteína) UGG (triptofano) Situações que as substituições de bases podem levar: - A subst. da base ocasiona a troca de um aa (mut. c/ sentido trocado ou errado – missense). - O efeito depende da natureza do aa substituído podendo levar a uma prot. Alterada c/ redução ou perda da ativ. biológica ou prot. semelhante à normal. SUBSTITUIÇÃO SINÔNIMA X NÃO SINÔNIMA ??? - Subst. faz surgir um dos 3 códons de terminação :UAA, UGA e UAG (mut. sem sentido - nonsense ). *EFEITO: perda de função *Adição/Inserção ou Deleção ou Perda: Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 47 -Alteram toda a leitura do código genético (mut. de mudança na leitura do código genético – frameshift) *EFEITO proteína praticamente perde sua função. Exceção: -deleção ou inserção de 3 bases adjacentes ou múltiplo de 3 bases resulta perda ou adição da cadeia polipeptídica, mas a estrut. de leitura das bases da seq. restante não se altera. *Mecanismos para ocorrência de mutações espontâneas: sugerido por Watson & Crick Modificações tautoméricas (envolve a substituição de um par de base por outro tipo mais comum). Hotspots: sítios que ganharam um no de mutações maior que o esperado para uma distribuição aleatória. Ocorrência pode ser por tratamentos com agentes mutagênicos (mutações induzidas). Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 48 Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 49 Agentes mutagênicos 1- Agentes mutagênicos físicos: Radiação ionizante (raios X, e cósmicos) rompe ligações açúcar-fosfato e causa quebras cromossômicas. Quando a radiação interage diretamente com as moléculas importantes como as de DNA, pode causar desde mutação genética até morte celular. Radiação não-ionizante (UV) formação de dímeros de PI. Induz mutações somáticas e câncer de pele (ex: Xeroderma pigmentoso). *Que tipo de mutação é gerada? Qual a consequência da lesão??? Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 50 Xeroderma pigmentoso: Desordem genética: a capacidade normal do organismo para remover o dano causado pela radiação ultravioleta (UV) é deficiente. Qual enzima está defeituosa?_________________ Múltiplos Carcinomas basocelulares e espino-celulares e mesmo melanomas em idade precoce. Em casos severos, é necessário evitar por completo a exposição à luz solar e a outras fontes de radiação ultravioleta. 2- Agentes mutagênicos químicos: Análogos de bases: 5-bromouracil: análogo da T e pareia com A (par AT muda p/ GC). -É utilizado principalmente como mutágeno experimental, mas o seu derivado desoxirribosido ( 5- bromo-2-desoxi-uridina) é utilizado para tratar neoplasmas. Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 51 2-aminopurina: pareia com a T, tautômero pareia com C. Ác. Nitroso (desaminação): - Adenina hipoxantina (pareia com C ao invés da T): - Citosina uracil (Pareia com A ao invés da G): *Onde encontramos o HNO2??? -Precursores: NaNo2 (nitrito de sódio) NaNo3 (nitrato de sódio) Nitrosaminas Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 52 Agentes alquilantes (mostardas nitrogenadas, éstes do ác. Metilsulfônico etc): Potentes! - agem sobre a guanina enfraquecendo sua ligação com a desoxirribose. - A guanina assim é perdida, e em seu lugar, pode entrar qualquer base. Corantes aromáticos nitrogenados: -Ligam-se ao DNA, inserindo -se entre bases adjacentes. Ex: Corantes Acridina (distorção da hélice que resulta em adição ou deleção de nt). Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 53 *Que tipo de mutação é gerada? Qual a consequência da lesão??? * Mutações no Homem: Hemoglobinopatias Hiperqueratoses (def. queratolítica) Câncer -Nos mamíferos há uma forte correlação entre mutagênese e a carcinogênese. Mutações favoráveis: raras (melhoramento de grãos), a maioria são deletéricas para as células. Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 54 Após conhecer tantas mutações, é normal perguntar-se: por que o câncer não é mais freqüente entre os seres vivos? As mutações são inevitáveis, pois o DNA, como qualquer substância química, não é totalmente estável. Então, os seres vivos desenvolveram mecanismos para corrigir esses erros naturais: é o chamado sistema de reparo. *Proteção natural contra as mutações: 1- Redundância do código genético 2- A posição em que a substituição de aa ocorre na proteína (mut. em parte da prot. que não seja crítica à sua função). 3- Mutações no DNA-não codificador (exceto quando ocorre em seq. relacionadas c/ a regulação de genes estruturais ou na junção da emenda entre íntrons e éxons). 4- Mecanismo de reparo. Obs: existe aindaa relação entre vírus e câncer Estudos indicam que os vírus podem contribuir para a ocorrência de câncer, por causar morte excessiva de células normais e promover o crescimento de células sobreviventes com traços cancerígenos. A infecção com vírus tem sido ligada a diversas formas de câncer em humanos, incluindo os linfomas de Hodgkin e não-Hodgkin, sarcomas e câncer de garganta e fígado. Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 55 Exercícios de fixação: MUTAÇÃO 1) Definir mutação e mutante. 2) Toda mutação é deletéria para a célula? Explique. 3) O DNA pode ser lesado por quais processos? 4) Como as mutações se manifestam fenotipicamente? 5) Como ocorrem as mutações do tipo missense, nonsense e frameshift e quais as conseqüências de cada uma? 6) Em que se baseiam as mutações espontâneas? 7) O que são agentes mutagênicos? Quais são? Dê exemplos. 8) Qual a relação entre mutagênese e carcinogênese? 9- A presença da anemia falciforme é determinada por uma quantidade elevada de hemácias deformadas. Em indivíduos normais, as células de transporte de gases, hemácias, têm forma arredondada côncava e flexível (B). A formação dessa hemoglobina, determinada por um par genético no cromossomo 11, muda nos indivíduos falciformes. Neles, há a presença de ao menos um gene mutante, que leva o organismo a produzir a hemoglobina S (C). Classifique esta mutação (A) e fale de suas possíveis consequência. 10-Indivíduos portadores da doença "xeroderma pigmentosum", condição genética autossômica recessiva, apresentam, em células epidérmicas, extrema sensibilidade à luz solar, resultando em alta freqüência de câncer de pele, principalmente na face. Alguns desses pacientes também desenvolvem anormalidades neurológicas, que parecem resultar da morte prematura de células nervosas. Estudos genéticos, em células de organismos afetados, revelam a existência de defeitos no sistema enzimático responsável pelo reparo de moléculas de DNA danificadas pela exposição a agentes mutagênicos (GARDNER, p. 307-8 - adaptação). Indique: a) Agente causador:___________ b) Lesão causada:_____________ c) Defeito genético associado:___________ d) Como evitar o dano:_________________ 11- Diferencie substituição sinônima de não sinônima. Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 56 *Esta lista de exercícios é um estudo dirigido para prova de 1ª V.A e será corrigida na próxima aula! Responda no caderno. ESTUDO DIRIGIDO BIOMOL 1ª. V.A 1. Em 1953, Watson e Crick identificaram a estrutura do DNA, vencendo uma batalha travada entre importantes cientistas para descobrir e mapear o código genético. Essa vitória foi ética e justa? Esclareça com base no livro: “Watson e Crick e o DNA em 90 minutos”. 2. Explique a seguinte afirmação: cromatina e cromossomos representam dois aspectos morfológicos da mesma estrutura. 3. Leia o seguinte texto e verifique o que há de errado ou se ele está correto: O núcleo interfásico, conhecido como núcleo em repouso, corresponde aquele momento em que a célula se prepara para iniciar a mitose, ou seja, a divisão celular. Na fase de interfase (a fase mais importante da mitose), a célula duplica seu material cromossômico e suas organelas citoplasmáticas. Logo após a duplicação do DNA a célula entra em mitose na qual ocorrem as seguintes fases: prófase, metáfase, anáfase e telófase. Após estas fases a célula de origem dá duas novas células não necessariamente geneticamente iguais. 4. Quando se observa a microscopia de uma célula em intérfase observa-se um núcleo bem corado com regiões mais escuras (heterocromatina) e outras mais claras (eucromatina), como observado na figura abaixo. Explique o que ocorre nestas regiões em relação ao metabolismo celular (dogma central). 6- A AIDS é causada por um retrovírus, o vírus da imunodeficiência humana (HIV). O tratamento da AIDS é complicado pela alta mutabilidade desse vírus. Por que quaisquer duas moléculas do RNA de HIV quase nunca são iguais em sua sequência de nucleotídeos? Molecularmente, o que contribui para que isso ocorra? 7- Correlacione: Ciclo celular X metabolismo celular X ploidia. 8- Ao revelar-se capaz de inibir a reprodução do vírus HIV, o AZT (Zidovudina) tornou-se a primeira substância aprovada para tratamento da Aids, ampliando sensivelmente a expectativa de vida dos pacientes. Atualmente é usado em conjunto com outras drogas na composição do coquetel anti-Aids pois reduz a carga viral, ou seja, a quantidade de vírus HIV no sangue, Manual de Estudo Dirigido em Biologia Molecular- Prof ª Cristiane Alves da Fonseca do Espírito Santo 57 preserva as células de defesa do organismo e também reduz a transmissão do vírus da aids da mãe para o seu bebê, a chamada transmissão vertical. Com base na estrutura da molécula do AZT abaixo, descreva o mecanismo molecular de ação dessa droga. 9- As quinolonas são um grupo de substâncias químicas antibacterianas. Devido a grande eficiência contra a maioria das Enterobacteriaceae, este grupo tornou-se de escolha no combate de infecções urinárias de difícil tratamento. As quinolonas são antimicrobianos bactericidas e sua atividade antimicrobiana se relaciona com a inibição das topoisomerases bacterianas do tipo II, também conhecida como DNA girase. Baseado no mecanismo de ação descrito, quais as conseqüências deste fármaco no metabolismo bacteriano? 10- Os agentes mutagênicos são fatores que podem elevar a freqüência das mutações. Em 1920, Hermann J. Muller descobriu que submetendo drosófilas ao raio X, a freqüência das mutações aumentava cerca de cem vezes em relação à população não exposta. O aumento na taxa de mutações pode ser obtido pelo emprego de numerosos agentes físicos e químicos. Todos os seres vivos estão submetidos, diariamente, a vários desses agentes. Entretanto, as mutações permanecem como eventos não muito freqüentes. A relativa estabilidade do material genético deve-se à existência de mecanismos que constituem uma proteção natural do genoma. Quais são estes mecanismos? Suponha que uma célula esteja na fase S da interfase ou seja, passando pela replicação do material genético, qual principal mutação ocorre e como a fidelidade da replicação pode manter a estabilidade do genoma? 11- Considere os seguintes valores de Lk (número de ligação) de moléculas de DNA: a) W= +1 → W= -1 b) L= n → L= n+1 → L= n+2 Quais são as enzimas que estão atuando nos modelos, seu mecanismo de ação e a conseqüência da sua ação.