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1. Em um estudo de desnaturação e renaturação de DNA um pesquisador observou que o DNA de uma bactéria A renaturava mais rapidamente que o de outra espécie de bactéria (B), porque: (a) A tinha o cromossomo linear e B circular; Não. Bactérias não possuem DNA linear. (b) o DNA de A era mais rico em bases G e C do que o de B; Sim. Apesar de demorarem mais para desnaturarem, as bases C e G se renaturam mais rapidamente. O processo de renaturaçao é o inverso da desnaturação, portanto ocorre de tras pra frente, logo as bases C e G se restauram muito mais rapidamente do que A e T. (c) o DNA de A era mais rico em bases A e T do que o de B; Não. Na renaturaçao C e G se reorganizam muito mais rapidamente do que A e T, logo a bactéria possui mais bases C e G. (d) o DNA de A tinha mais genes do que o de B; A quantidade de genes não interfere no tempo de renaturaçao. (e) Nenhuma das alternativas anteriores. 2. Se existe 15% de adeninas em uma molécula de DNA, qual a porcentagem de citosinas? (a) 15%; (b) 30%; (c) 35%; (d) 60%; (e) 70%. O DNA é formado por quatro bases nitrogenadas, Citosina, guanina, timina e adenosina. Adenina se liga com timina com uma dupla ligação e a citosina se liga com a guanina numa ligação tripla.Sabendo a porcentagem de uma das bases, pode-se deduzir as demais. No caso essa molécula é formada de 15% de adenina, logo os outros 15 são de timina e os 70% restantes se dividem igualmente entre citosina (35%) e guanina (35%). 3. Em um artigo do jornal Estadão: “Arqueólogos trabalharam nesta quinta-feira (30/09/2018) para remover o esqueleto pré-histórico encontrado ontem no canteiro de obras do Elevado do Rio Tavares, no Sul da Ilha da Santa Catarina. ... A ossada de um adulto de 1,50m é de um índio sambaquieiro, povo ancestral que habitou o litoral do estado por mais de três mil anos, do ano 580 a 3.000 a.C. “É uma grande conquista, por meio dele conheceremos a história de Santa Catarina. Temos muitas possibilidades, análises dos dentes, do DNA, dos artefatos ao redor do corpo”, disse o arqueólogo-coordenador da pesquisa, Osvaldo Paulino da Silva – que acredita que esqueleto tenha em torno de três mil anos.” De todas as biomoléculas, o DNA está sendo destacado como potencial material de análise genética pois: (a) é a mais reativa e, por isso mesmo, pode possibilitar análises; Se o DNA fosse mais reativo ele seria descartado dos possíveis materiais para analise, pois se fosse reativo, reagiria facilmente com outras moléculas, ocasionando modificações profundas em sua estrutura, o que não é o caso. (b) é a menos reativa que, mantendo a integridade da sequência linear de nucleotídeos, pode apresentar informações comparáveis às das populações atuais; Sim. Devido as fortes ligaçoes de hidrogênio entre as moléculas de Citosina e Guanina, Adenina e Timina; o fato de ela ser maleável podendo se mover de forma a conservar as ligações, as ligações de fosfodiésteres, ligações covalentes muito fortes entre os grupos fosfato, pentose e base nitrogenada. O que mantém a integridade da molécula de DNA por muito mais tempo que o restante. (c) é a biomolécula de maior tamanho; (d) porque tem carga residual negativa, podendo migrar em campos elétricos; Não. Apesar de possuir carga residual negativa graças aos grupos fosfatos, o DNA pode ser atraído por campos eletricamente positivos. Porém isso não responde a pergunta pois essa característica é útil em alguns procedimentos de extração de proteínas. (e) nenhuma das alternativas anteriores. Falso. 4. A replicação do DNA ocorre antes da mitose ocorre para: (a) garantir que as células-filhas contenham as mesmas informações da célula-mãe; (b) manter a mesma quantidade e qualidade molecular do DNA nas células-filhas; (c) que os cromossomos sejam os mesmos e se conservem na mesma quantidade nas células- filhas; (d) que se duplique todo o genoma antes da divisão celular que reduzirá a quantidade de DNA pela metade, retornando a quantidade de DNA original; Sim, pois no processo de mitose, uma única célula mãe da origem a duas células filhas com o mesmo numero de cromossomos e carga genética, por isso é necessário que a carga genética esteja duplicada. (e) todas as alternativas estão corretas. 5. Usando os experimentos de Meselson-Stahl como base, demonstre porquê a proposta de um modelo conservativo não é adequada para explicar a replicação do DNA. A deselicoidização dos dois filamentos irá expor as bases em cada filamento. Cada base exposta tem o potencial para parear com nucleotídeos livres na solução. Como a estruturado DNA impõe requisitos rígidos de pareamento, cada base exposta irá parear apenas com sua base complementar, A com T e G com C. Assim, cada um dos dois filamentos irá agir como um molde, para dirigir a montagem de bases complementares para reestruturar uma dupla hélice idêntica à original. Os nucleotídeos recém-adicionados são supostos como vindos de um conjunto de nucleotídeos livres que devem estar presentes na célula. 6. As moléculas hipotéticas à esquerda são replicadas em solução de “trifosfatos de 2’-desoxi- adenosina” com todos os seus átomos de fósforo na forma do isótopo radioativo 32P (representação do nucleotídeo radioativo em negrito). A maneira semiconservativa de representar a replicação é: Não pode ser a letra a, pois mostra como se a fita se quebrasse em varias partes diversas para depois se reorganizar, o que não ocorre. Não é a b pois apenas a adenosina foi corada, logo não faz sentido T estar em negrito também. Resposta correta é a letra C. Não é a letra d, pois o marcador irá marcar apenas a adenosina, A. 7. O genoma humano tem, em 23 cromossomos, aproximadamente 3,2x109 pares de bases (pb) de DNA, o equivalente a 3 – 3,5pg dessa molécula. Considerando que um par de deoxinucleotídeos mede 0,34nm de altura, qual o comprimento de DNA total, alinhando ponta a ponta todos os cromossomos: (a) de uma célula diploide em G0 (interfase): Na interfase O comprimento será de (b) de todas as células de uma pessoa? (considerando que a pessoa tenha 50 trilhões de células em G0): 8. Discuta a diferença de complexidade dos organismos em relação ao (a) número de genes: Os genes fornecem instruções para produzir proteínas, as quais dão às células e aos organismos, suas características funcionais. Quanto maior o numero de genes, maior a complexidade do organismo. (b) tamanho do genoma: Genoma é o conjunto de DNA encontrado no núcleo com toda informação hereditária de uma espécie. Porém, um genoma complexo não significa que ele seja necessariamente grande, existem espécies de animais considerados menos complexos que o homem, cujo o genoma é 10 vezes maior que o humano. Isso se deve ao fato de que em uma sequencia de genes, existem moléculas de DNA intercalante, sequencias repetidas de nucleotídeos, cuja função não funcionalidade não foi estabelecida e portanto é chamada de “lixo de DNA”. (c) número de cromossomos. Como essa questão se relaciona com o “paradoxo do valor C”? O valor C expressa a quantidade de DNA presente no genoma. O paradoxo do valor C diz respeito a impossibilidade de correlacionar o tamanho do genoma de uma espécie com o a complexidade da mesma. Cromossomos são uma forma de organização do DNA, que contém o material hereditário de casa espécie. A cromatina é “quebrada” e da origem a um cromossomo. O cariótipo humano possui 46 cromossomos que contem todo o genoma humano. Porém como visto anteriormente, não se pode relacionar a complexidade de uma espécie apenas pelo tamanho do seu genoma, existem espécies que ao longo dos anos, fundiram seus cromossomosde forma a diminuir seu cariótipo, porem preservam suas características hereditárias sem aparente prejuízo. 9. Na literatura acadêmica podemos encontrar figuras que confundem os leitores por conter erros conceituais. Algumas delas estão disponíveis na internet e são comumente utilizadas em apostilas, aulas e/ou seminários. Nos sites www..., por exemplo, encontra-se a ilustração (a) ao lado. Essa figura esteve presente na primeira edição do livro “Color Atlas of Genetics" de Eberhard Passarge, publicado pela Editora Thieme em 1995. Na segunda edição (2001) do livro a figura (a) foi substituída pela (b). a) Qual o erro conceitual contido em (a)? Os nucleossomos não possuem formato arredondado e sim achatado e cilíndrico. b) A figura (b) está correta? Figura A está errada, pois o número máximo de voltas em torno do nucleossomo é duas e na sua ilustração apresenta três voltas. A ligação das histonas está de forma errada, pois as histonas H3 e H4 se organizam de forma a formar um tetrâmero que então se conecta ao DNA, e então os dímeros, H2A-H2B se unem ao complexo H3-H4-DNA, completando o nucleossomo. 10. Quais as interações que de certa maneira estabilizam a associação do DNA com o octâmero de histonas? Apesar dessa pequena estabilidade, quais os modos em que o DNA se dissocia do octâmero para que ocorram associações com outras proteínas? Cerca de 142 ligaçoes de hidrogênio são formadas entre o DNA e o cerne de histonas. Quase metade dessas ligações se forma entre os aminoácidos da estrutura das histonas e o esqueleto fosfodiester do DNA. Numerosas interações hidrofóbicas e pontes salinas também mantem o DA ligado as proteínas do nucleossomo. Além disso cada histona do cerne possui uma causa n- terminal de aminoácidos que se projeta fora do cerne histona-DNA, sujeitas a diversos tipos de modificações covalentes que por sua vez controlam aspectos críticos da estrutura e função da cromatina. 11. (a) O cromossomo metafásico humano não pode ser observado em microscopia óptica convencional; Falso. Os Cromossomos estão presentes nas células que estão em processo de divisão. No lugar da cromatina, podemos observar no núcleo, pequenos corpos em forma de bastão bastante corados, facilmente visíveis quando observados ao microscópio óptico. (b) A histona H1 desempenha papel fundamental na estrutura em solenoide; Sim. A histona H1 tem papel na organização da cromatina ocupando lugar na região entre os nucleossomos, forçando o material a outro tipo de compactação, em estruturas secundárias helicóides, denominadas solenóides. O solenóide corresponde à compactação de 6 a 7 nucleossomos. (c) A fibra cromatínica é o estágio de máxima condensação cromossômica; Falso. A cromatina se divide em duas regiões: eucromatina, na sua forma descondensada, correspondendo a regiões em transcrição ativa, e heterocromatina, com regiões do material genético que não estão envolvidas na transcrição, portanto mais inativa devido ao alto grau de condensação. (d) Somente durante a divisão celular o DNA se enovela com o octâmero de histonas formando os nucleossomos; Falso. Ele sempre se liga ao octamero de histonas formando os nucleossomos, não somente durante a divisão celular. (e) Nenhuma das alternativas anteriores. Não 12. De que maneira as solenoides são estabilizadas para formar a fibra cromatínica de 30nm? A histona H1 tem papel na organização da cromatina ocupando lugar na região entre os nucleossomos, forçando o material a outro tipo de compactação, em estruturas secundárias helicóides, denominadas solenóides. O solenóide corresponde à compactação de 6 a 7 nucleossomos. 13. O que são os códigos de histonas? Proteínas histona são marcadas com etiquetas químicas, tais como grupos metila. O código de histona consiste nos padrões formados por tais marcas, em todo o genoma e são elas que dão as instruções de quando e como o DNA empacotado nos nucleossomos sera acessado, ou seja, determina quais genes que são, de fato, ativados em tipos de células particulares. 14. Explique o papel da proteína de barreira no efeito posicional variegado na Drosophila. efeitos posicionais, nos quais a atividade do gene depende da sua posição relativa à proximidade de uma região de heterocromatinano cromossomo. Os efeitos posicionais, primeiramente reconhecidos em Drosophila, foram observados em vários eucariotos, incluindo leveduras, plantas e humanos. Os efeitos posicionais associados à heterocromatina exibem uma característica denominada efeito posicional variegado, que forneceu pistas retrospectivas essenciais sobre a função da cromatina. Em Drosophila, os eventos de quebra cromossômica que ligam diretamente uma região de heterocromatina a uma região de eucromatina tendem a inativar genes eucarióticos localizados nas proximidades. 15. Diferencie ‘histonas covalentemente modificadas’ de ‘variantes de histonas’. 16. Qual o papel desempenhado pela CENP-A? (Centromere protein A), é responsável pela formação do centrômero. A partir do centrômero, as fibras do fuso puxam as cromátides-irmãs, por um processo de encurtamento, até os pólos da célula. CENP-A provoca mudanças na forma do nucleossomo, tornando-o mais rígido. Dessa forma, ela substitui a histona H3 nos nucleossomos localizados no centrômero. Tem a função de marcar a localização dos centrômeros por meio da reestruturação do nucleossomo. 17. O que é a memória celular epigenética? A epigenética é definida como modificações do genoma que são herdadas pelas próximas gerações, mas que não alteram a sequência do DNA. Por muitos anos, considerou-se que os genes eram os únicos responsáveis por passar as características biológicas de uma geração à outra. Entretanto, esse conceito tem mudado e hoje os cientistas sabem que variações não- genéticas (ou epigenéticas) adquiridas durante a vida de um organismo podem frequentemente serem passadas aos seus descendentes. A herança epigenética depende de pequenas mudanças químicas no DNA e em proteínas que envolvem o DNA. Existem evidências científicas mostrando que hábitos da vida e o ambiente social em que uma pessoa está inserida podem modificar o funcionamento de seus genes. 18. Verdadeiro ou falso: (a) O código de histonas é irreversível durante a vida de uma célula; Não, o código de histonas não é irreversível durante a vida da célula por conta das modificações covalentes. (b) A histona H1 exerce um papel fundamental na estrutura centromérica; Não, H1 exerce função na formação dos solemoides. (c) O que determina se uma porção cromossômica é eucromatina ou heterocromatina é o grau de compactação da fibra cromatínica por proteínas não histônicas; Verdadeiro. (d) Nas heterocromatinas constitutivas a histona H1 é a responsável pela compactação cromossômica; Falso, H1 é responsável pelo solenoide e não pela compactação. (e) Nenhuma das alternativas anteriores. Falso. 19. (a) A periferia interna do núcleo é rica em eucromatinas transcricionalmente ativas; Falso. A periferia interna do núcleo é rica em heterocromatina, que é transcricionalmente inativa. (b) O interior do núcleo é heterogêneo, e regiões nucleares vizinhas podem possuir efeitos distintos na expressão gênica; Sim. (c) Os genes possuem lugar fixo no núcleo, independentemente de sua atividade; Falso. O lugar dos genes no núcleo são dependentes de sua atividade. (d) A heterocromatinização eleva os níveis de transcrição do segmento modificado; Falso. É a eucromatinização que possibilita que a transcrição ocorra, pois está mais descondensada. (e) As bandas claras no bandamento G podem ser chamadas de heterocromatinas constitutivas. Falso. As bandas mais claras nobandamento G são chamadas de eucromatina. 20. O código de histonas pode determinar: (a) padrões epigenéticos; sim, pois ela “decide” quais genes serão ativos em determinadas células para que estas exerçam diferentes funções. * Epigenética é definida como modificações do genoma, herdável durante a divisão celular, que não envolve uma mudança na sequência do DNA. (b) ativação transcricional; quando ocorre a acetificação, ou seja, adição de um grupo acetil na molécula da histona. (c) silenciamento gênico; sim e também é responsável pela ativação genica. (d) atração de complexos proteicos com atividades catalíticas (funções biológicas); Sim, através de adições ou remoções de moléculas inibidoras ou ativadoras, determina-se determinadas funções biológicas como apoptose, diferenciação, parada do ciclo celular. (e) Todas as alternativas anteriores estão corretas. Sim. Além de organizar o DNA e de torná-lo mais compacto, as histonas possuem um papel importante na determinação de quais genes são ativos. 21. Nos centrômeros: (a) as CENP-A associam-se as proteínas do cinetócoro; Sim, pois se associa ao fuso de microtúbulos para ocorrer a separação das cromátides na mitose. (b) a replicação é mais demorada (tardia); (c) predomina heterocromatina; Sim (d) alternam-se segmentos de cromatinas com H3 e CENP-A; sim (e) Todas as alternativas anteriores estão corretas. Sim. Formação da herença da cromatina forma os centrômeros. CENP-A é uma variante da histona H3 que é especifica de centrômeros. Centromeros de organismos complexos são definidos por um conjunto de proteínas, ao invés de uma sequencia especifica de dna.
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