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Detecção de proteínas Proteínas são heteropolímeros de aminoácidos unidos por ligações peptídicas A detecção e quantificação de uma proteína através de espectrofotometria se baseia nas propriedades de absorção de luz: 1) da ligação peptídica; 2) de grupos presentes nas cadeias laterais dos aminoácidos que a constituem; 3) de produtos coloridos resultantes de reações entre a proteína e compostos químicos específicos. Referência: Zaia et al., 1998. Química Nova 21(6), 787 - 793 Método “princípio” interferentes observação Biureto Complexo entre Cu+2 e ligação peptídica absorve em 540nm Sulfato de amônio, lipídeos, amido, lactose, aminoácidos livres (His, Ser, Thr) Baixa sensibilidade (mg) Bradford Complexo entre o corante Comassie Blue G-250 e cadeias laterais de Lys, Arg, Tyr, e Trp absorve em 595 nm Uréia (> 45g/L), detergentes (Triton X-100 e SDS) e lipídeos “Boa” sensibilidade (µg) Rápida execução (min) Absorbância UV Cadeias laterais de Trp, Phe e Tyr aborvem em 280nm Aminoácidos livres (Trp, Phe e Tyr) “Boa” sensibilidade (µg) Rápida execução (min) É preciso conhecer a composição de aminoácidos da proteína para calcular ε (coeficiente de extinção molar) Ideal para proteínas purificadas Comassie Blue G-250 Complexo Cu+2-ligação peptídica Estratégia para dosagem de proteínas no lisado das células de levedura Proteínas + Corante (CBG) Complexo Colorido Como correlacionar a “cor formada” com a quantidade de proteína presente? log I/I0 = -α c l log I/I0 = - absorbância absorbância = α c l absorbância = cte. c y = inclinação . c Abs. concentração massas mols Abs. concentração massas mols Experimentalmente Abs. concentração massas mols Experimentalmente Abs. concentração massas mols Equação da reta (y = ax + b; neste caso Abs = inc. massa +b) Limites inferior e superior de absorbância – possibilidade de “fuga” da linearidade Curva padrão para dosagem de proteínas com Reagente de Bradford (Comassie Blue G) Diferentes massas de proteína Corante Absorbância (595 nm) Abs 595nm massa de proteína (mg) Tabela 1 tubos albumina 0,2 g/L (µL) água (µL) reagente de Bradford (mL) branco 0 100 1,0 1 10 90 1,0 2 20 80 1,0 3 30 70 1,0 4 40 60 1,0 5 50 50 1,0 6 60 40 1,0 7 70 30 1,0 8 80 20 1,0 tubos A595 A1 A2 A3 A4 Tabela 3 tubos L100X (µL) H2O (µL) reagente de Bradford (mL) branco - 100 1,0 A1 100 - 1,0 A2 50 50 1,0 A3 30 70 1,0 A4 20 80 1,0 [proteína] (mg/mL) Enzimas são catalisadores biológicos. -especificidade em relação aos produtos e reagentes E + S E + P A presença de uma enzima específica pode ser detectada através da ocorrência da reação (formação do produto) k E + S E + P k Como quantificar a enzima? v = k [E] [S] Assim, a velocidade é diretamente proporcional a concentração de enzima e de substrato [P] tempo v = k [E] [S] v [P] tempo inclinação = v = ∆[P]/∆t v Qual v usar? v = k [E] [S] Assim, se [S] ~ constante (igual à inicial), a velocidade é diretamente proporcional a concentração de enzima [P] tempo Se menos de 10 % for consumido, podemos assumir v ~ constante. (v inicial; v0). Medida de velocidade inicial Se a velocidade inicial é constante, então para determiná-la é preciso construir uma curva de [P] x tempo e verificar se é linear. [P] tempo vários tempos A velocidade inicial (v0) é proporcional à concentração de enzima [P] tempo - “esgotamento” do substrato - inativação da enzima v = k [E] [S] Medida de velocidade inicial [P] tempo vários tempos x 1 único tempo Medida de velocidade inicial [P] tempo vários tempos x 1 único tempo Medida de velocidade inicial [P] tempo vários tempos x 1 único tempo 1 U de atividade = quantidade de E em uma reação com velocidade de formação de 1 µmol de Produto / min 1 U = 1 µmol P / min [P] tempo O CH2OH O O CH2OH O CH2OH O CH2OH α-glicosidase ou maltase maltose H2O O CH2OH O NO2 p-nitrofenil-α-glucosídeo maltose O CH2OH O O CH2OH O CH2OH α-glicosidase pH 7,0 p-nitrofenil α−glucosídeo + NO2 HO O NO2 O CH2OH O CH2OH α-glicosidase pH 7,0 p-nitrofenil α−glucosídeo + NO2 HO H+ + -O (p-nitrofenolato; amarelo) O NO2 O CH2OH pH 11,0 Preparar este conjunto de tubos para as três diluições do lisado (10x, 50x e 500x) controle controle controle controle 1 U = 1 µmol P / min [P] tempo Concentração de atividade enzimática U/mL Concentração de proteína total mg/mL Atividade específica U/mg Número do slide 1 Número do slide 2 Número do slide 3 Número do slide 4 Número do slide 5 Número do slide 6 Número do slide 7 Número do slide 8 Número do slide 9 Número do slide 10 Número do slide 11 Número do slide 12 Número do slide 13 Número do slide 14 Número do slide 15 Número do slide 16 Número do slide 17 Número do slide 18 Número do slide 19 Número do slide 20 Número do slide 21 Número do slide 22 Número do slide 23 Número do slide 24 Número do slide 25 Número do slide 26 Número do slide 27 Número do slide 28 Número do slide 29 Número do slide 30 Número do slide 31
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