BIOINFORMÁTICA testes

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BIOINFORMÁTICA
1a aula
		
	 
	Lupa
	 
	 
	
	
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		Exercício: SDE4449_EX_A1_201912014467_V1 
	14/04/2020
	Aluno(a): MARCOS ANTONIO MEDEIROS DA SILVA
	2020.1 - F
	Disciplina: SDE4449 - BIOINFORMÁTICA 
	201912014467
	
	 
	
	 1a Questão
	
	
	
	
	Qual dos cientistas a seguir teve grande contribuição para o avanço da bioinformática como área da ciência?
		
	
	Charles Darwin, com a publicação do livro ¿A origem das espécies¿.
	
	Marie Curie, pela sua pesquisa sobre dois novos elementos químicos: o rádio e polônio.
	 
	Magaret Dayhoff, que usou computadores para o estudo de proteínas, criando o primeiro ¿Atlas de Proteínas¿.
	
	Alexander Fleming, com a descoberta da penicilina.
	
	Werner Karl Heisenberg, pela criação da mecânica quântica.
	Respondido em 14/04/2020 04:31:14
	
Explicação:
A brilhante Magaret Dayhoff  desvendou a ordem dos aminoácidos que formavam algumas proteínas e a forma que essas proteínas tinham, criando o primeiro ¿Atlas de Proteínas¿. Este é considerado um dos primeiros experimentos em bioinformática, que foi publicado em 1965.
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	Por que o "Projeto Genoma Humano" tem uma grande relação com a história da bioinformática?
		
	
	Foi durante esse projeto que se descobriu do que é feita e como se organiza a molécula de DNA.
	
	Porque foi a primeira vez que uma ferramenta computacional foi aplicada para analisar dados biológicos.
	 
	Pois muitas ferramentas computacionais precisaram ser desenvolvidas e aprimoradas para determinar todo o genoma humano e interpretar essas informações.
	
	Durante o período de execução desse projeto, a bioinformática ficou estagnada, e poucos avanços ocorram nessa área.
	
	Pois ficou provado que as ferramentas computacionais não eram essenciais para determinar e interpretar o genoma humano.
	Respondido em 14/04/2020 04:31:32
	
Explicação:
Esse projeto gerou muitos dados computacionais, que impulsionaram o avança da bioinformática.
	
	
	 
	
	 3a Questão
	
	
	
	
	Sobre a bioinformática, qual das afirmativas abaixo está incorreta?
		
	
	O desenvolvimento de tecnologias para sequenciar o DNA foi um dos principais pilares para o surgimento da bioinformática.
	
	Um bioinformata atua interpretando dados biológicos e desenvolvendo/aprimorando algoritmos computacionais.
	 
	Um bioinformata não é capaz de desenvolver ferramentas computacionais que ajudam na interpretação de dados obtidos de experimentos na bancada, ele só utiliza essas ferramentas.
	
	A bioinformática usa ferramentas computacionais para estudar informações biológicas.
	
	A bioinformática é considerada uma área interdisciplinar, que envolve profissionais de diferentes graduações.
	Respondido em 14/04/2020 04:31:40
	
Explicação:
O bioinformata pode sim desenvolver ferramentas computacionais.
	
	
	 
	
	 4a Questão
	
	
	
	
	 A seguir temos três afirmativas sobre as potencialidades da bioinformática. Julgue-as como verdadeiras ou falsas.
I) A análise de sequências possibilita comparar várias sequências de genes e determinar a relação evolutiva entra elas.
II) A análise de sequências permite encontrar genes em meio a longas sequências de DNA.
III) Com apenas a sequência do gene não é possível determinar sua através de métodos de bioinformática.
		
	 
	As afirmativas I e II estão corretas.
	
	Apenas a afirmativa III está correta.
	
	Apenas a afirmativa II está correta.
	
	Apenas a afirmativa I está correta.
	
	Todas as afirmativas estão corretas.
	Respondido em 14/04/2020 04:31:43
	
Explicação:
Pode ser realizado um alinhamento usando a sequência do gene contra sequências presentes em um banco de dados para determinar sua função, por exemplo.
	
	
	 
	
	 5a Questão
	
	
	
	
	Um profissional em bioinformática precisa ter conhecimento em qual das seguintes áreas abaixo?
		
	
	Biologia molecular.
	
	Computação.
	 
	Todas as alternativas anteriores.
	
	Matemática.
	
	Estatística.
	Respondido em 14/04/2020 04:31:51
	
Explicação:
A bioinformática é uma área interdisciplinar.
	
	 
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		Exercício: SDE4449_EX_A2_201912014467_V1 
	14/04/2020
	Aluno(a): MARCOS ANTONIO MEDEIROS DA SILVA
	2020.1 - F
	Disciplina: SDE4449 - BIOINFORMÁTICA 
	201912014467
	
	 
	
	 1a Questão
	
	
	
	
	A respeito dos computadores, marque a(S) alternativa(S) INCORRETA(S).
		
	
	O software dos computadores nada é do que o sistema e o programa que executam os comandos do usuário.
	
	Os computadores podem ser classificados quanto a sua utilização em: pessoais, científico e comercias.
	
	Software é composto por programas como o Windows, pelo HD e memória enquanto o hardware é composto por placa mãe e memória secundária
	 
	Todo computador é divido em dois sistemas eletrônicos: software e hardware
	
	Os supercomputadores são aqueles que apresentam uma velocidade maior no processamento de dados, sendo ideal para serem utilizados em estudos de bioinformática.
	Respondido em 14/04/2020 04:32:17
	
Explicação:
Todo computador necessita de um sofware e um hardware para funcionar.
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	 A evolução por homologia associa a similaridade morfológica de algumas estruturas corporais com a presença de um ancestral comum entre as espécies. As evidências evolutivas de que as espécies evoluíram por homologia é a presença de genes homólogos, ou seja, genes que apresentem com sequências nucleotídicas iguais ou altamente semelhantes que podem codificar para estruturas com a mesma função ou não. A respeito dos genes homólogos marque a alternativa correta.
		
	
	 
Os genes paralogos são genes ortólogos  que divergiram após o processo de duplicação dentro do genoma de uma mesma espécie.
 
	
	 
 Os genes ortólogos são provenientes dum ancestral comum e apresentam funções muito diferentes.
 
	
	 Os genes parálogos são aqueles que divergiram após o processo de inversão dentro do genoma de uma mesma espécie.
 
	
	Os genes homólogos encontrado no indivíduo são herdados apenas da mãe ou do pai.
 
	 
	 Os genes ortólogos são genes homólogos que divergiram após o processo de especiação, onde cada espécie descendente apresenta uma cópia do genee.
 
	Respondido em 14/04/2020 04:32:24
	
Explicação:
Resposta correta letra B
	
	
	 
	
	 3a Questão
	
	
	
	
	Sobre os processos evolutivos de analogia e homologia, marque a opção correta.
		
	
	Tanto a homologia quanto a analogia relacionam ancestralidade comum, semelhança anatômicas e divergência funcional.
	
	A analogia é um processo evolutivo que associa indivíduos relacionados à semelhanças anatômicas e funcional.
	
	 A homologia é um processo evolutivo que relaciona semelhança anatômica e semelhança funcional.
	
	 
Tanto a homologia quanto a analogia relaciona, ancestralidade comum e as divergências funcionais
 
	 
	A analogia é um processo evolutivo que associa indivíduos não relacionados à semelhanças anatômicas e funcional.
 
	Respondido em 14/04/2020 04:32:32
	
Explicação:
Letra D. A analogia é um processo evolutivo relacionado a convergência evolutiva
	
	
	 
	
	 4a Questão
	
	
	
	
	Quais são os principais eventos genéticos responsáveis pela variação gênica dos organismos ?
 
		
	
	Mutação e duplicação cromossômica
 
	 
	Mutação e duplicação gênica
	
	Translocação cromossômica e mutação
	
	Inserção e translocação genica
 
	
	Inversão e duplicação gênica
 
	Respondido em 14/04/2020 04:32:36
	
Explicação:
Letra C
	
	
		 
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		Exercício: SDE4449_EX_A3_201912014467_V1 
	14/04/2020
	Aluno(a): MARCOS ANTONIO MEDEIROS DA SILVA
	2020.1 - F
	Disciplina: SDE4449 - BIOINFORMÁTICA 
	201912014467
	
	 
	
	 1a Questão
	
	
	
	
	O que o dogma central da Biologia Molecular descreve?
		
	
	A sequência completa de DNA de um organismo.
	
	O processo de controle daexpressão gênica.
	 
	O fluxo de informações do código genético.
	
	O mecanismo de processamento do RNA, a partir do DNA.
	
	Os processos envolvidos na diferenciação celular.
	Respondido em 14/04/2020 04:32:55
	
Explicação:
Letra C. O dogma central descreve como ocorre o fluxo de informações do código genético. Segundo esse dogma, o fluxo da informação genética segue o seguinte sentido: DNA → RNA → PROTEÍNAS. Observa-se, portanto, que esse dogma demonstra todos os processos pelos quais os ácidos nucleicos podem passar. Dessa forma, temos o DNA, onde está contida a informação genética, que pode ser transcrito em moléculas de RNA. É nessa molécula de RNA que é encontrado o código usado para organizar a sequência de aminoácidos e formar as proteínas no processo de tradução, o qual consiste na união de aminoácidos, obedecendo à ordem de códons presentes em uma molécula de RNA mensageiro.
		 
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		Exercício: SDE4449_EX_A3_201912014467_V2 
	14/04/2020
	Aluno(a): MARCOS ANTONIO MEDEIROS DA SILVA
	2020.1 - F
	Disciplina: SDE4449 - BIOINFORMÁTICA 
	201912014467
	
	 
	
	 1a Questão
	
	
	
	
	O que o dogma central da Biologia Molecular descreve?
		
	
	A sequência completa de DNA de um organismo.
	
	O processo de controle da expressão gênica.
	
	Os processos envolvidos na diferenciação celular.
	
	O mecanismo de processamento do RNA, a partir do DNA.
	 
	O fluxo de informações do código genético.
	Respondido em 14/04/2020 04:33:11
	
Explicação:
Letra C. O dogma central descreve como ocorre o fluxo de informações do código genético. Segundo esse dogma, o fluxo da informação genética segue o seguinte sentido: DNA → RNA → PROTEÍNAS. Observa-se, portanto, que esse dogma demonstra todos os processos pelos quais os ácidos nucleicos podem passar. Dessa forma, temos o DNA, onde está contida a informação genética, que pode ser transcrito em moléculas de RNA. É nessa molécula de RNA que é encontrado o código usado para organizar a sequência de aminoácidos e formar as proteínas no processo de tradução, o qual consiste na união de aminoácidos, obedecendo à ordem de códons presentes em uma molécula de RNA mensageiro.
	
	
		 
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		Exercício: SDE4449_EX_A4_201912014467_V1 
	14/04/2020
	Aluno(a): MARCOS ANTONIO MEDEIROS DA SILVA
	2020.1 - F
	Disciplina: SDE4449 - BIOINFORMÁTICA 
	201912014467
	
	 
	
	 1a Questão
	
	
	
	
	O processo de extração tem como objetivo isolar o ácidos nucleico dos demais componentes celulares. Baseado neste processo marque a alternativa incorreta
		
	
	A remoção do RNA é uma etapa exclusiva da extração de DNA
	
	A precipitação do ácido nucleico pode se realizada com etanol ou álcool isopropílico.
	
	O fenol clorofórmio é um insumo muito utilizado para promover a precipitação de proteínas.
	
	Substâncias com ação de detergentes podem ser utilizadas para remoção dos lipídios da amostra
	 
	A primeira etapa da extração é a lise de membranas onde são utilizados substância com ação de solvente
	Respondido em 14/04/2020 04:33:29
	
Explicação:
Letra A. São substância detergentes e não solventes. 
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	Sobre o desenho experimental, ma rque a alternativa correta.
		
	
	Grupos controle, variáveis dependentes e independentes não são fatores importantes para pesquisa cientifica experimental, apenas para pesquisa científica não experimental.
	
	A hipótese nula de uma pesquisa confirma a relação de causa-efeito.
	 
	A pesquisa experimental tem como finalidade testar hipóteses que dizem respeito à convicção do pesquisador, envolvendo grupos de controle, seleção aleatória e manipulação de variáveis.
	
	A pesquisa científica experimental não busca ajudar um pesquisador a determinar o efeito causal entre dois fatores.
	
	Uma pesquisa científica pode ser desenvolvida sem o estabelecimento de uma hipótese.
	Respondido em 14/04/2020 04:33:38
	
Explicação:
Resposta  correta letra D.
	
	
	 
	
	 3a Questão
	
	
	
	
	Gabriela irá realizar a técnica de eletroforese para avaliar qualitativamente e quantitativa o RNA extraído de células bucais que será utilizado no seu projeto de mestrado. Porém, Gabriela tem duvidas quanto ao príncipio e aplicação da técnicas. Marque a alternativa  da melhor explicação que você daria a Gabriela.
		
	 
	 A eletroforese é técnica que utiliza campo elétrico para separar moléculas de acordo com carga e peso molecular
 
	
	A eletroforese é uma técnica ótica que associa a quantidade de luz absorvida com a quantidade da substância na amostra.
 
	
	A eletroforese é técnica que utiliza campo elétrico para separar moléculas de acordo com o peso molecular e afinidade.
 
 
	
	 
A eletroforese é uma técnica que utiliza corantes fluorescente como iodina  para detectar e quantificar substâncias.
 
	
	 A eletroforese é uma técnica ótica que associa a quantidade de luz transmitida com a quantidade da substância na amostra.
 
	Respondido em 14/04/2020 04:33:35
	
Explicação:
Resposta correta letra E.
	
	
	 
	
	 4a Questão
	
	
	
	
	A coleta e o armazenamento de amostras destinadas as técnicas de biologia molecular devem ser realizadas com muito cuidado devido ao alto risco de degradação das moléculas de ácidos nucleicos. A respeito destes processos marque a alternativa CORRETA.  
		
	
	A coleta de tecido proveniente de biópsia pode ser armazenado e transporta resfriado a temperatura de 2º a 8ºC
	 
	Para amostras de sangue e de medula as amostras destinadas a extração do RNA devem ser armazenadas em freezer -70ºC
	
	Independente do tipo de amostra, a coleta de espécimes clínicos destinados a extração de DNA e RNA devem ser realizadas com estabilizadores
	
	Não há necessidade de transportar as amostras coletadas em caixas isotérmicas com gelo seco.
	
	As amostras de tecido destinadas a extração do DNA devem obrigatoriamente ser armazenadas em nitrogênio líquido.
	Respondido em 14/04/2020 04:33:51
	
Explicação:
Neste tipo de amostras o RNA só se mantem instavel por algum tempo se armazenado em temperaturas superiores a -70ºC
	
	
	 
	
	 5a Questão
	
	
	
	
	A variabilidade genética é gerada por eventos espontâneos que contribuem para o processo evolutivo como a mutação. A respeito da mutação marque a alternativa INCORRETA
 
		
	 
	A substituição de nucleotídeos que gerar um novo códon sem alterar o aminoácido é chamada de mutação e de sentido trocado  (missense mutation).
	
	 A substituição de nucleotídeos que gera um códon de parada é chamanda de mutação sem sentido (nonsense mutation).
	
	A inserção e a deleção um ou alguns nucleotídeos geralmente levam a alterações mais drásticas nos códons e como consequência na proteína resultante. 
	
	As mutações conhecidas como mutação de fase de leitura (frameshift mutations) alteram a fase de leitura de todas as trincas de pares de bases no gene depois do sítio mutado.
	
	A substituição corresponde a troca de nucleotídeos incorporados na sequência do DNA.
	Respondido em 14/04/2020 04:34:00
	
Explicação:
Resposta letra D. A substituição de nucleotídeos que gerar um novo códon sem alterar o aminoácido é chamada de mutação silenciosa. 
	
	
	 
	
	 6a Questão
	
	
	
	
	Eduardo está desenvolvendo uma pesquisa para investigar a associado de mutações em células da mucosa da laringe com o desenvolvimento de câncer. Assim, ele recrutou pacientes saudáveis e com câncer de laringe para fazer a coleta do material. Após a biopsia Eduardo não sabia como armazenar este espécime clinico e de uma forma precisa e correta sua amiga Luana o orientou a: 
		
	 
	 
Manter o tecido no freezer (-70ºC) para posterior extração do DNA das células do tecido da laringe
 
	
	 
Manter o tecido no freezer (2º a 8ºC) para posterior extração do DNA das células do tecido da laringe
 
	
	Manter  o tecido em geladeira (2º a 8ºC) para posterior extraçãodo DNA das células do tecido da laringe
 
	
	 
Armazenar o tecido em nitrogênio líquido (-196ºC) para posterior extração do DNA das células do tecido da laringe
	
	 
Armazenar o tecido no freezer (-10ºC ) para posterior extração do DNA das células do tecido da laringe
 
	Respondido em 14/04/2020 04:34:10
	
Explicação:
Para a extração da DNA é suficiente armazenar em freezer -70º graus
	
	
	 
	
	 7a Questão
	
	
	
	
	Sobre as etapas da extração do DNA marque a alternativa correta.
		
	
	A segunda etapa é a precipitação do DNA após lavagens sequenciais com soluções alcoólicas e centrifugação
	
	A segunda etapa do processo é a lise das membranas lipídicas.
	
	A primeira etapa da extração tem por objetivo fazer a lise das membranas celulares utilizando fenol-cloroformio.
	
	A primeira etapa da extração tem por objetivo inativar nucleases e retirar outras proteínas contaminantes.
	 
	A terceira etapa consiste na remoção do RNA
	Respondido em 14/04/2020 04:34:20
	
Explicação:
Resposta letra C
	
	
		 
	BIOINFORMÁTICA
5a aula
		
	 
	Lupa
	 
	 
	
	
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		Exercício: SDE4449_EX_A5_201912014467_V1 
	14/04/2020
	Aluno(a): MARCOS ANTONIO MEDEIROS DA SILVA
	2020.1 - F
	Disciplina: SDE4449 - BIOINFORMÁTICA 
	201912014467
	
	 
	
	 1a Questão
	
	
	
	
	(UFMG) Se o total de bases nitrogenadas de uma sequência de DNA de fita dupla é igual a 240, e nela existirem 30% de adenina, o número de moléculas de guanina será:
		
	
	168
	 
	48.
	
	144
	
	120
	
	72
	Respondido em 14/04/2020 04:34:41
	
Explicação:
Para resolver essa questão, é necessário saber algumas noções de porcentagem.
Inicialmente temos que achar o valor real de adenina:
100%-----240
30%--------x
x= 72
Como a adenina só se liga à timina, há 72 timinas na fita. Temos, portanto, um total de 144 bases correspondentes à timina e adenina. Subtraímos esse valor de 240 e obtemos 96. Esse valor corresponde à quantidade de bases citosina e guanina. Como elas também se ligam, temos a metade para cada uma: 48 citosinas e 48 guaninas.
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	Em relação às macromoléculas que constituem a maioria dos seres vivos, é correto afirmar que
		
	
	as enzimas e os esteroides são proteínas.
	
	os lipídeos e os peptideoglicanos compõem a membrana plasmática de todos os eucariotos.
	 
	 os ácidos nucleicos, DNA e RNA, são formados por várias unidades chamadas de nucleotídeos.
	
	os triglicerídeos e polissacarídeos são carboidratos
	
	o glicogênio e o amido são polissacarídeos produzidos pelas células vegetais
	Respondido em 14/04/2020 04:34:51
	
Explicação:
Os ácidos nucleicos, DNA e RNA, são polímeros de monômeros denominados nucleotídeos.
	
	
	 
	
	 3a Questão
	
	
	
	
	(PUC-SP) [¿] De outro lado, o galardão de química ficou com os inventores de ferramentas para estudar proteínas, os verdadeiros atores do drama molecular da vida.
É verdade que a Fundação Nobel ainda fala no DNA como o diretor da cena a comandar a ação das proteínas, mas talvez não seja pretensioso supor que foi um lapso, e que o sinal emitido por essas premiações aponta o verdadeiro futuro das pesquisas biológicas e médicas muito além do genoma e de seu sequenciamento (uma simples soletração). (¿)
* LEITE, Marcelo. De volta ao sequenciamento. Folha de S. Paulo- 20 out. 2002.
O autor refere-se às proteínas como ¿atores do drama molecular¿ e ao DNA como ¿diretor de cena¿. Essa referência deve-se ao fato de:
		
	
	as proteínas não terem controle sobre o metabolismo celular.
	 
	o DNA controlar a produção de proteínas e estas controlarem a atividade celular.
	
	o material genético ser constituído por proteínas.
	
	não ocorrer uma correlação funcional entre DNA e proteínas no meio celular.
	
	o DNA controlar a produção de proteínas e também atuar como catalisador de reações químicas celulares.
	Respondido em 14/04/2020 04:34:56
	
Explicação:
O DNA possui sequências de nucleotídeos que serão usadas para a síntese de proteínas, que atuam em todas as atividades do nosso organismo.
	
	
	 
	
	 4a Questão
	
	
	
	
	Marque a alternativa que melhor define um gene.
		
	
	Trecho do RNA que contém sequências de nucleotídeos que são usados para a síntese de proteínas.
	
	O gene é uma porção da molécula de RNA que determina uma característica.
	
	 O gene é uma região do DNA que é responsável pela síntese de carboidratos, determinando nossas características.
	
	O gene é uma porção da célula.
	 
	O gene é uma sequência de nucleotídeos em que está contida a informação que será usada para a síntese de proteínas.
	Respondido em 14/04/2020 04:35:03
	
Explicação:
O gene é uma porção de DNA (sequência de nucleotídeos) onde estão contidas as informações que serão essenciais para a formação das proteínas.
	
	
	 
	
	 5a Questão
	
	
	
	
	Uma fita de DNA apresenta a seguinte sequência:
TCAAGT
Marque a alternativa que indica corretamente a sequência encontrada na fita complementar:
		
	
	ATAAUA
	
	AGUUCA
	
	UCTTGU
	 
	AGTTCA
	
	AGUUGA
	Respondido em 14/04/2020 04:35:12
	
Explicação:
 É importante perceber que o DNA é composto por duas fitas e que uma complementa a outra. Sabemos que na molécula de DNA a adenina sempre se une à timina e que a citosina sempre se liga à guanina. Sendo assim, uma sequência TCAAGT liga-se a uma sequência AGTTCA.
	
	
	 
	
	 6a Questão
	
	
	
	
	Sobre a estrutura do DNA, marque a alternativa incorreta:
		
	
	O DNA carrega as informações genéticas do indivíduo.
	 
	Os nucleotídeos que formam o DNA diferenciam-se do RNA por apresentarem uma ribose e a base timina.
	
	Os cromossomos são formados principalmente por DNA.
	
	Os cromossomos são formados principalmente por RNA.
	
	O DNA, assim como o RNA, é formado por nucleotídeos, que são constituídos por um fosfato, um açúcar e uma base nitrogenada.
	Respondido em 14/04/2020 04:35:20
	
Explicação:
 O DNA, assim como o RNA, é formado por nucleotídios. Estes se diferem pelo açúcar, que no RNA é uma ribose, mas no DNA é uma desoxirribose, e pela base nitrogenada. Somente no DNA ocorre a base timina.
	
	
	 
	
	 7a Questão
	
	
	
	
	A respeito dos sequenciadores, marque a alternativa INCORRETA.
		
	
	O Ion Torrent que é um equipamento entre 2º e 3º geração utiliza a variação do pH como mecanismo de detecção.
	
	 O pirossequenciador mede a liberação do pirofosfato por quimioluminescência
	 
	O Ilumina assim  como o método de Sanger realiza síntese usando DNA polimerase e dideoxinucleotídeos marcados e não constrói biblioteca.
	
	No SoLiD, a reação de sequenciamento é catalisada por uma DNA ligase e não pela DNA polimerase
	
	Os sequenciadores de 1º geração produzem fragmentos sequenciados maiores, porém os de 2º geração são muito mais rápidos.  
	Respondido em 14/04/2020 04:35:29
	
Explicação:
Resposta letra D. O Ilumina utiliza didesoxinucleotídeos assim como o sequenciamento por Sanger, porém ele constrói bibliotecas a a partir do PCR de emulsão.
	
	
	
		 
	BIOINFORMÁTICA
6a aula
		
	 
	Lupa
	 
	 
	
	
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		Exercício: SDE4449_EX_A6_201912014467_V1 
	14/04/2020
	Aluno(a): MARCOS ANTONIO MEDEIROS DA SILVA
	2020.1 - F
	Disciplina: SDE4449 - BIOINFORMÁTICA 
	201912014467
	
	 
	
	 1a Questão
	
	
	
	
	Dentre as vertentes das ômicas, marque a alternativa CORRETA.
		
	 
	Técnicas muito comuns usadas na metabolômica são a ressonância nuclear e as cromatografias.
	
	A genômica estrutural é sinônimo transcriptômica, já que as duas avaliam a expressão gênica
	
	A proteômica estuda a estrutura das proteínas e uma das técnicas utilizadas nesta ciência é o sequenciador automático.
	
	A transcriptômica tem como objetivo avaliar os genes transcritos em determinado organismo sobre determinada condição. Para isto a transcriptômica utiliza técnicas como a Eletroforese.
	
	A metabolômica avalia apenas metabólitos de origem proteica e lipídica.
	Respondido em 14/04/2020 04:35:57Explicação:
Resposta correta letra C. RMN e cromografias são as técnicas mais utilizadas para identificação e caracterização dos metabólitos 
		 
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		Exercício: SDE4449_EX_A6_201912014467_V2 
	14/04/2020
	Aluno(a): MARCOS ANTONIO MEDEIROS DA SILVA
	2020.1 - F
	Disciplina: SDE4449 - BIOINFORMÁTICA 
	201912014467
	
	 
	
	 1a Questão
	
	
	
	
	Dentre as vertentes das ômicas, marque a alternativa CORRETA.
		
	 
	Técnicas muito comuns usadas na metabolômica são a ressonância nuclear e as cromatografias.
	
	A metabolômica avalia apenas metabólitos de origem proteica e lipídica.
	
	A transcriptômica tem como objetivo avaliar os genes transcritos em determinado organismo sobre determinada condição. Para isto a transcriptômica utiliza técnicas como a Eletroforese.
	
	A genômica estrutural é sinônimo transcriptômica, já que as duas avaliam a expressão gênica
	
	A proteômica estuda a estrutura das proteínas e uma das técnicas utilizadas nesta ciência é o sequenciador automático.
	Respondido em 14/04/2020 04:36:13
	
Explicação:
Resposta correta letra C. RMN e cromografias são as técnicas mais utilizadas para identificação e caracterização dos metabólitos 
	
		 
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	Lupa
	 
	 
	
	
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		Exercício: SDE4449_EX_A7_201912014467_V1 
	14/04/2020
	Aluno(a): MARCOS ANTONIO MEDEIROS DA SILVA
	2020.1 - F
	Disciplina: SDE4449 - BIOINFORMÁTICA 
	201912014467
	
	 
	
	 1a Questão
	
	
	
	
	A respeito dos alinhamentos genômicos, marque a alternativa correta.
		
	
	O alinhamento global buscam pequenas regiões de similaridade.
	 
	O alinhamento global busca o maior número de matches do início ao final das sequências
	
	O ClustalW é programas de alinhamento local do genoma.
	
	Nos alinhamentos busca-se a menor quantidade de similaridade
	
	O alinhamento local é aquele que levam em consideração toda a extensão das sequências.
	Respondido em 14/04/2020 04:36:30
	
Explicação:
O alinhamento global analisa toda a extensão da sequência, buscando o maior número de matches. 
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	O blast é um software de alinhamento local básico gerenciado pelo NCBI e muito utilizado nos estudos em bioinformática. A respeito desta ferramenta, marque a alternativa correta.
		
	
	O blastn usa uma sequência de nucleotídeo de entrada e da como resultado uma sequência de proteína
	
	É um algoritmo capaz de realizar buscas baseadas em alinhamento que, apesar serem exatas apresentam um tempo de processamento alto.
 
	
	É uma ferramenta que compara uma sequência desconhecida com aquelas depositadas no computador do usuário.
	 
	É um algoritmo capaz de realizar buscas baseadas em alinhamento que, apesar de não serem exatas, são confiáveis e muito rápidas.
	
	O blastp usa uma sequência de nucleotídeo de entrada e da como resultado uma sequência de proteína
	Respondido em 14/04/2020 04:36:36
	
Explicação:
Resposta letra A. O blast é uma ferramenta confiavel para análises rápidas e iniciais de um trabalho. 
	
	
	 
	
	 3a Questão
	
	
	
	
	A respeito da confecção dos primers, marque a resposta correta.
		
	
	O primer deve apresentar temperatura de melt inferior a 50ºC.
	
	O primer deve ter um conteúdo de GC de cerca de 75%.
	
	Primers são iniciados específicos confeccionados com tamanho variando de 50 a 100 pares de bases
	
	Primers devem apresentar hompolinucleotídeos na sua sequência.
 
	 
	O programa PRIMER 3 é utilizado de forma customizada para a confecção de primers para uma sequência dada.
	Respondido em 14/04/2020 04:36:42
	
Explicação:
Resposta correta letra C. 
	
	
		
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9a aula
		
	 
	Lupa
	 
	 
	
	
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		Exercício: SDE4449_EX_A9_201912014467_V1 
	14/04/2020
	Aluno(a): MARCOS ANTONIO MEDEIROS DA SILVA
	2020.1 - F
	Disciplina: SDE4449 - BIOINFORMÁTICA 
	201912014467
	
	 
	
	 1a Questão
	
	
	
	
	A anotação funcional de um gene inclui saber a função da proteína codificada pelo gene e também identificar a qual processo biológico aquela proteína faz parte. Dentre os processos que ocorrem em uma célula podemos incluir as reações metabólicas e o processamento da informação genética.  Qual dos bancos de dados abaixo auxilia na busca por informações sobre processos biológicos?
		
	
	SWISS-Prot.
	
	GenBank.
	 
	KEGG.
	
	Nenhuma das opções anteriores.
	
	PDB.
	Respondido em 14/04/2020 04:37:26
	
Explicação:
KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) é um banco de dados extremamente completo. Conseguimos extrair dele informações como qual via metabólica a proteína está inserida, doenças relacionadas, dentre outras.
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	Através de estudos usando a bioinformática, um pesquisador identificou que um gene chamado p53 estava modificado em pacientes com câncer de pulmão agressivo em relação a outros pacientes que vêm tendo uma evolução mais lenta e favorável da doença. Caso esse pesquisador queira descobrir a FUNÇÃO desse gene usando a bioinformática, o que você recomendaria a ele?
		
	
	Identificar o códon de iniciação e o códon de parada do gene p53.
	 
	Comparar a sequência de nucleotídeos do gene p53 com outras sequências de genes com funções conhecidas, usando para isso bancos de dados biológicos.
	
	Produzir um embrião com ausência desse gene, e acompanhar o desenvolvimento desse indivíduo geneticamente modificado ao longo da vida.
	
	Silenciar esse gene no genoma de células em laboratório, e após isso observar as consequências.
	
	Não é possível determinar a função de um gene usando apenas métodos de bioinformática.
	Respondido em 14/04/2020 04:37:33
	
Explicação:
A alternativa descreve a etapa da anotação funcional, que pertence a anotação gênica.
	
	
	 
	
	 3a Questão
	
	
	
	
	A identificação de regiões funcionais ou de relevância biológica no DNA é conhecida como:
		
	
	banco de dados.
	
	montagem do genoma.
	 
	anotação do genoma.
	
	amplificação do genoma.
	
	sequenciamento do genoma.
	Respondido em 14/04/2020 04:37:25
	
Explicação:
Sequenciamento genômico é a definição da ordem exata dos pares de bases (A, T, G e C) em um segmento de DNA.
Amplificação do DNA é geração de milhares de cópias de um segmento de DNA a partir de uma ou poucas cópias desse segmento.
Montagem de genomas é ordenação de fragmentos de DNA afim de criar uma sequência única.
Banco de dados é o armazenamento das informações biológicas de maneira organização, facilitando a recuperação posterior
	
	
	 
	
	 4a Questão
	
	
	
	
	A sequência de Shine-Delgarno e as sequências das "pontas" dos íntrons são exemplos de sinais. Esses sinais são sequências características conservadas, que marcam as regiões necessárias para que a transcrição e tradução ocorram. Qual processo de bioinformática inclui a identificação desses sinais?
		
	
	Montagem do genoma.
	
	Construção de árvore filogenética.
	 
	Predição gênica.
	
	Extração do DNA.
	
	Sequenciamento do genoma.
	Respondido em 14/04/2020 04:37:45
	
Explicação:
Esses sinais ajudam a identificar quais regiões do genoma serão transcritas e traduzidas.
	
	
	 
	
	 5a Questão
	
	
	
	
	"Um programa usado para anotação gênica de procariotos normalmente pode ser utilizado para anotação gênica de eucariotos". Julgue a afirmativa anterior.
		
	
	Falsa, porque existem poucas espécies de bactérias e milhares de espécies de organismos eucariotos.
	
	Verdadeira, devido a característica universal do código genético.
	
	Verdadeira, pois os dois grupos de organismos possuem DNA como material genético.
	 
	Falsa, devido à complexidade da estrutura gênica em eucariotos, que possuem íntrons interrompendo as regiões codificantes, por exemplo.
	
	Falsa, devido à ausência de membrana nuclear nos procariotos e a dispersão do DNA pela célula.
	Respondido em 14/04/2020 04:37:53
	
Explicação:
Predição gênica é a mesmacoisa que encontrar um gene em meio a uma sequencia de DNA. A organização do genoma de procariotos é mais simples quando comparada aos eucariotos. 
	
	
	 
	
	 6a Questão
	
	
	
	
	Escolha a sequência correta de etapas envolvidas no processo de interpretação do genoma de um organismo:
		
	
	extração do DNA -> predição gênica -> sequenciamento -> anotação funcional.
	
	sequenciamento -> predição gênica -> anotação funcional -> extração do DNA.
	
	predição gênica -> extração do DNA -> anotação funcional -> sequenciamento.
	 
	extração do DNA -> sequenciamento -> predição gênica -> anotação funcional.
	
	extração do DNA -> sequenciamento -> anotação funcional -> predição gênica.
	Respondido em 14/04/2020 04:38:00
	
Explicação:
Primeiro é necessário obter o material biológico (DNA), determinar sua sequência de bases nitrogenadas, encontrar os genes e por fim determinar a função dessses genes.
	
	
		 
	BIOINFORMÁTICA
10a aula
		
	 
	Lupa
	 
	 
	
	
PPT
	
MP3
	 
		Exercício: SDE4449_EX_A10_201912014467_V1 
	14/04/2020
	Aluno(a): MARCOS ANTONIO MEDEIROS DA SILVA
	2020.1 - F
	Disciplina: SDE4449 - BIOINFORMÁTICA 
	201912014467
	
	 
	
	 1a Questão
	
	
	
	
	Qual das alternativas abaixo NÃO é um banco de dados biológico?
		
	
	SWISS-Prot.
	
	GenBank.
	 
	BLAST.
	
	PDB.
	
	KEGG.
	Respondido em 14/04/2020 04:38:24
	
Explicação:
BLAST é um algoritmo de alinhamento local.
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	"O ____________ busca usar um número limitado de palavras para descrever três conjuntos de informações sobre uma proteína. O conjunto "biological process" (processo biológico) representa objetivos específicos que o organismo é geneticamente programado para atingir, como por exemplo o processo biológico da divisão celular resulta na criação de duas células filhas a partir de uma única célula-mãe. Qual opção completa corretamente a lacuna?
		
	
	KEGG.
	
	CARD.
	 
	Gene Ontology (GO).
	
	GenBank.
	
	PDB.
	Respondido em 14/04/2020 04:38:33
	
Explicação:
A descrição corresponde ao banco Gene Ontology.
	
	
	 
	
	 3a Questão
	
	
	
	
	Qual dos bancos de dados biológicos abaixo é o principal reservatório de informações sobre sequências de proteínas, cujo os dados são validados por especialistas (curado)?
		
	
	KEGG.
	
	PDB.
	
	Gene Ontology (GO).
	 
	SWISS-Prot.
	
	GenBank.
	Respondido em 14/04/2020 04:38:29
	
Explicação:
O SWISS-Prot possui registros com informações extraídas da literatura e análise computacional avaliada pelo curador.
	
	
	 
	
	 4a Questão
	
	
	
	
	O aluno Rafael está começando agora uma nova iniciação científica. Sua orientadora lhe disse que ele irá trabalhar com a proteína OprD, mas ele ainda não compreende a importância do seu projeto. Ele precisa acessar um banco de dados biológico que reúna uma grande variedade de informações sobre essa proteína, como vias metabólicas e variações dessa proteína entre diferentes organismos. Qual banco de dados você recomendaria a ele?
		
	
	PDB.
	
	GenBank.
	 
	KEGG.
	
	Gene Ontology (GO).
	
	SWISS-Prot.
	Respondido em 14/04/2020 04:38:48
	
Explicação:
KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes.
	
	
	 
	
	 5a Questão
	
	
	
	
	O repositório mundial de estruturas 3D de grandes moléculas biológicas, incluindo proteínas e ácidos nucleicos é o:
		
	
	SWISS-Prot.
	 
	PDB.
	
	KEGG.
	
	Gene Ontology (GO).
	
	GenBank.
	Respondido em 14/04/2020 04:38:57
	
Explicação:
PDB: Protein Data Banking
	
	
	 
	
	 6a Questão
	
	
	
	
	Julgue as afirmativas abaixo usando seus conhecimentos sobre bancos de dados biológicos utilizados para anotação gênica.
I- Diversos bancos de dados podem ser utilizados para anotação de um gene, cada um deles focando em um conjunto de informações, como sequência, estrutura e vias metabólicas.
II- Os bancos de dados biológicos usados para anotação gênica só podem ser acessados mediante o pagamento de uma mensalidade pelo usuário.
		
	
	As afirmativas I e II são proposições verdadeiras.
	
	As afirmativas I e II são proposições falsas.
	
	Nenhuma das afirmativas anteriores.
	 
	A afirmativa I é uma proposição verdadeira, e a II é uma proposição falsa.
	
	A afirmativa I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
	Respondido em 14/04/2020 04:38:54
	
Explicação:
Todos os bancos de dados citados nas apostilas são de livre acesso para toda comunidade.