Bioinformática: Conceitos e Potencialidades

Prévia do material em texto

Um profissional em bioinformática precisa ter conhecimento em qual das seguintes áreas abaixo?
		
	
	Biologia molecular.
	
	Matemática.
	 
	Todas as alternativas anteriores.
	
	Estatística.
	
	Computação.
	Respondido em 18/04/2020 12:56:03
	
Explicação:
A bioinformática é uma área interdisciplinar.
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	Qual dos cientistas a seguir teve grande contribuição para o avanço da bioinformática como área da ciência?
		
	
	Charles Darwin, com a publicação do livro ¿A origem das espécies¿.
	
	Marie Curie, pela sua pesquisa sobre dois novos elementos químicos: o rádio e polônio.
	
	Alexander Fleming, com a descoberta da penicilina.
	
	Werner Karl Heisenberg, pela criação da mecânica quântica.
	 
	Magaret Dayhoff, que usou computadores para o estudo de proteínas, criando o primeiro ¿Atlas de Proteínas¿.
	Respondido em 18/04/2020 12:56:31
	
Explicação:
A brilhante Magaret Dayhoff  desvendou a ordem dos aminoácidos que formavam algumas proteínas e a forma que essas proteínas tinham, criando o primeiro ¿Atlas de Proteínas¿. Este é considerado um dos primeiros experimentos em bioinformática, que foi publicado em 1965.
	
	
	 
	
	 3a Questão
	
	
	
	
	Sobre a bioinformática, qual das afirmativas abaixo está incorreta?
		
	
	A bioinformática usa ferramentas computacionais para estudar informações biológicas.
	
	O desenvolvimento de tecnologias para sequenciar o DNA foi um dos principais pilares para o surgimento da bioinformática.
	 
	Um bioinformata não é capaz de desenvolver ferramentas computacionais que ajudam na interpretação de dados obtidos de experimentos na bancada, ele só utiliza essas ferramentas.
	
	Um bioinformata atua interpretando dados biológicos e desenvolvendo/aprimorando algoritmos computacionais.
	
	A bioinformática é considerada uma área interdisciplinar, que envolve profissionais de diferentes graduações.
	Respondido em 23/04/2020 18:58:22
	
Explicação:
O bioinformata pode sim desenvolver ferramentas computacionais.
	
	
	 
	
	 4a Questão
	
	
	
	
	Por que o "Projeto Genoma Humano" tem uma grande relação com a história da bioinformática?
		
	
	Foi durante esse projeto que se descobriu do que é feita e como se organiza a molécula de DNA.
	
	Porque foi a primeira vez que uma ferramenta computacional foi aplicada para analisar dados biológicos.
	 
	Pois muitas ferramentas computacionais precisaram ser desenvolvidas e aprimoradas para determinar todo o genoma humano e interpretar essas informações.
	
	Durante o período de execução desse projeto, a bioinformática ficou estagnada, e poucos avanços ocorram nessa área.
	
	Pois ficou provado que as ferramentas computacionais não eram essenciais para determinar e interpretar o genoma humano.
	Respondido em 23/04/2020 18:58:34
	
Explicação:
Esse projeto gerou muitos dados computacionais, que impulsionaram o avança da bioinformática.
	
	
	 
	
	 5a Questão
	
	
	
	
	 A seguir temos três afirmativas sobre as potencialidades da bioinformática. Julgue-as como verdadeiras ou falsas.
I) A análise de sequências possibilita comparar várias sequências de genes e determinar a relação evolutiva entra elas.
II) A análise de sequências permite encontrar genes em meio a longas sequências de DNA.
III) Com apenas a sequência do gene não é possível determinar sua através de métodos de bioinformática.
		
	 
	As afirmativas I e II estão corretas.
	
	Apenas a afirmativa I está correta.
	
	Todas as afirmativas estão corretas.
	
	Apenas a afirmativa III está correta.
	
	Apenas a afirmativa II está correta.
	Respondido em 23/04/2020 18:59:08
	
Explicação:
Pode ser realizado um alinhamento usando a sequência do gene contra sequências presentes em um banco de dados para determinar sua função, por exemplo.
	
	
	A respeito dos computadores, marque a(S) alternativa(S) INCORRETA(S).
		
	 
	Todo computador é divido em dois sistemas eletrônicos: software e hardware
	
	O software dos computadores nada é do que o sistema e o programa que executam os comandos do usuário.
	
	Os computadores podem ser classificados quanto a sua utilização em: pessoais, científico e comercias.
	
	Os supercomputadores são aqueles que apresentam uma velocidade maior no processamento de dados, sendo ideal para serem utilizados em estudos de bioinformática.
	
	Software é composto por programas como o Windows, pelo HD e memória enquanto o hardware é composto por placa mãe e memória secundária
	Respondido em 18/04/2020 22:34:47
	
Explicação:
Todo computador necessita de um sofware e um hardware para funcionar.
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	Quais são os principais eventos genéticos responsáveis pela variação gênica dos organismos ?
 
		
	
	Inserção e translocação genica
 
	
	Translocação cromossômica e mutação
	 
	Mutação e duplicação gênica
	
	Mutação e duplicação cromossômica
 
	
	Inversão e duplicação gênica
 
	Respondido em 18/04/2020 22:00:49
	
Explicação:
Letra C
	
	
	 
	
	 3a Questão
	
	
	
	
	Sobre os processos evolutivos de analogia e homologia, marque a opção correta.
		
	
	 
Tanto a homologia quanto a analogia relaciona, ancestralidade comum e as divergências funcionais
 
	 
	A analogia é um processo evolutivo que associa indivíduos não relacionados à semelhanças anatômicas e funcional.
 
	
	Tanto a homologia quanto a analogia relacionam ancestralidade comum, semelhança anatômicas e divergência funcional.
	
	 A homologia é um processo evolutivo que relaciona semelhança anatômica e semelhança funcional.
	
	A analogia é um processo evolutivo que associa indivíduos relacionados à semelhanças anatômicas e funcional.
	Respondido em 18/04/2020 22:24:44
	
Explicação:
Letra D. A analogia é um processo evolutivo relacionado a convergência evolutiva
	
	
	 
	
	 4a Questão
	
	
	
	
	 A evolução por homologia associa a similaridade morfológica de algumas estruturas corporais com a presença de um ancestral comum entre as espécies. As evidências evolutivas de que as espécies evoluíram por homologia é a presença de genes homólogos, ou seja, genes que apresentem com sequências nucleotídicas iguais ou altamente semelhantes que podem codificar para estruturas com a mesma função ou não. A respeito dos genes homólogos marque a alternativa correta.
		
	 
	 Os genes ortólogos são genes homólogos que divergiram após o processo de especiação, onde cada espécie descendente apresenta uma cópia do genee.
 
	
	 Os genes parálogos são aqueles que divergiram após o processo de inversão dentro do genoma de uma mesma espécie.
 
	
	 
 Os genes ortólogos são provenientes dum ancestral comum e apresentam funções muito diferentes.
 
	
	Os genes homólogos encontrado no indivíduo são herdados apenas da mãe ou do pai.
 
	
	 
Os genes paralogos são genes ortólogos  que divergiram após o processo de duplicação dentro do genoma de uma mesma espécie.
 
	O que o dogma central da Biologia Molecular descreve?
		
	
	Os processos envolvidos na diferenciação celular.
	 
	O fluxo de informações do código genético.
	
	A sequência completa de DNA de um organismo.
	
	O mecanismo de processamento do RNA, a partir do DNA.
	
	O processo de controle da expressão gênica.
	Respondido em 23/04/2020 19:21:57
	
Explicação:
Letra C. O dogma central descreve como ocorre o fluxo de informações do código genético. Segundo esse dogma, o fluxo da informação genética segue o seguinte sentido: DNA → RNA → PROTEÍNAS. Observa-se, portanto, que esse dogma demonstra todos os processos pelos quais os ácidos nucleicos podem passar. Dessa forma, temos o DNA, onde está contida a informação genética, que pode ser transcrito em moléculas de RNA. É nessa molécula de RNA que é encontrado o código usado para organizar a sequência de aminoácidos e formar as proteínas no processo de tradução, o qual consiste na união de aminoácidos, obedecendo à ordem de códons presentes em uma molécula de RNA mensageiro.
	
	
	A coleta e o armazenamentode amostras destinadas as técnicas de biologia molecular devem ser realizadas com muito cuidado devido ao alto risco de degradação das moléculas de ácidos nucleicos. A respeito destes processos marque a alternativa CORRETA.  
		
	
	Não há necessidade de transportar as amostras coletadas em caixas isotérmicas com gelo seco.
	
	As amostras de tecido destinadas a extração do DNA devem obrigatoriamente ser armazenadas em nitrogênio líquido.
	
	Independente do tipo de amostra, a coleta de espécimes clínicos destinados a extração de DNA e RNA devem ser realizadas com estabilizadores
	
	A coleta de tecido proveniente de biópsia pode ser armazenado e transporta resfriado a temperatura de 2º a 8ºC
	 
	Para amostras de sangue e de medula as amostras destinadas a extração do RNA devem ser armazenadas em freezer -70ºC
	Respondido em 23/04/2020 19:25:44
	
Explicação:
Neste tipo de amostras o RNA só se mantem instavel por algum tempo se armazenado em temperaturas superiores a -70ºC
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	Sobre o desenho experimental, ma rque a alternativa correta.
		
	
	A pesquisa científica experimental não busca ajudar um pesquisador a determinar o efeito causal entre dois fatores.
	
	Grupos controle, variáveis dependentes e independentes não são fatores importantes para pesquisa cientifica experimental, apenas para pesquisa científica não experimental.
	
	Uma pesquisa científica pode ser desenvolvida sem o estabelecimento de uma hipótese.
	 
	A pesquisa experimental tem como finalidade testar hipóteses que dizem respeito à convicção do pesquisador, envolvendo grupos de controle, seleção aleatória e manipulação de variáveis.
	
	A hipótese nula de uma pesquisa confirma a relação de causa-efeito.
	Respondido em 23/04/2020 19:36:17
	
Explicação:
Resposta  correta letra D.
	
	
	 
	
	 3a Questão
	
	
	
	
	Sobre as etapas da extração do DNA marque a alternativa correta.
		
	
	A primeira etapa da extração tem por objetivo inativar nucleases e retirar outras proteínas contaminantes.
	
	A primeira etapa da extração tem por objetivo fazer a lise das membranas celulares utilizando fenol-cloroformio.
	
	A segunda etapa é a precipitação do DNA após lavagens sequenciais com soluções alcoólicas e centrifugação
	
	A segunda etapa do processo é a lise das membranas lipídicas.
	 
	A terceira etapa consiste na remoção do RNA
	Respondido em 23/04/2020 19:36:24
	
Explicação:
Resposta letra C
	
	
	 
	
	 4a Questão
	
	
	
	
	Gabriela irá realizar a técnica de eletroforese para avaliar qualitativamente e quantitativa o RNA extraído de células bucais que será utilizado no seu projeto de mestrado. Porém, Gabriela tem duvidas quanto ao príncipio e aplicação da técnicas. Marque a alternativa  da melhor explicação que você daria a Gabriela.
		
	
	 
A eletroforese é uma técnica que utiliza corantes fluorescente como iodina  para detectar e quantificar substâncias.
 
	
	 A eletroforese é uma técnica ótica que associa a quantidade de luz transmitida com a quantidade da substância na amostra.
 
	
	A eletroforese é técnica que utiliza campo elétrico para separar moléculas de acordo com o peso molecular e afinidade.
 
 
	
	A eletroforese é uma técnica ótica que associa a quantidade de luz absorvida com a quantidade da substância na amostra.
 
	 
	 A eletroforese é técnica que utiliza campo elétrico para separar moléculas de acordo com carga e peso molecular
 
	Respondido em 23/04/2020 19:47:04
	Em relação às macromoléculas que constituem a maioria dos seres vivos, é correto afirmar que
		
	 
	 os ácidos nucleicos, DNA e RNA, são formados por várias unidades chamadas de nucleotídeos.
	
	os lipídeos e os peptideoglicanos compõem a membrana plasmática de todos os eucariotos.
	
	os triglicerídeos e polissacarídeos são carboidratos
	
	as enzimas e os esteroides são proteínas.
	
	o glicogênio e o amido são polissacarídeos produzidos pelas células vegetais
	Respondido em 01/05/2020 15:59:12
	
Explicação:
Os ácidos nucleicos, DNA e RNA, são polímeros de monômeros denominados nucleotídeos.
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	Uma fita de DNA apresenta a seguinte sequência:
TCAAGT
Marque a alternativa que indica corretamente a sequência encontrada na fita complementar:
		
	 
	AGTTCA
	
	UCTTGU
	
	AGUUGA
	
	AGUUCA
	
	ATAAUA
	Respondido em 01/05/2020 15:23:27
	
Explicação:
 É importante perceber que o DNA é composto por duas fitas e que uma complementa a outra. Sabemos que na molécula de DNA a adenina sempre se une à timina e que a citosina sempre se liga à guanina. Sendo assim, uma sequência TCAAGT liga-se a uma sequência AGTTCA.
	
	
	 
	
	 3a Questão
	
	
	
	
	(PUC-SP) [¿] De outro lado, o galardão de química ficou com os inventores de ferramentas para estudar proteínas, os verdadeiros atores do drama molecular da vida.
É verdade que a Fundação Nobel ainda fala no DNA como o diretor da cena a comandar a ação das proteínas, mas talvez não seja pretensioso supor que foi um lapso, e que o sinal emitido por essas premiações aponta o verdadeiro futuro das pesquisas biológicas e médicas muito além do genoma e de seu sequenciamento (uma simples soletração). (¿)
* LEITE, Marcelo. De volta ao sequenciamento. Folha de S. Paulo- 20 out. 2002.
O autor refere-se às proteínas como ¿atores do drama molecular¿ e ao DNA como ¿diretor de cena¿. Essa referência deve-se ao fato de:
		
	
	as proteínas não terem controle sobre o metabolismo celular.
	 
	o DNA controlar a produção de proteínas e estas controlarem a atividade celular.
	
	o material genético ser constituído por proteínas.
	
	o DNA controlar a produção de proteínas e também atuar como catalisador de reações químicas celulares.
	
	não ocorrer uma correlação funcional entre DNA e proteínas no meio celular.
	Respondido em 01/05/2020 15:51:55
	
Explicação:
O DNA possui sequências de nucleotídeos que serão usadas para a síntese de proteínas, que atuam em todas as atividades do nosso organismo.
	As alternativas a seguir estão relacionadas à transcriptômica, exceto:
		
	
	Determina os perfis da expressão de todos os genes presentes em um genoma.
	
	A abundância do mRNA nem sempre é bem correlacionada com a abundância da proteína.
	
	A atividade das proteínas codificadas pelos mRNAs é regulada em vários níveis após a sua expressão
	
	Várias técnicas podem ser aplicadas para o estudo, dentre elas, a técnica de microarranjos de DNA (DNA microarray).
	 
	É usada para quantificar a abundância, modificação e interação de peptídeos.
	Respondido em 01/05/2020 15:59:53
	
Explicação:
A proteômica, por sua vez, faz parte das ômicas e é usada para quantificar a abundância, modificação e interação de peptídeos, além de determinar sua localização sub-celular.
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	São aspectos relacionados à transcriptômica, exceto:
		
	 
	Tem sido utilizada para o estudo das respostas metabólicas de organismos a fatores bióticos e abióticos.
	
	Uma de suas limitações está relacionada ao fato de que a abundância do mRNA nem sempre é bem correlacionada com a abundância da proteína.
	
	Sua análise é característica de cada tipo de célula, e pode diferir em função de diferentes situações fisiológicas ou patológicas.
	
	Várias técnicas podem ser aplicadas para seu estudo, a exemplo dos microarranjos de DNA.
	
	Tem como objetivo determinar os perfis da expressão de todos os genes presentes em um genoma.
	Respondido em 01/05/2020 16:01:32
	
Explicação:
A metabolômica estuda as mudanças na expressão de pequenas moléculas orgânicas, conhecidas como metabólitos.
	
	
	 
	
	 3a Questão
	
	
	
	
	Com relação aos bancos de dados e uma melhor cobertura das análises metabolômicas, podemos afirmar que: 
		
	
	A normalização dos dados é desnecessária em quaisquer análises metabolômicas.
	
	Os dados gerados por microarranjos de DNA são suficientes para gerar bancos de dados completos. 
	
	As ferramentas usadas para as análisesde transcriptômica e proteômica são totalmente apropriadas para as análises metabolômicas. 
	
	Atualmente, os bancos de dados são atualizados o suficiente para garantir uma ampla cobertura sem entradas replicadas. 
	 
	Para garantir maior confiabilidade, as análises não devem se restringir ao uso de uma única base de dados . 
	Respondido em 01/05/2020 16:00:31
	
Explicação:
A única alternativa correta é a letra "a".
	
	
	 
	
	 4a Questão
	
	
	
	
	Em relação às ômicas e sua importância para as pesquisas científicas, qual das alternativas a seguir está incorreta:
		
	
	A metabolômica pode auxiliar na demonstração de como os genótipos estão associados aos fenótipos, além de permitir simulações de mecanismos celulares em larga escala.
	
	A genômica pode ser estrutural ou funcional; a primeira objetiva a caracterização da natureza física dos genomas completos e a segunda busca caracterizar a função biológica dos genes.
	 
	Um projeto de pesquisa só pode ser iniciado a partir de sequências genômicas conhecidas, não havendo possibilidade de efetuar estudos com sequências desconhecidas.
	
	A tecnologia de microarranjos de DNA possibilita a avaliação simultânea da expressão de milhares de genes em diferentes tecidos de um determinado organismo, e em diferentes estágios de desenvolvimento ou condições ambientais.
	
	Entre os grandes dificultadores nos estudos de biologia molecular estão a necessidade de acesso a várias fontes de dados para responder uma questão simples e a utilização de ferramentas de análise sofisticadas.
	Respondido em 01/05/2020 16:01:10
	
Explicação:
Um projeto de pesquisa pode iniciar com uma série de sequências genômicas, conhecidas ou não. As sequências desconhecidas podem ser submetidas a uma busca em bancos de dados por sequências similares, como será visto na próxima aula, ou podem ter suas identidades e funções preditas por meio do uso de algoritmos computacionai
	O BLAST e o CLUSTALW são ferramentas comuns utilizadas nos estudos de bioinformática, mas essas ferramentas são constituídas de algoritmos distintos que vão buscar parâmetros diferentes. A respeito desta afirmativa assinale a questão incorreta sobre essas ferramentas.
		
	
	O BLAST é um algoritmo de alinhamento local que busca de forma rápida pequenas regiões de similaridades
	
	 O BLAST efetua um alinhamentos mais simples que comparam apenas regiões de alta similaridade entre apenas duas sequências.
	
	De maneira geral, a opção pelo uso do Blast ou do ClustalW vai depender do objetivo da pesquisa. 
	 
	 O Clustal é um algoritmo de alinhamento múltiplo local que se baseia na distância evolutiva.
 
	
	ClustalW efetua um alinhamento mais complexo que estabelece a relação evolutiva entre todas as sequências utilizadas.
	Respondido em 01/05/2020 16:03:44
	
Explicação:
	Em relação ao alinhamento de sequência, ela pode ocorrer sendo alinhamento global ou local. Em relação ao alinhamento global, é correto, afirmar que:
		
	
	Ocorre pelo programa clustal W
	
	identificam regiões de similaridade dentro de sequencias longas que são geralmente bastante divergentes em um todo.
	
	Localiza similaridades apenas de um ponto específico da sequência.
	 
	é uma forma de otimização global que "força" o alinhamento a cobrir todo o comprimento de todas as sequencias interrogadas (query).
	
	É realizado através do desenho primer
	Respondido em 01/05/2020 16:04:46
	
Explicação:
É um tipo de alinhamento, aonde ocorre a leitura de toda a sequência para que posteriormente, possam ser analisados os pontos de similaridade.
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	Em relação ao desenho de primers, é incorreto, afirmar que:
		
	
	O número máximo de repetições aceitável é de 4 dinucleotdeos
	 
	Repetições não aumenta o potencial de anelamento incorreto/inespecífco
	
	Primers de tamanho muito curto leva a  baixa especifcidade, resultando em amplifcação não específca
	
	Incompatibilidade signifcativa do par de primers pode levar à má amplifcação
	
	O tamanho dos primers determina especificidade e afeta seu anelamento com o DNA molde
	Respondido em 01/05/2020 16:05:00
	
	"Um programa usado para anotação gênica de procariotos normalmente pode ser utilizado para anotação gênica de eucariotos". Julgue a afirmativa anterior.
		
	
	Falsa, devido à ausência de membrana nuclear nos procariotos e a dispersão do DNA pela célula.
	
	Verdadeira, devido a característica universal do código genético.
	
	Verdadeira, pois os dois grupos de organismos possuem DNA como material genético.
	
	Falsa, porque existem poucas espécies de bactérias e milhares de espécies de organismos eucariotos.
	 
	Falsa, devido à complexidade da estrutura gênica em eucariotos, que possuem íntrons interrompendo as regiões codificantes, por exemplo.
	Respondido em 01/05/2020 16:05:22
	
Explicação:
Predição gênica é a mesma coisa que encontrar um gene em meio a uma sequencia de DNA. A organização do genoma de procariotos é mais simples quando comparada aos eucariotos. 
	O repositório mundial de estruturas 3D de grandes moléculas biológicas, incluindo proteínas e ácidos nucleicos é o:
		
	
	Gene Ontology (GO).
	
	SWISS-Prot.
	 
	PDB.
	
	GenBank.
	
	KEGG.
	Respondido em 01/05/2020 16:07:23
	
Explicação:
PDB: Protein Data Banking
	
	
	 
	
	 2a Questão
	
	
	
	
	Julgue as afirmativas abaixo usando seus conhecimentos sobre bancos de dados biológicos utilizados para anotação gênica.
I- Diversos bancos de dados podem ser utilizados para anotação de um gene, cada um deles focando em um conjunto de informações, como sequência, estrutura e vias metabólicas.
II- Os bancos de dados biológicos usados para anotação gênica só podem ser acessados mediante o pagamento de uma mensalidade pelo usuário.
		
	
	As afirmativas I e II são proposições falsas.
	 
	A afirmativa I é uma proposição verdadeira, e a II é uma proposição falsa.
	
	A afirmativa I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
	
	Nenhuma das afirmativas anteriores.
	
	As afirmativas I e II são proposições verdadeiras.