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Prática como Componente Curricular Biologia Molecular Enzimas de restrição As enzimas de restrição são endonucleases que clivam em sequências específicas do DNA. Quase todas as enzimas de restrição reconhecem sequência palíndrômicas, isto é, quando uma das fitas for lida de 5’ 3’ e a outra no mesmo sentido, elas serão as mesmas. Exemplos: 1) A enzima EcoRV reconhece a seguinte sequência: 5’ GATATC 3’ 3’ CTATAG 5’ 2) A enzima TaqI reconhece a seguinte sequência : 5’ TCGA 3’ 3’ AGCT 5’ A enzima 1 foi isolada da Escherichia coli (Eco) e a enzima 2 foi isolada de Thermus aquaticus (Taq). A sequência reconhecida pela enzima de restrição é chamada de sítio de restrição. As enzimas de restrição são muito utilizadas em laboratórios de Biologia Molecular. Atividade A sequência abaixo foi obtida de um banco de dados que armazena sequências. Essa sequência é fita simples e está representada seguindo a convenção, ou seja, de 5’ 3’. GCCTTCAATGGCAAGCGGTCTGGAATCCTACTTCTTGAATCGGCACGGTGTCATTACGGGCGGGGGCC AGAACAACGTCCCTGGACATCACACCTAGCCCGTGCGACGGCGGAAACCTTCGCCGGCGCAGGCTTCG ACGTGACCCTCATCGCGGAACCCTCCCCCACCCCAGTGTTGGCGTGGCTGGTGCGCTCACGGCGAATG GACGTGGGCGTGCAGATCACCGCCTCGCACAATCGAATTCAGGACAACGGCTACAAGCTGTACCTGGAC GGCGGCTCTCAGCTGGTCTCCCCCGCCGACCGGCAGATCGAGGAGCACATTGCCGCCCAGCCAACTGA CGCGGCGAAGATCCCCCGCTCCGAGGCGAAGTCTGTAGACCTGTCCGTAGTCTCCGGCTATGTCACCG AGCTAAGTACCCTGGTGGCCACCGGCCGCCAATCCGAGCTGGCGCCGCGGCGGAAGCTGAAGATCCTC TACACCCCCATGCACGGCGTGGGCGGCAATGCCCTGGAGTGGGCCTTACGTGAATTCGGCTTCGGCAA CGTGCACGCGGTGGCCTCGCAGCGCTGGCCGGACCCGACCTTCCCGACTGTGGACTTCCCCAACCCTG AGGAGCCGGGTGCCACCGACGCGCTGCTGGAAGAAGCCCGCGCCATCGATGCGGACCTGCTGATCGCC CTGGATCCGGATGCGGACC Sabe-se que a enzima de restrição BamHI corta um DNA fita dupla do seguinte modo e no seguinte sítio (veja figura). a) Quantos sítios de restrição existem nessa sequência? _____________________________________________________________________________ b) Faça uma pesquisa sobre os tipos de cortes das enzimas de restrição. Descreva-os e classifique o corte da enzima BamHI. _____________________________________________________________________________ _____________________________________________________________________________ _____________________________________________________________________________ _____________________________________________________________________________ _____________________________________________________________________________ _____________________________________________________________________________ _____________________________________________________________________________ _____________________________________________________________________________ c) O gel abaixo apresenta, na canaleta 1, um padrão de peso molecular onde as bandas representam sequências com 50bp, 80bp, 200bp e 1000pb. Suponha que o DNA acima tenha sido clivado pela enzima PvuII e represente, na canaleta 2, os fragmentos resultantes do corte. 1 2 Sugestões: - O Word possui ferramentas para buscar e contar palavras. - Pesquise qual o sítio de restrição da enzima PvuII, encontre essa sequência no DNA representado acima e calcule o tamanho dos fragmentos. - O padrão de peso molecular é composto por fragmentos de tamanhos conhecidos que são utilizados para descobrir o tamanho de fragmentos desconhecidos. - Na eletroforese em gel de agarose, os fragmentos menores migram mais rapidamente e os maiores, mais lentamente.
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