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PCC BIOLOGIA MOLECULAR Aluna: Paula Freagapani Agner RA 1623759 Atividade A sequência abaixo foi obtida de um banco de dados que armazena sequências. Essa sequência é fita simples e está representada seguindo a convenção, ou seja, de 5’ → 3’. GCCTTCAATGGCAAGCGGTCTGGAATCCTACTTCTTGAATCGGCACGGTG TCATT ACGGGCGGGGGCCAGAACAACGTCCCTGGACATCACACCTAGCCCGTGC GACGG CGGAAACCTTCGCCGGCGCAGGCTTCGACGTGACCCTCATCGCGGAACC CTCCCC CACCCCAGTGTTGGCGTGGCTGGTGCGCTCACGGCGAATGGACGTGGGC GTGCAG ATCACCGCCTCGCACAATCGAATTCAGGACAACGGCTACAAGCTGTACCT GGACG GCGGCTCTCAGCTGGTCTCCCCCGCCGACCGGCAGATCGAGGAGCACAT TGCCGC CCAGCCAACTGACGCGGCGAAGATCCCCCGCTCCGAGGCGAAGTCTGTA GACCT GTCCGTAGTCTCCGGCTATGTCACCGAGCTAAGTACCCTGGTGGCCACCG GCCGC CAATCCGAGCTGGCGCCGCGGCGGAAGCTGAAGATCCTCTACACCCCC ATGCACG GCGTGGGCGGCAATGCCCTGGAGTGGGCCTTACGTGAATTCGGCTTCGG CAACGT GCACGCGGTGGCCTCGCAGCGCTGGCCGGACCCGACCTTCCCGACTGTG GACTTC CCCAACCCTGAGGAGCCGGGTGCCACCGACGCGCTGCTGGAAGAAGCCC GCGCC ATCGATGCGGACCTGCTGATCGCC CTGGATCCGGATGCGGACC Sabe-se que a enzima de restrição BamHI corta um DNA fita dupla do seguinte modo e no seguinte sítio . a) Quantos sítios de restrição existem nessa sequência? Cinco sítios de restrição b) Faça uma pesquisa sobre os tipos de cortes das enzimas de restrição. Descreva-os e classifique o corte da enzima BamHI. As enzimas de restrição são endonucleases que podem ser purificadas a partir de bactérias e que reconhecem sequências específicas, com 4 a 8pb, clivando em seguida as duas cadeias de DNA nesse mesmo sítio; essas sequências designam-se por sítio de restrição e são normalmente curtas sequências, isto é, a sequência do sítio de restrição é a mesma em ambas as cadeias quando estas são lidas no sentido 5→ 3. Os sítios de clivagem são, portanto, definidos pela sequência de nucleotídeos, e é portanto esta que define o tamanho dos fragmentos obtidos. As diferentes enzimas de restrição apresentam especificidade para diferentes sequências o que permite escolher a(s) enzima(s) de restrição necessárias para clivar um fragmento de DNA com um determinado gene. As enzimas de restrição são produzidas através das bactérias, como mecanismo de defesa, contra infecção por fagos, as endonucleases tipo II são enzimas de restrição pode gerar dois tipos diferentes de cortes, dependendo se eles cortam ambas as cadeias no centro da sequência de reconhecimento, ou cada fio mais perto de uma das extremidades da sequência de reconhecimento. O primeiro corte vai gerar “termina sem corte” sem saliências nucleotídeos. Este último, gera “pegajoso” ou “coesa” termina, porque cada fragmento resultante de DNA tem uma saliência que complementa os outros fragmentos. Ambos são úteis em genética molecular para a tomada de ADN recombinante e proteínas. c) O gel abaixo apresenta, na canaleta 1, um padrão de peso molecular onde as bandas representam sequências com 50bp, 80bp, 200bp e 1000pb. Suponha que o DNA acima tenha sido clivado pela enzima PvuII e represente, na canaleta 2, os fragmentos resultantes do corte. 1 2
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