Marcadores moleculares utilizados em programas de melhoramento genético nos últimos 5 anos e sua importância para o avanço genético brasileiro PDF

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Marcadores moleculares utilizados em programas de melhoramento 
genético nos últimos 5 anos e sua importância para o avanço genético 
brasileiro 
Os marcadores moleculares são uma importante ferramenta para identificar 
e acessar a variação genética entre os indivíduos, além de associa-la a uma 
característica de interesse. Seu uso permite identificar o potencial genético de 
um animal antes da expressão do seu fenótipo. A maioria das características de 
interesse econômico apresenta o padrão de herança poligênica, sendo 
determinadas por inúmeros genes de grande e/ou de pequeno efeito individuais 
e sob forte influência de fatores ambientais. De forma geral, os marcadores 
moleculares podem ser classificados em duas categorias: (1) marcadores 
baseados em técnicas de hibridização (RFLP), (2) marcadores baseados em 
técnicas de PCR (RAPD, VNTR, SSR, AFLP, SNPs). 
RFLP - Restriction Fragment Length Polymorphism: examina diferença em 
tamanho de fragmentos de restrição de DNA específicos. O polimorfismo deriva 
de mutação pontual, inserção, deleção. Utiliza-se o DNA celular total e requer 
DNA puro de alto peso molecular. Polimorfismo evidenciado pela fragmentação 
do DNA com enzimas de restrição e observado pela hibridização de sondas 
marcadas de DNA, com radioatividade ou compostos que desencadeiam uma 
reação luminescência. 
RAPD - Random Polymorphic: Utiliza um único primer que tem sequência 
arbitrária desconhecida. Embora a maioria dos marcadores RAPD possuam 
comportamento "dominante", existe a possibilidade de se amplificar marcadores 
co-dominantes e amplificar ambos os alelos de um loco. Obtenção de 
“fingerprinters” genômicos de indivíduos, variedades e populações. 
VNTR - Variable Number of Tandem Repeats: Sequências repetitivas 
agrupadas ou espalhadas ao longo do genoma. São constituídas por blocos cujo 
número de unidades repetitivas é variável, gerando polimorfismos. Blocos de 
unidades repetitivas formadas por 1 a 4 pb no locus hipervariável são conhecidas 
como microssatélites. Unidades de 5 a cerca de 100 pb são denominadas 
minissatélites. Obtém-se um padrão de múltiplas bandas devido ao caráter 
multilocus. Os padrões de múltiplas bandas constituem os chamados “DNA 
fingerprints” e permitem discriminar indivíduos e estabelecer graus de 
parentesco e consanguinidade. 
Microssatélites – SSR (Simple Sequence Repeats): marcadores que 
consistem de pequenas sequências (2 a 6 pares de base), repetidas em tandem, 
amplamente distribuídos nos genomas e encontrados em regiões codificadoras 
e não codificadoras. As regiões expressas do genoma apresentam uma alta 
frequência de SSR, os quais estão predominantemente localizados nas regiões 
que não codificam proteínas como 3’ e 5’ UTR. 
AFLP - Amplified fragment length polymorphism: Associa o polimorfismo 
gerado pelas enzimas de restrição com a capacidade de detecção da técnica de 
PCR. O DNA é clivado por enzimas de restrição, originando um número 
extremamente elevado de fragmentos que, em função da concentração, não são 
detectados em eletroforese. Pequenas sequências de DNA (adaptadores) são 
acopladas às extremidades desses fragmentos de restrição, as quais serão 
reconhecidas por primers específicos durante a PCR (pré-amplificação e 
amplificação seletiva). Os fragmentos gerados são então separados por 
eletroforese em gel de poliacrilamida. 
SNPs - Single nucleotidepolymorphism: Os SNPs envolvem a substituição de 
um nucleotídeo por outro, a adição ou deleção de um ou de alguns nucleotídeos. 
Para que a variação seja considerada um SNP, ela tem que ocorrer em pelo 
menos 1% da população. Eles são encontrados em abundância no genoma e 
localizados em regiões codificantes podem afetar diretamente a função da 
proteína. Esses SNPs podem ser responsáveis por algumas das variações entre 
os indivíduos com características importantes. Além de representam uma 
abordagem mais interessante para estudos de genotipagem, pois são 
geneticamente estáveis e passíveis de automatização.