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Revisão de Bioquímica 2 para AP2

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Revisão de Bioquímica 2
AP2 - 2019/1 (LARISSA)
5) Descreva as funções da enzima glicogênio fosforilase. Esta enzima sozinha é capaz de degradar totalmente uma molécula de glicogênio? Justifique sua resposta. [0,5 pt]
A enzima glicogênio fosforilase atua como uma enzima quinase em que catalisa a fosforilase do glicogênio. Esta enzima não é capaz de degradar a molécula de glicogênio totalmente, pois, age especificamente em ligações glicosídicas alfa-1,4, não sendo capaz de atuar nas ligações glicosídicas alfa-1,6. A ação desta enzima produz uma molécula residual denominada dextrina livre que participa das seguintes etapas de degradação do glicogênio. 
AP2 - 2018/2 (LARISSA)
2) Qual é o principal tecido responsável pela síntese de glicogênio e qual é a principal função desta macromolécula? Qual é a principal enzima envolvida nesse processo? [1pt]
Os principais tecidos responsáveis pela síntese de glicogênio são o fígado e o músculo. O carboidrato será armazenado no fígado na forma de glicogênio para enviar, pelo sangue aos outros tecidos, glicose quando necessário. Já o músculo armazena esta macromolécula apenas para seu consumo próprio, e só utiliza durante o exercício quando há necessidade de energia rápida. A principal enzima envolvida na síntese de glicogênio é a glicogênio sintase. Esta enzima utiliza como substrato a UDP e o final não reduzido do glicogênio com outro substrato.
AP2 - 2018/1 (LARISSA)
7) Explique as funções da Glicogenina e glicogênio sintase na biossíntese de glicogênio. [1 pt]
A glicogenina tem uma propriedade incomum, sendo a de catalisar a sua própria glicosilação, fixando o carbono-1 da UDP glicose a um resíduo de tirosina na enzima. A glicose fixada pode servir como um "primer" requerido pela glicose sintase.
Já a enzima glicose sintase forma um ligação glicosídica entre o carbono 1 da glicose ativada (UDPGlc), com o carbono 4 da glicose terminal do glicogênio que está sendo formado, liberando uma uridina difosfato (UDP). Esta enzima necessita de um "primer" ou de uma molécula de glicogênio preexistente para iniciar sua reação.
ANDREIA
AP2 - 2018/1 
3) Descreva bioquimicamente como o palmitato entra na mitocôndria. [1 pt]
AP2 - 2018/1 
6) É correto afirmar que a degradação do glicogênio ocorre por fosforólise? Justifique a sua resposta, indicando o principal produto da degradação do glicogênio e seu destino. [1 pt]
AP3 - 2018/1 
2) Descreva bioquimicamente as funções da glicogênio sintase e da glicogênio fosforilase. No que tange a regulação, quais os efeitos da fosforilação sobre cada uma delas? [2pts]
AP2 - 2018/1 (NARIELE)
2) O que são e quais são as funções das transaminases? [1 pt]
As transaminases são enzimas que apresentam como co-fator o grupamento piridoxal fosfato, a forma funcional da vitamina B6. Tem como função transferir grupamentos amino de aminoácidos para alfa-cetoácidos, elas permitem a síntese de aminoácidos não-essenciais a partir de outros aminoácidos. Na reação que envolve está enzima apenas os aminoácidos lisina e treonina não participam (Cap14 pág. 12 e 13).
AP2 - 2017/2 (CLARISSE)
4) Em que processo está envolvida e qual a função bioquímica da enzima acetil-CoAcarboxilase? [1pt]
Controle da síntese do ácido graxo por catalisar a irreversível carboxilação do acetil-CoA quando Malonil CoA. Processo é a síntese de palmitato.
MARCIA
AP2 - 2017/2
7) Descreva os passos mais importantes e produtos da degradação do palmitato. Qual o destino desses produtos? [1pts]
AP2 - 2017/1 (AUGUSTO)
3) Quais são os produtos da oxidação completa de uma molécula de palmitato? Por que, no fígado, boa parte do acetil-CoA gerado neste processo é convertido em corpos cetônicos ao invés de entrar no ciclo de Krebs? [1pt]
 Após a oxidação completa de uma molécula de palmitato são produzidas 8 moléculas de acetil-CoA; 7 moléculas de FADH2 e 7 moléculas de NADH+ H+; Boa parte das moléculas de acetil-CoA geradas nesse processo são convertidas em corpos cetônicos devido a baixa concentração de oxalacetato no fígado.
AP2 - 2017/1 (AUGUSTO)
4) Em que situação fisiológica é sintetizado o palmitato? Explique o papel da malonil-CoA nesse processo [1,5pts]
O palmitato é sintetizado quando há um excesso de nutrientes no organismo, dessa forma quando as necessidades energéticas das células forem supridas o excesso será convertido em ácidos graxos (palmitato) que vão ser depositados no tecido adiposo; o malonil-CoA é um percurso do palmitato, sem a presença dessa molécula o palmitato não pode ser sintetizado.
AP2 - 2015/1 (AUGUSTO)
8) Qual é a função da enzima piruvato carboxilase? [1pt]
A enzima piruvato carboxilase é a responsável por converter o piruvato em oxalacetato.
AP2 - 2019/1 (LEANDRO) 
3) Explique a importância do malonil-CoA na biossíntese e degradação do palmitato.
[1 pt]
O malonil-CoA é formado pela carboxilação do acetil-CoA em uma reação dependente de ATP, catalisada pela enzima acetil-CoA carboxilase. O malonil-CoA é o substrato utilizado pelo complexo ácido graxo sintase para iniciar cada ciclo da síntese de lipídio. Esta molécula é fundamental, pois sua condensação a um outro acil é seguida de uma descarboxilação e este processo permite que a síntese de ácidos graxos se torne exergônica e, portanto, ocorra espontaneamente. Para haver síntese de palmitato é necessário que haja muito malonil-CoA disponível.
AP2 - 2018/1 (LEANDRO)
4) Diferencie a biossíntese e a degradação do palmitato. [1 pt]
Na síntese de palmitato - Molécula com vários grupos de CH2 que na sua síntese utiliza-se do malato que é uma molécula que possui carbono ligado ao oxigênio. O oxigênio precisa sair para entrar H e assim forma CH2, por isso há reduções com o uso de NADPH, que cede seus H gerando NADP+. Além disso há uma etapa de desidratação que remove o oxigênio da molécula e há também a condensação de moléculas pequenas, como o malonil- CoA, visando formar uma molécula grande como o palmitato. Na β-oxidação - Forma-se o acetil-CoA, que tem o oxigênio ligado ao carbono e precisa ser oxidado. Por isso precisamos de FAD e NAD+, que irão receber os H vindos do palmitato, formando FADH2 e NADH. Além disso, na β-oxidação, há uma etapa de hidratação que insere oxigênio na molécula e há também a tiólise , que é a quebra do palmitato em unidades de 2 carbonos (acetil-CoA). Essas duas vias são quimicamente o reverso uma da outra.
AP2 - 2018/1 (LEANDRO)
5) Descreva os principais mecanismos de controle da biossíntese de palmitato. [1 pt]
A enzima acetil-CoA carboxilase é altamente controlada pela célula, pois ela irá gerar o malonil-CoA, principal substrato para a síntese do palmitato. A acetil- CoA carboxilase sofre dois controles.
Controle através do citrato - A acetil-CoA carboxilase possui um sítio de ligação ao citrato (sítio alostérico). Ao ocupar esse sítio a acetil-CoA carboxilase sofre uma mudança em sua forma que resulta na sua polimerização. Quando não há a presença de citrato no citoplasma da célula a acetli-CoA carboxilase existe na forma de monômeros isolados, com a presença de citrato esses monômeros se ligam e formam um filamento longo. Na forma filamentosa a acetil-CoA carboxilase apresenta uma atividade bem maior, do que na forma de monômero, então se pode dizer que o citrato ativa essa enzima.
Controle através da fosforilação induzida pelo hormônio glucagon - O glucagon é um hormônio liberado no momento do jejum e que ativa uma proteína chamada cinase que fosforilaa acetil-CoA carboxilase, dentre outras tantas.Essa fosforilação provoca a inibição da enzima, portanto quando estamos em jejum sob a ação do glucagon a acetil-CoA está completamente inibida.
AP2 - 2014/2 (ALINE)
3) Cite pelo menos 3 compostos que podem ser convertidos à glicose durante a gliconeogênese em vertebrados. Dado que existem reações irreversíveis na glicólise, como este processo é viável bioquimicamente?
Resp.1: Lactato, glicerol e aminoácidos.
Resp.2: Todos os aminoácidos que geram intermediários do ciclo de Krebs, após sua transaminação, são precursores para a síntese de glicose.
LEANDRO
AP2 - 2014/24) Quantas moléculas de Acetil-CoA, NADH+ E FADH2 são produzidas na produção de um ácido graxo hipotético de 6 carbonos? E quantas moléculas de ATPs poderiam ser formadas se Acetil-CoA fosse totalmente degradado em todos os NADH+ e FADH2 gerados fossem reoxidados?
AP2 - 2014/2 (YNGRID)
5) Qual o principal tecido responsável pela síntese do glicogênio e qual é a principal função desta macromolécula? Qual é a principal enzima envolvida nesse processo?
Resposta: A síntese do glicogênio ocorre principalmente no fígado. Ela tem a principal função de manter a glicemia nos períodos de jejuns, alimentando inclusive alguns órgãos como o cérebro. A principal enzima envolvida nesse processo é a PEP carboxicinase (PEPCK).
AP2 - 2019/1 (EDIMARI)
7) Descreva quais são e quais as funções das etapas de contorno da gliconeogênese. 
[1 pt]
Na gliconeogênese, as três etapas irreversíveis são contornadas por um grupo distintos de enzimas que catalisam as reações que são irreversíveis no sentido da síntese da glicose.
 O primeiro contorno da gliconeogêneses ocorre na conversão do piruvato em fosfoenolpiruvato (PEP).
 Esta reação não pode ocorrer por uma simples inversão da piruvato-cinase da glicose. Antes fosforilação do piruvato é alcançada por uma sequências de reações de desvio que, em eucariotos requer enzimas existentes tanto no citosol como nas mitocôndrias.
 A formação de PEP a partir de piruvato envolve uma grande barreira energética, que, para ser superada necessita de duas etapas:
 Na primeira etapa o piruvato é convertido em oxalacetato; através da carboxilação, catalisada pela enzima piruvato carboxilase. Como a membrana mitocondrial não tem transportador para oxalacetato, antes de ser exportado para o citosol, o oxalacetato formado a partir do piruvato deve ser reduzido a malato pela malatodesidrogenase mitocondrial, com o consumo de NADH
 Na segunda etapa, o oxalacetato é convertido a PEP, através de reação catalisada pela enzima PEP carboxicinase(PEPCK).
 O segundo contorno e a conversão de frutose-1,6-bifosfato e frutose 6 fosfato: é segunda reação glicolítica que não pode participar da gliconeogêneses é fosforilação da frutose-6-fosfato pela PFK-1, sendo, uma reação irreversível em células intactas, a geração de frutose-6-fosfato a partir de frutose -6-bifosfato é catalisada por enzima diferente dependente de Mg+, a frutose-1,6-bifosfatase (FBPase-1), que promove a hidrólise essencialmente irreversível do fosfato em C-1; 
Frutose-1,6-bifosfato+H2O Frutose -6 –fosfato+Pi
 O terceiro contorno é a reação final da gliconeogênese, a desfosforilação, da glicose 6-fosfato para formar glicose. A reação catalisada pela glicose 6-fosfatase não requer síntese de ATP, sendo hidrólise simples de uma ligação éster fosfato. 
Glicose-6-fosfato+H20 Glicose+Pi
 A glicose produzida pela gliconeogênes no, no fígado nos rins, ou ingerida na dieta é entregue a esses outros tecidos, inclusive o cérebro e os músculos pela corrente sanguínea.
AP2 - 2015/2 (EDIMARI)
5) É possível converter lactato a glicose por um processo chamado gliconeogênese. Como é possível esta transformação se há reações irreversíveis na glicólise? Que outros compostos podem ser convertidos à glicose pela gliconeogênese? [1,5pts]
Na via do gliconeogeneses que ocorre no fígado e córtex drenal, o lactado é convertido em piruvato através de uma reação reversível pela enzima lactato desidrogenase que, se encontra no citosol da célula. Esta enzima está presente em vários tipos celulares, inclusive no fígado, com isto, o piruvato se transforma em glicose. Além do lactato, o glicerol e aminoácidos glicogênicos podem ser utilizados para sintetizar glicose através da gliconeogênese.
AP2 - 2015/1 (EDIMARI)
6) Sabe-se que o lactato pode ser convertido à glicose durante a gliconeogênese. Dado que temos reações irreversíveis na glicólise, como pode ocorrer tal conversão? [1pt] 
Pode ocorrer através da reação reversível catalisada pelas enzima lactato desidrogenase presente em vários tipos celulares inclusive no fígado.
AP2 - 2017/1 (GABI)
6) Descreva as funções da enzima glicogênio fosforilase. Esta enzima sozinha é capaz de degradar totalmente uma molécula de glicogênio? Justifique sua resposta [1pt]
A glicogênio fosforilase atua como uma enzima quinase catalizando as reações de fosforólise do glicogênio. Esta enzima não é capaz de degradar totalmente o glicogênio, pois, age especificamente em ligações glicosídicas α- 1,4, não sendo capaz de atuar nas ramificações com ligações glicosídicas α- 1,6. A ação dessa enzima produz uma molécula residual denominada dextrina livre que participa das demais etapas de degradação do glicogênio.
AP2 - 2017/1 (GABI)
8) O que é Glicogenina? Qual é a sua função? [0,5pt]
A glicogenina é uma proteína licalizada no entro da molécula de glicogênio. Essa proteína tem como função fixar o carbono 1 da UDP glc, dando origem a uma molécula chamada prime, essa molécula de prime, irá dar origem a molécula de glicogênio no final da etapa através da ação da enzima glicogênio sintase que irá se ligar a glicogenina e as ramificações formadas na molécula de prime.
GABI
AP2 - 2015/2
4) A fosfodiesterase catalisa a conversão da AMPc a AMP. Qual o efeito da ativação desta enzima sobre a degradação do glicogênio a glicose 1-fosfato? [1pt]
AP2 - 2016/2
AP2 - 2016/1
Faltou essas APs
AP2 - 2017/1 (JOSY)
9) Descreva a beta-oxidação dos ácidos graxos, sem deixar de mencionar a importância e o destino dos produtos desta via. [1pt]
Inicialmente ocorre a primeira oxidação mediada pelo FAD, na segunda etapa há uma hidratação onde a hidroxila é fixada no carbono 3. Na terceira etapa ocorre uma segunda oxidação, agora mediada pelo NAD. Na quarta e ultima etapa, ocorre o catabolismo do palmitoil-CoA pela tiólise, gerando ácido graxo com 14C + 1 acetil-CoA. E em sucessivas tiólises ocorre a formação dos produtos: 8 Acetil-CoA (usado no CAC) + 7 FADH2 + 7 NADH2 (utilizados na CTE)
AP2 - 2015/2 (JOSY)
6) Onde, na célula, ocorre a oxidação de ácidos graxos? Quais são os produtos da beta-oxidação de um ácido graxo de número ímpar de carbonos? [1pt]
A oxidação de ácidos graxos ocorre na matriz mitocondrial. Além da formação de acetil-CoA, FADH2 e NADH2, há a molécula de succinil-CoA, e, por gerar posteriormente oxaloacetato, não há formação de grupos cetônicos.
AP2 - 2015/2 (JOSY)
7) Explique as funções do malonil-CoA na síntese de ácidos graxos saturados. Não deixe de mencionar na sua resposta qual é o seu precursor, a enzima responsável por sua síntese e os principais mecanismos de regulação. [1,5pts]
Ao ligar-se a fosfopantoteína, induz as enzimas de condensação que vem captar o acetato da cisteína, formando o composto de 5C. O seu percursor é o acetil-CoA, que é catalisado pela enzima acetil-CoA carboxilase. É regulada pela quantidade exorbitante de citrato e de NADPH para os processos de redução ate formar o oxaloacetato.
AP2 - 2015/1 (LUCAS)
1) Em que diferem os produtos da degradação de ácidos graxos de cadeia par ou ímpar? [0,5 pts] 
Os ácidos graxos diferem em seus produtos, pois ao final da degradação destes pela ß-oxidação, as cadeias que formam carbonos aos pares são mais degradadas ao final das quatro etapas da ß-oxidação do que os que chegam a cadeias com carbonos em formações impares. 
A última etapa da ß-oxidação em cadeias pares (quatro carbonos) gera um acetil-CoA e um éster de acil-CoA ao final de cada ciclo. Já quando a cadeia é impar (cinco carbonos) são gerados um acetil-CoA (dois carbonos) e um propionil-CoA (três carbonos). Em ambos os casos o acetil-CoA é direcionado para o CAC e no caso de cadeias ímpares, o propionil-CoA é transformado em succinil-CoA através da ação de três enzimas diferentes.
GONÇALVES, I. L.; VALDUGA, A. T.; PEREIRA, AAM. ESTEQUIOMETRIA ENERGÉTICA DE ÁCIDOS GRAXOS.
LUCAS
AP2 - 2015/1
7) Explique as funções do malonil-CoA na síntese de ácidos graxos saturados. Não deixe de mencionar na sua resposta qual é o seu precursor,a enzima responsável por sua síntese e os principais mecanismos de regulação. [1pt]
AP3 - 2014/1 (LUCAS)
5) Descreva brevemente como e aonde acorre a beta-oxidação de ácidos graxos. Não deixe de abordar os destinos dos produtos desta via.
A ß-oxidação ocorre dentro da mitocôndria, porem, os ácidos graxos que virão a ser oxidados não entram diretamente na mitocôndria. Pra isso, é necessário que ocorra a translocação destes através do translocador acilcarnitina, presente na membrana interna da mitocôndria. 
O processo de ß-oxidação se da pela remoção gradativa de dois carbonos, estes formarão acetil-CoA, que é constituída de quatro etapas: oxidação do acetil-CoA para enoil-CoA e formação de FADH2; hidratação da dupla ligação formando isômero L da 3-hidroxiacil-CoA; oxidação do grupamento hidroxila a carbonila com a formação de b-cetoacil-CoA e NADH; por fim a quebra da b-cetoacil-CoA por uma molécula de CoA com formação de acetil-CoA e um acil-CoA (dois carbonos a menos), o qual ira refazer o ciclo varias vezes ate ser totalmente convertido em acetil-CoA.
Os produtos da ß-oxidação são encaminhados para o Ciclo do Acido Cítrico (CAC) e Fosforização Oxidativa (FOX)onde serão totalmente oxidados gerando um total de 131 ATP.
http://lsgasques.blogs.unipar.br/files/2008/10/oxidacao-de-acidos-graxos.pdf
https://www.coladaweb.com/biologia/bioquimica/metabolismo-de-lipidios
BIANCA
AP2 - 2019/1 
1) Descreva resumidamente como funciona bioquimicamente o ciclo da ureia. Não deixe de mencionar os mecanismos de regulação. [2 pts]
AP2 - 2019/1 (CAROLINA)
2) A glicólise e o ciclo do ácido cítrico são vias cruciais no metabolismo energético.
No entanto, há situações em que grande parte do acetil-CoA é convertido em corpos cetônicos. Por que e como isto ocorre? Como são usados os corpos cetônicos? [1,5 pt]
Na degradação de lipídeos, temos como produto acetil-CoA que, no músculo seguirá para o ciclo de Krebs onde há disponibilidade de oxaloacetato e no fígado seguirá para síntese de corpos cetônicos.
Na página 51 do módulo 2 de bioquímica, temos que corpos cetônicos são compostos solúveis em água e consistem basicamente de acetoacetato e beta-hidroxibutirato.
Formação dos corpos cetônicos:
Após formados, esses corpos cetônicos serão lançados na corrente sanguínea com destino a células necessitadas de energia. Uma v z na célula, esse composto volta a acetil-CoA podendo assim ser lançado no ciclo de Krebs.
Encontrei a resposta entre as páginas 50 e 52 do módulo 2 de bioquímica.
AP2 - 2018/2 (ADRIANA)
1) Em que processo está envolvida e qual a função bioquímica da enzima acetil-CoA carboxilase? Explique como esta enzima é regulada pelo citrato. [1,5pts]
O ACETIL CoA PARTICIPA COMO INTERMEDIÁRIO DO CICLO DE KREBS, POIS AO CONDENSAR-SE AO OXALOACETATO, FORMA O CITRATO. É NESTE CICLO QUE O ACETIL CoA SERÁ TOTALMENTE OXIDADO A CO2, PARALELO À PRODUÇÃO DE COENZIMAS REDUZIDAS. A SÍNTESE DO ACETIL CoA É O ELO DE LIGAÇÃO DAS VIAS GLICOLÍTICAS, B-OXIDAÇÃO E DEGRADAÇÃO PROTÉICA AO CICLO DE KREBS.
CONSIDERENDO QUE O ACETIL-COA CARBOXILASE É UMA DAS ENZIMAS RESPONSÁVEIS PELA SÍNTESE DO ÁCIDO GRAXO, SUA FOSFORILAÇÃO VIA GLUCAGON SÓ PODE LEVAR A SUA INATIVAÇÃO. O CITRATO É UM MODULADOR ALOESTÉRICO QUE FAVORECE A POLIMERIZAÇÃO DOS MONÔMEROS DESTA ENZIMA TORNANDO-A ATIVA.
AP2 - 2018/2 (VANESSA)
6) Para que serve o ciclo da ureia? Descreva bioquimicamente este ciclo, sem deixar de mencionar as etapas mais importantes. [2pts]
O principal produto da degradação de aminoácidos é a amônia, que é muito tóxica. Em mamíferos, a principal fonte de amônia nos organismos vertebrados vem dos aminoácidos que são ingeridos pala dieta, que são a principal fonte de grupos amino em que a maioria é metabolizado pelo fígado. A amônia é convertida em uréia, através de um ciclo conhecido como “ciclo da uréia” que ocorre dentro dos hepatócitos, no fígado, pois, somente ele possui as enzimas para este ciclo. Esse processo é vital para o nosso organismo e qualquer problema na atividade de enzimas do ciclo, acarreta em níveis elevados de amônia no sangue, que além de alterar o pH sanguíneo, a amônia pode atravessar a barreira hematoencefálica e no cérebro, ser convertida em glutamato (pela glutamato desidrogenase) fazendo com que o cérebro perca substâncias como o alfa-cetoglutarato, substrato da enzima. Com isso, haverá diminuição dos níveis de oxaloacetato e uma queda na atividade do ciclo de Krebs, comprometendo a respiração celular, causando danos aos tecidos neurais, levando ao coma e a morte. Deficiência parcial das enzimas do ciclo causam retardamento mental, letargia e vômitos. 
Por isso, a amônia é considerada um composto tóxico quando em altas concentrações, por isso precisa ser eliminada. Alguma amônia gerada na degradação de aminoácidos proveniente da dieta é reciclada e usada em várias vias biossintéticas. O excesso é eliminado na forma de ureia nos mamíferos, como amônia nos peixes e animais aquáticos e como ácido úrico em répteis e aves.
A biossíntese da uréia é um processo cíclico, ou seja, um dos compostos (a ornitina) é consumido em uma reação e é regenerado em outra. Não há perda ou ganho efetivo de ornitina, de citrulina, argino-succinato e arginina. Todavia, íon amônio, CO2, aspartato e ATP são consumidos no ciclo. Algumas reações da síntese da uréia ocorrem na mitocôndria, enquanto outras ocorrem no citosol. A uréia é então transportada para o rim e eliminada na urina.
Reações do Ciclo da Uréia:
1ª reação: A biossíntese da uréia começa com a condensação do dióxido de carbono, com a amônia, utilizando ATP para formar carbamoil-fosfato. Tal reação é catalisada pela carbamoil-fosfato sintase I. A formação de carbamoil-fosfato requer dois moles de ATP. Um ATP ativa o bicarbonato e o outro doa o grupo fosfato para formar o carbamoil-fosfato. A carbamoil-fosfato sintase I ocorre na matriz mitocondrial, usa amônia como doador de nitrogênio e é absolutamente dependente de N-acetil glutamato para a sua atividade. A ação conjugada da glutamato desidrogenase e da carbamoilfosfato sintase I forma um intermediário com alto potencial de transferência de grupo, ou seja, um composto rico em energia. A síntese do carbamoil-fosfato, ocorre em etapas: Na primeira etapa, ocorre a reação do bicarbonato com o ATP formando o carbonil-fosfato e ADP. Na segunda etapa, a amônia desloca o ADP, formando carbamato e ortofosfato. Finalmente, ocorre a fosforilação do carbamato pelo segundo ATP, formando o carbamoilfosfato. A carbamoil-fosfato sintase I é a enzima do ciclo da uréia, limitante da velocidade, ou marcapasso. Essa enzima regulatória é ativa somente na presença do ativador alostérico N-acetil-glutamato, cuja ligação induz uma mudança conformacional, que aumenta a afinidade da enzima pelo ATP. 
2ª reação: A síntese da citrulina ocorre na mitocôndria e é catalisada pela L-ornitina transcarbamoilase. Esta enzima catalisa a transferência do grupo carbamoil-fosfato para a ornitina, e com isso forma a citrulina. Nesta reação, ocorre a liberação de fosfato inorgânico (Pi). A citrulina é transportada da mitocôndria para ocitosol, onde ocorrem as outras reações do ciclo. A citrulina, o composto utilizado nesta reação, foi formada no citosol e de lá foi transportada para a mitocôndria. Tanto a entrada da ornitina para a mitocôndria quanto a saída da citrulina da mesma mitocôndria, portanto, envolvem sistemas de transporte pela membrana interna mitocondrial.
3ª reação: A 3a reação é catalisada pela argino-succinato sintase, que liga o aspartato à citrulina, via aminogrupo do aspartato, e fornece o segundo nitrogênio. Tal reação requer ATP e envolve a formação intermediária de citrulil-AMP. O deslocamento subseqüente do AMP pelo aspartato, então, forma o argino-succinato. Esta é uma reação de condensação, onde a argino-succinato sintase requer a hidrólise de um ATP, o qual é hidrolisado em adenosina monofosfato (AMP) mais pirofosfato inorgânico (Ppi).
4ª reação: A clivagem do argino-succinato, catalisada pela argino-succinase, retém nitrogênio no produto argininae libera o esqueleto aspartato como fumarato. A adição de água ao fumarato forma o L-malato, e a oxidação subseqüente do malato, uma reação NAD+ dependente, forma o oxaloacetato. Essas duas reações, embora análogas às do ciclo de Krebs, são catalisadas pela fumarase e pela malato desidrogenase citosólicas. A transaminação do oxaloacetato pelo glutamato, então, forma novamente o aspartato. O esqueleto carbônico, tanto de aspartato como de fumarato, atua como um carreador no transporte de nitrogênio do glutamato para um precursor da uréia.
5ª reação: A reação final do ciclo da uréia, a clivagem hidrolítica do grupo guanidino da arginina, catalisada pela arginase hepática, libera uréia. O outro produto, a ornitina, torna a penetrar na mitocôndria hepática, para participar das etapas adicionais do ciclo da uréia. 
Regulação da síntese de uréia: A carbamoil-fosfato sintetase requer N-acetil glutamato como ativador alostérico. Este composto é sintetizado a partir do glutamato e do acetil-CoA, pela enzima N-acetil glutamato sintetase, a qual, por sua vez, é ativada por arginina. Acetil-CoA, glutamato e arginina são necessários para fornecer intermediários ou energia para o ciclo da uréia, e a presença de N-acetil-glutamato indica que todos eles estão disponíveis. A indução das enzimas do ciclo da uréia ocorre (10 a 20 vezes) quando a liberação de amônia ou de aminoácidos para o fígado aumenta. A concentração dos intermediários também tem um papel importante nessa regulação. Um alto teor de proteínas na dieta (excesso de fornecimento de aminoácidos), bem como situações de jejum (aumento da degradação de proteínas endógenas) resultam na indução de enzimas do ciclo da uréia.
JESSICA
AP2 - 2018/1 
1) Cite dois exemplos de aminoácidos cetogênicos e dois aminoácidos glicogênicos. Discorra sobre os possíveis pontos de entrada dos aminoácidos glicogênicos e cetônicos no ciclo do ácido cítrico. [1,5 pt]
AP2 - 2017/2
1) Quando os aminoácidos são degradados, qual o destino da cadeia carbônica e do grupamento amino (NH3) dessas moléculas? [1,5pts]
AP2 - 2017/1
1) Explique a importância da glutamina e alanina na oxidação dos aminoácidos? [1pt]
LARA
AP2 - 2015/1
4) Qual é o destino da cadeia carbônica e do grupamento amino (NH3) proveniente da degradação de aminoácidos em mamíferos, aves e peixes? [2pts] 
AP2 - 2014/2
1) Qual é a principal fonte de amônia nos organismos vertebrados? Por que este composto precisa ser eliminado? Qual é a diferença crucial nestas diferentes estratégias de eliminação da amônia em peixes, aves e mamíferos?
AP3 - 2014/2
1) Qual é a principal fonte de amônia nos organismos vertebrados? Por que este composto precisa ser eliminado? Qual a diferença crucial nestas diferentes estratégicas de eliminação da amônia em peixes, aves e mamíferos? [1,5]
AP2 - 2019/1 (SUELLEN)
4) Explique os produtos e a importância dos dois ramos da via das pentoses fosfato. [1,5 pt]
Aula 24, pág 151 e 154
O ramo oxidativo da via de pentoses gera duas moléculas de NADPH para cada molécula de glicose -6P. O resultado final do ramo não- oxidativo, é a conversão de 3 pentoses-fosfato em duas moléculas de frutose -6P e uma molécula de gliceraldeído-3P, que pode seguir pela via glicolítica. Esses dois ramos são importantes pois nem sempre apenas o ATP é suficiente para as reações de biossíntese, então é necessário o poder redutor do NADPH.
AP2 - 2018/1 (SUELLEN)
9) Quais são os principais produtos do ramo oxidativo da via das pentoses? 
Por que se diz que está via é um desvio da via glicolítica? [1 pt]
Aula 24, pág 151, 152 e 154 
O ramo oxidativo da via de pentoses gera duas moléculas de NADPH para cada molécula de glicose -6P. O resultado final do ramo não- oxidativo, é a conversão de 3 pentoses-fosfato em duas moléculas de frutose -6P e uma molécula de gliceraldeído-3P, que pode seguir pela via glicolítica. Diz- se que esta via é um desvio da via glicolítica pois as pentoses - fosfato são convertidos em intermediários da via glicolítica através de uma série de reações de rearranjo. Além disso, o ramo oxidativo começa com a glicose -6-fosfato (glicose -6P) que é desviada da via glicolítica.
AP3 - 2018/1 (TAYNARA)
5) Quais as principais funções da via das pentoses? Discorra sobre os ramos oxidativo e não oxidativo desta via. [1,5pts]
A via das pentoses-fosfato é uma via alternativa de oxidação da glicose-6-fosfato que leva a produção de ribose-5-fosfato, CO2 e NADPH, sendo sua maior importancia, a produção de NADPH.
O Ramo oxidativo tem como função, a redução de NADPH para as reações de biossintese, assimcomo a formação de pentoses-fosfato para a sintese de nucleotídeos através da glicose 6P. O Ramo não oxidativo, permite a conversão das pentoses formadas em intermediarios a via glicolítica, possibilitando sua utilização em outras vias do metabolismo da célula.
AP2 - 2017/2 (JACKLINE)
2) Explique a importância da Via das pentoses, não deixando de comentar os seus principais produtos e compostos comuns entre esta e a via glicolítica. Descreva resumidamente quais são os dois ramos desta via e a diferença entre eles. [2pts]
A via de pentose fosfato é uma via alternativa para o metabolismo da glicose que não resulta na formação de ATP. Suas principais funções são a formação de NADPH para a síntese de ácidos graxos e esteroides, assim como a síntese de ribose-5-fosfato para a formação de nucleotídeos e ácidos nucleicos. A via de pentoses forma 3 moléculas de CO2 e três açúcares de cinco carbonos, a partir de 3 moléculas de glicose-6-fosfato. Os açúcares serão rearranjados para regenerar duas moléculas de glicose-6-fosfato. A via das pentoses fosfato é realizada por todas as células, e as que sofrem múltiplas divisões fazem mais.
As enzimas da via de pentose fosfato são citossólicas, isto é, todas as reações da via ocorrem no citosol da célula. A sequência das reações pode ser dividida em duas fases: 
Ramo Oxidativo e ramo não-oxidativo.
Ramo Oxidativo
O ramo oxidativo é a fase em que a glicose-6-fosfato sofre desidrogenação e descarboxilação para dar origem a um 6-fosfogliconato, catalisada pela enzima glicose-6-fosfato desidrogenase, uma enzima dependente de NADP+, e um segundo passo é catalisado pela 6-fosfogliconato desidrogenase, que também é dependente de NADP+, para formar NADPH e a cetopentose ribulose-5-fosfato.
Ramo não-Oxidativo
Nesta fase, a ribulose-5-fosfato é convertida novamente em glicose-6-fosfato por uma série de reações envolvendo principalmente duas enzimas: a Transcetolase e a Transaldolase. Serão formadas, a partir da ribulose-5-fosfato, vários intermediários da via glicolítica, como a frutose-6-fosfato e o gliceraldeído-3-fosfato.
AP2 - 2017/1 (PRISCILA)
5) Quais são as funções dos ramos oxidativos e não oxidativo da via das pentoses? Por que eles recebem esses nomes? [1pt]
O ramo oxidativo produz NADPH e pentoses-fosfato. Ocorrem duas reações de oxidação para a síntese de NADPH e uma descarboxilação para a síntese de ribulose 5-fosfato. O ramo não oxidativo faz a conversão das pentoses formadas em frutose 6-fosfato e gliceraldeído 3-fosfato. Não ocorrem reações de oxidação, mas apenas de rearranjo de moléculas de carbono.
AP2 - 2015/1 (SAMARA)
3) Quais são os dois principais produtos da via das pentoses e quais são as suas respectivas funções? [1,5pts] 
Os dois principais produtos das vias da pentoses são o NADPH e a ribose-5P. O NADPH é utilizado nas biossínteses redutivas (como por exemplo na síntese de ácidos graxos). Já a ribose 5-P é necessária para a biossíntese de nucleotídeos.
Livro Bioquímica Pág. 80 (primeiro parágrafo) e 81 (resumo).
AP3 - 2014/1 (MONIQUE)
6) Em que via é produzida a ribose? Como é obtido o NADPH que é utilizado como poder redutos para síntese de ácidos graxos?
A ribose é obtida na via das pentoses. O NADPH é obtido na mesma via, pela oxidação de moléculas de NADP no ramo oxidativo.
AP2 - 2019/1 (AMANDA)
6) Explique as funções de insulina e glucagon sobre o glicogênio hepático em situação de jejum e recém-alimentado. [1,5 pt]
O glucagon funciona como um controleda relação glicólise/gliconeogênese de forma a minimizar ciclos fúteis e perda de energia. Em situação recém-alimentado cerca de 25% da glicose ingerida é convertida em glicogênio no fígado. O glicogênio no interior do hepatócito varia de 1 e 100 mg/g no tecido hepático. Tanto síntese quando a degradação desse glicogênio deve ser controlada para que não haja desperdício de energia em ciclos fúteis então através da ativação da PKA, pelo glucagon sobre a síntese do glicogênio, é a inativação da enzima glicogênio sintase. Fosforila essa enzima fazendo o glicogênio sintase ficar na sua forma b (inativa) Já na situação de jejum hiperglicemia, a fosforilase cinase também fosforilada a PKA, tornando-se ativa a enzima que catalisa a fosforilação da glicogênio fosforilase, enzima-chave da degradação do glicogênio. Uma vez fosforilada, o glicogênio muda para sua forma a(ativa). O nível plasmático da glicose após a refeição pode passar de 10mM, ou seja o dobro do nível basal. Então a secreção da insulina no organismo é gradual, após se alimentar a insulina secretada serve como uma chave que abre as portas das células para que a glicose entre e seja usada na geração de energia no corpo. Quando demais no organismo a resposta da insulina é armazená-las em reservas nos tecidos para ser utilizada depois. Já em situação de jejum
AP2 - 2019/1 (VERONICA)
8) Explique os mecanismos básicos da sinalização celular disparada pelos hormônios
insulina e glucagon. [1 pt]
AP3 - 2018/1 (VERONICA)
3) Explique os mecanismos básicos de sinalização dos hormônios insulina e glucagon. Em seguida, discorra sobre como estes hormônios afetam os estoques de glicogênio hepático. [1,5pts]
O glucagon aumenta o teor, pois vai sinalizar que o organismo necessita de energia e a Insulina vai absorver a glicose degradada no estoque do glicogênio. Pag 162 e 168.
LARA
AP2 - 2018/1 
8) Discorra sobre a natureza química, mecânica de sinalização via receptor e efeitos do glucagon sobre os estoques de glicogênio hepáticos. [1,5 pt]
AP2 - 2017/2
3) As degradações do glicogênio no fígado e no musculo iniciam-se por estímulos hormonais diferentes; Esquematize as reações de degradação do glicogênio e indique a partir de que etapa os processos desencadeados pelos dois hormônios são idênticos? [1,5pts]
LARISSA
AP2 - 2017/2
6) Explique o mecanismo elementar de funcionamento bioquímico dos hormônios. A seguir, explique como funcionam os hormônios insulina e glucagon, sem deixar de comentar sobre como estes se relacionam fisiologicamente. [2pts]
AP2 - 2014/1
6) Descreva as funções primordiais da insulina, glucagon e adrenalina. Não deixe de mencionar os locais onde tais moléculas são produzidas e a influência de cada uma delas no metabolismo do glicogênio.
RENATA
AP2 - 2017/1
7) Explique os mecanismos básicos da sinalização celular disparada pelos hormônios insulina e glucagon. Explique em que condições fisiológicas esses hormônios são induzidos e quais os seus efeitos nos estoques de glicogênio hepático e lipídeos nos adipócitos. [2pts]
AP2 - 2015/1
2) Explique o que são hormônios e como é o mecanismo básico de atuação dos hormônios hidrossolúveis. [1,5pts] 
JULIANA
AP2 - 2015/1
5) Descreva as funções primordiais da insulina e glucagon. Não deixe de mencionar os locais onde tais moléculas são produzidas e a influência de cada uma delas no metabolismo do glicogênio. [1,5pts] 
AP2 - 2014/2
7) Explique o mecanismo elementar de funcionamento bioquímico dos hormônios. A seguir, explique como funcionam os hormônios insulina e glucagon, sem deixar de comentar como estes se relacionam fisiologicamente.
AP3 - 2014/2
7) Um indivíduo procurou uma academia para iniciar uma atividade física visando o emagrecimento. Foi lhe sugerido uma série de exercícios intensos e de alto impacto que deveriam ser repetidos pelo menos 3 vezes por semana. Contudo, isso não resultou em emagrecimento. O indivíduo relatou que, antes de se exercitar, ingeria uma refeição rica em carboidratos. Que resultados sobre a liberação de hormônios teria estas dietas e por que isso não resulta em emagrecimento?

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